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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4921 | 2024-08-13 |
Cold-adapted influenza vaccine carrying three repeats of a respiratory syncytial virus (RSV) fusion glycoprotein epitope site protects BALB/c mice and cotton rats against RSV infection
2024-Sep, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2024.105960
PMID:38986872
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研究论文 | 本研究开发了一种携带三个呼吸道合胞病毒(RSV)融合糖蛋白表位重复序列的冷适应流感疫苗,用于保护BALB/c小鼠和棉鼠免受RSV感染 | 首次开发了一种携带RSV融合蛋白中和表位重复序列的冷适应流感疫苗,显示出双重保护作用 | 需要进一步的临床前和临床研究来验证其安全性和有效性 | 开发一种新型双价疫苗,用于预防流感和RSV感染 | BALB/c小鼠和棉鼠 | NA | 呼吸道病毒感染 | 反向遗传技术,单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞T细胞抗原受体(TCR)测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和棉鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4922 | 2024-08-13 |
Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver
2024-Aug-12, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00060a
PMID:38982979
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研究论文 | 本研究通过基因表达数据和生物信息学方法,识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因,并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系 | 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据,揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系 | 研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集,可能存在样本代表性不足的问题 | 探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系 | 非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CIBERSORT算法,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集,以及GSE129516单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4923 | 2024-08-13 |
Identifying polyamine related biomarkers in diagnosis and treatment of ulcerative colitis by integrating bulk and single-cell sequencing data
2024-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69322-6
PMID:39103474
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据,识别与溃疡性结肠炎诊断和治疗相关的聚胺相关生物标志物。 | 首次通过综合分析批量和单细胞测序数据,识别出与溃疡性结肠炎活动性和治疗反应相关的关键聚胺相关基因。 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏倚;体外和体内实验验证的样本量有限。 | 旨在识别关键的聚胺相关基因,并探索这些基因与溃疡性结肠炎疾病状态和治疗反应之间的关系。 | 溃疡性结肠炎患者的聚胺代谢酶及其相关基因。 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的溃疡性结肠炎患者数据,具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 4924 | 2024-08-13 |
Intratumoral Cell Heterogeneity in Patient-Derived Glioblastoma Cell Lines Revealed by Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158472
PMID:39126040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了来自不同患者的胶质母细胞瘤细胞系的肿瘤内细胞异质性 | 揭示了患者来源的胶质母细胞瘤细胞系在细胞组成和基因组变异方面的差异 | 研究仅限于六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 | 探究胶质母细胞瘤细胞模型中是否保持了肿瘤内异质性 | 胶质母细胞瘤细胞系和肿瘤样本的细胞组成及基因组变异 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4925 | 2024-08-13 |
Definition of a Multi-Omics Signature for Esophageal Adenocarcinoma Prognosis Prediction
2024-Aug-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152748
PMID:39123475
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,识别了与食管腺癌(EAC)抗肿瘤反应相关的特定免疫细胞类型和差异表达基因,并验证了这些转录特征在TCGA患者队列中的预测效能。 | 本研究首次系统地分析了食管腺癌的转录特征,并提出了新的免疫生物标志物,用于预测术后预后和个性化辅助治疗决策。 | NA | 研究旨在识别和验证食管腺癌的转录特征,以预测临床结果和术后预后。 | 食管腺癌(EAC)的转录特征和免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA序列 | TCGA患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 4926 | 2024-08-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of B cells reveals new insights into atypical memory B cells in COVID-19
2024-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29851
PMID:39132689
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了康复期COVID-19患者中S1和受体结合域蛋白特异性B细胞,旨在评估非典型记忆B细胞(MBCs)在严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染中的作用和发展途径 | 揭示了与疾病严重程度相关的B细胞亚群中的促炎特征,并提出了非典型MBCs通过生发中心的发展途径 | NA | 评估非典型记忆B细胞在SARS-CoV-2感染中的作用和发展途径 | 康复期COVID-19患者的S1和受体结合域蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同临床表现的康复期COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4927 | 2024-08-13 |
Advancements in Research and Treatment Applications of Patient-Derived Tumor Organoids in Colorectal Cancer
2024-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152671
PMID:39123399
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综述 | 本文综述了患者来源的肿瘤类器官(PDTOs)在结直肠癌(CRC)治疗中的应用,作为一种新型的药物抗性筛选工具 | PDTOs能够重现肿瘤的结构、细胞异质性和基因组景观,是一种有价值的体外预测药物筛选工具 | NA | 探讨PDTOs在预测结直肠癌治疗反应、药物抗性和生物标志物识别方面的潜力 | 结直肠癌及其治疗中的药物抗性问题 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 类器官 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4928 | 2024-08-13 |
Decoding Clonal Hematopoiesis: Emerging Themes and Novel Mechanistic Insights
2024-Jul-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152634
PMID:39123361
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综述 | 本文综述了克隆性造血(CH)的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 揭示了CH在老年人群中的普遍性及早期启动的可能性,并探讨了环境因素通过异常炎症促进克隆扩增和疾病进展的机制 | 克隆性造血现象的许多方面仍待阐明,精确机制、特定环境下的驱动因素及克隆扩增途径尚未完全建立 | 探讨克隆性造血的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 克隆性造血及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4929 | 2024-08-13 |
VNN2-expressing circulating monocytes exhibit unique functional characteristics and are decreased in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103275
PMID:38936146
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研究论文 | 本研究旨在阐明外周血单核细胞中VNN2表达的意义及其在原发性干燥综合征(pSS)中的临床相关性 | 研究首次发现VNN2在单核细胞中的高表达,并探讨了其在pSS中的潜在作用和诊断价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序和流式细胞术,未涉及VNN2功能的具体机制研究 | 阐明VNN2在原发性干燥综合征中的临床意义 | 外周血单核细胞中的VNN2表达 | NA | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4930 | 2024-08-13 |
Characterizing Rare Dormant and Cycling Lineages Using the Watermelon System
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3882-8_12
PMID:39037657
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研究论文 | 本文介绍了Watermelon系统,该系统能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态 | Watermon系统通过使用基于条形码的谱系追踪方法,实现了从单细胞RNA测序转录数据中解卷积谱系身份 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态的新系统 | 罕见的休眠和循环细胞谱系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4931 | 2024-08-12 |
Tumor-associated macrophage clusters linked to immunotherapy in a pan-cancer census
2024-Aug-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00660-4
PMID:39117688
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研究论文 | 本研究通过跨九种癌症类型的单细胞RNA测序分析,识别了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的不同组成模式,并探讨了TAMs在塑造肿瘤微环境(TME)和影响免疫治疗中的作用。 | 首次进行了跨多种癌症类型的TAMs单细胞RNA测序分析,并开发了机器学习模型来预测免疫检查点阻断反应。 | NA | 研究TAMs在不同癌症类型中的普遍特征及其与肿瘤微环境的相互作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其在肿瘤微环境(TME)中的功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 九种癌症类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4932 | 2024-08-12 |
The life-saving benefit of dexamethasone in severe COVID-19 is linked to a reversal of monocyte dysregulation
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.014
PMID:38964327
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research paper | 本文研究了地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制,发现其通过逆转单核细胞的转录特征来改善生存率 | 首次揭示了地塞米松通过逆转严重COVID-19患者的单核细胞失调来提高生存率的分子机制 | 尽管地塞米松治疗及时,但仍有部分患者病情恶化或死亡 | 探讨地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制及其对单核细胞的影响 | 严重COVID-19患者的单核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 两组独立队列的致命结果患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4933 | 2024-08-12 |
Occlusion enhanced pan-cancer classification via deep learning
2024-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05870-y
PMID:39118043
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GENESO的新框架,通过结合遮挡方法和深度学习进行泛癌分类和标记基因发现 | 提出了一种新的标记基因发现方法Symmetrical Occlusion (SO),能够模拟基因的“功能获得”和“功能丧失”,并使用较少的关键基因训练出性能更高的LSTM模型 | NA | 开发一种新的深度学习框架,用于泛癌分类和标记基因发现 | RNA-Seq数据中的泛癌样本及其标记基因 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | LSTM | RNA表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4934 | 2024-08-12 |
Single-cell genomic profiling to study regeneration
2024-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2024.102231
PMID:39053027
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综述 | 本文综述了近年来利用高通量单细胞转录组学和其他单细胞分析技术在不同动物模型中研究再生机制的最新进展 | 探讨了不同动物和细胞类型在再生能力上的差异,并总结了关键概念 | NA | 理解再生过程中的细胞和分子机制 | 不同动物模型中的再生能力 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4935 | 2024-08-12 |
Single-cell landscape reveals the immune heterogeneity of bone marrow involvement in peripheral T-cell lymphoma
2024-Aug, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16227
PMID:38845192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫异质性 | 首次揭示了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓微环境的单细胞景观 | NA | 探讨外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫景观及其与预后的关联 | 外周T细胞淋巴瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11份新鲜骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4936 | 2024-08-12 |
A comparison of scRNA-seq annotation methods based on experimentally labeled immune cell subtype dataset
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae392
PMID:39120646
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研究论文 | 本研究构建了一个实验标记的免疫细胞亚型单细胞数据集,并系统评估了18种细胞注释方法 | 首次使用实验标记的免疫细胞亚型数据集来评估细胞注释方法,揭示了无监督聚类方法的不足,并为监督方法提供了新的数据集支持 | 无监督聚类方法无法完全拟合实际的细胞类型分布 | 评估和比较不同细胞注释方法在单细胞数据分析中的效果 | 免疫细胞亚型单细胞数据集和18种细胞注释方法 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | SVM, scBERT, scDeepSort, Seurat | 单细胞数据 | 同一批次实验标记的免疫细胞亚型单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4937 | 2024-08-12 |
Integrating single-cell RNA-seq to identify fibroblast-based molecular subtypes for predicting prognosis and therapeutic response in bladder cancer
2024-Jul-18, Aging
DOI:10.18632/aging.206021
PMID:39033778
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,通过识别纤维母细胞标记基因,为膀胱癌患者建立了基于分子亚型的预后和治疗反应预测模型 | 首次基于纤维母细胞标记基因建立了一个新的预后和免疫治疗反应预测模型 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌的分子亚型,以预测患者的预后和治疗反应 | 膀胱癌患者的纤维母细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | UMAP | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4938 | 2024-08-12 |
Commensal bacteria promote type I interferon signaling to maintain immune tolerance in mice
2024-Jan-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230063
PMID:38085267
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研究论文 | 本文揭示了共生细菌Bacteroides fragilis通过经典的抗病毒途径调节肠道树突细胞和调节T细胞反应,从而促进肠道免疫耐受 | 首次阐明共生细菌通过I型干扰素信号途径支持肠道免疫耐受的机制 | NA | 探究共生细菌如何通过I型干扰素信号途径维持肠道免疫耐受 | 共生细菌Bacteroides fragilis、肠道树突细胞和调节T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肠道调节T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4939 | 2024-08-11 |
MICROPHERRET: MICRObial PHEnotypic tRait ClassifieR using Machine lEarning Techniques
2024-Aug-08, Environmental microbiome
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40793-024-00600-6
PMID:39113074
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研究论文 | 本文利用一系列监督机器学习算法,从广泛可获得的微生物基因组注释中建立了一系列86种代谢和其他生态功能分类模型 | 开发了一种名为MICROPHERRET的工具,能够对微生物基因组进行功能分类,适用于高质量和低质量的基因组数据 | NA | 开发快速自动化的策略,用于微生物基因组的功能分类 | 微生物基因组的功能分类 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 监督学习模型 | 基因组注释 | 86种功能分类模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4940 | 2024-08-11 |
Dedifferentiation-like reprogramming of degenerative nucleus pulposus cells into notochordal-like cells by defined factors
2024-Aug-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.06.018
PMID:38879755
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研究论文 | 本研究聚焦于椎间盘退行性疾病,发现通过特定因子组合(OCT4、FOXA2、TBXT)可以诱导退行性髓核细胞向诱导的脊索样细胞进行去分化样重编程 | 首次证明通过因子基础策略可以将退行性体细胞去分化样重编程为相应的祖细胞,为退行性椎间盘疾病的再生提供了一种有前景的方法 | NA | 探索在椎间盘退行性疾病中,通过特定因子组合诱导退行性髓核细胞向脊索样细胞重编程的可能性 | 退行性髓核细胞及脊索样细胞 | NA | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 使用大鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |