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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-08-04 |
Disease-specific T cell receptors maintain pathogenic T helper cell responses in postinfectious Lyme arthritis
2024-07-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179391
PMID:38963700
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研究论文 | 本研究通过高通量T细胞受体测序和单细胞RNA测序,揭示了感染后莱姆关节炎中疾病特异性T细胞受体维持致病性T辅助细胞反应的分子机制 | 首次在欧洲队列中鉴定出与HLA-DRB1*11或*13等位基因相关的特异性TCR-β基序,并将其作为疾病特异性T细胞的替代标志物,连接了TCR特异性与转录模式 | 未明确提及局限性,但可能包括样本量、地域差异或无法直接验证抗原特异性 | 阐明抗生素难治性莱姆关节炎中疾病特异性T辅助细胞的分子程序 | 欧洲ARLA患者关节中的CD4+ T辅助细胞 | 免疫学, 单细胞测序 | 莱姆关节炎 | 流式细胞术, 高通量T细胞受体测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | 未明确提供具体数字,但涉及欧洲ARLA患者关节样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序用于CD4+ T细胞转录组分析 |
| 462 | 2026-08-04 |
Unveiling mitochondrial and ribosomal gene deregulation and tumor microenvironment dynamics in acute myeloid leukemia
2024-07, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00788-2
PMID:38806621
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研究论文 | 通过重新分析急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据,揭示了线粒体和核糖体基因的失调以及肿瘤微环境的动态变化,并构建了预后模型 | 利用基于机器学习的scVI工具和WGCNA分析,识别出与有氧呼吸和核糖体/胞质翻译相关的基因模块失调,并通过CellChat揭示免疫信号通路的失衡,构建了基于10个基因的Cox和人工神经网络预后模型 | 未提供明确的局限性信息 | 理解白血病细胞与肿瘤微环境的相互作用,以预测预后并指导治疗 | 急性髓系白血病患者样本中的造血干细胞、多能祖细胞和自然杀伤细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, 人工神经网络 | 单细胞基因表达数据 | CSC和G20队列,具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2026-08-04 |
Single-cell RNA sequencing in exploring the pathogenesis of diabetic retinopathy
2024-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1751
PMID:38946005
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在探索糖尿病视网膜病变发病机制中的应用,涵盖差异表达基因鉴定、关键细胞亚群特征、细胞间通讯研究和与全基因组关联研究的整合,并讨论了未来挑战和期望 | 系统总结了scRNA-seq在DR研究中的四个关键应用方向,并强调了其与全基因组关联研究整合以识别与DR风险遗传位点最相关细胞类型的创新方法 | 未提及具体局限性,但讨论了未来挑战,如需要针对特定患者亚群和整合单细胞与空间多组学方法 | 总结scRNA-seq在探究糖尿病视网膜病变发病机制中的应用,并展望未来研究方向 | 糖尿病视网膜病变患者、非人灵长类动物和常用小鼠模型 | 基因组学, 单细胞生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 未明确说明具体样本数量,但提及了患者、非人灵长类和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 464 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1671
PMID:38924689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2026-08-04 |
The ω-3 Polyunsaturated Fatty Acid Docosahexaenoic Acid Enhances NK-Cell Antitumor Effector Functions
2024-06-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0359
PMID:38526128
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研究论文 | 本研究探讨了ω-3多不饱和脂肪酸二十二碳六烯酸(DHA)通过增强NK细胞的抗肿瘤效应功能来抑制肿瘤生长的免疫调节作用 | 首次从免疫调节角度揭示DHA通过上调NK细胞中PGC-1α信号介导的线粒体氧化磷酸化活性来增强其抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,未在人体中进行验证;且未深入探讨DHA对其他免疫细胞类型的潜在长期影响 | 探究DHA是否通过免疫调节,特别是增强NK细胞功能,来抑制肿瘤生长 | 小鼠模型中的自然杀伤(NK)细胞,以及B16F10黑色素瘤肿瘤模型 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,涉及小鼠模型和体外NK细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2026-08-04 |
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1735
PMID:38899748
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示线粒体外膜透化(MOMP)活性对免疫调节和免疫治疗响应的积极作用,并识别免疫治疗耐药潜在靶点 | 首次进行MOMP活性的泛癌综合分析,开发了MOMP.Sig特征以精确反映肿瘤MOMP活性,并整合CRISPR筛选识别FOXO1作为免疫治疗耐药的核心调节因子 | 未明确提及局限性 | 探讨肿瘤MOMP活性对免疫微环境和免疫治疗的影响,并识别克服免疫治疗耐药的潜在靶点 | 30种癌症类型的转录组队列、20个免疫治疗转录组队列、三个免疫治疗scRNA-seq数据集、65个scRNA-seq数据集以及皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌患者的临床免疫治疗队列 | 机器学习 | 泛癌(包括皮肤黑色素瘤、三阴性乳腺癌) | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 30种癌症类型的转录组队列、20个免疫治疗转录组队列、3个免疫治疗scRNA-seq数据集、65个scRNA-seq数据集、2个临床免疫治疗队列 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2026-08-04 |
miR-124-3p and miR-194-5p regulation of the PI3K/AKT pathway via ROR2 in medulloblastoma progression
2024-06, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00762-y
PMID:38632356
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,发现miR-124-3p和miR-194-5p通过调控ROR2/PI3K/AKT通路抑制髓母细胞瘤进展 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定ROR2在正常人类胎儿小脑中的表达,并揭示miR-124-3p和miR-194-5p协同调控ROR2/PI3K/AKT通路的新机制 | 未提及具体局限性 | 探究miRNAs在髓母细胞瘤发生发展中的具体作用机制 | 人类胎儿小脑组织、髓母细胞瘤组织及细胞系 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、qRT-PCR、Western blot、双荧光素酶报告基因 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2026-08-04 |
Living in Syn: T Cell Antigen Identification Based on Synapse Sequencing
2024-05-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0239
PMID:38557780
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评论文章 | 本文评论了Jin等人开发的新型T细胞抗原发现平台Tsyn-seq,该平台基于测序TCR-肽-HLA诱导的突触进行全基因组表位筛选 | 介绍了基于突触测序的T细胞抗原发现新平台Tsyn-seq,该平台通过测序TCR-肽-HLA诱导的突触实现全基因组表位筛选 | 文中未提及具体局限性 | 评论一种新的T细胞抗原发现平台Tsyn-seq及其在表位筛选中的应用 | T细胞受体与肽-HLA复合物诱导的突触 | 生物信息学、免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、突触测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2026-08-04 |
Single-cell atlas reveals the immunosuppressive microenvironment and Treg cells landscapes in recurrent Glioblastoma
2024-05, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00740-4
PMID:38429367
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示复发性胶质母细胞瘤的免疫抑制微环境及调节性T细胞景观,并比较肿瘤与脑脊液样本。 | 首次在单细胞水平比较复发性胶质母细胞瘤的肿瘤组织和脑脊液免疫微环境,发现S100A9作为潜在的诊断和复发生物标志物。 | 样本量小,仅来自两名患者,可能限制结果的普遍性。 | 揭示复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境,并探索脑脊液中的潜在生物标志物。 | 复发性胶质母细胞瘤患者和脑肿瘤患者的肿瘤及脑脊液样本。 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自2名患者的4份临床样本(1例复发性胶质母细胞瘤恶性样本,1例脑肿瘤非恶性样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2026-08-04 |
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-04, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00738-y
PMID:38291129
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌患者配对正常、原发肿瘤和转移淋巴结组织的H3K9ac全基因组图谱,揭示了H3K9ac特异性表观遗传重编程在肿瘤进展和转移中的作用 | 首次系统描绘了H3K9ac在食管鳞状细胞癌中的全基因组景观,并发现与H3K27ac不同的H3K9ac特异性重编程模式,且该模式与肿瘤发生和转移密切相关 | 样本量较小,仅来自三名患者;研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内功能验证 | 阐明H3K9ac乙酰化在食管鳞状细胞癌进展和转移中的具体作用及其表观遗传调控机制 | 食管鳞状细胞癌患者的配对正常组织、原发肿瘤组织和转移淋巴结组织 | 表观遗传学 | 食管鳞状细胞癌 | ChIP-seq、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 3名食管鳞状细胞癌患者的配对组织样本(正常、肿瘤、转移淋巴结) | NA | ChIP-seq、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2026-08-04 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-04, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示施万细胞来源的多效生长因子(PTN)通过PTN/NCL/PRAS40轴促进神经纤维瘤相关成纤维细胞增殖和胶原沉积的机制 | 首次在丛状神经纤维瘤中阐明施万细胞与成纤维细胞间的PTN/NCL/PRAS40信号轴作用,并通过功能实验验证其调控胶原合成的机制,为靶向治疗提供新思路 | 研究主要基于体外实验和单细胞数据,缺乏体内动物模型验证,且未涉及其他潜在信号通路或细胞类型的相互作用 | 阐明丛状神经纤维瘤中施万细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞间的分子交互机制,并探索潜在治疗靶点 | 人类丛状神经纤维瘤样本中的施万细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序、共培养模型、重组蛋白实验、CCK8、EdU、Western Blot、ELISA、羟脯氨酸测定、磷酸化激酶阵列、siRNA | NA | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 人类丛状神经纤维瘤样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2026-08-04 |
Single-Cell Sequencing of 3' RNA Transcripts
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_16
PMID:38907922
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研究论文 | 本文描述了一种通过单细胞封装和捕获mRNA转录本3'端多聚腺苷酸尾,结合细胞和分子条形码进行单细胞RNA测序的方法,以识别细胞中表达的基因。 | 该方法通过捕获3'端转录本并结合细胞和分子条形码,实现了对单细胞RNA的高通量测序,能够分析细胞状态、亚型和疾病中的细胞行为。 | 未在摘要中提及限制。 | 开发一种用于单细胞RNA测序的方法,以测量单个细胞的RNA表达谱。 | 单个细胞中的RNA转录本。 | 单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | RNA序列数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 473 | 2026-08-04 |
Sequencing: 10X Genomics 3' HT Assay for Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_15
PMID:38907921
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研究论文 | 本文介绍了10X Genomics 3' HT assay用于单细胞RNA测序的方法,涵盖样品质量控制、Chromium X仪器操作、cDNA合成及文库制备等步骤 | 该3' HT assay相比前代3' v3.1,具有更高数量的细胞条形码、新型专有芯片(每通道可靶向多达60,000个细胞)以及每次运行最多16个样品的捕获能力,并支持全细胞和细胞核输入 | 未在摘要中明确提及局限性,可能包括捕获率约60%并非100%等潜在限制 | 描述10X Genomics 3' HT assay的实验方法,以支持单细胞基因表达分析 | 单细胞或细胞核,用于基因表达分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达序列和细胞条形码数据 | 每个通道最多60,000个细胞,每次运行最多16个样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium X | 3' HT assay,使用液滴法分离细胞,凝胶珠带有独特条形码引物,支持全细胞和细胞核输入,捕获率约60% |
| 474 | 2026-08-04 |
Exploring the resistance mechanism of triple-negative breast cancer to paclitaxel through the scRNA-seq analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297260
PMID:38227591
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制 | 利用scRNA-seq数据结合伪时间分析和SCENIC分析,首次鉴定出与紫杉醇耐药相关的三个关键转录因子(STAT1、CEBPB和IRF7)及其抑制剂作为潜在联合治疗策略 | 该研究基于公共数据库的转录组数据,缺乏实验验证;样本量较小,且未涉及临床样本验证 | 探究三阴性乳腺癌对紫杉醇化疗耐药的分子机制,寻找新的治疗靶点 | 紫杉醇处理不同时间点的三阴性乳腺癌细胞(HCC1143细胞系) | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2798个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2026-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals a novel subtype of hepatocellular carcinoma with biological and clinical relevance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517312
PMID:39712016
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研究论文 | 整合多组学分析揭示肝细胞癌的一个具有生物学和临床意义的新亚型 | 通过整合多组学数据(包括bulk RNA-seq、蛋白质组学、单细胞RNA-seq、空间转录组和基因组测序)识别出与肿瘤纯度和肿瘤微环境风险相关的新的HCC亚型XPO1+上皮细胞,并通过功能富集、转录因子活性、细胞互作、药物敏感性和突变分析进行了全面验证 | 未明确提及局限性 | 构建肝细胞癌的预后风险预测模型,并识别新的亚型以改善预后评估和个性化药物治疗 | 肝细胞癌患者样本,包括实验室数据和公共队列 | 多组学分析 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序,空间转录组测序,基因组测序 | 预后风险模型(基于肿瘤纯度和肿瘤微环境) | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因组数据,临床数据 | 来自实验室和公共队列的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq,蛋白质组学,单细胞RNA-seq,空间转录组测序,基因组测序 | NA | NA |
| 476 | 2026-08-04 |
Exploring the heterogeneity of osteosarcoma cell characteristics and metabolic states and their association with clinical prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507476
PMID:39712023
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研究论文 | 本研究利用RNA测序和单细胞RNA测序数据,探索骨肉瘤细胞异质性和代谢状态及其与临床预后的关联 | 通过单细胞测序分析骨肉瘤细胞的代谢异质性,并结合WGCNA和风险特征模型,提供了新的预后评估和治疗靶点视角 | 研究基于公共数据库的数据,样本量有限,且未进行体外或体内实验验证 | 阐明骨肉瘤的分子机制和代谢特征,及其与患者预后的关系,为靶向治疗和预后评估提供新方法 | 骨肉瘤样本和健康对照的RNA测序数据及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 风险特征模型(基于基因表达) | 基因表达数据 | 9个样本(单细胞测序),患者数据来自多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2026-08-04 |
Effects of PGK1 on immunoinfiltration by integrated single-cell and bulk RNA-sequencing analysis in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1449975
PMID:39712033
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序分析,研究PGK1在脓毒症中的表达及其对免疫浸润的影响 | 首次揭示PGK1作为脓毒症的新型诊断生物标志物,并通过单细胞和批量RNA测序数据的综合分析阐明其在免疫调节中的作用 | 文章未明确提及局限性 | 探究PGK1在脓毒症中的表达水平及其与免疫细胞浸润的相关性,评估其作为诊断生物标志物的潜力 | 脓毒症患者和健康对照的血液样本及GEO数据库中的微阵列和RNA测序数据 | 基因组学 | 脓毒症 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序、定量实时PCR、蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个数据集,具体样本数未说明 | NA | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2026-08-04 |
Innovative strategies to optimise colorectal cancer immunotherapy through molecular mechanism insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1509658
PMID:39717768
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌组织样本,识别关键肿瘤亚型和预后基因,构建风险评分模型以优化免疫治疗策略 | 基于单细胞RNA测序识别出与癌症进展和不良预后显著相关的C0 FXYD5+肿瘤细胞亚型,并通过体外实验验证DLX2作为潜在治疗靶点 | 样本量较小,仅来自4名患者,且未进行体内验证 | 通过分子机制分析优化结直肠癌的免疫治疗策略 | 4名结直肠癌患者的13份组织样本 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 13份组织样本(来自4名患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2026-08-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional changes in circulating immune cells from patients with severe asthma induced by biologics
2024-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01368-y
PMID:39672815
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析重症嗜酸性哮喘患者在使用生物制剂治疗前后外周血免疫细胞的转录变化。 | 首次在重症哮喘患者中描述抗IL5和抗IL4Rα生物制剂对循环免疫细胞基因表达的影响,并发现NF-κB通路在多种细胞类型中受抑制。 | 样本量小,未识别与治疗反应和长期结果相关的生物标志物。 | 描述T2靶向生物制剂对血液免疫细胞基因表达的影响。 | 八名重症嗜酸性哮喘患者的外周血单核细胞(PBMCs)。 | 基因组学 | 重症哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 8名患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 480 | 2026-08-01 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 对人胚胎干细胞在培养过程中出现的遗传和表观遗传变化进行了纵向分析,揭示了“培养适应表型”获得的分子机制 | 首次通过同基因人胚胎干细胞模型,结合基因组、单细胞转录组和单细胞ATAC-seq分析,阐明了20q11.21拷贝数增加及表观遗传改变在触发“培养适应表型”中的协同作用 | 未明确提及 | 探究人胚胎干细胞在体外培养中获得“培养适应表型”的分子机制,特别是遗传和表观遗传变化的作用 | 人胚胎干细胞(hESCs)及其同基因模型 | 基因组学、单细胞转录组学、表观遗传学 | 不适用 | 基因组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |