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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4941 | 2024-09-15 |
Identifying novel risk genes in intracranial aneurysm by integrating human proteomes and genetics
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae111
PMID:39084678
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组和遗传数据,识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 采用多维高通量数据整合蛋白质组关联研究、转录组关联研究、孟德尔随机化分析和贝叶斯共定位分析,优先筛选出可能增加颅内动脉瘤风险的基因 | 未发现具有顺式调控血浆蛋白水平的显著基因与颅内动脉瘤相关 | 识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 颅内动脉瘤的风险基因 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS), 蛋白质组关联研究 (PWAS), 转录组关联研究 (TWAS), 孟德尔随机化 (MR), 贝叶斯共定位分析, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 基因集富集分析 (GSEA) | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4942 | 2024-09-15 |
Dissection of triple-negative breast cancer microenvironment and identification of potential therapeutic drugs using single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.100975
PMID:39263352
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了三阴性乳腺癌的微环境特征,并识别出潜在的治疗药物 | 首次在单细胞分辨率下解析了三阴性乳腺癌的微环境,并发现了与肿瘤细胞增殖相关的关键细胞亚群和潜在治疗靶点 | 研究结果主要基于体外实验和动物模型,需要在临床试验中进一步验证 | 揭示三阴性乳腺癌的微环境特征,并寻找潜在的治疗药物 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境和潜在治疗靶点 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肿瘤和健康乳腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4943 | 2024-09-15 |
Single-cell sequencing revealed metabolic reprogramming and its transcription factor regulatory network in prostate cancer
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101925
PMID:38447277
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研究论文 | 研究利用单细胞测序技术揭示了前列腺癌中的代谢重编程及其转录因子调控网络 | 首次通过单细胞测序技术全面分析了前列腺癌中代谢变化及其转录因子调控网络,并发现了抑制剂Betulin在抑制前列腺癌生长中的潜在治疗作用 | NA | 研究前列腺癌中的代谢重编程变化并识别潜在的治疗靶点 | 前列腺癌及其良性前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种前列腺癌亚型及良性前列腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4944 | 2024-09-15 |
MIF as a potential diagnostic and prognostic biomarker for triple-negative breast cancer that correlates with the polarization of M2 macrophages
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400578R
PMID:38787620
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研究论文 | 研究探讨了MIF作为三阴性乳腺癌的潜在诊断和预后生物标志物,并分析了其与M2巨噬细胞极化的关系 | 首次揭示了MIF在三阴性乳腺癌中通过调节巨噬细胞极化影响肿瘤微环境和预后的机制 | 研究样本量较小,且仅限于特定患者群体,需要进一步的大规模验证 | 探讨MIF在三阴性乳腺癌中的作用及其作为诊断和预后标志物的潜力 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境和预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | NA | RNA | 41,567个细胞来自10个三阴性乳腺癌肿瘤样本和2名患者的空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4945 | 2024-09-15 |
Dihydroartemisinin Regulated the MMP-Mediated Cellular Microenvironment to Alleviate Rheumatoid Arthritis
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0459
PMID:39257420
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研究论文 | 研究了双氢青蒿素通过调节MMP介导的细胞微环境来缓解类风湿性关节炎的作用机制 | 揭示了双氢青蒿素通过抑制MMP2和MMP3来改善类风湿性关节炎的免疫微环境的机制 | 研究主要集中在体外和体内实验,缺乏临床试验数据 | 揭示双氢青蒿素对抗类风湿性关节炎的药理机制 | 类风湿性关节炎的免疫微环境和双氢青蒿素的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(RNA-seq)、蛋白质组学、转录组学 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及RA大鼠和MH7A细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4946 | 2024-09-15 |
Single-cell and spatial transcriptome assays reveal heterogeneity in gliomas through stress responses and pathway alterations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1452172
PMID:39257581
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了胶质瘤在应激反应和通路改变中的异质性 | 首次从空间角度探讨了氧化应激反应在胶质瘤异质性中的机制 | 研究主要集中在高级别和低级别胶质瘤,未涵盖所有胶质瘤类型 | 探讨胶质瘤异质性的分子机制,特别是氧化应激反应的影响 | 高级别和低级别胶质瘤中的氧化应激反应基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 涉及高级别和低级别胶质瘤的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4947 | 2024-09-15 |
Application and research progress of single cell sequencing technology in leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1389468
PMID:39267837
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在白血病研究中的应用和进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上研究白血病的基因表达谱、突变和表观遗传特征,为白血病研究提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在白血病研究中的应用,增强对白血病发病机制的理解,发现治疗靶点和个性化治疗 | 白血病细胞的基因表达谱、突变和表观遗传特征 | 数字病理 | 白血病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4948 | 2024-09-15 |
Multi-omics analysis reveals the landscape of tumor microenvironments in left-sided and right-sided colon cancer
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403171
PMID:39267963
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异 | 首次通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境中免疫细胞浸润的显著差异,并发现右侧结肠癌中肿瘤细胞具有更高的突变频率和更强的免疫原性 | 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 | 探讨左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异及其对免疫治疗效果的影响 | 左侧和右侧结肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多组学分析,包括bulk RNA测序、单细胞RNA测序和全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 左侧结肠癌115例,右侧结肠癌162例 | NA | NA | NA | NA |
| 4949 | 2024-09-15 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment remodeling in hepatocellular carcinoma with varying tumor subclonal complexity
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1467682
PMID:39268081
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研究论文 | 研究探讨了肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境重塑之间的关系 | 提出了一个基于离散拷贝数变异(CNVs)的稳健指标,用于准确量化每个样本的亚克隆复杂度 | NA | 揭示肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境之间的关系 | 肝细胞癌中的肿瘤亚克隆复杂性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 30个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4950 | 2024-09-15 |
Dynamic changes in cellular atlases and communication patterns within yak ovaries across diverse reproductive states unveiled by single-cell analysis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1444706
PMID:39268087
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术描绘了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱,并构建了细胞间通信网络 | NA | 研究牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞和分子特征,以深入了解其卵巢功能 | 牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4951 | 2024-09-15 |
Inhibition of ALOX12-12-HETE Alleviates Lung Ischemia-Reperfusion Injury by Reducing Endothelial Ferroptosis-Mediated Neutrophil Extracellular Trap Formation
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0473
PMID:39268501
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研究论文 | 研究通过抑制ALOX12-12-HETE减轻肺缺血-再灌注损伤,减少内皮细胞铁死亡介导的中性粒细胞胞外陷阱形成 | 首次揭示了ALOX12及其代谢物12-HETE在促进肺缺血-再灌注损伤中的关键作用,并证明了ML355作为ALOX12的靶向抑制剂在减轻肺损伤中的有效性 | 研究主要基于小鼠和细胞模型,尚未在临床试验中验证其疗效 | 探讨ALOX12在肺缺血-再灌注损伤中的作用机制,并寻找潜在的治疗策略 | 小鼠肺组织、人肺移植受者血浆、人内皮细胞和肺功能 | NA | 肺部疾病 | 代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织、血浆、细胞 | 小鼠模型、人肺移植受者血浆、人内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4952 | 2024-09-14 |
S100A9-TLR4 axis aggravates dry eye through the blockage of autophagy
2024-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110052
PMID:39151778
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研究论文 | 研究探讨了S100A9上调如何通过阻断自噬加剧干眼症的发病机制,并评估了S100A9作为干眼症治疗靶点的潜力 | 首次揭示了S100A9-TLR4-自噬阻断途径在干眼症发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨S100A9在干眼症发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 干眼症及其相关生物标志物 | NA | 干眼症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠干眼症模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4953 | 2024-09-14 |
Single-cell transcriptome landscape of the kidney reveals potential innate immune regulation mechanisms in hybrid yellow catfish after Aeromonas hydrophila infection
2024-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109866
PMID:39214264
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了感染嗜水气单胞菌后杂交黄颡鱼肾脏的转录组图谱,揭示了潜在的先天免疫调节机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了杂交黄颡鱼肾脏在感染嗜水气单胞菌后的细胞组成和免疫调节机制 | 研究仅限于杂交黄颡鱼肾脏的单细胞RNA测序分析,未涉及其他器官或物种 | 探讨杂交黄颡鱼肾脏在感染嗜水气单胞菌后的先天免疫调节机制 | 杂交黄颡鱼肾脏细胞及其在感染嗜水气单胞菌后的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 杂交黄颡鱼肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4954 | 2024-09-14 |
