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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4661 | 2024-09-19 |
Integrin-associated transcriptional characteristics of circulating tumor cells in breast cancer patients
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16678
PMID:38250718
|
研究论文 | 研究了乳腺癌患者循环肿瘤细胞中整合素相关转录特征 | 首次探讨了不同整合素亚单位表达的循环肿瘤细胞的转录谱与其功能活性及转移潜能之间的关系 | 研究仅限于乳腺癌患者,且样本量较小 | 探讨循环肿瘤细胞中整合素表达与转录特征及其对转移潜能的影响 | 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 乳腺癌患者的CD45阴性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4662 | 2024-09-19 |
The burgeoning spatial multi-omics in human gastrointestinal cancers
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17860
PMID:39285924
|
综述 | 本文综述了空间多组学技术在人类消化系统癌症中的应用 | 介绍了空间多组学技术如何保留组织样本中的空间信息,从而增强对个体发育和疾病病理的理解 | NA | 促进空间多组学技术在消化系统肿瘤疾病研究中的应用 | 食管癌、胃癌和结直肠癌 | 数字病理学 | 消化系统癌症 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4663 | 2024-09-19 |
Comprehensive analysis of splicing factor SRs-related gene characteristics: predicting osteosarcoma prognosis and immune regulation status
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1456986
PMID:39286028
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研究论文 | 研究了剪接因子SRs相关基因对骨肉瘤患者总体生存和预后的影响,并通过单细胞RNA测序数据分析了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | 构建了基于SRs的预后模型,并揭示了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | NA | 探讨SRs相关基因对骨肉瘤患者预后和免疫调节状态的影响 | 骨肉瘤患者的总体生存和预后,以及SRs在免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | Lasso回归 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4664 | 2024-09-19 |
Multi-omics landscape of Interferon-stimulated gene OASL reveals a potential biomarker in pan-cancer: from prognosis to tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1402951
PMID:39286258
|
研究论文 | 本文通过多组学分析探讨了OASL在泛癌中的潜在生物标志物作用,从预后到肿瘤微环境的影响 | 首次系统性地研究了OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨OASL在泛癌中的预后和免疫学作用 | OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | COX和Log-Rank回归分析 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 4665 | 2024-09-19 |
Novel insights from human induced pluripotent stem cells on origins and roles of fibro/adipogenic progenitors as heterotopic ossification precursors
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1457344
PMID:39286484
|
综述 | 本文综述了成纤维/脂肪生成前体细胞(FAPs)的起源和功能,并探讨了其在异位骨化中的作用 | 利用患者来源的诱导多能干细胞和异位骨化的小鼠模型,提供了关于FAPs起源和功能的新见解 | NA | 探讨FAPs的起源和功能,并研究其在异位骨化中的作用 | 成纤维/脂肪生成前体细胞(FAPs)及其在肌肉组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4666 | 2024-09-19 |
A cheminformatics and network pharmacology approach to elucidate the mechanism of action of Mycobacterium tuberculosis γ-carbonic anhydrase inhibitors
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1457012
PMID:39286631
|
研究论文 | 本研究采用化学信息学和网络药理学方法,揭示结核分枝杆菌γ-碳酸酐酶抑制剂的作用机制 | 本研究首次通过同源建模和虚拟筛选方法,识别出与Cas9蛋白具有高结合亲和力的化合物,并分析了这些化合物在免疫反应和肺组织完整性相关通路中的作用 | 研究结果仍需实验验证以证明候选化合物在结核分枝杆菌感染中的疗效 | 探索结核分枝杆菌发病机制的生物学联系,并研究靶向Cas9蛋白的抗结核化合物的作用机制 | 结核分枝杆菌的γ-碳酸酐酶及其抑制剂 | 生物信息学 | 结核病 | 同源建模、虚拟筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4667 | 2024-09-19 |
The shared molecular mechanism of spinal cord injury and sarcopenia: a comprehensive genomics analysis
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1373605
PMID:39281413
|
研究论文 | 本研究通过综合基因组分析,探讨脊髓损伤与肌肉减少症之间的共享分子机制 | 本研究首次通过RNA-seq数据分析,识别出脊髓损伤与肌肉减少症共有的关键基因,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 本研究主要依赖于公共数据库中的基因表达数据,未进行体内实验验证 | 旨在识别脊髓损伤与肌肉减少症共有的生物标志物,以辅助急性期和康复期的诊断与预后评估 | 脊髓损伤与肌肉减少症的共有生物标志物 | 基因组学 | 脊髓损伤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4668 | 2024-09-19 |
Unveiling the cellular landscape: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458638
PMID:39281682
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,研究多发性骨髓瘤细胞间的通信过程,并探索潜在的治疗标志物 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤患者中的基因表达模式和分子通路,为未来的研究和临床干预提供了新的视角 | NA | 深入理解细胞通信过程,发现治疗多发性骨髓瘤的潜在标志物 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32个骨髓样本,来自22名不同疾病进展阶段的多发性骨髓瘤患者和9名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 4669 | 2024-09-19 |
Alterations in Astrocyte Subpopulations in Glioma and Identification of Cuproptosis-Related Genes Using Single-Cell RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S473932
PMID:39281776
|
研究论文 | 研究探讨了胶质瘤中星形胶质细胞亚群的变化及铜死亡相关基因的鉴定 | 首次揭示了铜死亡相关基因在胶质瘤微环境中的预后价值,并建立了一个新的三基因预后模型 | 研究样本量较小,且仅限于特定数据集,可能影响结果的普适性 | 探讨铜死亡相关基因在胶质瘤微环境中的作用及其预后价值 | 胶质瘤中的星形胶质细胞亚群及铜死亡相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,293个细胞来自三个内部单细胞RNA测序数据集,6,148个细胞来自中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)涉及14名胶质瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4670 | 2024-09-19 |
Single-Cell WGCNA Combined with Transcriptome Sequencing to Study the Molecular Mechanisms of Inflammation-Related Ferroptosis in Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S476456
PMID:39281774
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨心肌缺血-再灌注损伤(MIRI)中炎症相关铁死亡的分子机制 | 首次结合单细胞转录组测序和WGCNA技术,深入研究MIRI中不同细胞亚型的变化及其与铁死亡相关基因和免疫浸润的调控网络 | 实验验证仅限于大鼠模型,未在人体样本中进行验证 | 揭示心肌缺血-再灌注损伤中炎症和铁死亡的分子机制 | 心肌缺血-再灌注损伤中的细胞亚型变化、铁死亡相关基因调控网络及免疫浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus的四个数据集(GSE146285, GSE83472, GSE61592, GSE160516),并建立了MIRI大鼠模型进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 4671 | 2024-09-19 |
Expansion of a Novel Subset of L-Selectin+ Classical Monocytes in Kawasaki Disease
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S468472
PMID:39281780
|
研究论文 | 研究川崎病中L-选择素阳性经典单核细胞的新亚群的扩展 | 发现了一种新的L-选择素阳性经典单核细胞亚群,并探讨了其在川崎病中的诊断价值 | 样本量相对较小,需要进一步的大规模研究验证 | 探讨川崎病与L-选择素阳性经典单核细胞之间的关系 | 川崎病患者、发热患者和健康儿童的外周血样本 | 免疫学 | 川崎病 | 流式细胞术 | NA | 血液样本 | 81名川崎病患者、18名发热患者和36名健康儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 4672 | 2024-09-17 |
Targeting CNS myeloid infiltrates provides neuroprotection in a progressive multiple sclerosis model
2024-Nov, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.08.032
PMID:39179123
|
研究论文 | 研究通过靶向中枢神经系统(CNS)中的髓系浸润细胞,提供了一种在渐进性多发性硬化症模型中的神经保护策略 | 首次展示了通过调节CNS髓系细胞的毒性来减少不可逆组织损伤,并提出了一种新的疾病修饰方法 | 研究仅在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中进行,尚未在临床试验中验证 | 探讨靶向CNS髓系细胞是否能预防慢性免疫介导的脱髓鞘疾病的不可逆组织损伤 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中的髓系细胞和神经保护效果 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | Biozzi小鼠模型中的脊髓CD11b+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4673 | 2024-09-17 |
Integrative analysis of pan-cancer single-cell data reveals a tumor ecosystem subtype predicting immunotherapy response
2024-Sep-15, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00703-w
PMID:39277681
|
研究论文 | 本研究通过整合泛癌单细胞数据,揭示了一种肿瘤生态系统亚型,该亚型与免疫治疗反应的改善相关 | 建立了新的免疫治疗反应生态型特征(IRE.Sig),并通过机器学习模型成功预测了ICI反应 | 缺乏直接的临床证据支持 | 揭示肿瘤生态系统亚型与免疫治疗反应的关系,并开发预测工具 | 泛癌单细胞数据和ICI治疗患者的数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及5个CRISPR筛选队列和多个验证与测试队列 | NA | NA | NA | NA |
| 4674 | 2024-09-17 |
Single-cell sequencing analysis of multiple myeloma heterogeneity and identification of new theranostic targets
2024-Sep-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07027-4
PMID:39271659
