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当前共找到 7467 篇文献，本页显示第 5261 - 5280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5261 | 2024-08-05 |
Exploring the Role of Neutrophil-Related Genes in Osteosarcoma via an Integrative Analysis of Single-Cell and Bulk Transcriptome
2024-Jul-08, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12071513
PMID:39062086
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的作用及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 提出了一种新的NRG评分和NRG特征，能够评估骨肉瘤患者的预后 | 研究尚未深入探讨NRGs在不同骨肉瘤患者中的具体功能机制 | 研究中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含来自TARGET-OS和GEO数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5262 | 2024-08-05 |
Scanpro is a tool for robust proportion analysis of single-cell resolution data
2024-07-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66381-7
PMID:38971877
|
研究论文 | 本文介绍了Scanpro，一个用于单细胞分辨率数据的稳健比例分析工具 | 提出了一种新的工具Scanpro，用于在Python环境中进行单细胞数据的比例分析 | 当前缺乏对重复和不重复单细胞数据集进行稳健比例分析的生物信息学工具 | 研究高等生物体中个体细胞对信号的应答及其在不同生物条件下细胞类型比例的变化 | 主要研究单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据集中的细胞类型比例 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5263 | 2024-08-04 |
CrossMP: Enabling Cross-Modality Translation between Single-Cell RNA-Seq and Single-Cell ATAC-Seq through Web-Based Portal
2024-Jul-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070882
PMID:39062661
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研究论文 | 本研究提出了一个模型，以实现单细胞RNA测序和单细胞表观基因组的跨模态预测 | 提出了一个基于深度神经网络的模型，能够从源模态学习潜在表示并预测目标模态 | 生成多模态数据技术挑战大且成本高，导致单细胞共检测数据的可用性有限 | 探索如何在单细胞层面同时分析多种组学模态 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序的数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 深度神经网络 | 多模态数据 | 跨多个配对的人类scATAC-seq和scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5264 | 2024-08-05 |
CD163+ Macrophages Induce Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atheroma
2024-Jul-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324082
PMID:38860377
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研究论文 | 本研究探讨了CD163+巨噬细胞在动脉粥样硬化中诱导内皮细胞向间充质细胞转变的作用 | 揭示CD163+巨噬细胞通过促凋亡内皮细胞向间充质细胞转变来促进动脉粥样硬化斑块进展 | 仅使用了小鼠模型和人类动脉样本，可能无法完全代表所有类型的动脉粥样硬化 | 阐明动脉粥样硬化中细胞表型转变的刺激因素和意义 | 人类冠状动脉组织切片及不同小鼠模型（如ApoE-/-和ApoE-/-/CD163-/-小鼠） | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、组织病理学分析、西方印迹 | 小鼠模型 | 组织切片、细胞培养 | 107个急性冠状动脉斑块破裂病变 | NA | NA | NA | NA |
| 5265 | 2024-08-04 |
The impact of next-generation sequencing for diagnosis and disease understanding of myeloid malignancies
2024-Jul, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2024.2383445
PMID:39054632
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review | 本综述简要描述了应用于髓系肿瘤（MNs）临床诊断的技术及其相关挑战. | 介绍了当前尚为研究用途的长测序、全外显子组/全基因组测序和单细胞测序等新兴技术，将很快成为临床检测标准. | 讨论了在资源有限的环境中全面基因组测试的采用挑战，以及其纳入临床试验的限制. | 优化髓系肿瘤的临床护理，通过改善诊断、预后、治疗规划和患者监测. | 髓系肿瘤的分子评估与临床技术. | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5266 | 2024-08-05 |
Correction: Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012417
PMID:39058654
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更正 | 该论文修正了关于单细胞转录组分析和AID缺乏小鼠的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5267 | 2024-08-05 |
Dimethyl Fumarate Mediates Sustained Vascular Smooth Muscle Cell Remodeling in a Mouse Model of Cerebral Aneurysm
2024-Jun-27, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13070773
PMID:39061841
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研究论文 | 本研究探讨了二甲基富马酸在小鼠脑动脉瘤模型中对血管平滑肌细胞(VSMCs)的影响 | 文章创新点在于首次揭示了二甲基富马酸对VSMCs的抑制作用与抗氧化功能紊乱之间的关联 | 尚未调查二甲基富马酸对VSMCs功能的潜在副作用 | 研究二甲基富马酸对脑动脉瘤诱导后VSMCs的影响 | 脑动脉瘤诱导后圈状动脉(VSMCs)中的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 小鼠模型中未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 5268 | 2024-08-04 |
Inferring Tree-Shaped Single-Cell Trajectories with Totem
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_9
PMID:39068362
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研究论文 | 本文介绍了通过Totem推断树状单细胞轨迹和伪时间的方法 | 提出了两种用户友好的协议，可以灵活地推断树状单细胞轨迹，解决复杂拓扑结构预测的挑战 | 主要集中在单细胞转录组数据的应用，未涉及其他类型的数据 | 研究单细胞转录组数据中细胞发育过程的轨迹推断 | 人类骨髓CD34+细胞，研究三条谱系的分支：红系、淋巴系和单核系 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5269 | 2024-08-04 |
Unsupervised Single-Cell Clustering with Asymmetric Within-Sample Transformation and Per-Cluster Supervised Features Selection
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_8
PMID:39068361
|
研究论文 | 本文展示了如何将不对称样本内变换应用于单细胞RNA测序数据，与之前的缺失值插补相匹配 | 提出了一种不对称变换的方法以处理低表达强度，同时保留高表达基因水平，并结合每个基因的熵估计进行非信息基因的去除 | 样本量和不同基因类型的影响可能未在研究中充分探索 | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析和基因特征选择 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | GLM | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5270 | 2024-08-04 |
RNA-Seq Analysis of Mammalian Prion Disease
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_20
PMID:39068373
|
研究论文 | 本文介绍了利用单细胞RNA测序数据分析哺乳动物朊病毒病的RNA测序方法 | 提出了一种可重复使用的RNA测序分析协议，以揭示朊病毒病中的转录变化 | NA | 揭示哺乳动物朊病毒病的转录特征 | 哺乳动物朊病毒病的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用自NCBI GEO数据库获得的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5271 | 2024-08-05 |
Inferring Novel Cells in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_7
PMID:39068360
|
研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中推断新细胞类型的方法 | 提出了三类推断新细胞的方法，包括未监督和异常检测的方法、监督和半监督的方法、以及基于拷贝数变异的方法 | 推断新细胞在常规单细胞RNA测序分析中仍然具有挑战性 | 研究单细胞RNA测序技术中识别和表征新细胞类型 | 利用单细胞RNA测序技术分析细胞类型及其亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5272 | 2024-08-05 |
Zebrafish Thrombocyte Transcriptome Analysis and Functional Genomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_10
PMID:39068363
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研究论文 | 本文探讨了斑马鱼血小板的成熟过程与功能基因组学 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析年轻和成熟血小板的转录组，以识别特定基因并揭示其在成熟过程中的角色 | 在血液循环中成熟的具体机制尚不明确 | 理解斑马鱼血小板成熟的机制 | 年轻和成熟的斑马鱼血小板 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼血小板样本，包括年轻和成熟类型 | NA | NA | NA | NA |
| 5273 | 2024-08-05 |
Comprehensive integrated single-cell RNA sequencing analysis of brain metastasis and glioma microenvironment: Contrasting heterogeneity landscapes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306220
PMID:39058687
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研究论文 | 该文章综合分析了脑转移和胶质瘤微环境中的异质性特征 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了不同来源的脑转移在微环境中的异质性差异 | 本研究的数据来自于公开数据库，可能存在数据偏倚 | 探究不同来源的脑肿瘤微环境中的异质性，以指导治疗决策 | 本研究对象为17名患者的脑转移和胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 90,168个细胞样本来自17名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5274 | 2024-08-05 |
The vast majority of somatic mutations in plants are layer-specific
2024-Jul-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03337-0
PMID:39049052
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研究论文 | 本文分析了植物中体细胞突变的频率和分布，特别是在不同的分生组织层中 | 研究发现大多数体细胞突变特定于个别层，并揭示了不同层之间的变异动态 | 对突变特征的了解仍然有限，特别是在变异与表型变化的关系方面 | 研究植物分生组织中体细胞突变的特征与分布 | 在一个杏树的不同部位分析体细胞突变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多个水果样本来自整个树木 | NA | NA | NA | NA |
| 5275 | 2024-08-05 |
Whole-genome sequences reveal zygotic composition in chimeric twins
2024-Jul-18, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100301
PMID:38773773
|
研究论文 | 该研究使用全基因组测序揭示了嵌合双胞胎的合子组成 | 本研究首次精确理解双胞胎的合子组成，并展示了在血液组织中细胞交换的历史 | 研究仅限于一种特定的双胞胎和三胞胎家庭，样本量较小 | 探讨人类发育过程中双胞胎的细胞历史 | 研究了一个三胞胎家庭和一个双胞胎家庭的合子组成 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，血液组织样本 | 一组三胞胎和一对双胞胎 | NA | NA | NA | NA |
| 5276 | 2024-08-05 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-Jul-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202740
PMID:38884383
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研究论文 | 该文章探讨了mRNA不稳定性如何增强小鼠生精细胞启动减数分裂的能力 | 本文首次揭示了MEIOC在减数分裂启动前促进生精细胞转录组变化的机制 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全推广至其他物种 | 研究MEIOC如何在生精细胞中分子层面上支持减数分裂的早期阶段 | 小鼠生精细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 开发同步的小鼠生精细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5277 | 2024-08-04 |
Diffusion on PCA-UMAP Manifold: The Impact of Data Structure Preservation to Denoise High-Dimensional Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Jul-09, Biology
DOI:10.3390/biology13070512
PMID:39056705
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研究论文 | 该文章提出了一种基于PCA-UMAP扩散的方法来去噪高维单细胞RNA测序数据 | 通过使用PCA-UMAP扩散方法，增强了数据结构的保持，优化了PCA维度和扩散参数的使用 | 未明确提及 | 解决单细胞转录组学中数据噪声和低效转录捕获的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维单细胞数据 | 经过多种scRNA-seq数据集验证 | NA | NA | NA | NA |
| 5278 | 2024-08-05 |
Deciphering lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy response through an AI-driven stemness-related gene signature
2024-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18564
PMID:39046884
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研究论文 | 本文构建了一个基于人工智能的干性相关基因特征，解读肺腺癌预后和免疫治疗反应 | 该研究首次建立了干性相关基因特征，并分解了肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 研究中对干性基因特征与免疫环境的关联探索可能受到样本量和数据类型的限制 | 提升肺腺癌的预后准确性，以优化个性化免疫治疗策略 | 研究对象为肺腺癌（LUAD）细胞和相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | AI网络（传统回归、机器学习、深度学习） | 基因组数据 | 使用LUAD细胞系进行的实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 5279 | 2024-08-05 |
Reduction of Glyoxalase 1 Expression Links Fetal Methylmercury Exposure to Autism Spectrum Disorder Pathogenesis
2024-Jun-22, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics12070449
PMID:39058101
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研究论文 | 这篇文章探讨了甘油醛酶1表达的降低将胎儿甲基汞暴露与自闭症谱系障碍的发病机制联系起来 | 研究揭示了甲基汞暴露对自闭症风险基因在皮层发育中的直接影响 | 具体对照组和长时间观察的数据可能不足 | 本研究旨在确定孕期甲基汞诱导早熟神经分化和异常神经发育的分子机制 | 研究对象为孕期暴露于低剂量非凋亡性甲基汞的小鼠模型 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和实时定量PCR (RT-qPCR) | NA | 基因表达数据 | 培养的胚胎放射状胶质前体细胞 (RGPs) | NA | NA | NA | NA |
| 5280 | 2024-08-05 |
Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy
2024-Feb-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 该研究评估了妊娠-哺乳周期中乳腺胶原蛋白的动态变化 | 本研究首次显示免疫细胞在乳腺胶原动态中发挥作用 | 本研究主要依赖单细胞RNA测序数据，可能未能涵盖所有细胞类型的完整情况 | 阐明妊娠-哺乳周期中乳腺胶原的动态特征 | 乳腺组织中的免疫细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |