单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5321 - 5340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5321 | 2024-08-04 |
Spatially resolved transcriptome of the aging mouse brain
2024-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14109
PMID:38372175
|
研究论文 | 本文生成了小鼠大脑老化的空间转录组图谱。 | 建立了老化小鼠大脑的空间分子图谱，揭示了特定大脑区域的基因表达变化。 | 研究中对人脑老化的理解可能不适用于所有哺乳动物，数据主要来源于小鼠。 | 探讨老化小鼠大脑的基因表达及细胞类型在空间组织中的变化。 | 年轻和老年小鼠的大脑空间转录组图谱及其基因表达特征。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的大脑样本 |
| 5322 | 2024-08-05 |
Systematic mapping of TF-mediated cell fate changes by a pooled induction coupled with scRNA-seq and multi-omics approaches
2024-04-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277926.123
PMID:38580401
|
研究论文 | 本文介绍了一种新方法iTF-seq，用于识别可以诱导细胞命运改变的转录因子 | 创新点在于引入了iTF-seq方法，能够在单细胞水平上监测转录组变化并识别影响细胞命运的转录因子 | 对多个转录因子在可诱导方式下的命运转换潜力的理解仍然有限 | 探索转录因子介导的细胞命运变化机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 5323 | 2024-08-07 |
Corrigendum: A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-Apr-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279293.124
PMID:38664005
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5324 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome characteristics of testicular terminal epithelium lineages during aging in the Drosophila
2024-03, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14057
PMID:38044573
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研究论文 | 本研究对果蝇睾丸终末上皮细胞在衰老过程中的转录组特征进行了单细胞RNA测序分析 | 首次定义了以金属硫蛋白A为标志物的终末上皮群体，并细分为六个新的亚细胞群体 | 关于终末上皮的功能多样性和调控机制仍然了解不足 | 探讨衰老过程中果蝇睾丸终末上皮细胞的转录组特征及其功能 | 果蝇睾丸终末上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2天、10天和40天的果蝇样本 |
| 5325 | 2024-08-04 |
A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278098.123
PMID:38290978
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研究论文 | 本研究开发了一种基于融合套索模型的亚克隆聚类方法FLCNA，旨在同时检测单细胞DNA测序数据中的拷贝数异常(CNA) | FLCNA方法通过融合套索模型实现了同时检测CNA和亚克隆聚类，克服了现有方法可能产生的错误结果 | 未提及具体的限制 | 研究旨在改善在复杂细胞群体中亚克隆识别的准确性 | 研究对象为乳腺癌的单细胞DNA测序数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序（scDNA-seq） | 融合套索模型 | 基因组数据 | 未提及具体样本量 |
| 5326 | 2024-08-04 |
A Bayesian framework to study tumor subclone-specific expression by combining bulk DNA and single-cell RNA sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278234.123
PMID:38195207
|
研究论文 | 本研究开发了一种Bayesian框架scBayes，以结合肿瘤亚克隆特定的基因表达和基因组数据。 | 提出了一种新方法，通过结合bulk DNA测序和单细胞RNA测序数据，填补了肿瘤亚克隆结构与转录组异质性之间的缺口。 | 使用了模拟数据及生物学数据集进行验证，但缺乏更广泛的临床数据。 | 研究肿瘤亚克隆特定的基因表达，为癌症的演化和耐药机制提供新的见解。 | 针对来自同一肿瘤的bulk DNA和单细胞RNA测序数据进行分析。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | Bayesian模型 | 基因组数据和RNA测序数据 | 使用生物数据集和模拟数据集进行验证，具体样本规模未明确说明 |
| 5327 | 2024-08-05 |
Data integration and inference of gene regulation using single-cell temporal multimodal data with scTIE
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277960.123
PMID:38190633
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研究论文 | 本研究提出scTIE，一种整合时间多模态数据并推测基因调控关系的方法 | scTIE通过使用自编码器和迭代最优传输，联合分析不同时间点的细胞数据，提供了对细胞转态变化的预测 | 该研究主要集中在单细胞数据集的整合上，可能对其他类型的数据整合不适用 | 旨在通过整合和推断基因调控关系，理解细胞状态变化的机制 | 研究对象为不同时间点的单细胞样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 scATAC-seq | 自编码器 | 时间序列的多模态数据 | 使用多种合成和真实的时间多模态数据集进行验证 |
| 5328 | 2024-08-05 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.578624
PMID:38352559
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas基因编辑技术构建了前额叶痴呆的果蝇模型，并探讨了神经元功能障碍和死亡的分子机制 | 该研究使用自有基因编辑方法忠实地重现了人类疾病的遗传背景与表型特征 | 该研究使用的模型可能无法完全代表人类疾病的所有复杂性 | 研究前额叶痴呆中tau蛋白突变导致的神经元毒性及胶质细胞-神经元信号改变的分子机制 | 进行单细胞RNA测序分析的果蝇，具体包括tau P251L突变体和对照果蝇 | 数字病理 | 前额叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 突变体模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 5329 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomic analysis to unveil heterogeneity in high-grade serous ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420847
PMID:38975339
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示高等级浆液性卵巢癌的异质性 | 该研究首次揭示了HGSOC的特定细胞特征与不良结果的相关性，并提出了代谢通路的治疗靶点 | 本研究主要集中在HGSOC的特定特征上，可能限制了其他类型卵巢癌的适用性 | 研究HGSOC的复杂机制并识别其异质性 | HGSOC的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括转移样本在内的多种HGSOC样本 |
| 5330 | 2024-08-05 |
An age-and sex-matched postoperative therapy should be required in thyroid papillary carcinoma
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1339191
PMID:38974575
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）的淋巴结转移风险因素并提出了差异化治疗方案。 | 首次指出性别和年龄对PTC术后治疗的影响，并建议在治疗中考虑这些因素。 | 未能明确TSH对PTC行为的影响，且部分临床数据可能存在偏差。 | 研究PTC术后淋巴结转移的风险因素，并开发针对PTC的差异化治疗。 | 分析2073例PTC患者的临床信息及基因表达数据。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、基因表达数据 | 2073例 |
| 5331 | 2024-08-05 |
A comprehensive exploration of the heterogeneity of immune cells in Han and Zang systemic lupus erythematosus patients via single-cell RNA sequencing
2024-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110770
PMID:38128704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索汉族和藏族系统性红斑狼疮患者免疫细胞的异质性 | 首次揭示汉族和藏族SLE患者免疫细胞的异质性 | 可能样本量有限，未包括其他民族的比较 | 揭示SLE患者免疫细胞的异质性 | 汉族和藏族的系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 5332 | 2024-08-05 |
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01169-x
PMID:37378751
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研究论文 | 本研究探讨了急性缺血性中风中周细胞的转录组特征 | 首次揭示了缺血性中风后周细胞特有的转录变化和潜在的治疗靶点 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全代表人类缺血性中风的复杂性 | 改善缺血性中风的治疗效果，寻找新的治疗靶点 | 急性缺血性中风中的周细胞 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 通过中动脉闭塞模型获得的样本在1小时、12小时和24小时后进行分析 |
| 5333 | 2024-08-04 |
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01948-8
PMID:38970067
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研究论文 | 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 | 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因，并提出了其在卵巢癌中的预后意义 | 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 | 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 | 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的大样本 |
| 5334 | 2024-08-05 |
Deciphering lineage specification during early embryogenesis in mouse gastruloids using multilayered proteomics
2024-Jul-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.017
PMID:38754429
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研究论文 | 本研究利用多层质谱技术研究了小鼠胃胚体早期发育中的蛋白质表达动态 | 首次使用多层质谱技术对小鼠胃胚体发育中的蛋白质进行全面分析，发现了各个胚层特有的时间性表达模式 | 缺乏对早期哺乳动物胚胎发育的蛋白质组学研究，现有研究较为稀缺 | 探讨小鼠胃胚体发育过程中胚层特异性蛋白质的表达和功能 | 小鼠胃胚体和发育过程中相关的蛋白质 | 数字病理学 | NA | 质谱 | NA | 蛋白质组数据 | 研究涉及的小鼠胃胚体样本数量NA |
| 5335 | 2024-08-07 |
Author Correction: The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2024-Jul-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03329-0
PMID:38970115
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5336 | 2024-08-05 |
Harnessing Single-Cell Technologies in the Search for New Therapies for Diamond-Blackfan Anemia Syndrome
2024-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104235
PMID:38740323
|
综述 | 本文讨论了单细胞技术在钻石-黑凡贫血综合症(DBA)新疗法研究中的应用。 | 该文章创新性地探索了单细胞研究对理解DBA病理机制及新疗法开发的启示。 | 本文主要为综述，具体的实验数据和结果较为有限。 | 研究DBA的病理机制及其新疗法的潜在开发。 | 钻石-黑凡贫血综合症及其相关的单细胞技术研究。 | 数字病理学 | 其他血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 克隆细胞培养测定 | NA | NA | NA |
| 5337 | 2024-08-05 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49756-2
PMID:38942804
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研究论文 | 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 | 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 | 未提及特定的限制条件NA | 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 | 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | 无 | 血液样本和下呼吸道样本 | NA |
| 5338 | 2024-08-05 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202502
PMID:38912572
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研究论文 | 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 | 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域，并描述了它们的发育过程 | 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 | 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 | 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 5339 | 2024-08-05 |
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01350-3
PMID:38862979
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评论 | 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 | 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力，尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 | 文章提到了一些整体方法的挑战，但具体的限制未详细说明 | 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 | 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 | 计算免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 多组学数据 | NA |
| 5340 | 2024-08-05 |
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116235
PMID:38892421
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研究论文 | 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 | 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 | 当前研究主要比较年轻和老年人群，未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 | 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 | 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 | 数字病理学 | 衰弱 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析 |