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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5301 | 2024-08-05 |
Characterization of cuproptosis signature in clear cell renal cell carcinoma by single cell and spatial transcriptome analysis
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01162-2
PMID:39044005
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析对清细胞肾细胞癌中的铜死亡特征进行了表征 | 首次系统研究了铜死亡相关基因与清细胞肾细胞癌肿瘤微环境的关联 | 仅研究了清细胞肾细胞癌,未涉及其他类型肿瘤 | 探讨铜死亡在清细胞肾细胞癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 清细胞肾细胞癌的不同阶段的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 多阶段清细胞肾细胞癌的样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 5302 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis unveils immunosuppressive microenvironment in the occurrence and development of multiple pulmonary lung cancers
2024-Jul-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00651-5
PMID:39043808
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研究论文 | 本研究揭示了多发性肺癌中免疫抑制微环境的特征 | 研究首次全面调查了与不同影像学或病理特征相关的多发性肺癌的分子和免疫特征 | 未提供关于样本来源的详细信息及样本数量的具体分布 | 研究多发性肺癌的发生与发展与其免疫微环境之间的关系 | 收集了27个肺结节及相应的正常组织和血液样本进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子测序(WES)和全转录组测序 | NA | 组织样本,血液样本 | 27个肺结节及匹配的正常组织和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5303 | 2024-08-05 |
P53 Activation Promotes Maturational Characteristics of Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes in 3-Dimensional Suspension Culture Via FOXO-FOXM1 Regulation
2024-Jul-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.033155
PMID:38934864
|
研究论文 | 本研究探讨了p53激活如何通过调节FOXO和FOXM1的平衡来促进人诱导多能干细胞衍生心肌细胞的成熟特性 | 首次揭示了p53激活在三维悬浮培养中促进hiPSC-CM成熟的机制 | 研究样本量较小,仅为每组3到6个样本,可能影响结果的普遍性 | 研究hiPSC-CM的成熟机制,以促进其临床转化 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 每组3到6个hiPSC-CM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5304 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing analysis and bulk-RNA sequencing analysis to forecast necroptosis in cutaneous melanoma prognosis
2024-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15148
PMID:39051739
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和普通RNA测序分析预测皮肤黑色素瘤中的坏死性凋亡 | 研究中提出了一种通过机器学习算法构建的与坏死性凋亡相关的标志(NRS),并验证了其在多组中的预后能力 | 研究主要依赖于公共数据库的数据,可能存在数据的代表性和准确性问题 | 探讨坏死性凋亡在皮肤黑色素瘤预后中的作用 | 主要研究对象为皮肤黑色素瘤患者的细胞,包括不同类型的细胞团和相关基因表达模式 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序,普通RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 共分析了四个队列的黑色素瘤数据,包括一个TCGA和三个GEO队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5305 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of human tendon adhesion reveals that ACKR1-regulated macrophage migration is involved in regeneration
2024-May-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00324-w
PMID:38714649
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了ACKR1调控的巨噬细胞迁移参与人类肌腱粘连的再生过程 | 发现了一种新的抗纤维化巨噬细胞群体及其来源 | 研究中的抗纤维化机制仍需进一步验证和探讨 | 研究肌腱损伤后肌腱粘连的纤维化微环境 | 分析人类和小鼠的肌腱粘连组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白组学 | NA | 组织样本 | 超过74000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5306 | 2024-08-04 |
STIGMA: Single-cell tissue-specific gene prioritization using machine learning
2024-02-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2023.12.011
PMID:38228144
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞RNA-seq数据的针对特定组织的基因优先排序方法STIGMA | STIGMA通过学习不同细胞类型在健康器官生成过程中的基因表达动态,弥补了现有方法未能捕捉细胞亚群体表达异质性的不足 | 未提及具体局限性 | 研究主要致力于利用单细胞转录组数据优先排序与罕见先天疾病相关的候选基因 | 研究对象包括小鼠肢体和人类胎心的单细胞RNA-seq数据集,以及特定先天性疾病患者的基因变异 | 机器学习 | 先天性疾病 | 单细胞RNA-seq(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及7,958个个体的研究,特定病例的样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5307 | 2024-08-04 |
Integrative Pan-Cancer Analysis Reveals the Oncogenic Role of MND1 and Validation of MND1's Role in Breast Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S458832
PMID:39051055
|
研究论文 | 本研究全面分析了MND1在多种癌症中的表达和生物学功能 | 发现MND1在多种癌症中特别是乳腺癌中具有促进肿瘤进展的作用,并且能够作为生物标志物用于癌症预后和免疫治疗 | 本研究主要依赖于数据库分析,缺乏大规模临床样本的实验证据 | 探讨MND1在不同癌症中的角色及其与乳腺癌的关系 | MND1在不同类型癌症中的表达、预后意义及功能进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、CCK8、EdU、克隆形成和流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自不同癌症的多种样本及相关数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 5308 | 2024-08-05 |
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410603
PMID:39044829
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合构建了一种针对肝细胞癌的先进诊断模型 | 创新性地利用程序性细胞死亡相关基因构建了一个七基因的诊断模型,并揭示了其与免疫检查点抑制治疗的关联 | 样本量相对较小,仅使用了50个样本和104,288个单细胞,可能限制了模型的广泛适应性 | 明确程序性细胞死亡基因在肝细胞癌中的作用并构建诊断模型 | 肝细胞癌患者样本,包括血液来源的外泌体和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 50个样本,104,288个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5309 | 2024-08-05 |
Hemicentin-1 is an essential extracellular matrix component during tooth root formation by promoting mesenchymal cells differentiation
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1435241
PMID:39050894
|
研究论文 | 该文章探讨了Hemicentin-1在牙根形成中的作用,特别是在牙本质形成过程中的影响 | 识别并强调了Hemicentin-1作为牙根与牙冠之间牙本质形成差异的关键外部矩阵成分 | 未提供与人类牙髓细胞相关的体内实验数据 | 研究Hemicentin-1在牙根形成过程中的作用,特别是其在牙本质形成中的功能 | 使用小鼠的牙齿组织,特别是切牙和磨牙,作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,CCK8检测,BrdU检测,创伤愈合检测,ALP染色,茜素红染色 | NA | 组织样本 | 小鼠切牙和磨牙组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5310 | 2024-08-05 |
Mapping Single-Cell Transcriptomes of Endometrium Reveals Potential Biomarkers in Endometrial Cancer
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S470994
PMID:39050484
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,揭示了子宫内膜癌中的潜在生物标志物 | 首次综合分析了59,397个子宫内膜样本的单细胞转录组,识别出多种细胞亚型及其转录因子活性 | 未提及实验验证阶段的具体样本数据或者临床试验结果 | 研究子宫内膜的动态免疫微环境及其在子宫内膜癌中的作用 | 分析了十个子宫内膜样本中的59397个细胞的转录组 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10个子宫内膜样本和535个子宫内膜癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5311 | 2024-08-05 |
Characterization of the Prognosis and Tumor Microenvironment of Cellular Senescence-related Genes through scRNA-seq and Bulk RNA-seq Analysis in GC
2024, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老相关基因在胃癌中的预后作用和分子亚型 | 该研究首次基于细胞衰老相关基因划分胃癌分子亚型并发展了相应的风险模型 | 研究可能缺乏外部验证,依赖于特定的数据库资源 | 研究细胞衰老相关基因在胃癌中的作用和影响 | 胃癌患者的细胞衰老相关基因及其临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq和Bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 利用了TCGA数据库中各类胃癌患者的临床和基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5312 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Steroidogenesis and Spermatogenesis Impairment in the Testis of db/db Mice
2024, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/2024/8797972
PMID:38817616
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研究论文 | 本研究探讨了db/db小鼠睾丸中类固醇生成和精子发生的障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了db/db小鼠中睾丸的类固醇生成和精子发生缺陷 | 本研究仅限于db/db小鼠,可能不适用于其他类型的糖尿病模型 | 探究2型糖尿病对男性类固醇生成和精子发生的影响 | db/db小鼠及其对照C57BL/6J小鼠的睾丸 | 数字病理学 | 糖尿病相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠和C57BL/6J小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 5313 | 2024-08-04 |
Circular RNA-based therapy provides sustained and robust neuroprotection for retinal ganglion cells
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102258
PMID:39045516
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种基于环状RNA的疗法,该疗法为视网膜神经节细胞提供持久且强效的保护 | 本研究利用环状RNA(circRNA)来提高神经生长因子(NGF)的蛋白质表达,并为视网膜神经节细胞提供保护,这是一种创新的治疗方法 | 本研究未提及具体的药物传递系统的长期影响和临床转化的可行性 | 研究基于环状RNA的疗法在治疗眼部神经退行性疾病中的效果 | 研究对象为小鼠视神经挫伤模型中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 眼部神经退行性疾病 | 脂质纳米颗粒(LNP)制备的circNGF | 小鼠视神经挫伤模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本大小 | NA | NA | NA | NA |
| 5314 | 2024-08-05 |
Endogenous activation of peroxisome proliferator-activated receptor-α in proximal tubule cells in counteracting phosphate toxicity
2024-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00046.2024
PMID:38870264
