单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 4701 - 4720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4701 | 2024-08-14 |
ELF4 was a prognostic biomarker and related to immune infiltrates in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96886
PMID:39132148
|
研究论文 | 本研究探讨了ELF4作为胶质瘤的预后生物标志物及其与免疫浸润的关系 | 首次详细分析了ELF4在胶质瘤病理中的作用及其对临床结果的影响，并揭示了ELF4在免疫调节中的作用 | NA | 研究ELF4在胶质瘤中的作用及其对预后的影响 | ELF4在胶质瘤中的表达及其与恶性表型和不良临床结果的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了CGGA、TCGA和Gravendeel等多个数据库的数据 |
| 4702 | 2024-08-14 |
Screening of PDSS1 as a Potential Biomarker for Hepatocellular Carcinoma Based on a Copper-Related Prognostic Signature through Bulk and Single-cell RNA-sequencing Analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96867
PMID:39132167
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析，探讨了铜相关基因在肝细胞癌中的作用，并鉴定PDSS1作为潜在的生物标志物。 | 首次综合分析了铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了PDSS1在肿瘤微环境中的表达特征和功能。 | NA | 旨在通过多组学方法全面分析铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用。 | 肝细胞癌中的铜死亡相关基因及其潜在生物标志物PDSS1。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA表达数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据库的数据，以及单细胞RNA测序数据。 |
| 4703 | 2024-08-14 |
The combination of single-cell and RNA sequencing analysis decodes the melanoma tumor microenvironment and identifies novel T cell-associated signature genes
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96484
PMID:39132169
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了34个黑色素瘤样本，识别出与免疫治疗相关的T细胞标志性基因，并探讨了这些基因与免疫微环境的关系 | 首次揭示了标志性基因PEB4B与黑色素瘤免疫微环境的潜在关联，并通过多种免疫荧光和免疫浸润评估进行了探索 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术解码黑色素瘤肿瘤微环境，并识别新的T细胞相关标志性基因 | 黑色素瘤患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和COX回归分析 | 基因数据 | 34个黑色素瘤样本 |
| 4704 | 2024-08-14 |
Systematic analysis on the horse-shoe-like effect in PCA plots of scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae109
PMID:39132288
|
研究论文 | 本研究系统分析了单细胞RNA测序数据PCA图中马蹄形效应的现象 | 首次系统解释了PCA图中马蹄形效应，并提出了一个数学模型来解释这一现象 | NA | 探索并解释单细胞RNA测序数据PCA图中的马蹄形效应 | 单细胞RNA测序数据的PCA图中的马蹄形效应 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 数据集 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 4705 | 2024-08-13 |
Cold-adapted influenza vaccine carrying three repeats of a respiratory syncytial virus (RSV) fusion glycoprotein epitope site protects BALB/c mice and cotton rats against RSV infection
2024-Sep, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2024.105960
PMID:38986872
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带三个呼吸道合胞病毒（RSV）融合糖蛋白表位重复序列的冷适应流感疫苗，用于保护BALB/c小鼠和棉鼠免受RSV感染 | 首次开发了一种携带RSV融合蛋白中和表位重复序列的冷适应流感疫苗，显示出双重保护作用 | 需要进一步的临床前和临床研究来验证其安全性和有效性 | 开发一种新型双价疫苗，用于预防流感和RSV感染 | BALB/c小鼠和棉鼠 | NA | 呼吸道病毒感染 | 反向遗传技术，单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞抗原受体（TCR）测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和棉鼠 |
| 4706 | 2024-08-13 |
Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver
2024-Aug-12, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00060a
PMID:38982979
|
研究论文 | 本研究通过基因表达数据和生物信息学方法，识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因，并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系 | 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据，揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系 | 研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在样本代表性不足的问题 | 探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系 | 非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），CIBERSORT算法，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集，以及GSE129516单细胞RNA测序数据集 |
| 4707 | 2024-08-13 |
A Low Expression of NRF2 Enhances Oxidative Stress and Autophagy in Myofibroblasts, Promoting Progression of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Aug-08, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了NRF2低表达如何通过增强氧化应激和自噬促进肌成纤维细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用。 | 首次揭示了NRF2低表达在肌成纤维细胞中通过激活氧化应激和自噬途径促进COPD进展的机制。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现。 | 探索慢性阻塞性肺疾病中炎症的潜在机制。 | 肌成纤维细胞在COPD进展中的作用及其与NRF2、氧化应激和自噬途径的关系。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用GSE171541数据集中的肺组织单细胞RNA测序数据，并在小鼠模型中进行了实验验证。 |
| 4708 | 2024-08-13 |
Identifying polyamine related biomarkers in diagnosis and treatment of ulcerative colitis by integrating bulk and single-cell sequencing data
2024-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69322-6
PMID:39103474
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据，识别与溃疡性结肠炎诊断和治疗相关的聚胺相关生物标志物。 | 首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，识别出与溃疡性结肠炎活动性和治疗反应相关的关键聚胺相关基因。 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；体外和体内实验验证的样本量有限。 | 旨在识别关键的聚胺相关基因，并探索这些基因与溃疡性结肠炎疾病状态和治疗反应之间的关系。 | 溃疡性结肠炎患者的聚胺代谢酶及其相关基因。 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的溃疡性结肠炎患者数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 4709 | 2024-08-13 |
Intratumoral Cell Heterogeneity in Patient-Derived Glioblastoma Cell Lines Revealed by Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158472
PMID:39126040
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了来自不同患者的胶质母细胞瘤细胞系的肿瘤内细胞异质性 | 揭示了患者来源的胶质母细胞瘤细胞系在细胞组成和基因组变异方面的差异 | 研究仅限于六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 | 探究胶质母细胞瘤细胞模型中是否保持了肿瘤内异质性 | 胶质母细胞瘤细胞系和肿瘤样本的细胞组成及基因组变异 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 |
| 4710 | 2024-08-13 |
Definition of a Multi-Omics Signature for Esophageal Adenocarcinoma Prognosis Prediction
2024-Aug-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152748
PMID:39123475
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，识别了与食管腺癌（EAC）抗肿瘤反应相关的特定免疫细胞类型和差异表达基因，并验证了这些转录特征在TCGA患者队列中的预测效能。 | 本研究首次系统地分析了食管腺癌的转录特征，并提出了新的免疫生物标志物，用于预测术后预后和个性化辅助治疗决策。 | NA | 研究旨在识别和验证食管腺癌的转录特征，以预测临床结果和术后预后。 | 食管腺癌（EAC）的转录特征和免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA序列 | TCGA患者队列 |
| 4711 | 2024-08-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of B cells reveals new insights into atypical memory B cells in COVID-19
2024-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29851
PMID:39132689
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了康复期COVID-19患者中S1和受体结合域蛋白特异性B细胞，旨在评估非典型记忆B细胞（MBCs）在严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染中的作用和发展途径 | 揭示了与疾病严重程度相关的B细胞亚群中的促炎特征，并提出了非典型MBCs通过生发中心的发展途径 | NA | 评估非典型记忆B细胞在SARS-CoV-2感染中的作用和发展途径 | 康复期COVID-19患者的S1和受体结合域蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同临床表现的康复期COVID-19患者 |
| 4712 | 2024-08-13 |
Advancements in Research and Treatment Applications of Patient-Derived Tumor Organoids in Colorectal Cancer
2024-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152671
PMID:39123399
|
综述 | 本文综述了患者来源的肿瘤类器官（PDTOs）在结直肠癌（CRC）治疗中的应用，作为一种新型的药物抗性筛选工具 | PDTOs能够重现肿瘤的结构、细胞异质性和基因组景观，是一种有价值的体外预测药物筛选工具 | NA | 探讨PDTOs在预测结直肠癌治疗反应、药物抗性和生物标志物识别方面的潜力 | 结直肠癌及其治疗中的药物抗性问题 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 类器官 | NA |
| 4713 | 2024-08-13 |
Decoding Clonal Hematopoiesis: Emerging Themes and Novel Mechanistic Insights
2024-Jul-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152634
PMID:39123361
|
综述 | 本文综述了克隆性造血（CH）的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 揭示了CH在老年人群中的普遍性及早期启动的可能性，并探讨了环境因素通过异常炎症促进克隆扩增和疾病进展的机制 | 克隆性造血现象的许多方面仍待阐明，精确机制、特定环境下的驱动因素及克隆扩增途径尚未完全建立 | 探讨克隆性造血的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 克隆性造血及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 4714 | 2024-08-13 |
VNN2-expressing circulating monocytes exhibit unique functional characteristics and are decreased in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103275
PMID:38936146
|
研究论文 | 本研究旨在阐明外周血单核细胞中VNN2表达的意义及其在原发性干燥综合征（pSS）中的临床相关性 | 研究首次发现VNN2在单核细胞中的高表达，并探讨了其在pSS中的潜在作用和诊断价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序和流式细胞术，未涉及VNN2功能的具体机制研究 | 阐明VNN2在原发性干燥综合征中的临床意义 | 外周血单核细胞中的VNN2表达 | NA | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 4715 | 2024-08-13 |
Characterizing Rare Dormant and Cycling Lineages Using the Watermelon System
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3882-8_12
PMID:39037657
|
研究论文 | 本文介绍了Watermelon系统，该系统能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态 | Watermon系统通过使用基于条形码的谱系追踪方法，实现了从单细胞RNA测序转录数据中解卷积谱系身份 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态的新系统 | 罕见的休眠和循环细胞谱系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | NA |
| 4716 | 2024-08-12 |
Tumor-associated macrophage clusters linked to immunotherapy in a pan-cancer census
2024-Aug-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00660-4
PMID:39117688
|
研究论文 | 本研究通过跨九种癌症类型的单细胞RNA测序分析，识别了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的不同组成模式，并探讨了TAMs在塑造肿瘤微环境（TME）和影响免疫治疗中的作用。 | 首次进行了跨多种癌症类型的TAMs单细胞RNA测序分析，并开发了机器学习模型来预测免疫检查点阻断反应。 | NA | 研究TAMs在不同癌症类型中的普遍特征及其与肿瘤微环境的相互作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境（TME）中的功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 九种癌症类型的样本 |
| 4717 | 2024-08-12 |
The life-saving benefit of dexamethasone in severe COVID-19 is linked to a reversal of monocyte dysregulation
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.014
PMID:38964327
|
research paper | 本文研究了地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制，发现其通过逆转单核细胞的转录特征来改善生存率 | 首次揭示了地塞米松通过逆转严重COVID-19患者的单核细胞失调来提高生存率的分子机制 | 尽管地塞米松治疗及时，但仍有部分患者病情恶化或死亡 | 探讨地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制及其对单核细胞的影响 | 严重COVID-19患者的单核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 两组独立队列的致命结果患者 |
| 4718 | 2024-08-12 |
Occlusion enhanced pan-cancer classification via deep learning
2024-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05870-y
PMID:39118043
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GENESO的新框架，通过结合遮挡方法和深度学习进行泛癌分类和标记基因发现 | 提出了一种新的标记基因发现方法Symmetrical Occlusion (SO)，能够模拟基因的“功能获得”和“功能丧失”，并使用较少的关键基因训练出性能更高的LSTM模型 | NA | 开发一种新的深度学习框架，用于泛癌分类和标记基因发现 | RNA-Seq数据中的泛癌样本及其标记基因 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | LSTM | RNA表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 4719 | 2024-08-12 |
Single-cell genomic profiling to study regeneration
2024-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2024.102231
PMID:39053027
|
综述 | 本文综述了近年来利用高通量单细胞转录组学和其他单细胞分析技术在不同动物模型中研究再生机制的最新进展 | 探讨了不同动物和细胞类型在再生能力上的差异，并总结了关键概念 | NA | 理解再生过程中的细胞和分子机制 | 不同动物模型中的再生能力 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种动物模型 |
| 4720 | 2024-08-12 |
Single-cell landscape reveals the immune heterogeneity of bone marrow involvement in peripheral T-cell lymphoma
2024-Aug, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16227
PMID:38845192
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫异质性 | 首次揭示了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓微环境的单细胞景观 | NA | 探讨外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫景观及其与预后的关联 | 外周T细胞淋巴瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11份新鲜骨髓样本 |