单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
481 2024-12-14
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,尽管存在不同的免疫环境,但发现了保守的B细胞动态 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并发现尽管存在不同的免疫环境,B细胞动态在肠道位置间是保守的 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches,未涉及其他物种或其他肠道区域 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并研究其在不同肠道位置的保守性 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 免疫学 NA 单细胞和空间转录组学 NA 转录组数据 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞
482 2024-12-14
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research IF:28.1Q1
研究论文 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass,用于解析普遍的基因调控机制 GeneCompass通过整合四种先验生物学知识,在自监督学习中增强了基因调控机制的理解,并在多个下游任务中超越了现有模型 NA 解析跨物种的普遍基因调控机制,推动基础生命过程研究和临床应用 人类和小鼠的单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞测序 基础模型 转录组数据 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据
483 2024-12-14
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
研究论文 本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用 首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用,以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响 研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系,可能无法完全代表所有骨骼肌的情况 探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制 卫星细胞(SCs)及其在骨骼肌生长和再生中的作用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq)、免疫染色、EdU掺入实验 NA RNA 新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液(KO和对照组)、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞
484 2024-12-14
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research IF:5.7Q1
综述 本文综述了空间转录组学(ST)在口腔病理学中的应用,展示了其在不同颅面区域疾病发展中的研究进展 空间转录组学结合了全局基因表达和空间信息的分析,提供了传统转录组学方法所缺乏的空间分辨率,能够更好地研究疾病和健康组织状态中细胞区域的复杂相互关系 本文主要为综述性质,未提供具体的研究数据或实验结果 探讨空间转录组学在颅面区域疾病发展中的应用,并展示其在不同组织中的研究进展 颅面区域的组织,包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口腔底、口咽和牙周组织 数字病理学 NA 空间转录组学(ST) NA 基因表达数据 NA
485 2024-12-14
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了晶状体诱导性近视和电针干预下的视网膜细胞图谱,并探讨了电针改善实验性近视进展的潜在机制 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了电针通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的机制 研究仅在豚鼠模型上进行,结果的普适性有待进一步验证 探讨电针干预对实验性近视进展的影响及其潜在机制 晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞 NA 近视 单细胞RNA测序 NA RNA 晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞
486 2024-12-14
Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究探讨了机械负荷不足对软骨细胞中Piezo1表达的影响及其在骨折愈合中的作用 首次揭示了Piezo1在软骨细胞中的表达下调通过ApoE诱导的衰老影响骨折愈合的机制,并开发了一种可注射的热敏水凝胶来缓解这一问题 研究主要集中在体外实验和动物模型上,尚未在人体中验证其有效性 探讨机械负荷不足如何通过Piezo1和ApoE影响骨折愈合 软骨细胞、骨折愈合过程 NA 骨折 单细胞测序 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
487 2024-12-14
Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了典型金属量子点(InP/ZnS QDs)对斑马鱼视网膜的影响及其机制 首次揭示了InP/ZnS QDs通过抑制剪接体导致视网膜色素上皮细胞中的铁死亡和线粒体自噬,从而引起视网膜退化 研究仅在斑马鱼模型中进行,可能无法完全反映人类视网膜的反应 阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其机制 斑马鱼视网膜及视网膜色素上皮细胞 NA NA 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9系统 NA RNA 斑马鱼样本
488 2024-12-14
Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究探讨了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制 首次揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性 研究主要基于细胞和动物实验,临床证据有限 探讨周细胞如何影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性 EGFR突变肺癌细胞和周细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,多重免疫染色 NA RNA,蛋白质 来自EGFR突变患者的周细胞和肺癌细胞
489 2024-12-14
Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究探讨了HERC2在药物诱导的肝损伤中的保护作用,通过脂质纳米颗粒递送HERC2质粒,调控CYP2E1表达,减轻肝损伤 首次揭示了HERC2在药物代谢紊乱相关的急性肝损伤中的保护作用,并展示了脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探讨HERC2在药物诱导肝损伤中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 HERC2在肝细胞中的表达及其对CYP2E1调控的影响 NA 肝损伤 单细胞RNA测序 NA RNA APAP挑战的小鼠模型
490 2024-12-14
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences
研究论文 研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱 首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式,并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异 Glra4的表达水平过低,无法通过qRT-PCR检测到 探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异 甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达 NA NA 单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope NA mRNA表达数据 成年雌性和雄性小鼠
491 2024-12-14
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-Dec, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 研究探讨了年龄相关的ECM硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞的分化 首次揭示了年龄相关的ECM硬化通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化的分子机制,并使用BAPN抑制剂验证了这一机制 研究主要集中在体外实验和动物模型,尚未在人体中验证 研究年龄相关的ECM硬化对肌肉干细胞分化的影响及其分子机制 年轻和年老的肌肉干细胞在软和硬ECM微环境下的分化过程 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 年轻和年老的肌肉干细胞在四种不同条件下的样本
492 2024-12-14
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境,并识别了潜在的分子治疗靶点 样本量较小,仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境,为开发新型疗法提供分子靶点 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 数字病理学 心脏肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本
493 2024-12-14
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT)的数据,探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 引入了一种基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法,并通过混合遗传算法(HGA)进行参数估计 NA 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子(VEGF)以及免疫细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 混合遗传算法(HGA) 单细胞RNA测序数据 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT)
494 2024-12-14
Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research
2024-Nov-25, Plant cell reports IF:5.3Q1
综述 本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响 单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率,揭示了复杂的细胞过程和发育途径 单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战 探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景 植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应 植物生物技术 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
495 2024-12-14
Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells
2024-Nov-20, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本文开发了针对ROBO1和ROBO2外膜结构域的人源单克隆抗体,通过抑制SLIT-ROBO信号通路,减少病理性眼新生血管的形成 首次开发了能够抑制ROBO1和ROBO2信号通路的人源单克隆抗体,并验证了其在体内外对病理性眼新生血管的抑制作用 需要进一步验证该抗体在其他眼科疾病模型中的效果及临床应用潜力 开发新的药物工具以抑制SLIT-ROBO信号通路,从而治疗病理性眼新生血管相关疾病 ROBO1和ROBO2受体及其在病理性眼新生血管中的作用 NA 眼科疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 氧诱导视网膜病变(OIR)和激光诱导角膜新生血管(CNV)小鼠模型
496 2024-12-14
Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq
2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
研究论文 本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据,评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建了结肠癌风险模型 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建了结肠癌风险模型 研究仅基于现有数据集,未进行体外或体内实验验证 通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建结肠癌风险模型 结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据 数字病理学 结肠癌 RNA测序,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,单细胞转录组数据 结肠癌样本
497 2024-12-14
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者的治疗前和治疗中的活检样本,构建了恶性细胞和免疫细胞的详细分子分类,并揭示了治疗抵抗的机制 首次系统分类了胆道癌中的功能性注释细胞状态,并发现了神经样和内皮样状态在胆道癌中的存在,这些状态在其他癌症中与治疗抵抗相关 研究仅限于单一的临床试验,样本量较小,且未观察到客观反应 揭示胆道癌治疗抵抗的机制,并为下一代临床试验提供新的见解 胆道癌患者的治疗前和治疗中的活检样本 数字病理学 胆道癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 治疗前和治疗中的活检样本
498 2024-12-14
Spatial microenvironments tune immune response dynamics in the Drosophila larval fat body
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究果蝇幼虫脂肪体中抗菌肽表达的空间异质性及其与免疫反应的关系 首次在果蝇幼虫脂肪体中发现抗菌肽表达具有可重复的空间模式,并揭示了这种模式与微生物定位的相关性 研究仅限于果蝇幼虫脂肪体,未探讨其他组织或物种中的情况 探讨组织中免疫反应基因表达的空间和时间模式及其机制 果蝇幼虫脂肪体中的抗菌肽表达及其空间模式 NA NA 活体光片荧光显微镜 NA 图像 果蝇幼虫
499 2024-12-14
Aging- and alcohol-associated spatial transcriptomic signature in mouse acute pancreatitis reveals heterogeneity of inflammation and potential pathogenic factors
2024-08, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 本研究通过建立衰老酒精性急性胰腺炎小鼠模型,应用Visium空间转录组学技术,揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎空间转录组特征 首次通过空间转录组学技术揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的炎症异质性,并识别出潜在的致病因素 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 阐明衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的空间转录组特征及其潜在机制 衰老和年轻小鼠的急性胰腺炎模型 NA 胰腺炎 Visium空间转录组学 NA 转录组 衰老小鼠(18个月)和年轻小鼠(3个月)各一组
500 2024-12-14
Challenges and opportunities in cancer immunotherapy: a Society for Immunotherapy of Cancer (SITC) strategic vision
2024-Jun-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
review 本文由癌症免疫治疗学会召集的专家组讨论了癌症免疫治疗领域的当前机遇和挑战,并提出了未来十年的战略愿景 本文提出了七个高优先级的研究领域,并讨论了可能阻碍进展的潜在障碍,以及三个关键的指导原则 NA 识别癌症免疫治疗领域的当前机遇和挑战,并优先考虑具有最高临床影响的领域 癌症免疫治疗领域的七个高优先级领域及跨领域的优化工具 NA NA 单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA
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