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研究论文 | 这篇文章探讨了肾小管上皮细胞内源性活化过氧化物酰化酶-α以对抗磷毒性的机制 | 首次揭示了PPAR-α和脂肪酸β-氧化在肾小管上皮细胞中的内源性激活作为保护肾脏免受磷毒性的机制 | 对内源性机制的理解仍然有限,需进一步研究 | 旨在识别肾脏中对抗磷过负荷的内源性保护机制 | 对于对照组与饮食磷负荷(Phos)小鼠肾脏进行了单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 对照组与磷负荷小鼠的肾脏进行了比较 | NA | NA | NA | NA |
| 5315 | 2024-08-05 |
Elevated Cathepsin S Serum Levels in New-Onset Type 1 Diabetes and Autoantibody-Positive Siblings
2024-Aug-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0911
PMID:38701365
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研究论文 | 本文研究了1型糖尿病中溶酶体蛋白酶cathepsin S的潜在生物标志物作用 | 研究首次揭示了1型糖尿病新发患者血清中cathepsin S水平升高与自抗体状态的关联 | 该研究未明确cathepsin S的保护性或有害性作用 | 探讨cathepsin S作为1型糖尿病的新发生物标志物的潜力 | 研究对象包括新发1型糖尿病儿童及其自抗体阳性和阴性兄弟姐妹 | NA | 1型糖尿病 | ELISA、实时qPCR、免疫印迹 | NA | 血清 | 包含新发1型糖尿病儿童和其自抗体阳性及阴性兄弟姐妹的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5316 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals the potential prognostic roles and immunological values of unc-5 netrin receptor A (UNC5A) in glioma
2024-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01174-y
PMID:39039366
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研究论文 | 该文章探讨了UNC5A在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 首次综合分析了UNC5A在胶质瘤中的作用,并提出其作为新的预后和免疫标志物的潜力 | 未详细讨论UNC5A在治疗胶质瘤中的具体机制 | 研究UNC5A在胶质瘤中的功能及其与肿瘤免疫的关联 | UNC5A在胶质瘤患者中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 大规模RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用了TCGA及CGGA数据集中的胶质瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5317 | 2024-08-05 |
TGF-β1 mediates hypoxia-preconditioned olfactory mucosa mesenchymal stem cells improved neural functional recovery in Parkinson's disease models and patients
2024-Jul-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00550-7
PMID:39034405
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研究论文 | 该文章研究了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞改善帕金森病神经功能恢复中的作用 | 首次揭示了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞对神经功能恢复的调节作用及其机制 | 目前的研究主要集中在小鼠模型和初步临床试验,尚缺乏大规模的长期跟踪研究 | 探讨嗅觉黏膜间充质干细胞在帕金森病神经功能恢复中的潜在应用 | 帕金森病模型和患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、高通量测序的可接触染色质转座酶检测 (ATAC-seq) 和全长转录组同工谱测序 (ISO-seq) | NA | NA | 初步患者队列,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5318 | 2024-08-04 |
Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification
2024-Jul-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03447-6
PMID:39033098
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研究论文 | 本文开发了一种基于肿瘤特异性T细胞相关基因的五基因签名,以预测膀胱癌患者对免疫疗法的响应 | 提出了一种新的肿瘤特异性T细胞签名(TstcSig),该签名能够预测膀胱癌免疫疗法的结果 | 目前尚未对TstcSig在其他类型癌症中的预测能力进行广泛验证 | 研究肿瘤特异性T细胞在膀胱癌免疫治疗中的作用及其相关基因 | 膀胱癌患者及其免疫疗法响应的相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 在多个免疫治疗队列中验证,包括TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5319 | 2024-08-05 |
Determining M2 macrophages content for the anti-tumor effects of metal-organic framework-encapsulated pazopanib nanoparticles in breast cancer
2024-Jul-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02694-z
PMID:39033109
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研究论文 | 该文章探讨了金属有机框架封装的pazopanib纳米粒子在乳腺癌中的抗肿瘤效果。 | 创新点在于开发了一种新型纳米平台以提高pazopanib的抗肿瘤活性,并通过单细胞RNA测序揭示了其在抑制M2型巨噬细胞方面的作用。 | 研究中可能存在对临床适用性的局限性,尚需进一步的临床试验验证。 | 研究旨在提高pazopanib在乳腺癌治疗中的疗效。 | 研究对象包括四种小鼠肿瘤模型和人类乳腺癌MDA-MB-231模型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及小鼠和人类的乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5320 | 2024-08-05 |
Computing cell state discriminates the aberrant hematopoiesis and activated microenvironment in Myelodysplastic syndrome (MDS) through a single cell genomic study
2024-Jul-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05496-x
PMID:39033303
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组研究系统性描绘了骨髓异常造血、风险异质性和T细胞微环境的变化 | 提出了在MDS研究中使用整个骨髓细胞而非仅CD34+细胞可以提供更全面的信息 | 仅涉及五名MDS患者,样本量较小 | 探索骨髓样本中细胞状态与MDS异常造血和激活微环境之间的关系 | 研究五名MDS患者与四名健康供体的骨髓细胞 | 数字病理学 | 骨髓异常增生综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五名MDS患者和四名健康供体的整体骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |