本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5081 | 2024-08-04 |
Landscape of Epstein-Barr virus gene expression and perturbations in cancer
2024-Feb-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3911441/v1
PMID:38352479
|
研究论文 | 该文章研究了EB病毒在癌症中的基因表达及其扰动 | 首次识别出RPMS1非编码RNA通过干扰素反应的破坏支持癌细胞特性 | 研究中未详细探讨癌细胞和健康细胞的具体环境交互 | 探索EB病毒在癌症中的基因表达及其对癌细胞特性的影响 | 研究与EB病毒相关的肿瘤及其细胞特性 | 数字病理学 | NA | 长读长单分子测序 | NA | 转录组数据 | 通过单细胞测序分离了来自同一组织活检的癌细胞和健康细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5082 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 | NA | NA | NA | NA |
| 5083 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
|
研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来,揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠,数量未具体提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5084 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
|
研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用,提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 | NA | NA | NA | NA |
| 5085 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
|
研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加,并与PD-L1呈负相关,以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5086 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200
PMID:38989284
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因 | 本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式,并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色 | 研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达,未深入分析其他可能影响结果的因素 | 本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征 | 研究对象是高等级(胶质母细胞瘤,WHO IV级)和低等级(少突胶质瘤,WHO II级)胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个胶质瘤细胞类型的样本,具体样本量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 5087 | 2024-08-05 |
Reparative effects after low-dose radiation exposure: Inhibition of atherosclerosis by reducing NETs release
2024-Oct-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.174540
PMID:38977089
|
研究论文 | 该研究探讨了低剂量辐射如何通过减少 NETs 释放来抑制动脉粥样硬化。 | 首次探讨了低剂量辐射对心血管系统的影响及其抑制动脉粥样硬化的机制。 | 研究中未涉及不同剂量辐射的长期影响及其在临床中的应用。 | 研究低剂量辐射对动脉粥样硬化的影响机制。 | 研究对象为接受低剂量辐射和高脂饮食的动物模型。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定法(ELISA) | NA | 组学数据 | 高脂饮食下的动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5088 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular landscape of primary dermatofibrosarcoma protuberans: Insights from single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15121
PMID:39081004
|
研究论文 | 这项研究利用单细胞 RNA 测序分析了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征。 | 研究揭示了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞异质性及其分子机制,并建议了潜在的治疗靶点。 | 研究可能受到样本数量和特定细胞类型的限制。 | 研究疾病皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征,以了解其生物学行为。 | 主要研究皮肤纤维肉瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5089 | 2024-08-05 |
MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification
2024-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00875-6
PMID:37532927
|
研究论文 | 本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹(Crebzf)来影响卵母细胞衰老 | 提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力,并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制 | 本文未提及具体的样本量和长期影响的研究 | 研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用 | 聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制 | NA | 女性不孕 | 高通量测序和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5090 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法,能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释,尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5091 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
|
研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达,并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用,并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5092 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
|
研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能,以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8,并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线,未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 5093 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
|
研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达,并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5094 | 2024-08-05 |
Revealing Genetic Dynamics: scRNA-seq Unravels Modifications in Human PDL Cells across In Vivo and In Vitro Environments
2024-Apr-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094731
PMID:38731950
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析人类牙周韧带(PDL)细胞在体内和体外环境中的遗传变化 | 首次通过scRNA-seq揭示了PDL中不同细胞亚群的独特基因特征及其对培养条件的反应 | 未详细探讨不同捐献者之间的PDL细胞差异及其生物学影响 | 旨在填补对PDL病理生理学的理解空白 | 主要人类PDL样本,涉及7个捐献者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 7个主要人类PDL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5095 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507LE
PMID:37934672
|
研究论文 | 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 | 样本量相对较小,且仅限于特定患者群体 | 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 | 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 肺部组织样本 | 40名患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5096 | 2024-08-05 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
|
研究论文 | 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 | 通过综合差异表达基因和生存分析,提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 | NA | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 | 15种癌症的差异表达基因 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15种癌症类型的临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5097 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 | 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型,能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 | 未提及具体局限性 | 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 | 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学、机器学习算法 | 预测模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5098 | 2024-08-04 |
Dissecting prostate Cancer: Single-Cell insight into Macrophage Diversity, molecular Prognosticators, and the role of Peptidylprolyl Isomerase F
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112599
PMID:38959543
|
研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中的单细胞转录组学,确定了巨噬细胞的异质性及其预后基因标记。 | 揭示了前列腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性和功能特化,并识别了与预后相关的基因,特别是PPIF的作用。 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据,可能存在选择偏倚或数据完整性的问题。 | 研究前列腺癌中的肿瘤微环境及其与巨噬细胞的相互作用,识别潜在的预后基因。 | 前列腺癌的单细胞转录组学数据以及与巨噬细胞相关的基因。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 分析了9,178个细胞,归类为10种主要细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 5099 | 2024-08-04 |
CYP24A1 affected macrophage polarization through degradation of vitamin D as a candidate biomarker for ovarian cancer prognosis
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112575
PMID:38963981
|
研究论文 | 本研究探讨了CYP24A1如何通过维生素D降解影响巨噬细胞极化,并作为卵巢癌预后候选生物标志物。 | 发现CYP24A1通过调节巨噬细胞极化与维生素D的相互作用,促进卵巢癌的恶性进展。 | 研究在体外构建了异种移植模型,但缺乏临床样本验证。 | 旨在筛选与卵巢癌预后相关的线粒体相关基因。 | 主要研究CYP24A1在卵巢癌细胞中的表达及其功能。 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA卵巢癌数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5100 | 2024-08-05 |
The complex association between the immune system and the skeletal system in osteoporosis: A study of single-cell RNA sequencing
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112611
PMID:38976947
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫系统与骨骼系统在骨质疏松症中的复杂关系 | 揭示了特定细胞亚群及其细胞间相互作用在骨质疏松症发病机制中的关键角色 | 缺乏对临床样本的广泛验证以增强研究结果的适用性 | 探索免疫系统与骨骼系统之间的生态联系以寻找临床预防和治疗的新策略 | 以人类腰椎层组织为研究对象,进行了单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类腰椎层组织的质量控制单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |