单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 5101 - 5120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5101 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
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研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 |
| 5102 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 |
| 5103 | 2024-08-05 |
Migration Inhibition Factor Secreted by Peripheral Blood Memory B Cells Binding to CD74-CD44 Receptor Complex Drives Macrophage Behavior in Alzheimer's Disease
2024 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175241238577
PMID:38491918
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研究论文 | 本研究探讨了外周血记忆B细胞分泌的迁移抑制因子如何影响阿尔茨海默病中的巨噬细胞行为 | 发现迁移抑制因子与巨噬细胞上的CD74-CD44受体复合物结合，影响巨噬细胞行为 | NA | 探究外周免疫系统在阿尔茨海默病中的作用，特别是记忆B细胞的影响 | 外周血记忆B细胞及其分泌的迁移抑制因子 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq，免疫荧光及流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 5104 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
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研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 |
| 5105 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
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研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 |
| 5106 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
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研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 |
| 5107 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5108 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
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研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5109 | 2024-08-04 |
TFvelo: gene regulation inspired RNA velocity estimation
2024-Feb-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45661-w
PMID:38360714
|
研究论文 | TFvelo 是一种扩展 RNA 速度概念的模型，通过引入基因调控信息来提高模型的准确性 | 提出了一种不依赖剪接信息的 RNA 速度估计方法，结合了基因调控信息 | 可能在某些数据集上表现不佳，具体限制未在文中详细说明 | 提高 RNA 速度估计的准确性，拓宽其在单细胞数据上的应用 | 基因动态和细胞伪时间的推断 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 合成数据和多组单细胞 RNA-seq 数据集 | 具体样本数量未在文中说明 |
| 5110 | 2024-08-04 |
Microbial consortium assembly and functional analysis via isotope labelling and single-cell manipulation of polycyclic aromatic hydrocarbon degraders
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae115
PMID:38913500
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研究论文 | 文章提出了一种构建功能性微生物 consortium 的创新方法 | 通过使用单细胞识别和分选技术，首次在原位构建了基于基因组指导的功能性微生物 consortium | 研究中可能未涵盖所有类型的污染物降解微生物 | 探索构建原位功能性微生物 consortium 的方法以提高多环芳香烃的生物降解能力 | 聚焦于降解 phenanthrene 的细菌，如 Achromobacter sp. 和 Pseudomonas sp. | 数字病理学 | NA | 拉曼激活细胞分选-稳定同位素探测 | NA | 基因组数据和细胞功能数据 | 涉及 phenanthrene 降解细菌的单细胞 |
| 5111 | 2024-08-05 |
A general pHLA-CD80 scaffold fusion protein to promote efficient antigen-specific T cell-based immunotherapy
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200827
PMID:39027379
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研究论文 | 本文介绍了一种通用的pHLA-CD80融合蛋白，以促进有效的抗原特异性T细胞免疫治疗 | 文中提出的APC-mimic融合蛋白有效模仿了抗原呈递细胞的自然抗原呈递模式，能够直接扩展T细胞 | 研究中未提及特定抗原呈递细胞的需求，可能在应用中存在局限 | 研究旨在提高抗原特异性T细胞的激活和扩展 | 研究对象为抗原特异性T细胞及其在小鼠模型中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞TCR测序（scTCR-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | OT-1小鼠模型 |
| 5112 | 2024-08-04 |
Abnormal metabolism in melanocytes participates in the activation of dendritic cell in halo nevus
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110300
PMID:38950722
|
研究论文 | 本研究分析了光晕痣中黑色素细胞的异常代谢及其对树突状细胞激活的影响 | 首次揭示了光晕痣中黑色素细胞衍生的UDP-G在树突状细胞激活中的重要作用 | 实验中的样本量和具体机制尚需进一步研究 | 深入了解光晕痣的进展及其免疫反应的机制 | 聚焦于光晕痣中黑色素细胞、树突状细胞和相关代谢产物 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 5113 | 2024-08-04 |
Tissue gene expression profiles and communication networks inform candidate blood biomarker identification in psoriasis and atopic dermatitis
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110283
PMID:38880200
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了银屑病和特应性皮炎患者的转录特征。 | 本研究首次通过空间转录组学结合体外预测探索了潜在的血液生物标志物，为其他炎症性疾病的研究提供了新方法。 | 研究可能存在样本规模限制，且对某些转录本的验证仅限于外周血T细胞。 | 本研究旨在识别银屑病和特应性皮炎的潜在生物标志物。 | 研究对象为银屑病和特应性皮炎患者的角质形成细胞和特定CD4/CD8 T淋巴细胞。 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5114 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analysis and machine learning developed diagnostic markers and prognostic model based on Efferocytosis-associated signatures for septic cardiomyopathy
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110301
PMID:38944364
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研究论文 | 这篇文章通过整合多组学分析，揭示了与凋亡细胞吞噬相关的关键基因及其在脓毒症心肌病中的作用 | 识别了一个新的与凋亡细胞吞噬相关的脓毒症心肌病亚型及诊断生物标志物 | NA | 探讨凋亡细胞吞噬在脓毒症心肌病中的临床和遗传作用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症心肌病 | scRNA-seq | NA | 基因数据 | 感染脓毒症患者的外周血单核细胞 |
| 5115 | 2024-08-05 |
Perimenopausal and Menopausal Mammary Glands In A 4-Vinylcyclohexene Diepoxide Mouse Model
2024-Jul-17, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-024-09569-x
PMID:39017946
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研究论文 | 该论文描述了一种新的小鼠模型，能够表征围绝经期和绝经期乳腺腺体。 | 创新点在于开发了4-乙烯基环己烯二醇小鼠模型，该模型能够精准模拟女性的围绝经期和绝经期状态。 | 该研究未明确提及对模型的其他潜在限制。 | 研究围绝经期和绝经期对乳腺癌的影响。 | 对4-乙烯基环己烯二醇处理的小鼠乳腺进行表征与分析。 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | VCD小鼠模型 | 生物样本 | 实验中使用了处理的小鼠，但具体样本数量未提及 |
| 5116 | 2024-08-05 |
The thalamic reticular nucleus orchestrates social memory
2024-Jul-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.04.013
PMID:38701789
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研究论文 | 本文研究了感觉丘脑网状核中介导社会记忆的parvalbumin阳性神经元 | 揭示了sTRN神经元通过调节新的皮层-丘脑回路协调社会记忆的机制 | 研究中可能未涵盖所有影响社会记忆的神经元类型或回路 | 探讨sTRN神经元在社会记忆中的作用 | 老鼠的parvalbumin阳性神经元及其在社会记忆中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 5117 | 2024-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals cellular and molecular insights into primary Sjögren's syndrome
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33433
PMID:39027515
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研究论文 | 本研究综合分析了基因组、转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，以揭示原发性舍格伦综合征的分子基础 | 通过整合多组学数据，发现CTSS和GSTO1是潜在的生物标志物和治疗靶点 | 需要进一步研究以阐明潜在机制并开发针对这种复杂自身免疫疾病的靶向疗法 | 研究原发性舍格伦综合征的分子基础及探索潜在的治疗靶点 | 研究原发性舍格伦综合征患者的不同血细胞类型的差异表达基因 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 5118 | 2024-08-04 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-Jul, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 该研究探讨了HEC1在胶质瘤中的功能及其对预后的影响 | 首次揭示了HEC1的过表达与胶质瘤预后不良和肿瘤微环境中的免疫抑制相关 | 研究主要集中在细胞实验和RNA-seq分析，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HEC1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤及其细胞系 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 人类胶质瘤组织和细胞系 |
| 5119 | 2024-08-04 |
Opening the Black Box: Spatial Transcriptomics and the Relevance of Artificial Intelligence-Detected Prognostic Regions in High-Grade Serous Carcinoma
2024-Jul, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100508
PMID:38704029
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研究论文 | 本研究探讨了空间转录组学与人工智能识别的与预后相关区域在高等级浆液性癌中的相关性 | 该研究展示了AI引导的空间转录组分析改善了与患者预后相关的生物特征的识别 | 对肿瘤的异质性理解有限，且样本量相对较小 | 提高对高等级浆液性癌患者预后相关生物特征的理解 | 研究对象为16名接受初次减瘤手术和铂类化疗的高等级浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织样本 | 16名患者，分别为8名短期和长期化疗反应组 |
| 5120 | 2024-08-05 |
Integrative profiling of untreated primary membranous nephropathy at the single-cell transcriptome level
2024-Jul, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfae168
PMID:39027416
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研究论文 | 本研究在单细胞转录组水平上综合剖析了未治疗的原发性膜性肾病 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析原发性膜性肾病患者的血液、肾脏和尿液样本，揭示了细胞成分和细胞间通信的变化 | 样本数量较少，仅包含五名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨原发性膜性肾病的发病机制与潜在的干预策略 | 五名经活检证实的原发性膜性肾病患者 | 数字病理学 | 原发性膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液、肾脏和尿液样本 | 五名患者的血液、肾脏和尿液样本 |