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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-10-06 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者外周血单核细胞亚群的转录组差异与临床结局的关系 | 首次在单细胞水平揭示不同临床结局脓毒症患者的经典与非经典单核细胞转录组差异,发现TNF-α产生相关的基因表达模式 | 样本量未明确说明,研究结果需要更大规模验证 | 阐明决定脓毒症患者不同临床轨迹的免疫学机制 | 脓毒症患者的外周血经典和非经典单核细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,通路分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 482 | 2025-10-06 |
Scanorama: integrating large and diverse single-cell transcriptomic datasets
2024-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00991-3
PMID:38844552
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研究论文 | 介绍用于整合大型多样化单细胞转录组数据集的Scanorama工具及其使用流程 | 开发了能够有效整合来自不同实验、实验室和技术的单细胞RNA测序数据的工具,解决了数据集间技术变异问题 | 需要用户具备细胞生物学、转录组技术和生物信息学的基础知识 | 提高异质性单细胞RNA测序数据的质量和解释能力 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2025-10-06 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示猪胚胎着床过程中母胎对话的动态机制 | 开发了新型工具ExtraCellTalk构建母胎对话动态图谱,并发现保守的RBP4/STRA6信号通路 | 研究局限于猪模型,人类临床适用性需进一步验证 | 探究胚胎着床过程中的母胎对话机制 | 猪围植入期胚胎和对应母体子宫内膜 | 单细胞组学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2025-10-06 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者铜死亡相关基因表达,发现CD4+T细胞中GLS表达降低可作为预后指标 | 首次将铜死亡相关基因表达与脓毒症患者免疫细胞亚群分类和预后关联,并发现GLS表达变化与铜螯合治疗的独特响应模式 | GLS表达变化与铜关联机制尚未完全阐明,需要进一步研究 | 探索脓毒症患者铜死亡相关分子标志物以辅助分层和改善预后 | 脓毒症患者外周血样本和Jurkat细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | scRNA-seq, WGCNA, 免疫印迹, 流式细胞术, 免疫荧光, CFSE分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 脓毒症患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2025-10-06 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2024-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00773-6
PMID:39478117
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研究论文 | 通过多组学技术分析乳腺癌亚型及其谱系的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合配对转录组和染色质可及性分析,揭示乳腺癌亚型特异性谱系的调控网络 | 样本量相对有限(37例患者),需要更大规模验证 | 研究乳腺癌亚型特异性肿瘤-正常谱系的转录调控网络 | 乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像 | 调控网络分析 | 基因组, 转录组, 表观基因组, 图像 | 37例患者的61个样本 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2025-10-06 |
Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils
2024-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
PMID:38504138
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研究论文 | 开发了一种无应激小鼠嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析方案,并展示了其在结肠炎研究中的应用 | 建立了首个无应激的嗜酸性粒细胞单细胞转录组捕获方法,结合基因组CRISPR筛选技术研究其分化机制 | 方法主要针对小鼠模型,人类样本的适用性需要进一步验证 | 开发嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析和功能基因组学研究方法 | 小鼠组织驻留嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 多组织来源的小鼠嗜酸性粒细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | 微孔板单细胞RNA捕获系统 |
| 487 | 2025-10-06 |
CHST4 associates with high-abundance immune infiltration in hormone receptor-positive breast cancer
2024-12-31, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae190
PMID:39213175
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研究论文 | 本研究揭示了CHST4在激素受体阳性乳腺癌中通过调节免疫细胞浸润影响肿瘤进展的新机制 | 首次发现CHST4在HR+ BRCA中异常下调并与淋巴结转移相关,揭示了其通过调节硫酸化外周淋巴结地址素增强免疫细胞浸润的新功能 | 研究主要基于生物信息学分析和免疫组化验证,缺乏体内功能实验直接证明CHST4的因果作用 | 探究CHST4在激素受体阳性乳腺癌免疫浸润调控中的作用机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和相关免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、富集分析、单细胞测序分析 | NA | 组织样本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2025-10-06 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱流式细胞术解析人类胶质瘤的免疫景观 | 发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群,建立超越M1/M2范式的巨噬细胞极化基因组框架,提供胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量相对有限,未完全阐明遗传差异和治疗效果对免疫的长期影响 | 解析IDH分层的人类原发性和复发性胶质瘤的免疫特征 | 48例人类胶质瘤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 144,678个单细胞转录组, 超过200万个免疫细胞, 来自48例人类胶质瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2025-10-06 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫-成纤维细胞通讯的分子机制 | 首次在人类心脏疾病中系统描绘免疫-成纤维细胞通讯机制,并发现IL-1β信号通路在驱动FAP/POSTN成纤维细胞形成中的关键作用 | 研究样本量有限(45例),体外培养系统未能完全重现人类疾病表型 | 探索心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制及其治疗潜力 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞基因表达谱、表位图谱、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本(包括健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 490 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating immune cells from human gastric muscularis propria for single-cell analysis
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103258
PMID:39133613
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研究论文 | 本文提供了一种从人胃肌层分离免疫细胞进行单细胞分析的详细实验方案 | 开发了专门针对人胃肌层组织免疫细胞分离的单细胞分析方案 | NA | 建立人胃肌层免疫细胞分离和单细胞分析的标准实验流程 | 人胃肌层组织中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 491 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51761-4
PMID:39227568
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的个体发育、保守性和多样性 | 首次构建软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞单细胞图谱,发现软骨鱼中存在共表达T、B细胞标志的T细胞亚群和具有吞噬功能的B细胞群体 | 研究仅涵盖三种代表性鱼类物种,可能需要更多物种验证普遍性 | 阐明有颌类脊椎动物免疫系统的起源和进化特征 | 软骨鱼(白斑竹鲨)和硬骨鱼(斑马鱼和半滑舌鳎)的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种鱼类物种的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2025-10-06 |
Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51763-2
PMID:39227584
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示七鳃鳗中一种表达MPL-L受体的独特T样细胞亚型 | 首次在无颌类脊椎动物中发现表达MPL样受体的新型T样淋巴细胞亚型 | 研究仅针对七鳃鳗单一物种,需在更多无颌类脊椎动物中验证 | 探究无颌类脊椎动物适应性免疫系统的细胞多样性 | 七鳃鳗(Lampetra morii)的鳃、肠道和血液组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 七鳃鳗多个组织(鳃、肠、血液、肝脏、肾脏、皮肤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 493 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中新型免疫抑制性T细胞,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 首次在CMV感染的胶质母细胞瘤中发现双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞两种新型免疫细胞亚群,并证实FXYD6+ T细胞是一类新型免疫抑制性T细胞 | NA | 探究巨细胞病毒感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织、CMV感染的胶质母细胞瘤免疫微环境 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序,免疫电镜,免疫荧光,微滴数字PCR,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 494 | 2025-10-06 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析免疫检查点抑制剂相关结肠炎的细胞机制,重点关注类固醇治疗患者的免疫细胞和基质细胞变化 | 首次在类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者中系统分析CD4+和CD8+组织驻留记忆T细胞、髓系细胞和基质细胞的失调机制 | 样本主要来自类固醇治疗过的患者,可能影响对疾病原始机制的解读 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制,特别是在类固醇治疗背景下的细胞变化 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 单细胞组学 | 免疫相关结肠炎 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 主要来自类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 495 | 2025-10-06 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
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研究论文 | 通过谱系追踪与单细胞RNA测序技术研究上丘发育过程中祖细胞的多能性和定位模式 | 发现上丘发育过程中存在极端多能性的单个祖细胞,能够生成所有类型的神经元和胶质细胞,且细胞定位呈现非预定模式 | NA | 探索上丘发育过程中祖细胞的分化潜能和细胞定位规律 | 发育中的上丘组织 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic reduces mouse lung inflammation and fibrosis after radiation by attenuating activated endothelial phenotypes
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181330
PMID:39513364
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过抑制内皮细胞活化减轻辐射诱导的小鼠肺损伤 | 首次发现血小板生成素模拟物能通过调节毛细血管内皮细胞表型减轻辐射诱导的肺损伤 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证 | 评估血小板生成素模拟物对辐射诱导肺损伤的保护作用及机制 | 小鼠肺组织和原代肺微血管内皮细胞 | 病理生理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 497 | 2025-10-06 |
[Identification of prognostic genes in prostate cancer by single-cell sequencing combined with Mendelian randomization]
2024-Nov, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40783865
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研究论文 | 通过单细胞测序结合孟德尔随机化方法识别前列腺癌预后相关基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合识别前列腺癌预后基因 | 样本量较小(仅4例前列腺癌单细胞数据),需要更大样本验证 | 识别前列腺癌发展和预后的关键基因 | 前列腺癌患者组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 差异表达分析, 富集分析 | 单变量COX回归 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 4例前列腺癌单细胞数据 + TCGA和GEO数据库前列腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2025-10-06 |
Single Cell Profiling in the Sox10 Dom/+ Hirschsprung Mouse Implicates Hoxa6 in Enteric Neuron Lineage Allocation
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613729
PMID:39345473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10 Dom/+小鼠模型,揭示了Hoxa6在肠神经系统神经元谱系分配中的作用 | 首次报道Hox基因参与肠神经元谱系多样化,发现Sox10 Dom/+突变导致新的祖细胞簇和神经元轨迹改变 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠神经系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元亚型比例及其分子机制 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 杂交链式反应(HCR) | NA | 单细胞转录组数据 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 499 | 2025-10-06 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析猪到人肾脏异种移植中的细胞动态变化和免疫反应 | 首次在猪到人肾脏异种移植中应用纵向单细胞转录组分析,揭示了时间分辨的细胞动态变化和免疫反应 | 仅分析了两例异种移植案例,样本量有限 | 研究异种移植过程中移植肾脏与受体之间的相互作用和免疫反应 | 猪肾脏异种移植受体和移植肾脏组织 | 单细胞生物学 | 器官移植 | 单细胞RNA测序, 纵向RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 2例猪到人肾脏异种移植案例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 500 | 2025-10-06 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-08-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
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研究论文 | 本研究通过分析慢性HCV感染患者的B细胞受体库和单细胞转录组,揭示了表达病毒中和性抗原受体的B细胞具有淋巴瘤样转录组特征 | 首次发现表达IGHV1-69编码的HCV中和性抗原受体的B细胞在慢性HCV感染患者中表现出持续的致癌转录组特征,即使病毒清除后仍长期存在 | 研究样本量有限,体外信号传导实验可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究慢性HCV感染与B细胞异常增殖及淋巴瘤风险增加的机制关联 | 慢性HCV感染患者和经直接抗病毒治疗获得持续病毒学应答的患者 | 免疫学 | 丙型肝炎病毒感染 | B细胞受体测序,单细胞RNA测序,体外信号传导实验 | TKO模型 | 基因组测序数据,转录组数据 | 慢性HCV感染患者和HCV SVR患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |