单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5281 - 5300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5281 | 2024-08-05 |
Cell type evolution reconstruction across species through cell phylogenies of single-cell RNA sequencing data
2024-Feb, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02281-9
PMID:38182680
|
研究论文 | 该论文探讨了细胞类型的起源和进化，利用单细胞RNA测序数据重建细胞谱系 | 首次通过显式的谱系学方法应用于单细胞数据，使用主成分作为谱系特征以构建细胞谱系 | 谱系构建依赖于现有的数据，可能受限于样本的多样性和数量 | 研究细胞类型的进化及其在不同物种之间的比较 | 来自五种远缘相关哺乳动物的眼细胞的比较单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 五种哺乳动物的眼细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5282 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 5283 | 2024-08-05 |
LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110290
PMID:38944365
|
研究论文 | 该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例 | 首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果 | 仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证 | 探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案 | 一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者 | 数字病理学 | 青少年关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和血清细胞因子水平 | 1名患者和9名对照患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5284 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
|
研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5285 | 2024-08-05 |
Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation
2024-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248
PMID:38871242
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络 | 创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性 | 研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性 | 旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系 | 研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠骨髓细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5286 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5287 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5288 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
|
综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5289 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 | NA | NA | NA | NA |
| 5290 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
|
研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5291 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5292 | 2024-08-05 |
Migration Inhibition Factor Secreted by Peripheral Blood Memory B Cells Binding to CD74-CD44 Receptor Complex Drives Macrophage Behavior in Alzheimer's Disease
2024 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175241238577
PMID:38491918
|
研究论文 | 本研究探讨了外周血记忆B细胞分泌的迁移抑制因子如何影响阿尔茨海默病中的巨噬细胞行为 | 发现迁移抑制因子与巨噬细胞上的CD74-CD44受体复合物结合，影响巨噬细胞行为 | NA | 探究外周免疫系统在阿尔茨海默病中的作用，特别是记忆B细胞的影响 | 外周血记忆B细胞及其分泌的迁移抑制因子 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq，免疫荧光及流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5293 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
|
研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 5294 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
|
研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5295 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
|
研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 5296 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5297 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
|
研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5298 | 2024-08-04 |
TFvelo: gene regulation inspired RNA velocity estimation
2024-Feb-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45661-w
PMID:38360714
|
研究论文 | TFvelo 是一种扩展 RNA 速度概念的模型，通过引入基因调控信息来提高模型的准确性 | 提出了一种不依赖剪接信息的 RNA 速度估计方法，结合了基因调控信息 | 可能在某些数据集上表现不佳，具体限制未在文中详细说明 | 提高 RNA 速度估计的准确性，拓宽其在单细胞数据上的应用 | 基因动态和细胞伪时间的推断 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 合成数据和多组单细胞 RNA-seq 数据集 | 具体样本数量未在文中说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5299 | 2024-08-04 |
Microbial consortium assembly and functional analysis via isotope labelling and single-cell manipulation of polycyclic aromatic hydrocarbon degraders
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae115
PMID:38913500
|
研究论文 | 文章提出了一种构建功能性微生物 consortium 的创新方法 | 通过使用单细胞识别和分选技术，首次在原位构建了基于基因组指导的功能性微生物 consortium | 研究中可能未涵盖所有类型的污染物降解微生物 | 探索构建原位功能性微生物 consortium 的方法以提高多环芳香烃的生物降解能力 | 聚焦于降解 phenanthrene 的细菌，如 Achromobacter sp. 和 Pseudomonas sp. | 数字病理学 | NA | 拉曼激活细胞分选-稳定同位素探测 | NA | 基因组数据和细胞功能数据 | 涉及 phenanthrene 降解细菌的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5300 | 2024-08-05 |
A general pHLA-CD80 scaffold fusion protein to promote efficient antigen-specific T cell-based immunotherapy
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200827
PMID:39027379
|
研究论文 | 本文介绍了一种通用的pHLA-CD80融合蛋白，以促进有效的抗原特异性T细胞免疫治疗 | 文中提出的APC-mimic融合蛋白有效模仿了抗原呈递细胞的自然抗原呈递模式，能够直接扩展T细胞 | 研究中未提及特定抗原呈递细胞的需求，可能在应用中存在局限 | 研究旨在提高抗原特异性T细胞的激活和扩展 | 研究对象为抗原特异性T细胞及其在小鼠模型中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞TCR测序（scTCR-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | OT-1小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |