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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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5181 | 2024-08-04 |
Early human fetal lung atlas reveals the temporal dynamics of epithelial cell plasticity
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50281-5
PMID:39003323
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研究论文 | 该研究提供了发育中的人类肺脏的单细胞图谱 | 该研究通过对超过150,000个单细胞进行测序,揭示了人类胎肺的细胞谱系发展动态 | 该研究可能未涵盖所有潜在的细胞类型和发育阶段 | 研究人类胎肺的发展及其在发育缺陷和疾病状态下的功能变化 | 分析19个健康人类假腺性胎肺组织中的细胞发育轨迹 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 19个健康人类胎肺组织样本 |
5182 | 2024-08-04 |
Unraveling the molecular architecture of autoimmune thyroid diseases at spatial resolution
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50192-5
PMID:39003267
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术探讨自身免疫性甲状腺疾病的分子结构及细胞异质性 | 首次识别出不同类型的细胞亚群及其在甲状腺中的分布,揭示了与甲状腺疾病相关的特定细胞损伤和纤维母细胞亚群 | 该研究的样本量和选取标准未明确说明,可能影响结果的普适性 | 研究自身免疫性甲状腺疾病的分子机制和细胞间相互作用 | 研究对象为自身免疫性甲状腺疾病患者的甲状腺组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 空间转录组技术 | NA | 甲状腺组织样本 | NA |
5183 | 2024-08-05 |
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70025
PMID:39003681
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研究论文 | 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 | 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 | 研究样本量较小,仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 | 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 | 六名阴茎癌患者的细胞,分别为四名淋巴转移患者(IV期)和两名非淋巴转移患者(I期) | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本 |
5184 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65710-0
PMID:38926537
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 | 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用,及其细胞类型特异性的可变剪接动态 | 本研究仅基于小鼠模型,未来需要在其他物种中验证结果 | 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 | 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 | 数字病理 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 43323个睾丸单细胞 |
5185 | 2024-08-05 |
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109912
PMID:38974465
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研究论文 | 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 | 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 | 本研究主要集中在小鼠模型上,缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 | 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 | Lgr5+肠干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 | NA | RNA数据 | NA |
5186 | 2024-08-05 |
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00117-6
PMID:38499808
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研究论文 | 本文探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能特性中的影响 | 揭示了SorLA在调节小胶质细胞释放TNFα中的作用,其对胶质瘤微环境及肿瘤进展有重要影响 | 本研究主要依赖于已发布的scRNA-seq数据和体外模型,可能限制了在临床背景下的直接适用性 | 研究SorLA如何影响胶质瘤微环境中的小胶质细胞功能 | 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(GAMs) | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
5187 | 2024-08-05 |
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03010-7
PMID:38519642
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研究论文 | 本研究解码了ZEB1转录因子在黑色素瘤细胞状态转变中的关键作用 | 识别并验证了关键谱系特异基因的ZEB1结合峰,阐明了其在黑色素瘤细胞身份中的重要性 | 未提及具体实验的局限性 | 探讨ZEB1在黑色素瘤细胞内肿瘤异质性中的转录调控机制 | 黑色素瘤细胞模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | ChIP-sequencing和RNA-sequencing | NA | 单细胞空间多重分析及scRNA-Seq分析 | 人类黑色素瘤样本 |
5188 | 2024-08-04 |
Glutamine metabolism prognostic index predicts tumour microenvironment characteristics and therapeutic efficacy in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18198
PMID:38506093
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研究论文 | 本文探讨了谷氨酰胺代谢在卵巢癌肿瘤微环境特征和治疗效果中的预测作用 | 构建了谷氨酰胺代谢预测指数(GMPI),作为卵巢癌的独立预测因子 | 尚未全面阐明谷氨酰胺代谢在肿瘤微环境中的总体角色 | 研究谷氨酰胺代谢在卵巢癌中的作用及其预测患者预后的能力 | 患者的卵巢癌及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
5189 | 2024-08-05 |
Combining bulk and scRNA-seq to explore the molecular mechanisms governing the distinct efferocytosis activities of a macrophage subpopulation in PDAC
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18266
PMID:38501838
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研究论文 | 本研究探讨了在胰腺导管腺癌(PDAC)中不同巨噬细胞亚群的吞噬活性所涉及的分子机制。 | 首次结合大样本和单细胞RNA测序数据,揭示了PDAC中巨噬细胞亚型在吞噬过程中的活性差异及其转录因子的作用。 | 样本量虽大,但只来自于基因表达公共数据库,缺乏临床数据的交叉验证。 | 分析巨噬细胞亚群在PDAC中的作用,以提高PDAC患者的预后。 | 涉及22,124个细胞的PDAC组织样本,分析其在吞噬过程中的活性及转录因子。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型数据 | 8个PDAC组织样本,分析了22,124个细胞 |
5190 | 2024-08-05 |
Exploring the current landscape of single-cell RNA sequencing applications in gastric cancer research
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18159
PMID:38494861
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在胃癌研究中的应用现状 | 研究单细胞RNA测序在揭示肿瘤异质性及识别潜在治疗靶点方面的重要性 | 肿瘤异质性和技术限制仍然是该领域面临的主要障碍 | 探讨单细胞RNA测序对胃癌研究的意义及其优缺点 | 胃癌的细胞群体、稀有细胞及动态转录变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
5191 | 2024-08-04 |
STRN3 promotes tumour growth in hepatocellular carcinoma by inhibiting the hippo pathway
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18147
PMID:38429901
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研究论文 | 本研究发现STRN3通过抑制Hippo通路促进肝细胞癌的肿瘤生长 | 首次揭示了STRN3通过抑制Hippo通路来促进肝细胞癌肿瘤生长的机制 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在数据来源的限制 | 旨在探究STRN3在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤生长的影响 | 对371名肝癌患者及其肿瘤和正常组织进行了临床相关性分析 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, western blotting, CCK8实验, 转移实验, 流式细胞术, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 细胞组织样本和临床数据 | 371名肝癌患者及其组织样本 |
5192 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic analysis in clear cell renal cell carcinoma: Deciphering the role of APP within the tumour microenvironment
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18186
PMID:38445803
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研究论文 | 本研究探讨了淀粉样前体蛋白(APP)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的角色 | 首次运用单细胞转录组分析揭示了APP在ccRCC的肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其与临床结果的相关性 | 需要进一步研究来验证这些发现并探讨APP的调控机制及治疗意义 | 了解淀粉样前体蛋白(APP)在ccRCC肿瘤微环境中的潜在预后生物标志物作用 | 聚焦于肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中APP的表达及其与ccRCC患者预后的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达谱 | NA |
5193 | 2024-08-04 |
Progress in single-cell multimodal sequencing and multi-omics data integration
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01092-3
PMID:38495443
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综述 | 本文总结了单细胞多模态组学数据的实验方法和多组学数据整合的计算方法 | 提出了将多种单细胞组学技术整合以获得更全面的细胞状态 | 可能没有深入探讨每种整合技术的具体应用和局限性 | 旨在探讨单细胞多模态组学及其数据整合在理解细胞状态和基因调控中的应用 | 单细胞多模态组学技术和数据整合方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 组学数据 | NA |
5194 | 2024-08-05 |
Increased blood CSF3R+ myeloid-derived suppressor cell is a predictor for breast cancer recurrence
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/MUKD2745
PMID:39005677
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研究论文 | 本研究探讨了CSF3R+骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在乳腺癌复发中的潜在作用 | 首次确认CSF3R+ MDSCs作为预测乳腺癌复发的生物标志物 | 该研究样本量较小,仅包含35名乳腺癌患者 | 研究MDSCs在乳腺癌复发中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者中MDSCs的丰度及基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NanoString分析 | 动物模型 | 血液标本 | 35名乳腺癌患者 |
5195 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer genomic analysis reveals the role of SLC30A5 in the proliferation, metastasis, and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97214
PMID:39006068
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研究论文 | 本研究探讨了SLC30A5在肝细胞癌中的表达及其预后意义。 | 发现SLC30A5在多个肿瘤类型中表达上调,并与肝细胞癌的不良预后相关联。 | 研究主要集中于肝细胞癌,其他类型癌症的相关性尚需进一步验证。 | 探讨SLC30A家族基因在多种癌症中的表达及其预后影响,特别是在肝细胞癌中的作用。 | 主要研究对象为SLC30A5及其在肝细胞癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型的样本,Huh7细胞系用于功能实验 |
5196 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies Distinct Populations of Cytotoxic CD4+ T Cells Linked to the Therapeutic Efficacy of Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S457570
PMID:39006494
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析了转移性肾细胞癌患者中的细胞毒性CD4+ T细胞亚群及其与免疫检查点抑制剂疗效之间的关系 | 首次揭示了转移性肾细胞癌中细胞毒性CD4+ T细胞的不同状态及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 该研究的验证主要依赖于初步的多重免疫荧光染色,进一步验证需要更多的实验支持 | 探讨细胞毒性CD4+ T细胞在转移性肾细胞癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗时的作用 | 转移性肾细胞癌患者的CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 转移性肾细胞癌患者的相关数据集 |
5197 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of blood identified IFIT1+ neutrophil subcluster expansion in NTM-PD patients
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112412
PMID:38901242
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研究论文 | 这项研究揭示了非结核性分枝杆菌肺病患者外周血免疫细胞的转录组特征 | 识别出IFIT1+中性粒细胞亚群在非结核性肺病患者中的扩张,以及其在宿主免疫防御中的潜在重要性 | 样本量较小,仅有六名非结核性肺病患者参与研究 | 解析非结核性分枝杆菌肺病患者外周血免疫细胞的转录组,以探索潜在的临床标志物 | 来自六名非结核性肺病患者及两名健康对照的外周血样本 | 数字病理学 | 非结核性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 六名非结核性肺病患者和两名健康对照,共分析了27,898个细胞 |
5198 | 2024-08-04 |
Selumetinib overcomes ITGA2-induced 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112487
PMID:38889513
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研究论文 | 本研究探讨了Selumetinib如何克服ITGA2诱导的结直肠癌对5-氟尿嘧啶的耐药性 | 发现ITGA2与5-FU耐药性之间的关键关系,并提出了结合Selumetinib改善治疗效果的新策略 | 本研究的结果主要基于细胞模型,临床验证仍需进一步研究 | 揭示结直肠癌中5-FU耐药性机制及寻找潜在的二线治疗方法 | 结直肠癌细胞及其与5-FU耐药性的相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 体内和体外模型 | 基因组数据 | 使用了多个GEO数据集中的结直肠癌组织的单细胞RNA测序数据 |
5199 | 2024-08-05 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Effects of Circadian Rhythm Disruption on the Metabolic Reprogramming of CD4+ T Cells in Alzheimer's Disease
2024-Aug, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03907-6
PMID:38265551
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研究论文 | 这项研究揭示了生物节律失调对阿尔茨海默病CD4+ T细胞代谢重编程的影响 | 提出了一种基于23个生物节律相关基因的CRDscore算法,用于有效分类阿尔茨海默病数据集中生物节律状态 | 缺乏对其他类型免疫细胞的深入研究 | 阐明生物节律相关基因对阿尔茨海默病T细胞免疫功能的影响机制 | 研究阿尔茨海默病中的CD4+ T细胞及其代谢 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, RF | 脑部样本 | 112个脑样本 |
5200 | 2024-08-05 |
Colorectal cancer-associated fibroblasts inhibit effector T cells via NECTIN2 signaling
2024-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216985
PMID:38821255
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研究论文 | 研究揭示了结直肠癌相关成纤维细胞通过NECTIN2信号抑制效应性T细胞的机制 | 首次识别出一种新的免疫抑制性 CAF 群体,并表明 NECTIN2 是T细胞抑制的关键驱动因子 | 尚缺乏对结直肠癌中 CAF 的全面特征描述 | 探究结直肠癌中成纤维细胞的异质性及其对效应性T细胞的影响 | 健康人类结肠和结直肠癌患者中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间蛋白组学 | NA | 细胞样本 | 近23,000个成纤维细胞 |