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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5121 - 5140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5121 | 2024-08-04 |
A Review of the Application of Spatial Transcriptomics in Neuroscience
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00603-4
PMID:38374297
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综述 | 这篇文章回顾了空间转录组学在神经科学中的应用 | 全面概述了空间转录组学在神经科学中的关键方法、数据资源和技术应用 | 缺乏对空间转录组学在神经科学中的深入研究 | 调查空间转录组学在神经科学中的应用和发展方向 | 空间转录组学数据分析方法及其在神经科学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 数据分析方法 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5122 | 2024-08-05 |
scEM: A New Ensemble Framework for Predicting Cell Type Composition Based on scRNA-Seq Data
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00601-y
PMID:38368575
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的集成框架scEM，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞类型组成 | 提出了一种新的集成细胞类型识别方法scEM，通过熵权法学习共识相似性矩阵，弥补了当前方法的不足 | 缺乏对不同数据集和性能指标的标准化比较分析 | 研究旨在填补细胞类型组成预测领域的分析空白 | 对20种先进的无监督细胞类型识别方法进行评估 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | 集成模型 | 真实scRNA-seq数据集 | 24个不同规模的真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5123 | 2024-08-05 |
Inference of Gene Regulatory Networks Based on Multi-view Hierarchical Hypergraphs
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00604-3
PMID:38342857
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研究论文 | 该文章提出了一种基于多视图层次超图的基因调控网络推断模型 | 引入了多视图层次超图，以整合多个异质生物信息，模型更好地捕捉多对多的复杂调节关系 | 尚未提及具体限制。 | 旨在改善基因调控网络的推断准确性 | 使用大肠杆菌和酿酒酵母的数据集进行实验验证 | 计算生物学 | NA | 超图卷积网络 | 层次超图模型 | 基因表达数据 | 对5个小鼠和2个人类细胞系的scRNA-seq数据集进行了分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5124 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell RNA-seq analysis using deep interpretable generative modeling guided by biological hierarchy knowledge
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae314
PMID:38960404
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研究论文 | 本文提出了一种深度可解释生成模型d-scIGM，用于单细胞数据分析。 | d-scIGM结合锯齿连接技术和残差网络，并引入生物领域的层次先验知识，增强了模型的可解释性。 | 之前基于生成模型的研究大多限于浅层神经网络，可能限制了模型的能力。 | 探讨细胞异质性并提高单细胞转录组数据分析的可解释性。 | 单细胞转录组数据及其生物学解释。 | 计算机视觉 | 黑色素瘤 | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 涉及多个大规模实验和黑色素瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5125 | 2024-08-05 |
High-Throughput Host-Microbe Single-Cell RNA Sequencing Reveals Ferroptosis-Associated Heterogeneity during Acinetobacter baumannii Infection
2024-04-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202400538
PMID:38419141
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研究论文 | 该文章首次报告了一种高通量交叉物种双单细胞RNA测序技术，以同时捕获真核和细菌RNA | 创新点在于开发了一种高通量的scRandom-seq技术，能够高效捕获宿主与微生物之间的复杂相互作用 | 限制未具体说明，但涉及高通量技术可能存在样本处理和解析上的挑战 | 研究宿主与微生物之间的相互作用及其在感染中的复杂性 | 研究对象为Acinetobacter baumannii感染模型中的宿主细胞及其与微生物的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | THP-1来源的巨噬细胞和细菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5126 | 2024-08-05 |
Dystrophin deficiency impairs cell junction formation during embryonic myogenesis
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569919
PMID:38106055
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研究论文 | 本研究探讨了肌营养不良症中缺少肌营养蛋白对骨骼肌发育的早期影响 | 首次揭示了肌营养蛋白缺失与细胞连接蛋白家族的显著失调有关 | 未提及特定的实验条件或样本的多样性 | 探讨肌营养蛋白缺失对骨骼肌发育的早期后果 | 人类多能干细胞的肌源性轨迹 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞转录组谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5127 | 2024-08-05 |
Uncovering the Cellular Microenvironment in Chronic Rhinosinusitis via Single-Cell RNA Sequencing: Application and Future Directions
2024-Apr, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-024-08992-6
PMID:38687404
