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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4761 | 2024-08-22 |
Identification and validation of tryptophan-related gene signatures to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma reveals a critical role for PTTG1
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1386427
PMID:39144144
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研究论文 | 本研究通过分析色氨酸代谢相关基因,构建了预测肺腺癌预后和免疫治疗反应的模型,并探讨了PTTG1在其中的关键作用 | 首次揭示了色氨酸代谢在肺腺癌中的模式和分子特征,并建立了色氨酸代谢相关的肺腺癌预后模型 | NA | 研究色氨酸代谢在肺腺癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个数据集,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 4762 | 2024-08-22 |
Development of a Novel CD8+ T Cell-Associated Signature for Prognostic Assessment in Hepatocellular Carcinoma
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748241270583
PMID:39152700
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研究论文 | 本研究旨在分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌(HCC)中的临床意义和预后价值 | 构建了一个新的8基因CD8+ T细胞相关签名,用于肝细胞癌的预后评估 | NA | 分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的临床意义和预后价值 | CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 组织微阵列, CIBERSORT算法 | Lasso-Cox回归分析 | RNA测序数据 | 使用了TCGA-LIHC和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4763 | 2024-08-22 |
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309076
PMID:39159158
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研究论文 | 本研究旨在开发基于G0停滞(G0A)相关基因的肺腺癌(LUAD)患者基因特征,并探讨其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 | 成功建立了一个包含六个基因(CHCHD4, DUT, LARP1, PTTG1IP, RBM14, 和 WBP11)的特征,该特征对LUAD患者的总体生存具有显著的预测能力,并显示出独立的预后价值 | NA | 开发肺腺癌患者的基因特征,并研究其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | qRT-PCR | Cox和lasso回归模型 | 转录组数据 | 使用TCGA-LUAD数据库作为发现队列,验证模型使用了多个转录组数据集(GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907 和 EMTAB6149) | NA | NA | NA | NA |
| 4764 | 2024-08-22 |
The single-cell atlas of the epididymis in mice reveals the changes in epididymis function before and after sexual maturity
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1440914
PMID:39161591
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞,揭示了附睾功能在性成熟前后的变化 | 首次构建了小鼠附睾的单细胞图谱,并分析了主要细胞类型在性成熟前后的功能变化 | NA | 探究附睾在性成熟前后的功能变化及其对精子成熟和免疫反应的影响 | 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4765 | 2024-08-22 |
Combining Bulk and Single Cell RNA-Sequencing Data to Identify Hub Genes of Fibroblasts in Dilated Cardiomyopathy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S470860
PMID:39161677
|
研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别扩张型心肌病中成纤维细胞的关键基因 | 本研究首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,通过细胞间通信网络和活性分析,筛选出与扩张型心肌病相关的重要细胞和基因 | 本研究主要基于公开数据集,未来需进一步在更大规模和多样性的样本中验证结果 | 揭示扩张型心肌病的病理生理机制 | 扩张型心肌病中的成纤维细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4766 | 2024-08-21 |
Integrative analysis of single-Cell RNA sequencing and experimental validation in the study of abdominal aortic aneurysm progression
2024-Dec-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148820
PMID:39103059
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序数据和实验验证,探讨腹主动脉瘤进展中的细胞相互作用和分子机制 | 通过单细胞RNA测序和细胞间相互作用分析,揭示了腹主动脉瘤中特定的配体-受体对在疾病发生中的关键作用 | NA | 理解腹主动脉瘤发展的细胞相互作用和分子机制,以识别潜在的治疗靶点 | 腹主动脉瘤及其对照样本的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE197748、GSE164678和GSE183464数据集,包括腹主动脉瘤和对照样本的单细胞和批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4767 | 2024-08-21 |
Comparative assessment of the intragenomic variations of dinoflagellate Tripos species through single-cell sequencing
2024-Sep, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2024.116690
PMID:39024906
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术评估和比较了三角藻属(Tripos)物种的基因组内变异(IGVs) | 首次使用高通量测序(HTS)对Tripos物种的18S rDNA V4区域进行单细胞测序,揭示了高水平的基因组内变异 | 研究仅限于Tripos物种的30个单细胞,可能无法代表所有Tripos物种的基因组内变异情况 | 评估和比较Tripos物种的基因组内变异,探讨其在分子多样性分析中的影响 | Tripos物种的基因组内变异 | 生物信息学 | NA | 高通量测序(HTS) | NA | DNA序列 | 30个Tripos物种的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4768 | 2024-08-21 |
Targeting mitochondrial dysfunction in atopic dermatitis with trilinolein: A triacylglycerol from the medicinal plant Cannabis fructus
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155856
PMID:39024674
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研究论文 | 本研究探讨了从药用植物大麻果实中提取的三亚油酸甘油酯(trilinolein)在治疗特应性皮炎(AD)中的作用及其机制 | 首次揭示了trilinolein通过AhR-Nrf2途径减轻NOX2依赖的线粒体功能障碍,修复皮肤屏障 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上,尚未进行人体临床试验 | 评估trilinolein在预防和治疗特应性皮炎中的潜力及其作用机制 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤样本,以及DNCB诱导的BALB/c小鼠和IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 | NA | 特应性皮炎 | HPLC-ESI-MS/MS分析,单细胞转录组分析,蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质表达数据 | 慢性AD患者和健康对照者的皮肤样本,DNCB诱导的BALB/c小鼠,IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4769 | 2024-08-21 |
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101095
PMID:38986165
|
研究论文 | 本研究探讨了FAT1基因突变与头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者免疫治疗反应之间的关系 | 发现FAT1基因突变与HNSCC患者对免疫治疗的抵抗性相关,并涉及多个代谢相关通路 | 样本量较小,仅包括33名HNSCC患者 | 研究肿瘤突变负荷(TMB)特异性基因如何影响头颈部鳞状细胞癌的免疫治疗效果 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 下一代测序(NGS) | NA | 转录组数据 | 33名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4770 | 2024-08-21 |
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101116
PMID:38968684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,发现具有上皮-间质转化(EMT)特征的尿路上皮细胞亚群(EMT-UC)与化疗耐药和癌症复发显著相关,并验证了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进肿瘤血管生成的作用。 | 首次揭示了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进尿路上皮癌化疗耐药和复发的机制。 | EMT-UC不仅在肿瘤组织中被识别,也在邻近的正常组织中被发现,这限制了对EMT-UC特异性的理解。 | 探究尿路上皮癌化疗耐药和复发的潜在机制。 | 尿路上皮细胞亚群(EMT-UC)及其在化疗耐药和癌症复发中的作用。 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自不良预后患者的尿路上皮癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4771 | 2024-08-21 |
Recryopreservation impairs blastocyst implantation potential via activated endoplasmic reticulum stress pathway and induced apoptosis
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.689
PMID:39156765
|
研究论文 | 本研究探讨了重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其机制 | 首次揭示了重复冷冻保存通过激活内质网应激途径和诱导细胞凋亡影响胚泡植入潜能的机制 | 研究样本仅来自一个学术生殖医学中心,可能限制了结果的普遍性 | 探究重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其分子机制 | 人类胚泡及其植入潜能 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、TUNEL检测 | NA | 细胞 | 捐赠的人类胚泡 | NA | NA | NA | NA |
| 4772 | 2024-08-21 |
Prognostic and immune infiltration implications of SIGLEC9 in SKCM
2024-Aug-17, Diagnostic pathology
IF:2.4Q2
DOI:10.1186/s13000-024-01536-8
PMID:39153970
|
研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC9在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的表达、预后及免疫相关性 | 首次详细分析了SIGLEC9在SKCM中的表达与患者预后及免疫细胞浸润的关系 | NA | 探究SIGLEC9在SKCM中的表达与患者预后及免疫细胞浸润的关系 | SIGLEC9在SKCM中的表达及其对患者预后和免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 基于TCGA-SKCM数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4773 | 2024-08-21 |
TLR9 activation in large wound induces tissue repair and hair follicle regeneration via γδT cells
2024-Aug-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06994-y
PMID:39153998
|
研究论文 | 本研究利用成年小鼠的伤口诱导毛发新生(WIHN)模型,探讨了损伤程度与愈合过程及结果之间的关联,并揭示了 toll 样受体 9(TLR9)在感知皮肤损伤和通过调节 γδT 细胞迁移影响组织修复和再生的新作用。 | 首次揭示了 TLR9 在感知皮肤损伤和通过调节 γδT 细胞迁移影响组织修复和再生的新作用,并识别了 TLR9-γδT 细胞-areg 轴作为增强组织再生的新潜在靶点。 | NA | 探讨损伤程度与愈合过程及结果之间的关联,并揭示 TLR9 在组织修复和再生中的作用。 | 成年小鼠的伤口诱导毛发新生(WIHN)模型。 | 免疫学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | RNA | TLR9 缺陷小鼠及伤口注射 TLR9 拮抗剂的小鼠,以及抑制 γδT 细胞迁移或敲除 γδT 细胞的小鼠。 | NA | NA | NA | NA |
| 4774 | 2024-08-21 |
Transcriptomic analysis unveils bona fide molecular signatures of microglia under conditions of homeostasis and viral encephalitis
2024-Aug-17, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03197-2
PMID:39153993
|
研究论文 | 本研究通过多种实验方法描绘了病毒感染期间小胶质细胞的转录组图谱,并发现细胞分选过程中的剪切应力是激活基因人工诱导的关键因素 | 开发了一种利用核糖体标签方法富集小胶质细胞特异性转录本的策略,并定义了健康和病毒感染条件下小胶质细胞的真实分子特征 | NA | 研究小胶质细胞在健康和病毒性脑炎条件下的转录组特征 | 小胶质细胞在健康和病毒感染条件下的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大规模 | NA | NA | NA | NA |
| 4775 | 2024-08-21 |
Combining single-cell spatial transcriptomics and molecular simulation to develop in vivo probes targeting the perineural invasion region of adenoid cystic carcinoma
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34628
PMID:39157355
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研究论文 | 本文通过结合单细胞空间转录组学和分子模拟技术,开发了一种针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针 | 设计了基于神经周围侵犯区域施万细胞抗原呈递特性的肽探针,用于动态标记肿瘤细胞侵入神经的过程 | NA | 开发针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针 | 腺样囊性癌的神经周围侵犯区域 | 数字病理学 | 头颈部肿瘤 | 空间转录组学和单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 一例腺样囊性癌伴有神经周围侵犯的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4776 | 2024-08-21 |
Identification of epithelial-related artificial neural network prognostic models for the prediction of bladder cancer prognosis through comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34632
PMID:39157397
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,识别出与膀胱癌预后相关的上皮细胞相关的人工神经网络预测模型 | 本研究创新性地融合了单细胞RNA测序和RNA测序评估,以识别膀胱癌的新型生物标志物,并构建了包含17个特征基因的人工神经网络预后模型 | NA | 旨在通过融合单细胞RNA测序和RNA测序评估,识别膀胱癌的潜在生物标志物,并建立实用的临床预后模型 | 膀胱癌(BLCA)及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | RNA测序数据 | 训练集来自TCGA数据库,验证集(GSE32894)和单细胞数据集(GSE135337)来自GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 4777 | 2024-08-21 |
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01885-y
PMID:38956380
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究了人类组织中第1组先天淋巴细胞(ILC1s)的多样性 | 首次在人类组织中识别出高度可变的ILC1亚型,并描述了不同组织中ILC1和自然杀伤(NK)细胞的表达谱 | NA | 探究人类组织中第1组先天淋巴细胞(ILC1s)的多样性及其在疾病中的潜在作用 | 人类组织中的第1组先天淋巴细胞(ILC1s)及其亚型 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA | 多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4778 | 2024-08-21 |
ScRNA-seq revealed the tumor microenvironment heterogeneity related to the occurrence and metastasis in upper urinary tract urothelial carcinoma
2024-Aug, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00779-3
PMID:38877164
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术,研究了上尿路上皮癌(UTUC)的肿瘤微环境异质性及其与发生和转移的关系 | 首次揭示了UTUC肿瘤细胞的起源及其与转移性肿瘤细胞的同源性,并发现UTUC肿瘤微环境中不存在免疫抑制现象 | 研究样本仅来自3名高级别UTUC患者,可能存在样本量较小的问题 | 探索UTUC发生和转移的可能机制,并寻找潜在的诊断和治疗靶点 | 上尿路上皮癌的正常组织、原发肿瘤病变和淋巴转移 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 28,315个细胞来自3名高级别UTUC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4779 | 2024-08-21 |
Mining alternative splicing patterns in scRNA-seq data using scASfind
2024-Jul-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03323-6
PMID:39075577
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASfind的新型计算方法,用于使用全长scRNA-seq数据进行细胞类型特异性剪接事件的定量分析 | scASfind利用高效的数据结构存储每个剪接事件的剪接入百分比值,使得能够全面搜索所有差异剪接事件中的模式 | NA | 开发一种新的计算方法,用于在scRNA-seq数据中定量分析细胞类型特异性的剪接事件 | scRNA-seq数据中的替代剪接模式 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4780 | 2024-08-21 |
Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01937-y
PMID:37667091
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研究论文 | 本文介绍了一种结合组织学、质谱成像和空间转录组学的空间多组学方法,用于在组织区域中精确测量mRNA转录物和小分子代谢物 | 该方法兼容市售的Visium玻璃载玻片,并展示了在多巴胺和帕金森病背景下对小鼠和人类脑样本的应用潜力 | NA | 开发一种新的空间多组学方法,以提高对组织中转录物和代谢物的测量精度 | 小鼠和人类脑样本,特别是在多巴胺和帕金森病的背景下 | 数字病理学 | 帕金森病 | 质谱成像 | NA | 图像 | 小鼠和人类脑样本 | NA | NA | NA | NA |