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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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5161 | 2024-08-04 |
Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis
2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05855-7
PMID:38910204
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综述 | 本研究通过文献计量学分析,全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点 | 这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展 | 具体的局限性未在摘要中提及 | 提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述 | 与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 331篇相关出版物 |
5162 | 2024-08-05 |
Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis
2024-May-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgad723
PMID:38127960
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研究论文 | 本研究旨在调查Hashimoto甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达,并探索其在病理生理过程中的作用 | 首次在Hashimoto甲状腺炎患者的甲状腺中发现DPP4表达显著增加,并主要局限于淋巴细胞 | 样本量较小,且未能探讨DPP4在其他类型甲状腺疾病中的作用 | 研究Hashimoto甲状腺炎患者中DPP4的表达及其在炎症过程中的角色 | 40名未服药的Hashimoto甲状腺炎患者和81名对照个体 | 数字病理学 | Hashimoto甲状腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液和甲状腺组织样本 | 共121个样本(40名HT患者和81名对照个体) |
5163 | 2024-08-04 |
Investigating the characteristics of mild intervertebral disc degeneration at various age stages using single-cell genomics
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1409287
PMID:39015652
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研究论文 | 该研究探讨了不同年龄段轻度椎间盘退变的特征和机制 | 首次从年龄视角研究椎间盘轻度退变的分子机制 | 样本量可能有限,未探索重度退变的影响 | 探讨年轻人与老年人椎间盘退变的潜在机制 | 不同年龄段的椎间盘细胞,分为正常和轻度退变组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 样本 | 四种类型的椎间盘样本 |
5164 | 2024-08-05 |
Ultrasound-Guided Fine Needle Biopsy of Human Axillary Lymph Nodes to Assess B Cell Responses to Vaccination
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3950-4_2
PMID:39017882
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研究论文 | 本研究探讨了超声引导下细针活检在人类腋窝淋巴结中评估疫苗接种后B细胞反应的应用 | 提出了一种安全有效的活检方法,用于直接研究淋巴结中免疫细胞的动态过程和相互作用 | 由于关键细胞的解剖位置受到保护,直接研究这些细胞的动态过程和相互作用存在挑战 | 研究疫苗接种后腋窝淋巴结中的免疫应答,特别是B细胞的反应 | 腋窝淋巴结中的免疫细胞,重点分析B细胞群体 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术免疫表型分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
5165 | 2024-08-05 |
Mitotic catastrophe heterogeneity: implications for prognosis and immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1409448
PMID:39015573
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研究论文 | 本研究探讨了有丝分裂灾难在肝细胞癌中的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 通过揭示肝细胞癌中的有丝分裂灾难异质性及其与免疫逃避和疗法抵抗的关系,为临床决策提供了新的治疗策略 | 尚未明确有丝分裂灾难异质性与免疫逃避和治疗反应之间的机制 | 研究有丝分裂灾难在肝细胞癌进展中的作用以及其对免疫环境的调控 | 分析肝细胞癌患者的有丝分裂灾难相关基因和免疫特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 94名肝细胞癌患者的数据 |
5166 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
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研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变,揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡,可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 |
5167 | 2024-08-05 |
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16182
PMID:38655660
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研究论文 | 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗,协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 | 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 | 研究局限于小鼠模型,临床应用尚需进一步验证 | 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 | 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 | 数字病理 | 结直肠癌 | 微波消融和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本和肿瘤细胞 | 小鼠模型,样本数量未具体说明 |
5168 | 2024-08-05 |
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data
2024-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxad010
PMID:37257175
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研究论文 | 本研究探讨了基于液滴的单核RNA测序数据的量化和统计建模 | 系统评估了基于液滴的单核RNA测序数据的概率分布,并发现其符合负二项分布 | 未能详细分析所有可能的量化映射策略 | 准确建模单核RNA测序数据,以改进下游分析 | 使用小鼠皮层和肾脏的单核RNA测序数据进行研究 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠皮层和肾脏的伪阴性对照数据 |
5169 | 2024-08-05 |
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.25.546453
PMID:37645844
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 | IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序,揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 | 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 | 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 | 后天发育的小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | 5xFAD模型 | NA | NA |
5170 | 2024-08-07 |
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01847-y
PMID:39009876
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5171 | 2024-08-05 |
Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Jun-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060806
PMID:38927741
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研究论文 | 本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制 | 本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系 | 本研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类情况 | 阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响 | 使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含肾上腺髓质素足量(野生型或基因敲除)和肾上腺髓质素单倍缺失(haplodeficient)小鼠的肺组织样本 |
5172 | 2024-08-04 |
LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126707
PMID:38928412
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研究论文 | 本文探讨了LHFPL2在肾细胞癌中作为巨噬细胞M2极化的潜在生物标志物的作用 | 揭示了LHFPL2与肾细胞癌及其在巨噬细胞M2极化中的关系,并提出了潜在的靶向药物 | 尚未在体外或临床试验中验证LHFPL2作为生物标志物的有效性 | 研究LHFPL2在肾细胞癌中对巨噬细胞极化的影响及其作为癌症治疗靶点的潜力 | 研究对象为609名肾透明细胞癌患者的转录组数据及34,326个肾癌细胞的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 609名KIRC患者和34,326个肾癌细胞 |
5173 | 2024-08-05 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
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研究论文 | 本文探讨了miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次揭示miR-874-3p通过靶向ATF3调控椎间盘退变的病理过程 | 仅在实验室环境和动物模型中验证,临床应用尚需进一步研究 | 研究miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的作用及机制 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包含椎间盘退变患者和多种细胞类型的椎间盘退变大鼠样本 |
5174 | 2024-08-04 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2024-05-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03267-x
PMID:38773520
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法HATCHet2,用于从肿瘤的多样本群体DNA测序数据中同时推断克隆和单倍型特异的拷贝数异常。 | HATCHet2改进了早期HATCHet方法,通过引入新的统计量mhBAF来提高对焦点拷贝数异常的识别,并能识别镜像亚克隆CNAs。 | 该研究可能受限于从相对较小的样本中得出的结论,并未涵盖更广泛的样本多样性。 | 研究的目的是提高从肿瘤样本中推断拷贝数异常的准确性。 | 研究对象为来自10名前列腺癌患者的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 群体DNA测序 | HATCHet2 | 基因组数据 | 10个前列腺癌患者的肿瘤样本 |
5175 | 2024-08-05 |
Adipose-tissue regulatory T cells are a consortium of subtypes that evolves with age and diet
2024-Jan-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320602121
PMID:38227656
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研究论文 | 研究表明,脂肪组织中的调节性T细胞随着年龄和饮食的变化而演变 | 发现脂肪组织中存在功能上不同的调节性T细胞亚型,并且这些亚型在不同年龄和饮食下表现出不同的基因表达特征 | 未涉及具体的临床应用示例,仅在小鼠模型中进行研究 | 探索年龄和饮食对脂肪组织调节性T细胞异质性的影响 | 研究了小鼠的腹膜内脂肪组织中的调节性T细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和饮食的小鼠多个样本 |
5176 | 2024-08-04 |
Endothelial cell ferroptosis influences IDH wild-type glioblastoma growth in recurrent glioblastoma multiforme patients
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13961
PMID:38985083
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞铁死亡在复发性胶质母细胞瘤中的作用 | 本研究首次通过单细胞测序分析复发性胶质母细胞瘤中内皮细胞铁死亡的上调及其对肿瘤生长的影响 | 研究主要集中在内皮细胞与胶质母细胞瘤的相互作用,可能忽略了其它细胞类型的影响 | 理解复发性胶质母细胞瘤中肿瘤内变化驱动因素 | 分析复发性和原发性胶质母细胞瘤的内皮细胞铁死亡特征 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | 对两对原发性和复发性胶质母细胞瘤进行分析 |
5177 | 2024-08-05 |
M2 Macrophage Classification of Colorectal Cancer Reveals Intrinsic Connections with Metabolism Reprogramming and Clinical Characteristics
2024, Pharmacogenomics and personalized medicine
DOI:10.2147/PGPM.S458798
PMID:39011168
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌中M2巨噬细胞的分类及其与代谢重编程和临床特征的内在联系 | 提出了一种独特的M2分类技术,并发现了代谢表型与免疫特征之间的关系 | 仍需进一步研究以确认所识别的基因特征在免疫与肿瘤代谢之间的关键作用 | 探讨结直肠癌中免疫细胞代谢演变的临床意义 | M2巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的代谢变化 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | 混合聚类模型 | 基因表达数据 | 分析了来自TCGA和GEO数据集的多组样本 |
5178 | 2024-08-05 |
Identification of Regulatory RNA-Binding Proteins Associated with Immune Infiltration in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300498
PMID:38912837
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研究论文 | 本文分析了与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的替代剪接事件和调节RNA结合蛋白 | 介绍了新的剪接位点使用变异分析软件和科学反卷积算法,以识别重要的免疫细胞和调节RNA结合蛋白 | 只使用了从公共数据库下载的数据,可能未涵盖所有相关生物样本 | 识别与人类喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的调节RNA结合蛋白 | 研究对象包括20个喉癌及其旁癌组织样本 | 数字病理学 | 喉癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20个喉癌及旁癌组织样本和117个人喉癌样本 |
5179 | 2024-08-05 |
Dysregulated energy and protein homeostasis and the loss of GABAergic amacrine cells in aging retina
2024-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109985
PMID:38945518
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研究论文 | 本研究阐明了C57BL/6小鼠在衰老过程中的主要视网膜神经元的转录组变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同类型视网膜细胞在衰老过程中的独特变化 | 研究主要集中于C57BL/6小鼠,结果可能不适用于其他品系或物种 | 探讨衰老过程中视网膜细胞转录组的变化,以理解与衰老相关的视网膜退化机制 | 1.5-2个月和24-30个月大的C57BL/6小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组年龄小鼠(1.5-2个月与24-30个月) |
5180 | 2024-08-04 |
Paris saponin VII inhibits triple-negative breast cancer by targeting the MEK/ERK/STMN1 signaling axis
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155746
PMID:38763012
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研究论文 | 本研究探讨了Paris saponin VII对三阴性乳腺癌的治疗效果及其潜在机制 | 首次表明STMN1磷酸化的抑制可能是PSⅦ抗癌作用的机制 | 尚未进行临床试验验证 | 阐明PSⅦ对三阴性乳腺癌的治疗作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞及相关基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 分子对接、分子动力学、西方印迹 | NA | 单细胞测序数据 | 4T1异种移植模型 |