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review | 这篇文章回顾了慢性鼻窦炎中单细胞RNA测序的最新进展 | 该文章提供了对慢性鼻窦炎的新见解，探讨了分子生物标志物、信号通路和免疫微环境的关系 | 关于慢性鼻窦炎的异质性及其治疗的具体应用缺乏深入的实验数据 | 探讨慢性鼻窦炎的细胞微环境以及改进诊断和治疗的可能途径 | 慢性鼻窦炎患者的细胞组成、功能与相互作用 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5128 | 2024-08-05 |
EML4-ALK fusions drive lung adeno-to-squamous transition through JAK-STAT activation
2024-Mar-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232028
PMID:38284990
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研究论文 | 本文揭示了EML4-ALK融合如何通过JAK-STAT激活驱动肺腺癌向鳞状细胞转变 | 研究发现ALK重排在LUAS中的存在以及EML4-ALK驱动的表型转变机理 | 未提及具体样本特征和研究范围的限制 | 探讨ALK重排肿瘤的表型转变及其药物耐药性机制 | 人类肺腺鳞癌（LUAS）和转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞和组织样本 | 5.1-7.5%的LUAS样本和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5129 | 2024-08-04 |
Short-chain fatty acids regulate erastin-induced cardiomyocyte ferroptosis and ferroptosis-related genes
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1409321
PMID:39070785
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研究论文 | 这项研究探讨了短链脂肪酸对心肌细胞铁死亡的影响以及ATF3的表达。 | 本研究首次揭示了短链脂肪酸在缺血刺激心肌细胞中对铁死亡途径的调节作用。 | 本研究未在临床环境中验证短链脂肪酸的效果。 | 探讨短链脂肪酸对心肌细胞铁死亡及其相关基因的影响。 | 主要研究对象为缺血刺激下的心肌细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序, RT-PCR, Western blot | 模仿缺血再灌注的细胞模型 | 单细胞RNA数据 | 从公共人类心肌梗死单细胞RNA-seq数据集中提取并重新聚类的心肌细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5130 | 2024-08-04 |
A systematic overview of single-cell transcriptomics databases, their use cases, and limitations
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1417428
PMID:39040140
|
综述 | 本文系统性地审查了大规模单细胞RNA测序数据库，分类并讨论了其用途及局限性 | 提出了单细胞RNA测序数据库的分类，并指出理解其局限性对有效利用数据的重要性 | 未具体提及具体案例或数据分析的细节 | 探讨单细胞转录组数据库的使用案例及面临的技术挑战 | 大规模的单细胞RNA-seq数据库 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5131 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human PBMCs in healthy and type 2 diabetes populations: dysregulated immune networks in type 2 diabetes unveiled through single-cell profiling
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1397661
PMID:39072276
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了2型糖尿病患者中免疫网络的失调 | 首次通过单细胞RNA测序特征化了2型糖尿病患者免疫细胞的性质和网络 | 缺乏对其他类型糖尿病和健康人群的比较分析 | 探讨与2型糖尿病相关的免疫细胞的特征 | 健康人和2型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 来自非糖尿病和2型糖尿病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5132 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk RNA sequencing reveals the heterogeneity of melanoma tumor microenvironment and predicts the response of immunotherapy
2024-Aug, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01905-5
PMID:38896289
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研究论文 | 本文综合分析了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性，并预测了免疫治疗的反应。 | 提出了一种新的预测生物标志物，揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性。 | 未提及特定的样本数量和多样性，可能影响结果的普遍适用性 | 研究黑色素瘤的肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗反应的预测能力。 | 分析了来自两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序及批量RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 分析了两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5133 | 2024-08-04 |
scDrug+: predicting drug-responses using single-cell transcriptomics and molecular structure
2024-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.117070
PMID:38964180
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研究论文 | 本文介绍了scDrug+，一个利用单细胞转录组和药物分子结构预测药物反应的综合管道 | scDrug+能够通过分析新药的分子结构来预测响应，这是一个新颖的研究方向 | 对新发现药物的反应预测研究仍然稀缺 | 研究如何基于单细胞转录组预测药物反应，以推动精准医学 | 研究对象为药物反应及其与转录组特征的关系 | 计算机视觉 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5134 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate
2024-Aug-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfae064
PMID:38730545
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研究论文 | 本文首次揭示了小鼠青春期接触环境污染物DEHP后睾丸的单细胞转录组特征 | 研究中首次使用单细胞RNA测序技术分析DEHP暴露对小鼠睾丸的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚需进一步验证结果在其他物种中的适用性 | 探索DEHP在青春期对小鼠睾丸发育的影响及其细胞机制 | 主要研究对象为幼鼠的睾丸及其相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每组8只3周龄的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 5135 | 2024-08-05 |
CD8+ T Cells Drive Plaque Smooth Muscle Cell Dedifferentiation in Experimental Atherosclerosis
2024-Aug, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320084
PMID:38868941
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研究论文 | 本研究探讨了CD8+ T细胞在既存动脉粥样硬化中对平滑肌细胞的影响 | 发现CD8+ T细胞能够调控平滑肌细胞的表型，促进其去分化并诱导表现出巨噬细胞样和成骨细胞样特征 | 研究未能检测到动脉粥样硬化病灶大小的差异 | 明确CD8+ T细胞在进展性动脉粥样硬化中的作用 | 研究对象为既有动脉粥样硬化病灶的低密度脂蛋白受体缺失小鼠及其平滑肌细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 既有动脉粥样硬化病灶的Ldlr-/-小鼠和初代主动脉平滑肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5136 | 2024-08-05 |
Heterogeneous fibroblasts contribute to fibrotic scar formation after spinal cord injury in mice and monkeys
2024-Jul-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50564-x
PMID:39060269
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研究论文 | 这篇文章揭示了脊髓损伤后纤维化瘢痕中成纤维细胞的异质性。 | 这项研究首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序展示了成纤维细胞在脊髓损伤后纤维化瘢痕中的分布、起源和功能差异。 | 该研究集中于小鼠和雌性猴子模型，可能在其他物种或人类中不具普遍性。 | 研究脊髓损伤后纤维化瘢痕形成过程中成纤维细胞的异质性。 | 研究对象为小鼠和雌性猴子模型中的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 小鼠和雌性猴子中多个成纤维细胞亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 5137 | 2024-08-05 |
PPAR-γ/NF-kB/AQP3 axis in M2 macrophage orchestrates lung adenocarcinoma progression by upregulating IL-6
2024-Jul-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06919-9
PMID:39060229
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研究论文 | 这项研究探讨了AQP3在肺腺癌中的作用及机制 | 本研究首次揭示了AQP3通过PPAR-γ/NF-κB轴在M2巨噬细胞极化中的重要作用 | 研究中仅涉及5名肺腺癌患者，样本量较小 | 探讨AQP3在肿瘤微环境中对肺腺癌进展的影响 | 研究对象为肺腺癌患者及相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 小鼠模型 | 生物样本 | 5名肺腺癌患者的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5138 | 2024-08-05 |
Preclinical efficacy of peanut-specific IgG4 antibody therapeutic IGNX001
2024-Jul-26, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.014
PMID:39069172
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研究论文 | 本文开发了一种具有说服力的花生特异性IgG4抗体治疗方法 | 利用来自过敏个体的人类IgE单克隆抗体的多样性开发了新的IgG4抗体治疗 | 目前研究仅在小鼠模型中进行，临床效果尚需进一步验证 | 研究一种能够迅速提供保护的花生过敏治疗方法 | 研究花生过敏个体的IgE单克隆抗体及其转化为IgG4抗体的效果 | NA | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 全血样本 | 来自多个不同人群的过敏个体的全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5139 | 2024-08-04 |
Open-ST: High-resolution spatial transcriptomics in 3D
2024-Jul-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.055
PMID:38917789
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研究论文 | 本文介绍了一种开放源代码的高分辨率3D空间转录组学方法Open-ST | Open-ST提供了一种易于使用、高分辨率、成本效益高且可扩展到3D的空间转录组学方法 | NA | 研究组织在2D和3D中的分子组织 | 小鼠大脑、头颈部肿瘤及患者匹配的健康/转移性淋巴结 | 数字病理学 | NA | 测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑和头颈部肿瘤样本，以及患者匹配的淋巴结 | NA | NA | NA | NA |
| 5140 | 2024-08-05 |
Cytotoxic Lymphocyte-Monocyte Complex Reflects the Dynamics of Coronavirus Disease 2019 Systemic Immune Response
2024-Jul-25, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae048
PMID:39052699
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研究论文 | 本研究揭示了在外周血中由CD14+单核细胞与不同的细胞毒性淋巴细胞形成的异质性细胞复合体。 | 该研究首次描述了SARS-CoV-2特异性免疫反应中细胞间相互作用的复杂性。 | 本文未讨论细胞相互作用的长期后果及其对其他疾病的影响。 | 探究新冠病毒感染中细胞免疫反应的动态变化。 | 重点研究CD14+单核细胞与SARS-CoV-2特异性细胞毒性淋巴细胞之间的相互作用。 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序和成像流式细胞术分析 | NA | 血液样本 | NA | NA | NA | NA | NA |