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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5081 | 2024-08-04 |
Multiomics profiling of buffy coat and plasma unveils etiology-specific signatures in hepatocellular carcinoma
2024-Jul, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0042
PMID:38486508
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肝细胞癌中致病因素特异性的血液生物标志物。 | 研究提出了根据病毒感染综合分析得出的致病因素特异性基因表达模式,发现了与肝细胞癌相关的新的血液生物标志物。 | 结果需进一步验证,特别是在不同人群和多种致病因素下的普适性和准确性。 | 探索肝细胞癌中特定病因的血液生物标志物,以提高早期检测能力。 | 肝细胞癌患者的buff coat和血浆样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | 全转录组测序(WTS)和靶向蛋白组学分析 | NA | 基因表达数据 | 来源于HCC患者的样本及多个独立数据集的DEGs验证 | NA | NA | NA | NA |
| 5082 | 2024-08-05 |
Enhancer demethylation-regulated gene score identified molecular subtypes, inspiring immunotherapy or CDK4/6 inhibitor therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105177
PMID:38924839
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研究论文 | 本研究识别了食管鳞状细胞癌的分子亚型,以指导免疫疗法或CDK4/6抑制剂治疗。 | 提出了一种增强子去甲基化调控基因评分模型(EDRGS),能够有效分类食管鳞状细胞癌的亚型,并预测不同肿瘤的治疗反应。 | 本研究的样本规模在不同癌症类型中有所不同,可能影响结果的推广性。 | 旨在识别肿瘤亚型分类的特征,从而实现精准的临床治疗。 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者及多个癌症类型的相关数据。 | 数字病理学 | 食管癌 | 多组学数据分析 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 310个食管鳞状细胞癌样本,60个单细胞RNA序列样本,其他癌症类型的数据包括42个、181个和348个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5083 | 2024-08-04 |
Pharmacological Improvement of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Function Rescues Airway Epithelial Homeostasis and Host Defense in Children with Cystic Fibrosis
2024-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202310-1836OC
PMID:38259174
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研究论文 | 该研究探讨了药理改善囊性纤维化转膜导管调节因子(CFTR)功能对儿童囊性纤维化患者上呼吸道上皮稳态和宿主防御的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮和免疫细胞转录组的影响 | 仅在小样本的儿童群体中进行观察,结果可能无法推广到更广泛的人群 | 研究ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮细胞和免疫细胞的机制 | 儿童囊性纤维化患者的鼻拭子样本 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13名囊性纤维化儿童和12名健康儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 5084 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications
2024-May-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02003-0
PMID:38702773
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺腺癌肝转移的亚型特异性克隆演化和微环境变化及其临床意义 | 揭示了基底样亚型细胞在化疗反应和患者结局中的关键作用以及PDAC的克隆演变与癌症相关基因的剂量变化之间的关系 | 研究仍需进一步探讨不同细胞亚型与TME的具体相互作用 | 了解胰腺导管腺癌的肿瘤演变和其临床关联 | 治疗前的原发性胰腺导管腺癌样本及其配对肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 治疗前的原发性PDAC样本和配对的肝转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5085 | 2024-08-04 |
The mucosal concept in chronic rhinosinusitis: Focus on the epithelial barrier
2024-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.01.015
PMID:38295881
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综述 | 该文献主要探讨了慢性鼻窦炎中上皮屏障的关键作用 | 文章强调了新技术(如单细胞转录组学)揭示的上皮屏障的新功能,如炎症记忆和神经内分泌功能 | 未提供具体的实验数据或样本数量,以支持提出的观点 | 旨在深入理解慢性鼻窦炎中的上皮细胞在粘膜框架中的作用 | 针对慢性鼻窦炎中上皮细胞的相关研究 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5086 | 2024-08-05 |
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-May, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02218-6
PMID:38467768
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3在造血干细胞中的保护作用,防止有害自分泌式I型干扰素反应的激活 | 揭示了STAT3如何通过抑制有害的自分泌型I型干扰素反应来维持造血干细胞功能的全新机制 | 由于在骨髓嵌合小鼠中进行的研究,可能存在系统性炎症未完全消除的潜在影响 | 研究STAT3在造血干细胞功能中的作用及其潜在的治疗应用 | STAT3缺失的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 20%的造血腔室中的混合骨髓嵌合小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 5087 | 2024-08-04 |
Bento: a toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
2024-04-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03217-7
PMID:38566187
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研究论文 | Bento是一个用于亚细胞空间转录组数据分析的Python工具包 | Bento利用单分子信息实现亚细胞尺度的空间分析,填补了现有方法在多细胞尺度的局限 | 目前尚未提到Bento在极端实验条件或特定细胞类型下的表现 | 开发一个用于亚细胞尺度空间分析的工具包 | 分子坐标和分割边界的数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 空间转录组数据 | 演示了MERFISH、seqFISH+、分子地图绘制和Xenium数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5088 | 2024-08-04 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-Mar, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
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研究论文 | 本文探讨了SIRT6在减轻博来霉素诱导的肺纤维化中的作用 | 首次揭示了SIRT6通过激活脂质分解代谢来改善肺纤维化 | 对SIRT6在肺纤维化机制中的具体作用尚需进一步研究 | 研究SIRT6在肺纤维化中的保护机制 | 人类肺组织中的SIRT6及其对小鼠的影响 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 高通量测序 | NA | 数据 | 小鼠模型及单细胞测序数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 5089 | 2024-08-04 |
Cell-type deconvolution of bulk-blood RNA-seq reveals biological insights into neuropsychiatric disorders
2024-02-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2023.12.018
PMID:38306997
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研究论文 | 本研究通过对大规模血液RNA测序数据进行细胞类型解卷积,提供了精神疾病的生物学见解 | 本研究使用计算推断细胞类型比重和基因表达,发现了多个未通过常规分析得出的与精神疾病相关的基因 | 该研究的细胞类型特定信号可能仍会受到某些因素的影响,且未使用单细胞测序 | 探讨基因变异与精神疾病风险之间的因果机制 | 来自1730例患有双相情感障碍和精神分裂症个体的全血样本 | 数字病理学 | 精神疾病 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 1730个全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5090 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals distinct cell populations in dorsal root ganglia and their potential roles in diabetic peripheral neuropathy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306424
PMID:39083491
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示了背根神经节中不同细胞群体及其在糖尿病周围神经病中的潜在作用 | 首次系统性地分析了背根神经节的细胞组成及其在糖尿病周围神经病中的作用 | 缺乏对背根神经节在糖尿病周围神经病发病机制的深入探索 | 深入了解背根神经节的细胞类型组成及其在糖尿病周围神经病中的角色 | 健康对照组及糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自健康对照组和糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 | NA | NA | NA | NA |
| 5091 | 2024-08-05 |
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398990
PMID:39086489
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研究论文 | 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 | 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 | 心肌梗死(MI)和骨关节炎(OA)患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 心肌梗死与骨关节炎 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 无特定模型类型 | 基因表达数据 | 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本,具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5092 | 2024-08-05 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 这篇文章探讨了HIF2A在肺癌脑转移中促进癌症相关成纤维细胞的谱系转变及其侵袭性表型的机制 | 本研究揭示了肺癌脑转移中HIF-2α诱导的CAF谱系转变及其功能改变的新机制 | 本研究的局限性在于数据主要来源于单细胞RNA测序,可能无法全面反映所有CAF的复杂性 | 本研究的目的是探讨肺癌脑转移中的肿瘤微环境变化及CAF的作用 | 研究对象为不同转移阶段的肺癌患者的CAF及其在脑转移中的表现 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 大规模RNA测序, 多重免疫组化 | NA | RNA数据 | 包括四对脑转移和原发肺癌样本的配对样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5093 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424933
PMID:39086485
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研究论文 | 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 | 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 | 论文未提及具体的样本数量及其来源,限制了结果的普遍性 | 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 | t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞浸润数据 | 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5094 | 2024-08-05 |
Unveiling major histocompatibility complex-mediated pan-cancer immune features by integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217062
PMID:38878852
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大规模RNA测序揭示了主要组织相容性复合体介导的全癌症免疫特征 | 开发了MHC转录特征(MHC.sig),并展示其作为普遍性的全癌症抗肿瘤免疫标记的潜力 | 未提及潜在的局限性 | 全面探索主要组织相容性复合体在癌症免疫疗法中的作用 | 分析了663,760个细胞的单细胞RNA测序数据以及30种实体肿瘤类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,Bulk RNA-seq,空间转录组分析 | NA | RNA测序数据 | 663,760个细胞和30种实体肿瘤类型 | NA | NA | NA | NA |
| 5095 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis" [Cancer Lett. (2023 May 1) 561 216149]
2024-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217071
PMID:38971695
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5096 | 2024-08-04 |
Blockade of Discoidin Domain Receptor Signaling with Sitravatinib Reveals DDR2 as a Mediator of Neuroblastoma Pathogenesis and Metastasis
2024-Aug-01, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0741
PMID:38670553
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研究论文 | 本研究揭示了DDR2作为神经母细胞瘤发病机制和转移的介导者。 | 此文首次定义了DDR2在神经母细胞瘤中的新功能,以及sitravatinib作为其治疗剂的潜力。 | 研究仅在特定的肿瘤模型中进行,可能无法全面反映在临床中的效果。 | 研究sitravatinib对神经母细胞瘤的影响及其作用机制。 | 主要研究对象为神经母细胞瘤及其相关的受体酪氨酸激酶。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | NA | 肿瘤模型 | 单细胞测序数据 | 使用了不同的肿瘤相关模型,包括转基因小鼠和人类异种移植 | NA | NA | NA | NA |
| 5097 | 2024-08-04 |
Spatial enrichment and genomic analyses reveal the link of NOMO1 with amyotrophic lateral sclerosis
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae123
PMID:38643019
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研究论文 | 本研究揭示了NOMO1与运动神经元疾病(ALS)之间的关联 | 使用Entropy加权的差异基因表达矩阵工具SpatialE,首次在运动皮层中识别ALS相关基因的空间富集 | 本研究主要依赖于有限的样本量及特定脑区的分析,未能全面涵盖所有与ALS相关的区域 | 旨在研究运动皮层中ALS相关基因的空间分布和与ALS风险的关系 | 本研究分析了6814名ALS患者和3324名对照的基因组数据 | 数字病理学 | 运动神经元疾病 | 全基因组测序和空间转录组学 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 6814名ALS患者和3324名对照 | NA | NA | NA | NA |
| 5098 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analyses Reveal the Metabolic Heterogeneity and Plasticity of the Tumor Microenvironment during Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Progression
2024-Aug-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1344
PMID:38718319
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研究论文 | 本研究揭示了头颈部鳞状细胞癌进展过程中肿瘤微环境的代谢异质性和可塑性 | 确定了SPP1+巨噬细胞作为一种具有高果糖和甘露糖代谢的致瘤和促转移的巨噬细胞亚型 | 没有提供数据样本的长期随访信息 | 定义头颈部鳞状细胞癌发展过程中的肿瘤微环境代谢景观 | 对26个人类患者样本进行单细胞RNA测序 | 数字病理 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 26个样本,包含正常组织、癌前病变、早期癌症、晚期癌症、淋巴结转移和复发肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 5099 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling of sarcomas from archival tissue reveals programs associated with resistance to immune checkpoint blockade
2024-Jul-31, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2976
PMID:39083415
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研究论文 | 该文章探讨了如何从存档组织中进行肉瘤的单细胞分析,并揭示了与免疫检查点抑制剂抵抗相关的程序 | 提出了一种从冷冻组织中生成多模态单细胞基因组学和全基因组测序数据的新方法 | 由于肉瘤的结构复杂,使用尖端的分子分析方法生成高质量数据存在挑战 | 研究肉瘤的治疗机制及其对免疫检查点抑制剂的抵抗性 | 分析了来自两名接受免疫检查点抑制剂治疗患者的五个未分化多形性肉瘤和三个内膜肉瘤样本的细胞转录组 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 75,716个细胞转录组,来自五个UPS和三个INS样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5100 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis revealed that MTIF2 could promote hepatocellular carcinoma progression through modulating the ROS pathway
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34438
PMID:39082024
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研究论文 | 本研究分析了线粒体翻译起始因子2 (MTIF2) 在肝细胞癌 (HCC) 中的表达及其生物功能。 | 研究首次确认MTIF2通过调节反应性氧种 (ROS) 通路促进肝细胞癌的进展,并揭示了MTIF2与SOD2的相互作用。 | 研究可能缺乏临床试验验证和长期随访的数据。 | 探讨MTIF2在HCC中的表达及其在癌症发展的作用。 | 研究对象为HCC组织中MTIF2的表达及其在不同细胞类型中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | HCC组织和其旁癌组织中的10种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |