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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4801 | 2024-08-29 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Regulatory Dynamics in Developing Cotton Anthers
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304017
PMID:37974530
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研究论文 | 本研究建立了棉花花药的第一个单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,揭示了花药中不同细胞类型的特异性表达和表观遗传景观,并探讨了高温应激对花药细胞的异质性响应。 | 首次在棉花花药中建立了单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,重建了减数分裂细胞、绒毡层细胞和中层细胞的发育轨迹,并揭示了高温应激下花药细胞的异质性响应。 | NA | 研究花药发育过程中的空间表达图谱和调控动态,以及高温应激下的响应机制。 | 棉花花药中的不同细胞类型及其在高温应激下的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4802 | 2024-08-28 |
ST2+ T-regulatory Cells in Renal Inflammation and Fibrosis following Ischemic Kidney Injury
2024-Aug-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000471
PMID:39186386
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研究论文 | 本研究探讨了IL-33/ST2信号通路在调节性T细胞(Tregs)中对肾脏损伤修复的作用 | 首次研究了内源性IL-33/ST2在Tregs中对肾脏损伤修复的贡献 | NA | 探讨IL-33/ST2信号通路在Tregs中对肾脏损伤修复的作用 | 肾脏炎症和纤维化 | NA | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了小鼠肾脏缺血-再灌注损伤模型和肾脏类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 4803 | 2024-08-28 |
Lamc1 promotes osteogenic differentiation and inhibits adipogenic differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-08-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69629-4
PMID:39179716
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓间充质干细胞(BMSCs)晚期分化的分子机制,并鉴定了四个关键基因Lamc1、Tln2、Hexb和St3gal5在BMSCs分化中的作用 | 首次揭示了Lamc1在BMSCs晚期分化中的重要作用,并验证了其在脂肪形成和骨形成中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和单细胞RNA测序数据,未进行体内实验验证 | 阐明骨髓间充质干细胞晚期分化的关键生物过程 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)的晚期分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分析了约14天的骨髓间充质干细胞在成骨、成脂和软骨分化后的公共转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4804 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling reveals altered immune landscape and impaired NK cell function in gastric cancer liver metastasis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03114-0
PMID:39060439
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胃癌肝转移的免疫景观,揭示了肿瘤免疫微环境中多种免疫抑制成分的变化,并发现NK细胞功能受损与TGFβ的诱导有关 | 首次揭示胃癌肝转移中免疫微环境的详细变化,并发现TGFβ在NK细胞功能障碍中的作用,提出联合TGFβ抑制和NK细胞免疫疗法的新策略 | NA | 探讨胃癌肝转移的免疫景观及其对患者预后的影响 | 胃癌肝转移中的免疫细胞及其功能 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌肝转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4805 | 2024-08-28 |
CD28-expressing δ T cells are increased in perivascular adipose tissue of hypertensive mice and in subcutaneous adipose tissue of obese humans
2024-Jul-01, Journal of hypertension
IF:3.3Q1
DOI:10.1097/HJH.0000000000003725
PMID:38704218
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研究论文 | 本研究探讨了高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织(MV/PVAT)和肥胖人类皮下脂肪组织(SAT)中表达CD28的δ T细胞的增加情况。 | 首次揭示了在高血压小鼠和肥胖人类中,CD28高表达的δ T效应记忆细胞的增加,并提出了这些细胞可能在肥胖相关高血压中具有致病作用。 | 研究仅限于小鼠模型和人类样本,可能需要更多种类的样本和更广泛的人群来验证结果。 | 验证高血压小鼠和肥胖人类中γδ T细胞亚型的相似性,并探讨这些细胞在高血压发展中的作用。 | 高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织和肥胖人类的皮下脂肪组织中的γδ T细胞。 | 免疫学 | 高血压 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠实验包括高血压小鼠的MV/PVAT T细胞;人类实验包括三名瘦女性和三名肥胖女性的SAT CD45+细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 4806 | 2024-08-28 |
Single cell RNA-sequencing reveals the cellular senescence of placental mesenchymal stem/stromal cell in preeclampsia
2024-05, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2024.03.014
PMID:38588616
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老特征,并鉴定了与子痫前期相关的特征基因CTSZ | NA | 揭示子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 胎盘间充质干细胞/基质细胞在子痫前期中的细胞衰老 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的多个数据集,包括GSE173193、GSE99007和GSE75010 | NA | NA | NA | NA |
| 4807 | 2024-08-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals association of aberrant placental trophoblasts and FN1 reduction in late-onset fetal growth restriction
2024-02, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2023.12.022
PMID:38160601
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了异常胎盘滋养层细胞与FN1减少在晚发型胎儿生长受限中的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胎盘细胞的异质性,并探讨了滋养层亚型在胎儿生长受限发病机制中的细胞和分子水平作用 | 研究样本量较小,仅包括四名孕妇的胎盘样本,可能影响结果的普遍性 | 旨在表征胎盘细胞在单细胞水平的异质性,并研究滋养层亚型在胎儿生长受限发病机制中的作用 | 胎盘细胞,特别是滋养层细胞及其亚型 | 数字病理学 | 胎儿生长受限 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 39,161个细胞,来自两名正常孕妇和两名患有胎儿生长受限的孕妇的胎盘 | NA | NA | NA | NA |
| 4808 | 2024-08-28 |
MZB1-expressing cells are essential for local immunoglobulin production in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-02, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2023.10.008
PMID:37852603
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研究论文 | 研究MZB1阳性B细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)中的作用及其对局部免疫球蛋白过度产生的影响 | 首次揭示了MZB1在CRSwNP中与局部IgE产生的关系,并通过单细胞RNA测序等技术详细分析了MZB1阳性B细胞的特征 | 研究主要集中在CRSwNP患者,可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他疾病或更广泛的人群 | 探讨MZB1阳性B细胞在CRSwNP中的作用及其对局部免疫球蛋白产生的影响 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者中的MZB1阳性B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学,免疫荧光染色,Western blot,QuantiGene Plex assay,B-cell ImmunoSpot assay,Luminex assay,酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | CRSwNP患者与健康对照组的鼻组织和外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4809 | 2024-08-28 |
Single-cell RNA sequencing of aging neural progenitors reveals loss of excitatory neuron potential and a population with transcriptional immune response
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1400963
PMID:39184324
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了衰老神经前体细胞的转录变化,发现兴奋性神经元潜能的丧失及具有转录免疫反应的细胞群 | 首次在单细胞水平上比较了不同神经发生区域的前体细胞转录谱,并揭示了衰老相关炎症对这些细胞的影响 | NA | 探究衰老过程中神经前体细胞的转录变化及其与衰老相关炎症的关系 | 成年小鼠大脑中的神经干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4810 | 2024-08-28 |
Characteristics and impact of infiltration of B-cells from systemic sclerosis patients in a 3D healthy skin model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373464
PMID:39185406
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研究论文 | 研究了系统性硬化症(SSc)患者B细胞与健康皮肤模型中成纤维细胞的相互作用及其影响 | 首次展示了激活的B细胞改变了健康和SSc成纤维细胞的转录组特征,向促炎(TNF和IL-17信号传导)和干扰素特征转变 | NA | 探讨B细胞与成纤维细胞在组织水平上的相互作用及其机制 | 系统性硬化症患者B细胞与三维重建的健康皮肤模型中的成纤维细胞、角质形成细胞和细胞外基质的共培养 | NA | 系统性硬化症 | 细胞成像策略、流式细胞术、批量和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4811 | 2024-08-27 |
Exploring the Influence of T Cell Marker Gene Expression on the Pathobiology and Clinical Prognostic Outcomes in Intestinal-Type Gastric Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-024-01104-9
PMID:39136893
|
研究论文 | 本研究探讨了T细胞标记基因表达在肠型胃癌病理生物学和临床预后中的作用 | 开发了一种基于T细胞标记基因的风险评分,用于胃癌患者的生存预测 | NA | 阐明免疫系统,特别是T细胞及其亚型在肠型胃癌发病和进展中的作用,并评估基于T细胞标记基因的风险评分对总体生存的预测效用 | 肠型胃癌患者的T细胞标记基因表达及其对生存预后的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱(TCGA)和GSE15459数据集的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4812 | 2024-08-27 |
Connectivity Network Feature Sharing in Single-Cell RNA Sequencing Data Identifies Rare Cells
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00796
PMID:39096508
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCLCNF的新方法,通过分析单细胞RNA测序数据中的局部连接网络特征共享来识别稀有细胞 | SCLCNF通过创建细胞连接网络并利用稀有性评分来识别稀有细胞,相较于现有技术在检测稀有细胞方面表现更优 | NA | 开发一种新方法以克服传统方法在检测稀有细胞时的不足 | 稀有细胞的识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类胚胎数据集和脓毒症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4813 | 2024-08-27 |
scSwinFormer: A Transformer-Based Cell-Type Annotation Method for scRNA-Seq Data Using Smooth Gene Embedding and Global Features
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00616
PMID:39101690
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的深度学习方法scSwinFormer,用于大规模scRNA-seq数据的细胞类型注释 | scSwinFormer通过平滑基因嵌入模块和自注意力模块捕获基因间的潜在依赖关系,并利用Cell Token整合scRNA-seq数据中的全局信息,提高了细胞类型注释的准确性 | NA | 开发一种新的细胞类型注释方法,以提高scRNA-seq数据分析的准确性 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | Transformer | 文本 | 多个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4814 | 2024-08-27 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals that the IRF7 gene in M1 macrophages inhibits the occurrence of pancreatic cancer by regulating lipid metabolism-related mechanisms
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1799
PMID:39118300
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合空间转录组学技术,揭示了M1巨噬细胞中的IRF7基因通过调控脂质代谢相关机制抑制胰腺癌的发生 | 首次揭示了IRF7在M1巨噬细胞中通过抑制RPS18的转录和转移,进而影响胰腺癌细胞中ILF3的表达,从而抑制脂质代谢和细胞增殖等过程 | 研究主要基于数据库中的scRNA-seq和ST数据,未涉及临床样本的直接验证 | 探索IRF7在M1巨噬细胞中调控RPS18转录的分子机制,以及IRF7通过外泌体传递RPS18至胰腺癌细胞并调控ILF3表达的过程 | M1巨噬细胞中的IRF7基因、RPS18基因、ILF3表达及胰腺癌细胞的脂质代谢 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、流式细胞术、CRISPR/Cas9编辑技术、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的scRNA-seq和ST数据,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 4815 | 2024-08-26 |
Effects of tumor treating fields (TTFields) on human mesenchymal stromal cells
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04740-0
PMID:38900237
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研究论文 | 研究肿瘤治疗场(TTFields)对人类间充质基质细胞(MSCs)的影响 | 首次探讨了TTFields对MSCs的影响,填补了该领域的知识空白 | 仅在体外进行了实验,尚未在临床环境中验证 | 研究TTFields对间充质基质细胞的生物学效应 | 人类间充质基质细胞(MSCs) | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、Boyden室实验 | NA | 细胞 | 患者样本中的间充质基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4816 | 2024-08-07 |
Unlocking Skin's Symphony: Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal the Harmonious Interplay among Diverse Cell Populations
2024-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.01.039
PMID:38678464
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4817 | 2024-08-26 |
Mitochondrial DNA Leakage Promotes Persistent Pancreatic Acinar Cell Injury in Acute Pancreatitis via the cGAS-STING-NF-κB Pathway
2024-Aug-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02132-0
PMID:39180578
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研究论文 | 研究探讨了线粒体DNA泄漏通过cGAS-STING-NF-κB途径在急性胰腺炎中促进胰腺腺泡细胞损伤的作用 | 首次研究了cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的潜在炎症机制 | NA | 探讨cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的机制 | 急性胰腺炎患者的血浆和胰腺腺泡细胞 | NA | 急性胰腺炎 | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 血浆, 细胞 | 50名急性胰腺炎患者和10名健康捐赠者的血浆, 以及小鼠和细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4818 | 2024-08-26 |
Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes
2024-Aug-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.038
PMID:39047727
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研究论文 | 本文通过整合来自19种主要癌症类型的649名患者的单细胞RNA测序数据,建立了一个全面的人类B细胞资源,并揭示了肿瘤浸润B细胞(TIBs)的组成和表型特征的显著异质性 | 本文首次识别出应激反应记忆B细胞和肿瘤相关非典型B细胞(TAABs),这两种肿瘤富集亚群具有预后潜力,并在泛癌种中共享 | NA | 深入理解B细胞在癌症发展中的作用 | 肿瘤浸润B细胞(TIBs)的组成和表型特征 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 649名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4819 | 2024-08-26 |
Prognositic value of anoikis and tumor immune microenvironment-related gene in the treatment of osteosarcoma
2024-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了与肿瘤免疫微环境相关的细胞凋亡(anoikis)基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 首次在骨肉瘤中研究了anoikis及其与肿瘤免疫微环境的关系,并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 阐明anoikis及肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 骨肉瘤患者及其肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 51个与肿瘤微环境密切相关的关键anoikis相关基因(ANRGs) | NA | NA | NA | NA |
| 4820 | 2024-08-25 |
A highly neutralizing human monoclonal antibody targeting a novel linear epitope on staphylococcal enterotoxin B
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2024.2360338
PMID:38857905
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs中鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487,并通过X射线晶体学和功能研究验证了其高效中和SEB的能力 | 本研究首次鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487,并揭示了其通过别构效应而非竞争受体结合位点来中和SEB的机制 | NA | 研究旨在发现和验证一种新型的人源单克隆抗体,用于中和SEB的毒性及其引起的感染 | SEB毒素及其引起的中毒性休克综合征 | NA | 中毒性休克综合征 | 单细胞测序,X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs | NA | NA | NA | NA |