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析多发性骨髓瘤的异质性,并识别新的治疗靶点 | 通过单细胞转录组测序揭示了多发性骨髓瘤与健康捐赠者之间B淋巴细胞系通讯的破坏,并发现了独特的信号分子 | NA | 阐明多发性骨髓瘤的异质性并识别新的治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞和健康捐赠者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 48,293个骨髓细胞,包括多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 4675 | 2024-09-17 |
Cell therapy using ex vivo reprogrammed macrophages enhances antitumor immune responses in melanoma
2024-Sep-14, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03182-w
PMID:39272209
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研究论文 | 研究通过体外重编程巨噬细胞进行细胞疗法,增强黑色素瘤中的抗肿瘤免疫反应 | 首次展示了使用HDAC6抑制剂体外重编程巨噬细胞作为治疗实体瘤的可行性细胞疗法 | NA | 设计新策略以增加肿瘤微环境中M1/M2比例,从而增强基于巨噬细胞的细胞疗法 | 巨噬细胞、肿瘤微环境、黑色素瘤 | 细胞疗法 | 黑色素瘤 | HDAC6抑制剂、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用SM1小鼠黑色素瘤模型和NSG-SGM3人源化小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 4676 | 2024-09-17 |
Single-cell profiling uncovers proliferative cells as key determinants of survival outcomes in lower-grade glioma patients
2024-Sep-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01302-8
PMID:39276278
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序,识别出一种与低级别胶质瘤患者预后不良相关的新型细胞类型,并构建了基于该细胞类型的预测模型 | 本研究首次识别出一种名为“Prol”的细胞类型,该细胞类型与低级别胶质瘤患者的预后不良相关,并构建了基于该细胞类型的预测模型,具有泛癌预测潜力 | NA | 本研究旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA测序,识别出与低级别胶质瘤患者预后相关的新型细胞类型,并开发新的预测模型 | 低级别胶质瘤患者及其细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | AI网络 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4677 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing analysis of peripheral blood mononuclear cells in PD-1-induced renal toxicity in patients with lung cancer
2024-Sep-14, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03754-0
PMID:39277735
|
研究论文 | 研究分析了PD-1治疗引起的肾毒性中,外周血单核细胞的单细胞RNA测序特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析了PD-1治疗引起的肾毒性中,外周血单核细胞的差异表达基因及其富集的生物学过程 | 样本量较小,仅包括六名患者 | 旨在分析PD-1治疗引起的肾毒性中,外周血单核细胞的特征 | 外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4678 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the differentiation and regulation of endplate cells in human intervertebral disc degeneration
2024-Sep-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71891-5
PMID:39271714
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类椎间盘退变中的终板细胞的分化和调控 | 首次通过单细胞RNA测序分析了退变终板细胞的细胞命运和特性,并发现了两种软骨细胞分化途径 | NA | 揭示椎间盘退变过程中终板细胞的分化和调控机制 | 人类椎间盘退变中的终板细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8534个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4679 | 2024-09-17 |
Machine learning algorithms for predicting glioma patient prognosis based on CD163+FPR3+ macrophage signature
2024-Sep-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00692-w
PMID:39271911
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研究论文 | 研究利用机器学习算法基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征预测胶质瘤患者预后 | 首次基于CD163+FPR3+巨噬细胞相关特征构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型,并展示了其优于传统临床因素和其他已发表签名的预测准确性 | NA | 开发一种基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的机器学习模型,以提高胶质瘤患者预后的预测准确性 | 胶质瘤患者及其肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 六个胶质瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 4680 | 2024-09-17 |
scBubbletree: computational approach for visualization of single cell RNA-seq data
2024-Sep-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05927-y
PMID:39271980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scBubbletree的新方法,用于可视化单细胞RNA测序数据 | scBubbletree方法通过将细胞聚类可视化为树状图上的气泡,解决了现有方法在可视化高维数据时的过绘制、缺乏定量信息和扭曲全局及局部生物模式的问题 | NA | 开发一种新的可视化方法,以更好地量化和展示单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 包括一个超过120万细胞的大规模数据集 | NA | NA | NA | NA |