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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5201 | 2024-08-05 |
MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification
2024-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00875-6
PMID:37532927
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研究论文 | 本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹(Crebzf)来影响卵母细胞衰老 | 提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力,并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制 | 本文未提及具体的样本量和长期影响的研究 | 研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用 | 聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制 | NA | 女性不孕 | 高通量测序和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5202 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法,能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释,尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5203 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达,并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用,并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5204 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能,以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8,并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线,未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 5205 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达,并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5206 | 2024-08-05 |
Revealing Genetic Dynamics: scRNA-seq Unravels Modifications in Human PDL Cells across In Vivo and In Vitro Environments
2024-Apr-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094731
PMID:38731950
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析人类牙周韧带(PDL)细胞在体内和体外环境中的遗传变化 | 首次通过scRNA-seq揭示了PDL中不同细胞亚群的独特基因特征及其对培养条件的反应 | 未详细探讨不同捐献者之间的PDL细胞差异及其生物学影响 | 旨在填补对PDL病理生理学的理解空白 | 主要人类PDL样本,涉及7个捐献者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 7个主要人类PDL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5207 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507LE
PMID:37934672
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 | 样本量相对较小,且仅限于特定患者群体 | 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 | 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 肺部组织样本 | 40名患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5208 | 2024-08-05 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
|
研究论文 | 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 | 通过综合差异表达基因和生存分析,提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 | NA | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 | 15种癌症的差异表达基因 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15种癌症类型的临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5209 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 | 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型,能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 | 未提及具体局限性 | 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 | 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学、机器学习算法 | 预测模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5210 | 2024-08-04 |
Dissecting prostate Cancer: Single-Cell insight into Macrophage Diversity, molecular Prognosticators, and the role of Peptidylprolyl Isomerase F
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112599
PMID:38959543
|
研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中的单细胞转录组学,确定了巨噬细胞的异质性及其预后基因标记。 | 揭示了前列腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性和功能特化,并识别了与预后相关的基因,特别是PPIF的作用。 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据,可能存在选择偏倚或数据完整性的问题。 | 研究前列腺癌中的肿瘤微环境及其与巨噬细胞的相互作用,识别潜在的预后基因。 | 前列腺癌的单细胞转录组学数据以及与巨噬细胞相关的基因。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 分析了9,178个细胞,归类为10种主要细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 5211 | 2024-08-04 |
CYP24A1 affected macrophage polarization through degradation of vitamin D as a candidate biomarker for ovarian cancer prognosis
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112575
PMID:38963981
|
研究论文 | 本研究探讨了CYP24A1如何通过维生素D降解影响巨噬细胞极化,并作为卵巢癌预后候选生物标志物。 | 发现CYP24A1通过调节巨噬细胞极化与维生素D的相互作用,促进卵巢癌的恶性进展。 | 研究在体外构建了异种移植模型,但缺乏临床样本验证。 | 旨在筛选与卵巢癌预后相关的线粒体相关基因。 | 主要研究CYP24A1在卵巢癌细胞中的表达及其功能。 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA卵巢癌数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5212 | 2024-08-05 |
The complex association between the immune system and the skeletal system in osteoporosis: A study of single-cell RNA sequencing
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112611
PMID:38976947
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统与骨骼系统在骨质疏松症中的复杂关系 | 揭示了特定细胞亚群及其细胞间相互作用在骨质疏松症发病机制中的关键角色 | 缺乏对临床样本的广泛验证以增强研究结果的适用性 | 探索免疫系统与骨骼系统之间的生态联系以寻找临床预防和治疗的新策略 | 以人类腰椎层组织为研究对象,进行了单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类腰椎层组织的质量控制单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5213 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional landscape of intestinal diseases (Review)
2024-09, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2024.13281
PMID:38994768
|
综述 | 本文总结了空间转录组学在肠道疾病中的应用。 | 通过空间转录组技术,深入揭示了肠道中细胞、基因、蛋白及信号之间的相互作用。 | NA | 探讨空间转录组学如何帮助理解与胃肠道相关的疾病机制。 | 肠道中的不同细胞类型及其相互作用。 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 空间转录组学(ST) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5214 | 2024-08-05 |
From genes to therapy: A comprehensive exploration of congenital heart disease through the lens of genetics and emerging technologies
2024-Sep, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102726
PMID:38944223
|
综述 | 本研究全面探索了先天性心脏病(CHD)的遗传学和新兴技术。 | 探讨了单基因和多基因因素对CHD的影响,并强调了新兴技术在该领域的变革性影响。 | 关于CHD病因的主要部分仍然不清楚,且研究可能未覆盖所有相关因素。 | 提升对先天性心脏病遗传机制的理解,以改善诊断和开发新疗法。 | 先天性心脏病的遗传学及其相关的疾病机制。 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 靶向新一代测序(NGS)、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、人诱导多能干细胞(hiPSCs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5215 | 2024-08-05 |
Correlation of Professional Antigen-Presenting Tbet+CD11c+ B Cells With Bone Destruction in Untreated Rheumatoid Arthritis
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42857
PMID:38570939
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研究论文 | 本研究探讨了Tbet+CD11c+ B细胞与未治疗的类风湿关节炎(RA)患者骨破坏之间的关联 | 首次揭示了Tbet+CD11c+ B细胞在未治疗RA中的功能特性及其对骨破坏的促进作用 | 样本量较小,且仅涉及未治疗RA患者,可能影响结果的广泛性 | 研究CD21-/low Tbet+CD11c+ MBCs与骨破坏及其他临床参数的关联 | 未治疗的类风湿关节炎患者的外周血记忆B细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序和V(D)J测序 | NA | 血液样本 | 36个来自未治疗RA患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5216 | 2024-08-05 |
Vaccine Therapy for Heart Failure Targeting the Inflammatory Cytokine Igfbp7
2024-Jul-30, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了针对炎性细胞因子Igfbp7的疫苗治疗心力衰竭的效果 | 提出了通过疫苗靶向Igfbp7改善老化内皮细胞引起的心脏功能障碍的创新方法 | 研究主要在小鼠模型上进行,临床应用的验证尚未完成 | 探究炎性细胞因子Igfbp7在心力衰竭中的作用及其作为疫苗靶点的可能性 | 研究对象为小鼠模型和心力衰竭患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、毛细管电泳-飞行时间-质谱系统 | AAV9(腺相关病毒血清型9) | 组织样本 | 使用了小鼠模型和心力衰竭患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5217 | 2024-08-04 |
Unveiling heterogeneity and prognostic markers in ductal breast cancer through single-cell RNA-seq
2024-Jul-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03325-1
PMID:39068476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了导管乳腺癌的细胞异质性及其预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析乳腺癌细胞的异质性,识别CYP24A1和TFPI2作为潜在的预后标志物 | 研究主要依赖生物信息学分析,可能缺乏大规模临床样本验证 | 调查导管乳腺癌细胞的异质性机制及潜在预后标志物 | 导管乳腺癌细胞,特别是Type 1和Type 2导管上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso回归,Cox比例风险回归 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5218 | 2024-08-07 |
Developing a simple and rapid method for cell-specific transcriptome analysis through laser microdissection: insights from citrus rind with broader implications
2024-Jul-27, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-024-01242-y
PMID:39068421
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研究论文 | 本文开发了一种简单快速的激光显微切割方法,用于细胞特异性转录组分析,并通过柑橘皮的研究展示了其有效性 | 本文省略了样本固定和防冻剂添加步骤,采用新鲜样本快速冷冻并立即进行冷冻切片,缩短了脱水时间并省略了组织清除步骤,提高了RNA提取的质量和效率 | NA | 开发一种改进的、简单且高效的激光显微切割方法,用于细胞特异性转录组分析 | 柑橘皮组织及其细胞 | 分子生物学 | NA | 激光显微切割、下一代测序 | NA | 转录组数据 | 柑橘皮组织的多个厚度切片 | NA | NA | NA | NA |
| 5219 | 2024-08-04 |
Decoding the spatiotemporal heterogeneity of tumor-associated macrophages
2024-Jul-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02064-1
PMID:39068459
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review | 本综述探讨了肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的空间和时间异质性 | 创新点在于揭示了TAMs的不同亚型、起源及功能,以及其与其他肿瘤微环境成分的复杂相互作用 | 该综述可能未覆盖所有相关研究,且主要基于现有文献,缺乏新的实验数据 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其潜在治疗靶点 | 研究对象为肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序,空间多组学 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5220 | 2024-08-04 |
IRF8 deficiency-induced myeloid-derived suppressor cell promote immune evasion in lung adenocarcinoma
2024-Jul-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05519-7
PMID:39049031
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研究论文 | 该文章探讨了IRF8缺乏如何通过促进骨髓来源抑制细胞(MDSCs)影响肺腺癌的免疫逃逸机制 | 发现IRF8是LUAD骨髓细胞中MDSC分化的重要调节因子,并通过IL6-JAK-STAT3信号通路调节MDSC的分化 | 未提及样本的具体来源及其多样性,可能影响结果的广泛适用性 | 探索肺腺癌患者的肿瘤免疫逃逸机制,以期扩展受益于免疫疗法的患者群体 | 以954个肺腺癌患者的RNA-seq数据和15个单细胞RNA-seq数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 954个肺腺癌患者的群体数据和15个单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |