单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2025-07-10	Neutralization of the autophagy-repressive tissue hormone DBI/ACBP (diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein) enhances anticancer immunosurveillance 2024-12, Autophagy IF:14.6Q1 DOI:10.1080/15548627.2024.2411854 PMID:39419485	research paper	该研究探讨了DBI/ACBP（地西泮结合抑制剂，酰基辅酶A结合蛋白）作为自噬抑制因子在癌症免疫监视中的作用	发现DBI/ACBP水平升高是癌症发展的风险因素，并通过基因或抗体介导的抑制延缓癌症发展	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的可行性和效果尚需进一步验证	探索DBI/ACBP在癌症免疫监视中的作用及其作为治疗靶点的潜力	DBI/ACBP蛋白及其在癌症发展中的作用	癌症研究	乳腺癌、非小细胞肺癌、肉瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	生物标志物数据	癌症易感综合征患者及无已知癌症易感综合征的患者
502	2025-07-10	The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development 2024-10-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52809-1 PMID:39366945	研究论文	本研究揭示了Dhx36解旋酶在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用	首次发现Dhx36通过调控启动子G-四链体结构影响心肌细胞基因网络和传导系统发育	研究仅限于小鼠模型，人类心脏发育的适用性尚需验证	探索心脏传导系统发育和心肌细胞分化的转录调控机制	胚胎期和新生期小鼠心脏	发育生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序(snRNA-seq)，单细胞ATAC测序(snATAC-seq)	基因敲除小鼠模型	单细胞转录组和表观基因组数据	Dhx36敲除小鼠胚胎和新生心脏样本
503	2025-07-10	Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state 2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.25.614841 PMID:39386468	研究论文	该研究通过单细胞测序技术，识别了果蝇中调节睡眠与代谢状态交互作用的神经元及其转录响应	首次在单神经元水平上鉴定了调节睡眠与代谢交互作用的基因，并验证了多个基因的功能	研究仅针对果蝇的特定神经元，结果在更复杂生物中的普适性尚不明确	探索睡眠与代谢状态交互作用的细胞机制	果蝇的侧脑白激肽神经元(LHLK neurons)	神经科学	NA	单细胞测序(CEL-Seq), Patch-seq	NA	RNA测序数据	喂食和24小时饥饿处理的果蝇LHLK神经元
504	2025-07-10	Single-cell RNA sequencing in pediatric research: Focusing on differentiation trajectories and immune microenvironment of neuroblastoma 2024-Sep, Pediatric discovery.. DOI:10.1002/pdi3.61 PMID:40625458	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经母细胞瘤（NB）研究中的应用，重点探讨了分化轨迹、肿瘤异质性和免疫微环境	利用scRNA-seq技术深入解析神经母细胞瘤的分化轨迹、肿瘤异质性及免疫微环境，为疾病机制研究和临床诊疗提供新视角	综述性质文章，未涉及具体实验设计和数据验证	总结scRNA-seq技术在神经母细胞瘤研究中的最新进展和应用价值	神经母细胞瘤（NB）	digital pathology	neuroblastoma	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	NA
505	2025-07-08	Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis 2024-07-18, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03835-9 PMID:39020442	研究论文	通过单细胞测序技术揭示FKBP5作为面部浸润性脂肪瘤病治疗靶点的研究	首次在面部浸润性脂肪瘤病（FIL）患者的脂肪组织中，通过单细胞转录组测序发现FKBP5的过表达及其在脂肪生成中的作用	研究样本量有限，且机制研究主要在体外和动物模型中进行，需进一步临床验证	探索面部浸润性脂肪瘤病的发病机制并寻找潜在治疗靶点	面部脂肪组织中的基质血管部分（SVF）及纤维脂肪前体细胞（FAPs）	数字病理学	面部浸润性脂肪瘤病	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	FIL患者和非FIL个体的面部脂肪组织样本
506	2025-07-08	Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing 2024-07-06, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03816-y PMID:38971839	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了角膜缘干细胞（LSCs）及其微环境细胞在角膜损伤修复中的分子特征和功能响应	首次定义了LSCs的分子特征，重建了角膜上皮细胞的伪时间轨迹，并发现转录因子Creb5和Arg1+巨噬细胞分泌的OSM在角膜上皮伤口愈合中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探索角膜缘干细胞及其微环境在角膜伤口愈合中的分子机制	小鼠角膜组织和角膜上皮缺损模型	单细胞组学	角膜疾病	单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 基因敲除实验	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量的小鼠角膜组织
507	2025-07-08	DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis 2024-04-23, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03720-5 PMID:38650025	研究论文	本研究探讨了口腔黏膜下纤维化(OSF)的致病机制，并探索了牙髓干细胞(DPSCs)作为治疗手段的潜力	发现了一个具有促炎和促纤维化功能的上皮细胞亚群Epi1.2，揭示了其通过MIF-CD74和CXCR4途径与T细胞互作的机制，并首次评估了DPSCs在OSF治疗中的应用效果	OSF的动物模型可能无法完全模拟人类疾病，DPSCs的治疗机制仍需进一步验证	探索OSF的致病机制并开发新的治疗方法	口腔黏膜下纤维化(OSF)患者组织样本、大鼠模型	口腔医学	口腔黏膜下纤维化	单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜	动物模型	基因表达数据、组织图像	未明确说明样本数量，涉及人类组织样本和大鼠模型
508	2025-07-08	An integrated toolkit for human microglia functional genomics 2024-04-10, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03700-9 PMID:38600587	研究论文	本文介绍了一个集成的工具包，用于人类小胶质细胞的功能基因组学研究，优化了iPSC向iMG的分化过程，并提供了多组学数据分析平台	开发了一个优化的两步骤、20天的iPSC分化流程，结合了CRISPR-ON/OFF系统和多组学数据平台，显著提高了iMG的生成效率和研究能力	未提及在体内环境中的验证，可能限制了其在真实生理条件下的应用	开发一个高效的工具包，用于人类小胶质细胞的功能基因组学研究	人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的小胶质细胞(iMG)	功能基因组学	阿尔茨海默病(AD)	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质可及性分析(ATAC-Seq)、蛋白质组学、CRISPR-Cas9	iPSC-derived Microglia (iMG)模型	多组学数据(转录组、蛋白质组、表观基因组)	未明确提及具体样本数量，但强调了可重复收获iMG的能力
509	2025-07-08	Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3 2024-03-27, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03706-3 PMID:38539221	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了不同批次培养基对MSCs亚群组成和异质性的影响，并发现CD317+ MSCs具有增强的免疫抑制活性	发现CD317+ MSCs亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白，从而提高治疗效果，并提出了减少MSCs异质性和提高治疗一致性的新策略	研究未涉及CD317+ MSCs在其他疾病模型中的应用效果	提高间充质干细胞（MSCs）的治疗一致性和效果	间充质干细胞（MSCs）及其CD317+亚群	细胞治疗	NA	scRNA-seq分析	NA	转录组数据	NA
510	2025-07-08	Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells 2024-03-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03670-y PMID:38475896	研究论文	本文研究了人类表皮干细胞（SCs）的细胞周期持续时间（CCD），发现与传统观点相反，SCs的细胞周期比更分化的祖细胞（CPs）更短	挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点，揭示了人类表皮干细胞具有更短的细胞周期持续时间	研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞，未涉及体内环境或其他类型的干细胞	探究人类表皮干细胞的细胞周期特性及其与分化祖细胞的差异	人类角质形成细胞（包括干细胞和分化祖细胞）	细胞生物学	NA	活细胞成像、单细胞RNA测序	NA	图像数据、基因表达数据	初始传代的人类角质形成细胞
511	2025-07-08	Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome 2024-Feb-19, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1 PMID:38463959	研究论文	研究探讨了PEG化血小板生成素模拟肽JNJ-26366821（TPOm）如何通过刺激骨髓血管和基质微环境来缓解急性辐射综合征（ARS）	首次阐明了TPOm通过调节骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞和祖细胞（HSPCs）再生的机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索TPOm作为治疗急性辐射综合征（ARS）的潜在医疗对策	C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞和祖细胞（HSPCs）、内皮细胞（ECs）和间充质基质细胞（MSCs）	放射医学	急性辐射综合征	流式细胞术、全组织共聚焦显微镜、单细胞RNA测序	小鼠模型	实验数据	C57BL/6J小鼠（9-14周龄）
512	2025-07-07	B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates 2024-07-04, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023022717 PMID:38558106	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CARneg旁观者T细胞的激活及其在增强肿瘤反应中的潜力	首次全面鉴定和分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CARneg旁观者CD8+ T细胞的表型和转录组特征，揭示了其通过非T细胞受体依赖机制高效杀伤白血病细胞的新机制	研究样本量有限，且主要基于非人灵长类动物模型和部分患者样本，需要更大规模的临床研究验证	探索CAR T细胞治疗后CARneg旁观者T细胞的激活机制及其在抗白血病反应中的作用	非人灵长类动物和患者的T细胞	免疫治疗	B细胞恶性肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	非人灵长类动物模型和患者样本（临床试验#NCT03369353）
513	2025-07-06	Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis 2024-04-30, Clinical oral investigations IF:3.1Q1 DOI:10.1007/s00784-024-05659-6 PMID:38684576	研究论文	本研究通过全外显子测序等技术，鉴定了一个与Coffin-Siris综合征（CSS）患者牙齿发育不全相关的新SOX4突变，并探索了其潜在的调控机制	首次报告了SOX4错义突变导致综合征性牙齿发育不全，并验证了Sox4在小鼠牙齿发育过程中的高表达及其在牙齿发育通路中的核心作用	研究仅针对一名中国CSS患者，样本量较小，且未进行功能实验验证突变的具体机制	鉴定CSS患者牙齿发育不全的致病突变并探索其调控机制	Coffin-Siris综合征（CSS）患者和小鼠牙齿发育过程	遗传学	Coffin-Siris综合征	全外显子测序、Sanger验证、单细胞RNA测序、荧光原位杂交（FISH）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	基因组数据、RNA测序数据	一名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本
