单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了新的免疫抑制T细胞，并研究了CMV-TCR-T细胞对胶质母细胞瘤的细胞毒性 | 首次识别了在CMV感染下的胶质母细胞瘤中的新型免疫细胞亚群，特别是FXYD6+ T细胞作为免疫抑制T细胞 | CMV感染对GBM免疫微环境的具体影响机制尚不完全明确，工程化TCR-T细胞的长期效果尚需进一步研究 | 研究CMV感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响以及CMV-TCR-T细胞的治疗潜力 | CMV感染的胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 涉及CMV感染的胶质母细胞瘤患者的多种样本 |
| 4902 | 2024-08-04 |
Pten regulates endocytic trafficking of cell adhesion and Wnt signaling molecules to pattern the retina
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114005
PMID:38551961
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研究论文 | 本研究展示了磷酸酶和张力同源物（Pten）如何通过调节细胞粘附分子和Wnt蛋白的囊泡运输来控制视网膜星爆细胞的间距 | 揭示了Pten在星爆细胞模式形成中的作用，以及与Down综合征细胞粘附分子Dscam的协同效应 | 对具体机制的深入探讨和长时间的观察尚待进一步研究 | 探讨Pten如何通过调节内吞运输模式来决定视网膜星爆细胞的排列 | 主要研究视网膜星爆细胞及其相关的细胞粘附和信号传导分子 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 分子标志物和囊泡蛋白组 | NA |
| 4903 | 2024-08-05 |
Well-Paired-Seq2: High-Throughput and High-Sensitivity Strategy for Characterizing Low RNA-Content Cell/Nucleus Transcriptomes
2024-04-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c05785
PMID:38597061
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的高通量高灵敏度策略Well-Paired-Seq2，用于表征低RNA含量细胞/细胞核的转录组 | 该研究创新地利用尺寸排斥和准静态流体动力学实现高效细胞捕获，并显著提高了转录组的检测灵敏度 | 未提及具体的样本类型和数量限制 | 研究旨在解决低RNA含量细胞的转录组分析中的灵敏度和通量问题 | 研究对象为低RNA含量的单细胞及细胞核转录组 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 无具体样本数量，提到的分析样本包括冷冻临床样本 |
| 4904 | 2024-08-04 |
Multi-Omics Pan-Cancer Analysis of Procollagen N-Propeptidase Gene Family of ADAMTS as Novel Biomarkers to Associate with Prognosis, Tumor Immune Microenvironment, Signaling Pathways, and Drug Sensitivities
2024-Apr-12, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2904151
PMID:38682182
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研究论文 | 本研究旨在进行ADAMTS的procollagen N-propeptidase亚组的全癌症分析 | 首次揭示了PNPSA成员在肿瘤免疫微环境和预后中的双重角色，及其在不同癌症中的潜在生物标志物和治疗靶点 | 本研究主要依赖于公开数据库，可能存在数据的不一致性和局限性 | 探讨PNPSA在全癌症中的表达、基因组变异及其与肿瘤进展的关系 | ADAMTS家族的procollagen N-propeptidase亚组的成员 | 数字病理学 | 肿瘤 | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 基于多个集成的开放数据库进行分析，样本数未特定说明 |
| 4905 | 2024-08-04 |
CD301 and LSECtin glycan-binding receptors of innate immune cells serve as prognostic markers and potential predictors of immune response in breast cancer subtypes
2024-04-01, Glycobiology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/glycob/cwae003
PMID:38206856
|
研究论文 | 这篇文章探讨了糖基化在乳腺癌不同亚型中的作用，并确认CD301和LSECtin作为预后标志物和免疫反应的潜在预测因子 | 本研究首次系统性地确定了改变的糖基化在乳腺癌中的相关性，并识别了特定的糖结合受体作为预后指标 | 研究仅基于特定的样本群体，可能无法广泛适用所有乳腺癌患者 | 研究旨在探索糖基化改变在乳腺癌中的预后作用 | 研究对象为一大批不同组织病理类型的侵袭性乳腺癌样本（n = 1859） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 重组C型糖结合受体 | 无 | 组织微数组 | 1859个侵袭性乳腺癌样本 |
| 4906 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals periodontal ligament fibroblast heterogeneity with distinct IL-1β and RANKL expression in periodontitis
2024-Apr, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100059
PMID:38554844
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研究论文 | 这项研究揭示了牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的异质性，并探讨了IL-1β和RANKL的不同表达。 | 首次揭示了牙周韧带成纤维细胞的异质性，并确定了与骨吸收相关的不同细胞亚群。 | 研究中仅使用了人类牙周炎患者的单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的样本或疾病模型。 | 研究牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的功能和异质性。 | 人类牙周炎患者的牙周韧带成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自人类牙周炎患者的多个单细胞样本数据 |
| 4907 | 2024-08-04 |
Landscape of Epstein-Barr virus gene expression and perturbations in cancer
2024-Feb-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3911441/v1
PMID:38352479
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研究论文 | 该文章研究了EB病毒在癌症中的基因表达及其扰动 | 首次识别出RPMS1非编码RNA通过干扰素反应的破坏支持癌细胞特性 | 研究中未详细探讨癌细胞和健康细胞的具体环境交互 | 探索EB病毒在癌症中的基因表达及其对癌细胞特性的影响 | 研究与EB病毒相关的肿瘤及其细胞特性 | 数字病理学 | NA | 长读长单分子测序 | NA | 转录组数据 | 通过单细胞测序分离了来自同一组织活检的癌细胞和健康细胞 |
| 4908 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析，发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 |
| 4909 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
|
研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来，揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠，数量未具体提及 |
| 4910 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
|
研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用，提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 |
| 4911 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加，并与PD-L1呈负相关，以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 |
| 4912 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200
PMID:38989284
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因 | 本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式，并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色 | 研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达，未深入分析其他可能影响结果的因素 | 本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征 | 研究对象是高等级（胶质母细胞瘤，WHO IV级）和低等级（少突胶质瘤，WHO II级）胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个胶质瘤细胞类型的样本，具体样本量未提供 |
| 4913 | 2024-08-05 |
Reparative effects after low-dose radiation exposure: Inhibition of atherosclerosis by reducing NETs release
2024-Oct-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.174540
PMID:38977089
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研究论文 | 该研究探讨了低剂量辐射如何通过减少 NETs 释放来抑制动脉粥样硬化。 | 首次探讨了低剂量辐射对心血管系统的影响及其抑制动脉粥样硬化的机制。 | 研究中未涉及不同剂量辐射的长期影响及其在临床中的应用。 | 研究低剂量辐射对动脉粥样硬化的影响机制。 | 研究对象为接受低剂量辐射和高脂饮食的动物模型。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定法（ELISA） | NA | 组学数据 | 高脂饮食下的动物模型 |
| 4914 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular landscape of primary dermatofibrosarcoma protuberans: Insights from single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15121
PMID:39081004
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研究论文 | 这项研究利用单细胞 RNA 测序分析了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征。 | 研究揭示了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞异质性及其分子机制，并建议了潜在的治疗靶点。 | 研究可能受到样本数量和特定细胞类型的限制。 | 研究疾病皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征，以了解其生物学行为。 | 主要研究皮肤纤维肉瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4915 | 2024-08-05 |
MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification
2024-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00875-6
PMID:37532927
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研究论文 | 本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹（Crebzf）来影响卵母细胞衰老 | 提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力，并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制 | 本文未提及具体的样本量和长期影响的研究 | 研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用 | 聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制 | NA | 女性不孕 | 高通量测序和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 4916 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 | 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征，以及与音调相关的新基因 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能不完全适用于人类 | 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了不同位置的内外毛细胞样本 |
| 4917 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法，能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释，尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA |
| 4918 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达，并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用，并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 4919 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 |
| 4920 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 |