Development of a prognostic model for NSCLC based on differential genes in tumour stem cells
2024-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71317-2
PMID:39251710
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研究论文 | 开发基于肿瘤干细胞差异基因的非小细胞肺癌(NSCLC)预后模型 | 结合10种机器学习方法及其101种组合,开发出最佳的预后风险模型,并验证了其在TCGA和GEO数据集中的预测准确性 | NA | 开发和验证一种基于肿瘤干细胞差异基因的NSCLC预后模型 | 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤干细胞的差异基因 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 218379个细胞,162个差异基因 | NA | NA | NA | NA |
| 4955 | 2024-09-14 |
Microvascular and cellular dysfunctions in Alzheimer's disease: an integrative analysis perspective
2024-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71888-0
PMID:39251797
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研究论文 | 本研究整合了阿尔茨海默病患者脑血管系统的单细胞测序和全基因组关联分析,旨在阐明周细胞损伤、细胞外基质紊乱和少突胶质细胞功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的关联和潜在机制 | 本研究首次揭示了周细胞PI3K-AKT-FOXO信号通路异常可能在阿尔茨海默病的发病过程中起作用 | NA | 阐明阿尔茨海默病发病机制中的关联和潜在机制 | 阿尔茨海默病患者的脑血管系统 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4956 | 2024-09-14 |
Exploring single-cell RNA sequencing as a decision-making tool in the clinical management of Fuchs' endothelial corneal dystrophy
2024-Sep, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2024.101286
PMID:38969166
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在Fuchs角膜内皮营养不良临床管理中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术识别Fuchs角膜内皮营养不良的亚型及其相关基因特征,为精准医疗提供新方法 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在Fuchs角膜内皮营养不良临床诊断和治疗中的应用潜力 | Fuchs角膜内皮营养不良及其亚型 | 基因组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4957 | 2024-09-14 |
scNODE : generative model for temporal single cell transcriptomic data prediction
2024-09-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae393
PMID:39230694
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研究论文 | 本文提出了一种名为scNODE的深度学习模型,用于预测未观测时间点的单细胞基因表达数据 | scNODE结合了变分自编码器和神经常微分方程,使用连续非线性潜在空间进行基因表达预测,并引入动态正则化项以提高预测的鲁棒性 | NA | 开发一种能够预测未观测时间点的单细胞基因表达数据的深度学习模型 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 变分自编码器、神经常微分方程 | 基因表达数据 | 三个真实世界的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4958 | 2024-09-14 |
Predicting spatially resolved gene expression via tissue morphology using adaptive spatial GNNs
2024-09-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae383
PMID:39230702
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研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的框架,用于从组织病理图像中预测高表达基因的空间表达 | 本文的创新点在于使用自适应空间图神经网络(GNNs)从组织形态学线索中预测空间基因表达,提供了一种可扩展的方法来解码组织复杂性 | NA | 本文的研究目的是通过组织形态学信息预测空间基因表达,以降低空间转录组技术的成本 | 本文的研究对象是乳腺癌数据集中的组织病理图像和基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 图神经网络(GNNs) | 图神经网络(GNNs) | 图像 | 两个独立的乳腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4959 | 2024-09-14 |
A physics-informed neural SDE network for learning cellular dynamics from time-series scRNA-seq data
2024-09-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae400
PMID:39230705
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研究论文 | 本文提出了一种基于物理信息的神经随机微分方程(PI-SDE)框架,用于从时间序列单细胞RNA测序数据中学习细胞动力学 | 结合了Hamilton-Jacobi方程和神经随机微分方程,通过强制执行HJ方程来重建细胞势能函数,提高了预测精度和可解释性 | NA | 通过重建细胞势能景观来学习细胞动力学 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经随机微分方程 | 时间序列数据 | 两个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4960 | 2024-09-14 |
Graspot: a graph attention network for spatial transcriptomics data integration with optimal transport
2024-09-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae394
PMID:39230711
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Graspot的图注意力网络,用于空间转录组学数据集成与最优传输 | Graspot结合基因表达和空间信息,能够有效去除批次效应并保留生物结构变异,实现了多空间转录组数据集的部分对齐 | NA | 解决空间转录组学数据集成中的批次效应问题,并保留生物结构变异 | 空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 最优传输 | 图注意力网络 | 空间转录组学数据 | 四个真实的空间转录组学数据集 | NA | NA | NA | NA |