单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 4941 - 4960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4941 | 2024-08-09 |
Machine learning-based biomarker screening for acute myeloid leukemia prognosis and therapy from diverse cell-death patterns
2024-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68755-3
PMID:39090256
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研究论文 | 本文利用13种程序性细胞死亡途径和73种机器学习组合，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）临床结果和药物反应的6基因指数（PPCDI） | 开发了一种新的6基因指数（PPCDI），该指数通过综合分析多种程序性细胞死亡途径，显示出预测AML患者临床预后和药物敏感性表型的潜力 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测急性髓系白血病的临床预后和药物反应 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-AML、Tyner和GSE37642-GPL96队列的bulk RNA测序和单细胞RNA测序转录组数据以及匹配的临床病理信息 | NA | NA | NA | NA |
| 4942 | 2024-08-09 |
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies
2024-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02717-4
PMID:38783165
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研究论文 | 本文探讨了腹膜表面恶性肿瘤（PSMs）中与转移相关的成纤维细胞（MAFs）的作用及其异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫调节性癌相关成纤维细胞（iCAFs）在PSMs中的普遍性，并探讨了其他主要亚型如肌成纤维细胞样CAFs（myCAFs）和基质CAFs（mCAFs）的分布 | NA | 旨在理解腹膜MAFs与肿瘤细胞间的复杂相互作用，以开发针对性和局部治疗策略，改善PSMs患者的治疗效果 | 腹膜表面恶性肿瘤中的转移相关成纤维细胞及其亚型 | NA | 腹膜表面恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4943 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic insights into chemotherapy-induced remodeling of the osteosarcoma tumor microenvironment
2024-Jul-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05787-2
PMID:39033089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗前后骨肉瘤患者的肿瘤样本，揭示了化疗对肿瘤微环境的复杂影响 | 研究发现化疗导致骨肉瘤细胞表达更多与干细胞相关的基因，并增强了癌症相关成纤维细胞的能力，同时增加了内皮细胞的数量但降低了其分化能力 | NA | 深入了解化疗如何重塑骨肉瘤的局部环境，以推进骨肉瘤治疗方案的发展 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化疗前后收集的骨肉瘤患者肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4944 | 2024-08-09 |
Therapeutic potential of the secreted Kazal-type serine protease inhibitor SPINK4 in colitis
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50048-y
PMID:38997284
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了炎症性肠病早期黏膜损伤与杯状细胞（GC）耗竭的关系，发现Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂SPINK4在结肠炎肠道中的动态调节与疾病活动平行，并探讨了其在结肠炎治疗中的潜在治疗作用。 | 发现SPINK4在结肠炎中的动态调节，并证实其与现有TNF-α抑制剂infliximab在治疗结肠炎中的协同作用，以及通过Kazal样基序调节EGFR-Wnt/β-catenin和Hippo通路促进GC分化。 | NA | 探讨SPINK4在炎症性肠病中的作用及其作为治疗和诊断标志物的潜力。 | SPINK4在结肠炎中的调节及其治疗潜力。 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | NA | Spink4条件性敲除小鼠及健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 4945 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-Mar-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了白斑综合症病毒（WSSV）感染的南美白对虾血细胞的转录组图谱，并与健康血细胞的数据进行对比，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的异质性响应和功能分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了南美白对虾血细胞在WSSV感染后的异质性响应和功能分化过程 | NA | 探究南美白对虾血细胞在白斑综合症病毒感染后的免疫响应和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和WSSV感染的血细胞共16个转录不同的细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 4946 | 2024-08-09 |
TREX1 is required for microglial cholesterol homeostasis and oligodendrocyte terminal differentiation in human neural assembloids
2024-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02348-w
PMID:38129659
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研究论文 | 研究探讨了TREX1基因在人神经集合体中对小胶质细胞胆固醇稳态和少突胶质细胞终末分化的作用 | 首次揭示了TREX1在人小胶质细胞中的功能，包括影响胆固醇代谢和少突胶质细胞的分化 | NA | 探究TREX1基因在人小胶质细胞生物学中的作用及其对神经发育和疾病的影响 | 人胚胎干细胞衍生的工程化小胶质细胞样细胞、集合体中的小胶质细胞和少突胶质细胞 | NA | Aicardi-Goutières综合征 | 单细胞转录组学、光学和透射电子显微镜 | NA | 转录组数据 | 三个月大的集合体 | NA | NA | NA | NA |
| 4947 | 2024-08-09 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物代谢产物尸胺是否通过组胺H4受体（H4R）和瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）介导小鼠的瘙痒反应 | 首次发现尸胺可能作为H4R的内源性配体，并通过H4R/TRPV1信号通路在初级感觉神经元中诱导瘙痒 | NA | 研究尸胺在生理和病理条件下是否调节疼痛或瘙痒 | 尸胺对小鼠瘙痒反应的影响及其分子机制 | NA | NA | 分子对接模拟、scRNA-Seq数据分析、钙成像分析、膜片钳记录 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、电生理数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4948 | 2024-08-09 |
Identification of CGNL1 as a diagnostic marker in fibroblasts of diabetic foot ulcers: Insights from single cell RNA sequencing and bulk sequencing data
2024 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320241265945
PMID:39102374
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研究论文 | 本研究旨在探索糖尿病足溃疡（DFUs）中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 通过单细胞RNA测序和批量测序数据，本研究首次确定了CGNL1作为成纤维细胞中的一个独特诊断标志物，并揭示了其在促炎性成纤维细胞中的正相关性 | NA | 探索糖尿病足溃疡中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 糖尿病足溃疡中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 83529个单细胞转录组来自足部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4949 | 2024-08-09 |
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398719
PMID:39108261
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联，揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色，并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 | NA | 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用，并开发新的预后和治疗策略 | 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4950 | 2024-08-08 |
A novel model combining genes associated with disulfidptosis and glycolysis to predict breast cancer prognosis, molecular subtypes, and treatment response
2024-Sep, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24329
PMID:38747344
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研究论文 | 本文开发了一种新型模型，结合与二硫化物死亡和糖酵解相关的基因，用于预测乳腺癌的预后、分子亚型和治疗反应 | 首次探讨了二硫化物死亡和糖酵解相关基因在乳腺癌中的作用机制及其预后价值 | NA | 开发一种能够准确预测乳腺癌预后、肿瘤微环境及药物治疗反应的模型 | 乳腺癌及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及正常和乳腺癌组织中的差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 4951 | 2024-08-08 |
scTab: Scaling cross-tissue single-cell annotation models
2024-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51059-5
PMID:39098889
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTab的自动化细胞类型预测模型，专门针对表格数据，并使用一种新颖的数据增强方案在大量单细胞RNA-seq数据集上进行训练 | scTab模型能够处理大规模数据集，并在跨组织细胞注释中表现出良好的泛化能力，同时数据增强方案提高了模型的泛化性能 | NA | 开发一种能够在大规模单细胞RNA-seq数据集上进行跨组织细胞类型预测的自动化模型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 表格数据 | 2220万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4952 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome reveals the region-specific genes and pathways regulated by Satb2 in neocortical development
2024-Aug-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10672-w
PMID:39095712
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫染色技术，系统研究了Satb2基因在不同新皮质区域发育中的区域特异性基因调控。 | 首次全面描绘了Satb2基因在新皮质发育中的空间调控途径，并揭示了其在不同区域的具体调控基因和通路。 | 研究主要集中在胚胎阶段的Satb2+/+和Satb2-/-小鼠，未涉及成年阶段或其他相关基因的影响。 | 探究Satb2基因在新皮质发育中的区域特异性基因调控及其相关通路。 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的新皮质区域，包括室管膜区（VZ）、室下区（SVZ）、中间区（IZ）和皮质板（CP）。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫染色 | NA | 转录组数据 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的胚胎阶段样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4953 | 2024-08-08 |
Genome-wide CRISPR screening identifies tyrosylprotein sulfotransferase-2 as a target for augmenting anti-PD1 efficacy
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02068-x
PMID:39095793
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选，发现酪氨酰蛋白磺基转移酶-2（TPST2）是增强抗PD1疗效的潜在靶点 | 首次揭示了TPST2在癌症免疫中的抑制作用，并提出其作为免疫检查点疗法治疗靶点的可能性 | NA | 探索影响抗PD1反应性的肿瘤细胞内在因素，并评估TPST2在癌症免疫中的具体作用 | TPST2在癌症免疫中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | NA | NA | CRISPR筛选，共免疫沉淀，质谱分析，RNA测序 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，RNA数据 | 在人源化小鼠中进行实验，使用同基因小鼠肿瘤模型进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 4954 | 2024-08-08 |
Bioengineered human colon organoids with in vivo-like cellular complexity and function
2024-Aug-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.05.007
PMID:38876106
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的人类结肠类器官模型——“迷你结肠”，通过结合类器官和芯片上的器官技术，实现了与体内组织高度相似的细胞复杂性和功能 | 采用非对称刺激与生长因子结合的方法，显著增强了组织寿命，并模拟了体内细胞类型的多样性和排列 | NA | 开发一种能够精确模拟人体肠道生理和病理的先进类器官模型 | 人类结肠类器官及其在肠道生理和病理研究中的应用 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4955 | 2024-08-08 |
Lipid Deficiency Contributes to Impaired Alveolar Progenitor Cell Function in Aging and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0290OC
PMID:38657143
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研究论文 | 本研究评估了脂质代谢在特发性肺纤维化（IPF）患者和健康捐赠者肺泡II型细胞（AEC2s）中的作用，并探讨了脂质补充和PPARγ激活对AEC2s干细胞更新能力的影响。 | 首次揭示了IPF和老年小鼠肺泡II型细胞中脂质代谢的缺陷，并证明了脂质补充和PPARγ激活可以促进AEC2s的干细胞更新能力。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在临床试验中验证脂质补充和PPARγ激活的治疗效果。 | 探讨脂质代谢在特发性肺纤维化和衰老中的作用，并寻找可能的治疗策略。 | 特发性肺纤维化患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞脂质含量数据 | 包括IPF患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 4956 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，利用自然杀伤细胞相关基因（NKRGs）建立了一个预测乳腺癌预后的模型 | 本研究首次利用NKRGs结合机器学习算法，开发了一种新的乳腺癌风险评估和个性化治疗模型 | NA | 建立一个基于自然杀伤细胞相关基因的预测乳腺癌预后的模型 | 自然杀伤细胞相关基因在乳腺癌预后中的作用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | Lasso + RSF | 转录组数据 | 44个显著表达的NKRGs，9个关键NKRGs | NA | NA | NA | NA |
| 4957 | 2024-08-08 |
Identifying MSMO1, ELOVL6, AACS, and CERS2 related to lipid metabolism as biomarkers of Parkinson's disease
2024-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68585-3
PMID:39080336
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习方法，识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 首次将MSMO1, ELOVL6, AACS, 和CERS2作为与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物进行研究。 | NA | 旨在识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 帕金森病患者中的脂质代谢相关基因。 | 生物信息学 | 帕金森病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR | 反向传播神经网络 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4958 | 2024-08-08 |
Sustained generation of neurons destined for neocortex with oxidative metabolic upregulation upon filamin abrogation
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110199
PMID:38989458
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中通过抑制Flna和Flnb基因，成年V-SVZ区域是否能持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | 首次展示了成年V-SVZ区域通过上调氧化磷酸化、线粒体生物合成和血管丰富度，能够持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | NA | 探讨成年V-SVZ区域是否具有产生大脑皮层神经元的能力 | 小鼠模型中的V-SVZ区域 | 神经科学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4959 | 2024-08-08 |
Mechanical stress during confined migration causes aberrant mitoses and c-MYC amplification
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404551121
PMID:38990945
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研究论文 | 研究机械应力在限制性迁移过程中对肿瘤细胞基因组完整性的影响 | 发现机械应力在转移性迁移过程中通过c-MYC位点扩增促进基因毒性和致癌事件，并绕过检查点控制 | NA | 探究转移性间质迁移产生的机械应力是否导致肿瘤细胞染色体不稳定性的增强 | 转移性肿瘤细胞在限制性迁移过程中的行为 | 数字病理学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4960 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-Jun-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术对胸腺上皮肿瘤（TETs）的研究进展，探讨了胸腺发育和肿瘤形成的分子机制 | 利用单细胞分子 profiling 技术深入分析肿瘤细胞的分子特征，为胸腺上皮肿瘤的研究提供了新的视角 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了对肿瘤发生机制的深入研究和合理治疗方案的开发 | 探讨胸腺上皮肿瘤的生物学特性，加速开发针对这些罕见肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤及其在胸腺发育和老化过程中的细胞多样性 | NA | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |