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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2024-09-04 |
Self-organizing models of human trunk organogenesis recapitulate spinal cord and spine co-morphogenesis
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01956-9
PMID:37709912
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研究论文 | 本文报道了生成类似人类躯干结构的方法,这些结构模拟了人类脊柱和脊髓的共同形态发生、模式化和分化 | 本文首次展示了在体外模型中实现类似体内的多组织共同形态发生和终端细胞类型的地形组织 | NA | 阐明人类器官发生中多系统事件的机制 | 人类脊柱和脊髓的共同形态发生 | 生物医学工程 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5142 | 2024-09-04 |
Prognostic model based on B cell marker genes for NSCLC patients under neoadjuvant immunotherapy by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data
2024-Aug, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03428-1
PMID:38563846
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,构建了一个基于B细胞标记基因的预测模型,用于非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后评估 | 首次构建了基于B细胞标记基因的预测模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | NA | 构建和验证一个基于B细胞标记基因的预测模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | 非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的B细胞标记基因及其与临床结果的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 基于TCGA队列构建模型,并在三个独立的GSE队列中进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 5143 | 2024-09-04 |
Detection of transcriptome-wide microRNA-target interactions in single cells with agoTRIBE
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01951-0
PMID:37735263
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research paper | 本文通过将miRNA效应蛋白Argonaute2与ADAR2的RNA编辑域融合,实现了在单细胞水平上检测转录组范围内的miRNA-靶标相互作用。 | 本文创新性地开发了agoTRIBE方法,能够在单细胞水平上检测miRNA的靶标,克服了传统方法需要大量细胞的局限。 | NA | 研究miRNA在单细胞水平上的基因调控作用及其在细胞周期中的差异靶向作用。 | miRNA及其靶标在单细胞中的相互作用。 | natural language processing | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5144 | 2024-09-04 |
Unlocking T cell exhaustion: Insights and implications for CAR-T cell therapy
2024-Aug, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.04.022
PMID:39220881
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综述 | 本文综述了T细胞耗竭的最新机制及其对优化CAR-T细胞疗法的影响 | 探讨了利用先进的基因组工程工具和单细胞测序技术克服CAR-T细胞耗竭的策略 | 尽管CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中显示出希望,但在实体瘤中的效果仍有限 | 旨在通过理解T细胞耗竭的机制来优化CAR-T细胞疗法,以应对癌症治疗中的挑战 | CAR-T细胞疗法的优化及克服T细胞耗竭的策略 | NA | 血液恶性肿瘤 | 基因组工程工具、单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5145 | 2024-09-04 |
DEPDC1 as a metabolic target regulates glycolysis in renal cell carcinoma through AKT/mTOR/HIF1α pathway
2024-Jul-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06913-1
PMID:39068164
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研究论文 | 本研究探讨了DEPDC1作为代谢靶点在肾细胞癌中通过AKT/mTOR/HIF1α途径调控糖酵解的作用 | 发现了DEPDC1在肾细胞癌中的新作用,并证明了其作为TKI联合靶向代谢治疗的潜在靶点 | 研究样本量相对较小,需要进一步的大规模临床研究验证 | 探索肾细胞癌中的代谢调控机制及潜在治疗靶点 | 肾细胞癌及其药物抵抗性 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(RNA-seq)、非靶向代谢组学测序 | NA | RNA序列、蛋白质水平数据 | 14名肾细胞癌患者(包括3份TKI耐药的针刺活检样本)及98份临床组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5146 | 2024-09-04 |
Decoding single-cell molecular mechanisms in astrocyte-to-iN reprogramming via Ngn2- and Pax6-mediated direct lineage switching
2024-Jul-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01989-z
PMID:39068473
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研究论文 | 本研究通过Ngn2和Pax6介导的直接谱系转换,探讨了星形胶质细胞向诱导神经元(iN)重编程的单细胞分子机制 | 本研究揭示了星形胶质细胞向诱导神经元重编程的关键基因和通路,为优化重编程过程提供了新的见解 | NA | 阐明星形胶质细胞向诱导神经元重编程的分子动力学 | 星形胶质细胞和诱导神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用10×Genomics平台进行了单细胞RNA测序,涉及的细胞数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5147 | 2024-09-04 |
Systemic and skin-limited delayed-type drug hypersensitivity reactions associate with distinct resident and recruited T cell subsets
2024-Jul-23, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178253
PMID:39042477
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研究论文 | 本研究利用先进技术探讨了不同类型的药物过敏反应中皮肤驻留记忆T细胞(TRMs)和招募T细胞亚群的起源、表型和功能 | 通过单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和细胞内转录组和表位的测序(CITE-Seq)以及T细胞受体测序(TCR-Seq),揭示了系统性和皮肤局限性药物过敏反应中T细胞亚群的差异 | NA | 探究不同严重程度的药物过敏反应中致病性T细胞的起源、表型和功能 | 皮肤驻留记忆T细胞(TRMs)和招募T细胞亚群 | 免疫学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),细胞内转录组和表位的测序(CITE-Seq),T细胞受体测序(TCR-Seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5148 | 2024-09-04 |
De novo identification of CD4+ T cell epitopes
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02255-0
PMID:38658646
|
研究论文 | 本文介绍了使用SABR-IIs平台进行CD4 T细胞抗原发现的方法,该平台能够展示共价连接的肽段并诱导信号传导 | 开发了一种新的SABR-IIs平台,用于快速、灵活、可扩展和多功能的CD4 T细胞配体从头鉴定 | NA | 探索和鉴定CD4 T细胞的抗原特异性 | CD4 T细胞及其抗原识别 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5149 | 2024-09-04 |
Reclassify High-Grade Serous Ovarian Cancer Patients Into Different Molecular Subtypes With Discrepancy Prognoses and Therapeutic Responses Based on Cancer-Associated Fibroblast-Enriched Prognostic Genes
2024, Biomedical engineering and computational biology
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11795972241274024
PMID:39221174
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研究论文 | 本研究基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因,将高级别浆液性卵巢癌患者重新分类为具有不同预后和治疗反应的分子亚型 | 首次基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因对高级别浆液性卵巢癌患者进行重新分类,并发现这些亚型对传统化疗和免疫治疗的反应存在差异 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 | 旨在通过癌症相关成纤维细胞富集的预后基因,筛选出预后不良和治疗反应不佳的高级别浆液性卵巢癌患者 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其治疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织样本来自TCGA和GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 5150 | 2024-09-03 |
Dynamic changes in pyroptosis following spinal cord injury and the identification of crucial molecular signatures through machine learning and single-cell sequencing
2024-Aug-26, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2024.116449
PMID:39217701
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后细胞焦亡的动态变化,并通过机器学习和单细胞测序技术识别了关键的分子特征 | 本文首次通过机器学习算法和单细胞测序数据分析,揭示了脊髓损伤后细胞焦亡的时序动态变化和关键分子特征 | NA | 阐明脊髓损伤后细胞焦亡的主要细胞类型和相关关键基因 | 脊髓损伤后的细胞焦亡及其相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了BV2细胞和脊髓组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5151 | 2024-09-03 |
Dissociation of Human and Mouse Tumor Tissue Samples for Single-cell RNA Sequencing
2024-Aug-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66766
PMID:39221955
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研究论文 | 本文介绍了一种快速通用的组织解离协议,用于从人和小鼠肿瘤组织样本中进行单细胞RNA测序(scRNAseq)。 | 开发了一种快速通用的解离协议,适用于多种类型的人和小鼠肿瘤样本,确保了单细胞悬液的纯净和活力。 | 解离过程可能影响单细胞的交叉污染和数据质量,以及可能导致敏感细胞群的消除和应激反应基因的上调。 | 旨在克服现有解离技术的局限性,提高单细胞RNA测序的质量和可靠性。 | 人及小鼠的肿瘤组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 细胞 | 多种类型的人和小鼠肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5152 | 2024-09-03 |
[Recent advances in capillary electrophoresis-mass spectrometry analysis of trace biomolecules]
2024, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.24036
PMID:39218679
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综述 | 本文综述了毛细管电泳-质谱(CE-MS)在痕量生物分子分析中的最新进展,特别是单细胞分析方面 | 结合高灵敏度的纳米电喷雾电离质谱(MS)和在线样品预浓缩方法,能够检测到纳摩尔至亚纳摩尔级别的生物分子 | NA | 探讨和总结CE-MS在痕量生物分子分析中的应用,特别是单细胞分析 | 痕量生物分子,特别是单细胞中的代谢物、蛋白质、脂质等 | 分析化学 | NA | 毛细管电泳(CE)、纳米电喷雾电离质谱(MS) | NA | 生物分子 | 单细胞级别 | NA | NA | NA | NA |
| 5153 | 2024-09-02 |
PPIC-labeled CAFs: Key players in neoadjuvant chemotherapy resistance for gastric cancer
2024-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102080
PMID:39116799
|
研究论文 | 本文研究了胃癌中与新辅助化疗耐药性相关的癌症相关成纤维细胞(CAFs)的特定亚群,特别是PPIC标记的CAFs。 | 首次揭示了PPIC标记的CAF亚群在胃癌新辅助化疗耐药性中的关键作用,并探讨了其可能的信号通路机制。 | 需要进一步研究PPIC标记的CAF在胃癌药物耐药性中的确切机制。 | 探讨胃癌中新辅助化疗耐药性的机制,特别是与癌症相关成纤维细胞(CAFs)的关系。 | 胃癌患者的新辅助化疗耐药性和癌症相关成纤维细胞(CAFs)。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 109例耐药组和55例敏感组胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5154 | 2024-09-02 |
Navigating the Landscape of Intestinal Regeneration: A Spotlight on Quiescence Regulation and Fetal Reprogramming
2024-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23176
PMID:38267367
|
综述 | 本文综述了肠道再生过程中静息状态调节和胎儿重编程的关键作用 | 强调了静息干细胞和复苏干细胞在肠道再生中的重要性,并探讨了其潜在的临床应用 | NA | 探讨肠道再生过程中干细胞的调控机制及其临床应用潜力 | 肠道组织再生中的静息干细胞和复苏干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 类器官系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5155 | 2024-09-02 |
μ-Opioid receptor transcriptional variants in the murine forebrain and spinal cord
2024-Aug-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148890
PMID:39187136
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研究论文 | 本文通过长读RNA测序、空间和单细胞转录组学技术,全面研究了小鼠中枢神经系统中μ-阿片受体编码基因Oprm1的转录变体 | 发现了小鼠Oprm1基因的主要转录本具有一个长的3'非翻译区,这与人类OPRM1主要转录本同源,并编码相同的保守C端氨基酸序列 | NA | 探索Oprm1基因在小鼠中枢神经系统中的转录变体及其功能意义 | 小鼠的前脑和脊髓中的μ-阿片受体转录变体 | 分子生物学 | NA | 长读RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列 | 小鼠的丘脑、纹状体、皮质和脊髓组织 | NA | NA | NA | NA |
| 5156 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
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综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制,以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用,以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展,但耐药机制仍然是一个挑战,需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制,以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5157 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性,强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性,且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能,并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5158 | 2024-09-02 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals a Positive Correlation between Ferroptosis and Beta-Cell Dedifferentiation in Type 2 Diabetes
2024-Jul-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081687
PMID:39200152
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了铁死亡与2型糖尿病中β细胞去分化之间的潜在关联 | 首次揭示了铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化过程中的作用,并识别了关键的转录因子和长非编码RNA | 研究仅基于公共数据集,未进行体内实验验证所有发现 | 探究铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化中的作用 | 2型糖尿病患者的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5159 | 2024-09-01 |
Comprehensive analysis of single-cell transcriptomics and genetic factors reveals the mechanisms and preventive strategies for the progression from pulmonary fibrosis to lung cancer
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112803
PMID:39094357
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞转录组学和遗传因素,揭示了从肺纤维化到肺癌进展的机制和预防策略。 | 本文首次使用孟德尔随机化方法确定肺纤维化诱发的肺癌初期属于小细胞肺癌,并通过伪时间序列分析识别出具有致癌潜力的肺神经内分泌细胞。 | NA | 研究从肺纤维化到肺癌的进展机制及其预防策略。 | 肺纤维化细胞、肺神经内分泌细胞及其相互作用,以及肺纤维化微环境中纤维母细胞对免疫细胞的影响。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5160 | 2024-09-01 |
Alterations in intratumoral and peripheral immune status in recurrent gliomas and their prognostic implications for patients underwent reoperation
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112797
PMID:39083926
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研究论文 | 本文分析了复发性胶质瘤中肿瘤内和外周免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义 | 发现复发性胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的浸润增加,并且TAMs在复发性胶质瘤中表现出显著的表型异质性和代谢重编程 | NA | 研究复发性胶质瘤中免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义 | 复发性胶质瘤患者的肿瘤内和外周免疫状态 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学染色、血液学检查、批量和单细胞测序 | NA | 组织样本、血液样本、测序数据 | 使用自家的样本和公开来源的数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |