单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2024-09-17 |
CYR61/CCN1: A Novel Mediator of Redox Response in Corneal Stromal Cells of Keratoconus
2024-Sep-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110093
PMID:39277098
|
研究论文 | 研究探讨了CYR61/CCN1在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的作用 | 首次揭示了CYR61在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的关键作用 | 研究主要集中在细胞水平，缺乏临床数据支持 | 阐明氧化应激在圆锥角膜病理生理中的分子机制 | 圆锥角膜基质细胞 | NA | 圆锥角膜 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 圆锥角膜组和对照组的基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4902 | 2024-09-17 |
Approximating mutual information of high-dimensional variables using learned representations
2024-Sep-03, ArXiv
PMID:39279839
|
研究论文 | 本文提出了一种名为潜在互信息（LMI）近似的方法，用于在高维数据中近似互信息 | LMI方法利用高维数据中的低维结构，通过非参数互信息估计器和简单理论模型架构学习到的低维表示来近似高维变量间的互信息 | NA | 探索在高维数据中利用低维结构近似互信息的方法 | 高维变量间的互信息 | 机器学习 | NA | 非参数互信息估计器 | 理论模型架构 | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4903 | 2024-09-17 |
Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02325-3
PMID:38965443
|
研究论文 | 本文系统比较了11种基于测序的空间转录组学方法 | 首次全面基准测试不同的空间转录组学平台，并强调了分子扩散作为不同方法和组织中的变量参数 | 现有技术之间的变异性和数据集的多样性使得制定标准化的评估指标具有挑战性 | 帮助生物学家选择空间转录组学平台，并促进评估标准的共识 | 11种空间转录组学方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个参考组织和区域 | NA | NA | NA | NA |
| 4904 | 2024-09-17 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Opening New Horizons for Breast Cancer Research
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179482
PMID:39273429
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对理解乳腺癌生物学和个性化治疗策略的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术为乳腺癌研究提供了前所未有的细胞异质性和复杂性洞察 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对个性化治疗策略的潜在影响 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4905 | 2024-09-17 |
Deciphering Dormant Cells of Lung Adenocarcinoma: Prognostic Insights from O-glycosylation-Related Tumor Dormancy Genes Using Machine Learning
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179502
PMID:39273449
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，揭示了肺腺癌中休眠细胞与O-糖基化相关基因的关系，并开发了一个预测肺腺癌预后的风险评分模型 | 首次揭示了O-糖基化在肺腺癌休眠细胞中的关键作用，并开发了一个基于机器学习的高精度预后预测模型 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的验证 | 揭示肺腺癌中休眠细胞的分子机制，并开发一个预测肺腺癌预后的模型 | 肺腺癌中的休眠细胞及其与O-糖基化相关基因的关系 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4906 | 2024-09-17 |
Potential molecular metabolic mechanisms underlying the effects of cimifugin in gastric cancer through single-cell and bulk RNA sequencing combined with network pharmacology
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-413
PMID:39279957
|
研究论文 | 研究了传统中药刺五加素在胃癌中的潜在分子代谢机制，通过单细胞和批量RNA测序结合网络药理学的方法 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了刺五加素在胃癌微环境和代谢途径中的潜在作用机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨刺五加素在胃癌中的分子机制，为胃癌治疗提供新的策略 | 胃癌细胞、胃癌微环境细胞类型及其代谢途径 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学 | NA | RNA | 使用了GSE134520数据库中的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库中的胃腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4907 | 2024-09-17 |
Proteome-wide Mendelian randomization and single-cell sequencing analysis identify the association between plasma proteins and gastric cancer
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-200
PMID:39279974
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析和单细胞测序分析，识别了与胃癌相关的血浆蛋白质 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞测序技术，系统地识别了与胃癌因果相关的血浆蛋白质 | 研究仅基于现有数据进行分析，未进行实验验证 | 识别与胃癌因果相关的血浆蛋白质，探索新的遗传靶点 | 胃癌及其相关血浆蛋白质 | 数字病理学 | 胃癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞测序 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据 | 4907个血浆蛋白质样本、基因表达数据库中的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4908 | 2024-09-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Effects of Ionizing Radiation on Bone Marrow Mononuclear Cells in Mice
2024-Aug-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179287
PMID:39273235
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示电离辐射对小鼠骨髓单核细胞的早期影响 | 首次通过单细胞转录组测序技术研究电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的早期响应基因，揭示了放射敏感性和放射抗性细胞之间的基因表达差异 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的放射敏感性和抗性的分子机制 | 小鼠骨髓中的单核细胞，包括粒细胞-巨噬细胞祖细胞、造血干细胞/祖细胞、B细胞、中性粒细胞、自然杀伤细胞、T细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多种骨髓造血细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 4909 | 2024-09-17 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data to Identify Prognostic Features Related to Activated Dendritic Cells in Clear-Cell Renal-Cell Carcinoma
2024-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179235
PMID:39273185
|
研究论文 | 本研究整合了批量和单细胞RNA测序数据，识别了与激活树突状细胞相关的预后特征，用于透明细胞肾细胞癌 | 首次从免疫激活的角度研究树突状细胞与透明细胞肾细胞癌的关系，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来确认模型的临床应用价值 | 研究激活树突状细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用，并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌患者的预后特征和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个验证集（GSE167573, ICGC, E-MTAB-1980）和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4910 | 2024-09-17 |
Interleukin-7 expression by CAR-T cells improves CAR-T cell survival and efficacy in chordoma
2024-Aug-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03756-9
PMID:39093440
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了14个脊索瘤样本，识别出B7-H3和IL-7作为潜在的靶点和增强因子，并评估了B7-H3 CAR-T细胞和表达IL-7的B7-H3 CAR-T细胞的抗肿瘤活性 | 首次将IL-7表达引入CAR-T细胞，增强了CAR-T细胞的存活和疗效，提供了一种新的双重治疗策略 | NA | 识别脊索瘤的潜在新型免疫治疗靶点，并通过肿瘤微环境因素增强疗效 | 脊索瘤样本和CAR-T细胞 | NA | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞 | RNA | 14个脊索瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4911 | 2024-09-17 |
Metabolic targeting of cancer associated fibroblasts overcomes T-cell exclusion and chemoresistance in soft-tissue sarcomas
2024-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46504-4
PMID:38509063
|
研究论文 | 研究通过代谢靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）克服软组织肉瘤中的T细胞排除和化学抗性 | 首次识别并命名了一种依赖GLUT1表达CXCL16的糖酵解癌症相关成纤维细胞（glyCAF），并证明靶向糖酵解可以减少glyCAF在肿瘤边缘的积累，增强T细胞浸润和化疗效果 | 研究结果需要在进一步的临床试验中验证 | 探索通过靶向CAFs改善软组织肉瘤中T细胞浸润和化疗效果的策略 | 软组织肉瘤中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和T细胞浸润 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用雌性小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 4912 | 2024-09-16 |
Reconstitution of the Multiple Myeloma Microenvironment Following Lymphodepletion with BCMA CAR-T Therapy
2024-Sep-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0352
PMID:39024031
|
研究论文 | 研究了BCMA CAR-T细胞疗法后多发性骨髓瘤微环境的重组 | 揭示了BCMA CAR-T疗法后多发性骨髓瘤微环境的动态变化，并提供了预测治疗反应性的线索 | 样本量较小，仅涉及七名患者 | 研究BCMA CAR-T细胞疗法后多发性骨髓瘤微环境的重组 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个骨髓样本，来自7名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4913 | 2024-09-16 |
Exploring the relationship between the interleukin family and lung adenocarcinoma through Mendelian randomization and RNA sequencing analysis
2024-Sep-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01325-1
PMID:39264458
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和RNA测序分析探索白细胞介素家族与肺腺癌之间的关系 | 首次通过孟德尔随机化和RNA测序分析揭示了白细胞介素因子与肺腺癌发生和进展的因果关系 | 研究主要基于数据集分析，缺乏体内实验验证 | 揭示白细胞介素因子与肺腺癌之间的关联 | 白细胞介素因子与肺腺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 多个中心的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4914 | 2024-09-16 |
Spatial transcriptomics reveals tumor-derived SPP1 induces fibroblast chemotaxis and activation in the hepatocellular carcinoma microenvironment
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05613-w
PMID:39267037
|
研究论文 | 研究揭示了肝细胞癌微环境中肿瘤细胞分泌的SPP1诱导成纤维细胞趋化和激活的机制 | 首次阐明了SPP1-CD44信号轴在肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据和临床样本，缺乏体内外实验的直接验证 | 探讨肝细胞癌微环境中肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用的机制 | 肝细胞癌微环境中的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了10个空间转录组和12个单细胞转录组样本，以及20个肝癌患者的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4915 | 2024-09-16 |
Single-cell sequencing of the vermiform appendix during development identifies transcriptional relationships with appendicitis in preschool children
2024-Sep-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03611-9
PMID:39267041
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类阑尾在发育过程中的转录特征，并探讨了其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了阑尾发育过程中的细胞图谱，并发现了BMP信号通路在阑尾上皮发育中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅限于学龄前儿童，可能影响结果的普适性 | 深入了解人类阑尾的发育过程及其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 人类阑尾在胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的细胞 | 数字病理学 | 阑尾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的阑尾样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4916 | 2024-09-16 |
Multi‑omics identification of a signature based on malignant cell-associated ligand-receptor genes for lung adenocarcinoma
2024-Sep-12, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12911-5
PMID:39267056
|
研究论文 | 本文通过多组学分析，构建了一个基于恶性细胞相关配体-受体基因的肺腺癌预后标志物 | 本文通过结合10种机器学习算法，开发了一种新的计算框架，用于识别肺腺癌的预后标志物 | NA | 开发一种新的方法来评估肺腺癌患者的预后，并提供开发更有效免疫疗法的见解 | 肺腺癌的恶性细胞相关配体-受体基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 317例免疫治疗患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4917 | 2024-09-16 |
A novel spherical GelMA-HAMA hydrogel encapsulating APET×2 polypeptide and CFIm25-targeting sgRNA for immune microenvironment modulation and nucleus pulposus regeneration in intervertebral discs
2024-Sep-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02783-z
PMID:39267105
|
研究论文 | 研究开发了一种新型球形GelMA-HAMA水凝胶，用于调节免疫微环境并促进椎间盘髓核再生 | 首次使用球形GelMA-HAMA水凝胶封装APET×2多肽和CFIm25靶向sgRNA，用于治疗椎间盘退变 | NA | 探讨CFIm25在椎间盘退变中的作用，并开发新型治疗策略 | 椎间盘髓核细胞和小鼠模型 | 生物医学工程 | 脊柱疾病 | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 高通量转录组学 | NA | 基因表达, 蛋白质表达, 细胞活性, 细胞迁移 | 小鼠椎间盘髓核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4918 | 2024-09-16 |
Identification of macrophage driver genes in fibrosis caused by different heart diseases based on omics integration
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05624-7
PMID:39267173
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和批量RNA测序分析，探讨了不同心脏病引起的纤维化中巨噬细胞驱动基因的关系 | 首次通过整合单细胞转录组学和批量RNA测序数据，揭示了四种心脏病中巨噬细胞介导的心肌纤维化的驱动基因，并验证了左心室辅助装置（LVAD）对心衰患者的治疗效果 | NA | 探讨不同心脏病引起的心肌纤维化中巨噬细胞的遗传病理生理机制 | 巨噬细胞在心肌纤维化中的作用及其驱动基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四种心脏病（扩张型心肌病、缺血性心肌病、心肌梗死、心衰）的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4919 | 2024-09-16 |
Construction and validation of a TAMRGs prognostic signature for gliomas by integrated analysis of scRNA and bulk RNA sequencing data
2024-Sep-11, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2024.149237
PMID:39270996
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一种新的预后模型，并验证了其在胶质瘤患者中的预后价值 | NA | 构建并验证一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 胶质瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | RNA测序数据 | 三个内部胶质瘤组织样本和TCGA-GTEx数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4920 | 2024-09-15 |
Spatial transcriptomics in pancreatic cancer: Advances, prospects and challenges
2024-Nov, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2024.104430
PMID:38942220
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在胰腺癌研究中的进展、前景和挑战 | 空间转录组学技术整合了细胞位置和全转录表达信息，提供了对胰腺癌微环境中细胞亚型时空变化的详细观察 | 空间转录组学技术在胰腺癌中的临床应用场景和技术局限性仍需进一步探索 | 探讨空间转录组学在胰腺癌研究中的应用及其对肿瘤异质性和免疫微环境的理解 | 胰腺癌中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |