单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 4741 - 4760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4741 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing revealed the roles of macromolecule epidermal growth factor receptor (EGFR) in the hybrid sterility of hermaphroditic Argopecten scallops
2024-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136062
PMID:39341320
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了巨分子表皮生长因子受体（EGFR）在雌雄同体扇贝杂交不育中的作用 | 首次在杂交扇贝的性腺中进行全面的单细胞RNA测序，揭示了EGFR在杂交不育中的关键作用 | NA | 探讨EGFR在雌雄同体扇贝杂交不育中的遗传机制 | 雌雄同体扇贝的杂交不育性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌雄同体扇贝的杂交不育性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4742 | 2024-09-30 |
nsDCC: dual-level contrastive clustering with nonuniform sampling for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae477
PMID:39327063
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研究论文 | 提出了一种名为nsDCC的双层对比聚类方法，结合非均匀采样技术用于单细胞RNA测序数据分析 | 引入双层对比聚类方法，结合实例级和聚类级对比，同时优化降维和聚类任务，并通过非均匀采样和注意力机制增强模型性能 | NA | 开发一种新的方法来优化单细胞RNA测序数据的降维和聚类任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 对比聚类模型 | RNA测序数据 | 涉及真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4743 | 2024-09-30 |
Maximizing single cell dissociation protocol for individual zebrafish embryo
2024-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2024.102958
PMID:39329153
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鱼胚胎单细胞分离协议 | 提出了针对小鱼胚胎的高质量单细胞悬液分离方法 | NA | 优化单细胞分离技术，以研究细胞异质性和细胞状态 | 小鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单个小鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 4744 | 2024-09-30 |
Natural hydrogen gas and engineered microalgae prevent acute lung injury in sepsis
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101247
PMID:39328786
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研究论文 | 研究探讨了天然氢气和工程微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 提出了DQB@C作为一种新型生物纳米系统，具有治疗脓毒症相关急性肺损伤的巨大潜力 | NA | 整合氢气和生物纳米微藻，扩展脓毒症的治疗选择 | 研究氢气和微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 生物医学工程 | 脓毒症 | 磷酸蛋白质组学、代谢组学和蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4745 | 2024-09-30 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveal immune-related biomarkers in postmenopausal osteoporosis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38022
PMID:39328516
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研究论文 | 研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了绝经后骨质疏松症中的免疫相关生物标志物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出六个免疫相关差异表达基因（IR-DEGs），并构建了绝经后骨质疏松症的分子亚型和诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的数据，缺乏临床样本的验证 | 探讨绝经后骨质疏松症的免疫调节机制和早期诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序 | 随机森林（RF）、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）和LASSO回归模型 | RNA | 训练组使用GSE56815数据集，验证组使用GSE2208数据集，涉及单细胞RNA测序数据分析11个不同的细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 4746 | 2024-09-30 |
NOX2 mediates NLRP3/ROS facilitating nasal mucosal epithelial inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38029
PMID:39328569
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研究论文 | 本研究探讨了NOX2在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中通过NLRP3/ROS途径促进鼻黏膜上皮炎症的机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示了NOX2在CRSwNP中通过ROS积累和NLRP3炎症小体激活的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨氧化应激在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）鼻黏膜上皮细胞中的机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的鼻黏膜上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HRA000772数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4747 | 2024-09-30 |
Beyond the bulk: overview and novel insights into the dynamics of muscle satellite cells during muscle regeneration
2024-Sep-26, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00354-1
PMID:39327631