514	2025-07-05	Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET 2024-Nov-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05821-4 PMID:39548496	研究论文	该研究通过单细胞转录组学分析，揭示了促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤（PitNET）中基因表达特征与临床病理特征的联系	首次在PitNET中系统比较了促性腺激素和催乳素亚型的肿瘤微环境差异，并发现了与肿瘤侵袭性相关的淋巴细胞亚群	样本量相对较小（7例促性腺激素和3例催乳素PitNET），且主要关注两种亚型	探究PitNET肿瘤微环境与肿瘤侵袭性行为的关系	促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤	数字病理学	垂体神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序，bulk RNA-seq，免疫组化	NA	基因表达数据，组织切片图像	10例单细胞测序样本（7例促性腺激素+3例催乳素），134例bulk RNA-seq样本
515	2025-07-05	The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2 2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028 PMID:38796708	研究论文	本文探讨了PSMP/MSMP作为急性肾损伤（AKI）的新型潜在治疗靶点，通过CCR2促进AKI的机制	首次揭示了PSMP在AKI中的关键作用，并证明PSMP中和抗体可作为AKI的治疗药物	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证PSMP中和抗体的疗效	探索PSMP在AKI中的作用机制并评估其作为治疗靶点的潜力	AKI患者和小鼠模型	肾脏病学	急性肾损伤	单细胞RNA测序	AKI小鼠模型（肾缺血再灌注损伤、甘油和顺铂诱导）	RNA测序数据、临床样本数据	AKI患者和小鼠模型，具体样本量未明确说明
516	2025-07-05	S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis 2024-06-28, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06849-6 PMID:38942784	研究论文	本文研究了S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷在脓毒症期间诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制	揭示了S100A8/A9通过下调Nrf1表达抑制线粒体复合物I中的Ndufa3表达，进而导致线粒体功能障碍和PANoptosis的新机制	研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏在体实验验证	探究S100A8/A9在脓毒症期间诱导内皮细胞功能障碍的分子机制	中性粒细胞和内皮细胞	分子生物学	脓毒症	scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	测序数据	NA
517	2025-07-05	Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization 2024-06-21, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06840-1 PMID:38906852	研究论文	通过单核RNA测序和空间转录组学对58,081个细胞核进行综合分析，揭示了颅咽管瘤的免疫微环境特征及其细胞间网络	首次通过多组学整合分析揭示了颅咽管瘤的免疫抑制微环境特征，并发现了一种与肿瘤角质化相关的调控网络	样本量相对有限，且研究结果需要进一步的功能验证	阐明颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与肿瘤进展的关系	颅咽管瘤(ACP)样本	数字病理学	颅咽管瘤	单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学, asmFISH	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	58,081个细胞核
518	2025-07-05	CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06816-1 PMID:38898019	研究论文	本研究揭示了CSTF3通过调节lncRNA NEAT1的选择性多聚腺苷酸化（APA）在卵巢癌铂类耐药中的作用机制	首次发现CSTF3通过调控NEAT1的APA过程生成短亚型NEAT1_1，从而促进卵巢癌铂类耐药的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证	探索卵巢癌铂类耐药的分子机制	卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织	癌症生物学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据集
519	2025-07-05	CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06784-6 PMID:38898023	研究论文	本研究探讨了CXCR7激活通过重塑CXCL12介导的免疫反应，增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效	发现了CXCR7作为CXCL12的非典型受体在肿瘤细胞中的负调控作用，并验证了选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAM诱导的免疫抑制，增强抗PD-L1抗体的治疗效果	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探索通过靶向CXCR7-CXCL12轴增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制	胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)和T细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	转录组分析、单细胞转录组测序、体外共培养系统	小鼠胶质母细胞瘤模型	转录组数据、单细胞测序数据、体外实验数据	未明确说明样本数量，但使用了复发胶质母细胞瘤标本、公共胶质母细胞瘤数据集和小鼠模型
520	2025-07-05	Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2 2024-06-18, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06820-5 PMID:38890311	研究论文	本研究探讨了中性粒细胞反向迁移（rM）的机制，发现趋化因子受体样2（Ccrl2）及其配体chemerin在这一过程中起关键作用	首次揭示了chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞离开炎症部位的新机制	研究主要基于小鼠模型，人体中的相关性尚需验证	探索中性粒细胞反向迁移的分子机制	中性粒细胞及其迁移行为	免疫学	急性肺损伤	scRNA-seq、气袋模型	NA	基因表达数据、细胞追踪数据	小鼠急性肺损伤模型