单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 5081 - 5100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5081 | 2024-08-05 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
|
研究论文 | 本文研究了嗜碱性粒细胞在小鼠机械损伤后皮肤屏障功能恢复中的保护作用 | 揭示了嗜碱性粒细胞通过下调Il17a表达来对抗IL-17A对皮肤屏障功能恢复的不良影响 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类尚不清楚 | 探索机械损伤后皮肤屏障功能恢复的机制 | 小鼠的皮肤屏障功能和细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 5082 | 2024-08-04 |
CAbiNet: joint clustering and visualization of cells and genes for single-cell transcriptomics
2024-Jul-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae480
PMID:38850160
|
研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学数据的聚类和可视化的新方法 | 提出了基于网络的对应分析双聚类方法CAbiNet，该方法高效地进行细胞及其标记基因的共同聚类和可视化 | 文章未提及具体的限制 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的聚类和可视化效果 | 研究对象是单细胞RNA测序数据中的细胞及其标记基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | NA |
| 5083 | 2024-08-05 |
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573939
PMID:38260306
|
研究论文 | 本研究介绍了具有反向生物极性的人的气道类器官，推动药物开发标准化。 | 提出了一种新型的气道类器官，能够高通量分析与病毒感染的相关性，具有重要临床意义。 | 本研究主要集中在SARS-CoV-2的研究上，可能限制了其在其他病毒研究中的应用。 | 探讨高通量气道类器官在抗病毒药物筛选中的应用。 | 研究对象为与SARS-CoV-2相关的人气道类器官。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 约100个细胞 |
| 5084 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing, spatial transcriptome ad periodontitis: Rethink pathogenesis and classification
2024-07, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14761
PMID:37794757
|
综述 | 本综述阐明了单细胞RNA测序和空间转录组学在牙周炎中的应用 | 探讨了细胞群体和基因特征与牙周炎病因的相关性，带来了新的诊断思路 | 目前尚未确定与牙周炎相关的具体细胞或基因特征 | 研究单细胞测序和空间转录组学在牙周炎病理学和分类中的应用 | 人类的牙周炎相关研究 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 (ST) | NA | 文献 | 22篇涉及人类的研究论文 |
| 5085 | 2024-08-05 |
CTCF mutation at R567 causes developmental disorders via 3D genome rearrangement and abnormal neurodevelopment
2024-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49684-1
PMID:38951485
|
研究论文 | 本文探讨了CTCF R567W突变对发育紊乱的影响及其机制 | 研究首次揭示了CTCF突变如何通过3D基因组重构影响神经发育 | 仅探索了特定突变的影响，缺乏对其他CTCF突变的广泛分析 | 阐明CTCF突变对人类神经发育障碍的影响及其潜在机制 | 小鼠模型和人类胚胎干细胞衍生的皮层类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠及其胚胎干细胞衍生的皮层类器官 |
| 5086 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
|
研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85（NUP85）在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性，并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌（HCC）样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% |
| 5087 | 2024-08-05 |
Cell type evolution reconstruction across species through cell phylogenies of single-cell RNA sequencing data
2024-Feb, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02281-9
PMID:38182680
|
研究论文 | 该论文探讨了细胞类型的起源和进化，利用单细胞RNA测序数据重建细胞谱系 | 首次通过显式的谱系学方法应用于单细胞数据，使用主成分作为谱系特征以构建细胞谱系 | 谱系构建依赖于现有的数据，可能受限于样本的多样性和数量 | 研究细胞类型的进化及其在不同物种之间的比较 | 来自五种远缘相关哺乳动物的眼细胞的比较单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 五种哺乳动物的眼细胞数据集 |
| 5088 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 |
| 5089 | 2024-08-05 |
LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110290
PMID:38944365
|
研究论文 | 该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例 | 首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果 | 仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证 | 探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案 | 一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者 | 数字病理学 | 青少年关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和血清细胞因子水平 | 1名患者和9名对照患者 |
| 5090 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
|
研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 |
| 5091 | 2024-08-05 |
Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation
2024-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248
PMID:38871242
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络 | 创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性 | 研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性 | 旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系 | 研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠骨髓细胞样本 |
| 5092 | 2024-08-05 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-Aug, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
|
研究论文 | 本文构建了一种新的5-FU耐药相关预后标志物，以预测结直肠癌患者的化疗和免疫治疗效果 | 建立并验证了5-FU耐药相关标志物5-FRSig模型，并与多个临床特征及治疗效果相关联 | 未提及具体的样本数量和相关数据的全面性 | 构建5-FU耐药相关标志物以预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，定量实时聚合酶链反应（RT-qPCR） | 统计回归模型 | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列 |
| 5093 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 5094 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |
| 5095 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
|
综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 5096 | 2024-08-04 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
|
综述 | 本文汇编了19种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法 | 提供了一种全面的参考，帮助研究人员选择适合其特定研究目的的整合方法 | 每种方法有其自身的优缺点和适用范围，研究者需要根据实际情况进行选择 | 旨在帮助研究人员了解和选择适合的整合方法以分析scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组测序数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA测序数据 | 19种整合方法 |
| 5097 | 2024-08-04 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法以提高细胞类型识别 | 提出了一种新的高斯噪声增强的对比学习方法(GsRCL)，用于细胞类型识别任务 | 未提及具体的局限性 | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别准确性 | 面向具有挑战性的细胞类型识别任务 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 大规模计算评估 |
| 5098 | 2024-08-05 |
Single-cell immune landscape of measurable residual disease in acute myeloid leukemia
2024-Jul-19, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2666-8
PMID:39034351
|
研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病中可测残留疾病的单细胞免疫景观 | 该论文利用单细胞RNA测序技术，创建了一个包含184,231个细胞的全面免疫景观，并发现MRD阳性和阴性CD8 T细胞在细胞毒性基因表达上的差异 | 本研究样本量较小，仅包含32名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 研究可测残留疾病在急性髓性白血病中的免疫细胞特征及其转化机制 | 源自20名MRD阳性患者和12名MRD阴性患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 32个样本（20个MRD阳性患者和12个MRD阴性患者） |
| 5099 | 2024-08-05 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
|
研究论文 | 本研究整合多组学数据分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 通过整合eQTL、GWAS和单细胞转录组数据，确定了与1型糖尿病相关的四个潜在致病基因 | 未提及具体的局限性 | 探讨CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的作用 | 分析1型糖尿病患者与健康对照的胰腺组织中的基因表达 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含1型糖尿病患者和健康对照的胰腺组织样本 |
| 5100 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 |