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综述 | 本文综述了肌肉卫星细胞在肌肉再生过程中的动态变化，并介绍了单细胞技术在研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，揭示了肌肉再生过程中肌肉卫星细胞的动态异质性 | NA | 综述肌肉卫星细胞在肌肉再生中的作用，并探讨单细胞技术带来的新见解 | 肌肉卫星细胞及其在肌肉再生中的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4748 | 2024-09-30 |
Single-cell dissection of the human blood-brain barrier and glioma blood-tumor barrier
2024-Sep-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.07.026
PMID:39191260
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研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序技术分析了人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人脑血脑屏障的分子图谱，并揭示了胶质母细胞瘤中血脑屏障的异常特征 | 研究样本仅限于13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织 | 探究人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征，并研究其在胶质母细胞瘤中的异常变化 | 人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织，共103,230个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4749 | 2024-09-30 |
Single-cell resolution profiling of the immune microenvironment in primary and metastatic nasopharyngeal carcinoma
2024-Aug-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05900-5
PMID:39158776
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对原发性和转移性鼻咽癌的免疫微环境进行了高分辨率分析 | 首次在单细胞水平上详细描述了鼻咽癌转移的进化动态及其对肿瘤微环境的影响 | NA | 研究鼻咽癌转移的进化路径及其免疫微环境的动态变化 | 原发性和转移性鼻咽癌患者的肿瘤样本及外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 24例原发性鼻咽癌、7例外周血单个核细胞鼻咽癌和7例转移性鼻咽癌患者的样本，共292,298个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4750 | 2024-09-30 |
Consensus clustering and development of a risk signature based on trajectory differential genes of cancer-associated fibroblast subpopulations in colorectal cancer
2024-Aug-09, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05906-z
PMID:39120743
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞亚群在结直肠癌中的轨迹差异，并通过共识聚类和机器学习构建了风险特征 | 首次基于癌症相关成纤维细胞亚群的轨迹差异基因进行共识聚类，并开发了高风险特征签名 | 研究主要基于批量和单细胞测序数据，未涵盖所有可能的成纤维细胞亚群 | 探讨癌症相关成纤维细胞亚群在结直肠癌中的作用，并开发新的预后标志物 | 结直肠癌患者的癌症相关成纤维细胞亚群及其轨迹差异基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4751 | 2024-09-30 |
Cryopreservation of cerebrospinal fluid cells preserves the transcriptional landscape for single-cell analysis
2024-Mar-23, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03047-1
PMID:38521932
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研究论文 | 研究探讨了不同冷冻保存方法对脑脊液细胞单细胞RNA测序结果的影响 | 首次比较了三种不同冷冻保存方法对脑脊液细胞单细胞RNA测序结果的影响，发现冷冻保存方法对细胞类型比例、细胞应激标志物和整体基因表达的影响较小 | 研究样本量较小，仅涉及三种冷冻保存方法，且样本来自单一来源 | 评估不同冷冻保存方法对脑脊液细胞单细胞RNA测序结果的影响 | 脑脊液细胞的冷冻保存方法及其对单细胞RNA测序结果的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自三种不同冷冻保存方法的脑脊液样本，每种方法各一份 | NA | NA | NA | NA |
| 4752 | 2024-09-30 |
Single-nuclei transcriptome analysis of channel catfish spleen provides insight into the immunome of an aquaculture-relevant species
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309397
PMID:39325796
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术分析了养殖相关物种——通道鲶鱼脾脏的转录组，揭示了其免疫系统的细胞组成和基因表达特征 | 首次对通道鲶鱼脾脏进行单核RNA测序，识别了多种免疫细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于通道鲶鱼脾脏，未涉及其他组织或物种 | 深入研究通道鲶鱼的免疫系统，特别是脾脏的免疫细胞组成和基因表达 | 通道鲶鱼脾脏的免疫细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从8,157个细胞中生成了278,717,872条reads，整合数据包括19,613个细胞和20,121个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 4753 | 2024-09-30 |
Specific cell subclusters of dental pulp stem cells respond to distinct pathogens through the ROS pathway
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452124
PMID:39328360
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研究论文 | 研究分析了牙髓干细胞在受到口腔真菌和细菌感染时的细胞和分子特性 | 发现了一个特定的牙髓干细胞亚群对不同病原体感染有特异性反应，并通过ROS途径激活MAPK和NF-κB通路引发免疫反应 | NA | 研究牙髓干细胞在不同病原体感染下的反应机制 | 牙髓干细胞及其在真菌和细菌感染下的反应 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 6名健康受试者的阻生第三磨牙中的牙髓干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4754 | 2024-09-30 |
Monocytes as an early risk factor for acute graft-versus-host disease after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1433091
PMID:39328417
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病（aGVHD）的早期风险因素 | 首次发现移植后第21天外周血单核细胞的显著增加和激活与aGVHD的发生密切相关 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 识别异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病的潜在生物标志物，以预防和治疗该疾病 | 异基因造血干细胞移植后发生或未发生急性移植物抗宿主病的患者 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及发生和未发生急性移植物抗宿主病的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4755 | 2024-09-28 |
[Advances in the application of single-cell sequencing technology in the study of neonatal necrotizing enterocolitis]
2024-Oct-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4756 | 2024-09-28 |
Machine Learning Developed a MYC Expression Feature-Based Signature for Predicting Prognosis and Chemoresistance in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10625-0
PMID:38245886
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MYC表达特征的签名，用于预测胰腺腺癌的预后和化疗耐药性 | 首次在胰腺腺癌中建立了基于MYC表达特征的风险模型，并发现了与MYC表达和患者生存密切相关的七个基因 | 研究主要基于TCGA和其他数据库的数据，缺乏临床验证 | 开发一种新的生物标志物，用于预测胰腺腺癌患者的预后和化疗耐药性 | 胰腺腺癌患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理 | 胰腺癌 | LASSO回归分析 | 风险模型 | 基因表达数据 | 训练集包括TCGA数据库的胰腺腺癌患者数据，验证集包括GSE57495、GSE62452和ICGC-PACA数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4757 | 2024-09-28 |
Interactions between fibroblasts and monocyte-derived cells in chronic lung injuries induced by real-ambient particulate matter exposure
2024-Oct, Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis
DOI:10.1016/j.mrgentox.2024.503807
PMID:39326935
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研究论文 | 研究长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的相互作用 | 揭示了特定成纤维细胞和单核细胞来源细胞亚群在长期PM暴露下的显著增加及其促炎和促纤维化功能 | 仅在C57BL/6 J雄性小鼠中进行了实验，结果的普适性有待验证 | 探讨长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的多样性和功能 | 成纤维细胞、髓源抑制细胞（MDSCs）和间质巨噬细胞（IMs） | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 16周暴露于石家庄市真实环境PM的C57BL/6 J雄性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4758 | 2024-09-28 |
Single-cell mapping of peripheral blood mononuclear cells reveals key transcriptomic changes favoring coronary artery lesion in IVIG-resistant Kawasaki disease
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37857
PMID:39323779
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉免疫球蛋白（IVIG）抵抗型川崎病（KD）患者的外周血单核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 首次全面描绘了IVIG抵抗型KD患者PBMCs的整体转录组图谱，揭示了CD8+效应T细胞分化受阻以及髓系细胞与T细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小，仅包括12名参与者 | 探索IVIG抵抗型KD患者外周血单核细胞的转录组特征，揭示其与冠状动脉病变的关系 | IVIG抵抗型KD患者、IVIG反应型KD患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12名参与者，包括5名IVIG抵抗型KD患者、4名IVIG反应型KD患者和3名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 4759 | 2024-09-28 |
Macrophage-Expressed Coagulation Factor VII Promotes Adverse Cardiac Remodeling
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324114
PMID:39234697
|
研究论文 | 研究了巨噬细胞表达的凝血因子VII在心肌梗死后不良心脏重塑中的作用 | 首次揭示了外周TF-FVIIa-PAR2信号复合体在缺血性心脏病中驱动炎症性巨噬细胞极化的作用，并提出了针对这一信号复合体的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血-炎症回路在心肌梗死后巨噬细胞重编程中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 心肌梗死后巨噬细胞的极化和心脏重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、共聚焦显微镜、纵向监测 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、显微镜图像 | 使用永久性左前降支结扎的小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 4760 | 2024-09-28 |
A Ctnnb1 enhancer transcriptionally regulates Wnt signaling dosage to balance homeostasis and tumorigenesis of intestinal epithelia
2024-Sep-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98238
PMID:39320349
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研究论文 | 本文研究了Ctnnb1增强子对Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的作用 | 发现了ieCtnnb1增强子在肠道稳态和肿瘤发生中的关键作用，揭示了增强子依赖的Wnt信号调控机制 | NA | 研究Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的机制 | Ctnnb1增强子及其在肠道上皮中的功能 | NA | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |