单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4601	2024-08-21	An integrated multi-omics analysis reveals osteokines involved in global regulation 2024-May-07, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.006 PMID:38574738	研究论文	本研究通过综合多组学分析方法，探讨了骨分泌蛋白（osteokines）在骨代谢和全身稳态中的作用及其调控机制	本研究首次识别了375种候选osteokines及其在衰老和机械加载/卸载条件下的变化，并揭示了它们在骨和其他器官间的通信机制	NA	揭示osteokines的真实身份、细胞来源及其调控机制	骨和非骨骼组织、成骨细胞条件培养基、骨髓上清液和血清中的osteokines	数字病理学	NA	RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学	NA	RNA、蛋白质	NA
4602	2024-08-21	Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma 2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.03.573968 PMID:38260522	研究论文	本研究通过使用CRISPR/Cas9和化学致癌物3-甲基胆蒽（MCA）生成具有高肿瘤突变负荷的自体软组织肉瘤模型，探讨了TLR9激动剂CpG与放射治疗（RT）联合使用对肿瘤反应的增强作用及其机制。	首次在自体软组织肉瘤模型中验证了TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对肿瘤反应的增强作用，并揭示了CD8 T细胞在其中的关键作用。	研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验来验证这些发现。	探讨TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对软组织肉瘤的治疗效果及其机制。	自体软组织肉瘤模型中的肿瘤反应及免疫细胞变化。	数字病理学	软组织肉瘤	CRISPR/Cas9, RNA测序, 质谱细胞术	NA	RNA	多个自体软组织肉瘤模型样本
4603	2024-08-21	The Downregulation of ITGAX Exacerbates Amyloid-β Plaque Deposition in Alzheimer's Disease by Increasing Polarization of M1 Microglia 2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD DOI:10.3233/JAD-240118 PMID:38905043	研究论文	本研究探讨了ITGAX下调通过增加M1型小胶质细胞极化加剧阿尔茨海默病中淀粉样β斑块沉积的分子机制	通过单细胞RNA测序和APP/PS1小鼠模型，揭示了ITGAX表达上调与阿尔茨海默病病理过程中的关系	NA	识别阿尔茨海默病中小胶质细胞参与的更精确分子靶点，并探索其潜在机制	ITGAX在阿尔茨海默病中的作用及其对小胶质细胞极化和淀粉样β斑块沉积的影响	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	APP/PS1小鼠模型	RNA	使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的单细胞RNA测序数据
4604	2024-08-21	Role of glycosylation-related gene MGAT1 in pancreatic ductal adenocarcinoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1438935 PMID:39156890	研究论文	本文探讨了糖基化相关基因MGAT1在胰腺导管腺癌（PDAC）中的作用	首次揭示了MGAT1通过调节巨噬细胞中的糖基化水平，影响PDAC的进展和预后	需要进一步的研究来开发针对MGAT1的靶向治疗策略	研究MGAT1在PDAC中的作用及其作为治疗靶点的潜力	胰腺导管腺癌（PDAC）细胞和肿瘤微环境	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据	来自GSE197177和GSE224411的数据, 以及UCSC Xena和TCGA的RNA-seq数据和生存信息
4605	2024-08-21	Advancing precision medicine in gliomas through single-cell sequencing: unveiling the complex tumor microenvironment 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1396836 PMID:39156969	研究论文	本文通过单细胞测序技术深入研究胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤微环境，揭示了肿瘤细胞与周围正常细胞的复杂相互作用	利用单细胞转录组学和空间转录组学技术，精确分类肿瘤微环境中的细胞类型，并探讨了多组学条件下细胞间的相互作用及其对GBM生长的影响	NA	通过深入理解肿瘤微环境中的细胞相互作用，开发新的治疗策略以提高GBM患者的治疗效果	胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤微环境中的细胞类型和相互作用	数字病理学	脑癌	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
4606	2024-08-21	Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Unique Fibroblastic Subset and Immune Disorder in Lichen Sclerosus Urethral Stricture 2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S466317 PMID:39157587	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了硬化性苔藓尿道狭窄中独特的成纤维细胞亚群及免疫紊乱	发现了一种独特的成纤维细胞亚群Fib7，该亚群仅存在于硬化性苔藓尿道狭窄中，并表现出SAA1和SAA2的高表达水平	NA	旨在深入理解硬化性苔藓尿道狭窄的组织微环境，以助于阐明其发病机制	硬化性苔藓尿道狭窄疾病中的细胞亚群及其转录组特征	数字病理学	尿道疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	三名硬化性苔藓尿道狭窄患者和三名非硬化性苔藓尿道狭窄患者
4607	2024-08-20	Integrated metabolomics and proteomics analyses to reveal anticancer mechanism of hemp oil extract in colorectal cancer 2024-Oct-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jpba.2024.116379 PMID:39059180	研究论文	本研究通过代谢组学和蛋白质组学分析，探讨了大麻油提取物（HOE）在结直肠癌（CRC）治疗中的抗癌机制	首次详细揭示了大麻油提取物通过影响嘌呤代谢途径和下调c-MYC等细胞周期相关蛋白的表达，导致细胞周期在G1期停滞，从而抑制结直肠癌细胞增殖的机制	NA	阐明大麻油提取物在结直肠癌治疗中的具体抗癌机制	大麻油提取物对结直肠癌细胞的影响	数字病理学	结直肠癌	质谱法	NA	代谢组学数据和蛋白质组学数据	NA
4608	2024-08-20	IL-17A/F double producing T cells, unstable Tregs and quiescent TRMs in clinically healed lesions are potential cellular candidates for recurrence of psoriasis 2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110328 PMID:39067676	研究论文	本研究通过单细胞测序和多重免疫组化染色技术，分析了自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤中的T细胞亚群，以揭示银屑病复发的细胞机制	首次在临床愈合的银屑病变中识别出IL-17A/F双产T细胞、不稳定Tregs和静息TRMs作为复发的潜在细胞候选者	研究结果需要进一步的深入工作以加深理解	阐明银屑病复发的免疫学机制	银屑病愈合病变中的T细胞亚群	NA	银屑病	单细胞测序，多重免疫组化染色	NA	细胞	自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤样本
4609	2024-08-20	RBMS1 reflects a distinct microenvironment and promotes tumor progression in ocular melanoma 2024-Sep, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109990 PMID:38969283	研究论文	本研究通过多种机器学习算法分析了UM患者的DNA甲基化、转录组数据及临床信息，发现甲基化驱动的基因RBMS1与UM患者的临床预后不良相关，并揭示了RBMS1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤进展的影响。	首次揭示RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用，及其与肿瘤微环境和预后的关联。	研究主要基于UM患者的数据，未来研究需验证RBMS1在其他类型眼部黑色素瘤中的作用。	探讨RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响。	眼部黑色素瘤，包括葡萄膜黑色素瘤（UM）和结膜黑色素瘤（CM）。	数字病理学	眼部黑色素瘤	DNA甲基化分析、RNA测序、单细胞RNA测序	机器学习算法	DNA甲基化数据、转录组数据、临床信息	具体样本数量未在摘要中明确提及
4610	2024-08-20	Adenosine A2A receptor activation regulates the M1 macrophages activation to initiate innate and adaptive immunity in psoriasis 2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110309 PMID:39002795	研究论文	本研究探讨了腺苷A2A受体激活对M1巨噬细胞的调节作用及其在银屑病中的免疫机制	首次发现KRT16在M1巨噬细胞中的表达，并确定CXCL10/11主要来源于巨噬细胞和树突状细胞而非角质形成细胞	NA	探究M1巨噬细胞在银屑病发病机制中的作用	M1巨噬细胞在银屑病中的作用及腺苷A2A受体的调节机制	免疫学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
4611	2024-08-20	Integrated analysis reveals an aspartate metabolism-related gene signature for predicting the overall survival in patients with hepatocellular carcinoma 2024-Sep, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03431-6 PMID:38472558	研究论文	本研究通过多组学数据分析，建立了一个与天冬氨酸代谢相关的基因签名（AMGS），用于预测肝细胞癌患者的总体生存率	首次揭示了天冬氨酸代谢重编程在肝细胞癌中的作用，并建立了一个新的基因签名用于预测患者的生存率	NA	探索天冬氨酸代谢在肝细胞癌中的作用，并开发新的预测工具	肝细胞癌患者及其天冬氨酸代谢相关基因	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Cox回归模型	多组学数据	来自公共数据库的肝细胞癌患者数据
4612	2024-08-20	TDP-43 was Involved in Radiation-induced Neuronal Damage and May Not Through the BDNF/TrkB Pathway 2024-03-01, Radiation research IF:2.5Q2 DOI:10.1667/RADE-23-00168.1 PMID:38235539	研究论文	本研究探讨了TDP-43在辐射诱导的海马损伤中的作用，并评估了BDNF/TrkB通路是否参与此过程。	首次揭示了TDP-43在辐射诱导的神经元损伤中的作用，并发现BDNF/TrkB信号通路可能不参与此过程。	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步的人体研究来验证结果。	探究TDP-43在辐射诱导的认知功能障碍中的作用及其与BDNF/TrkB通路的关系。	辐射诱导认知功能障碍的大鼠模型及体外神经元细胞。	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	大鼠海马组织及体外神经元细胞
4613	2024-08-19	HAO2 protects from proximal tubular cells injured in rats with chronic kidney disease by promoting fatty acid metabolic processes 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167342 PMID:39002705	研究论文	本研究使用单细胞转录组测序技术，对正常对照组和慢性肾脏病（CKD）大鼠的血液和肾脏组织细胞进行测序和分析，重点关注关键细胞群和功能富集，以探索CKD的发病机制	成功建立了CKD大鼠的单细胞转录组图谱，并发现HAO2通过促进脂肪酸代谢过程保护近端小管细胞免受损伤	NA	探索慢性肾脏病的发病机制	慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞转录组测序技术	NA	细胞	正常对照组和慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞
4614	2024-08-19	Lysine lactylation-based insight to understanding the characterization of cervical cancer 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167356 PMID:39025375	研究论文	本文通过综合蛋白质组学分析，研究了赖氨酸乳酸化（Kla）在宫颈癌中的特征和功能	首次全面分析了Kla在宫颈癌细胞中的分布和功能，并构建了基于Kla的宫颈癌预后模型	研究主要集中在HeLa细胞系，可能需要进一步在更多样化的细胞系和临床样本中验证	探索赖氨酸乳酸化在宫颈癌中的特征和功能，为治疗提供潜在途径	宫颈癌细胞中的赖氨酸乳酸化位点和相关蛋白	数字病理学	宫颈癌	蛋白质组学分析	NA	蛋白质组、转录组和单细胞转录组数据	3633个Kla位点，1637种蛋白质
4615	2024-08-19	Single-cell analysis identifies critical regulators of spermatogonial development and differentiation in cattle-yak bulls 2024-Sep, Journal of dairy science IF:3.7Q2 DOI:10.3168/jds.2023-24442 PMID:38642661	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了牦牛和牛-牦牛杂交种在睾丸细胞组成和生精细胞发育轨迹上的差异	首次在单细胞水平上获得了不同生殖细胞和睾丸体细胞的转录组特征，并识别了牦牛和无生育能力牛-牦牛的生精细胞分化和减数分裂的关键调控因子	NA	探讨导致牛科物种杂交不育和物种形成的遗传机制	牦牛和牛-牦牛杂交种的生精细胞发育和分化	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	NA
4616	2024-08-19	Requirement of Pdgfrα+ cells for calvarial bone repair 2024-Aug-16, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szae041 PMID:38986535	研究论文	本文研究了血小板衍生生长因子受体α（PDGFRα）阳性细胞在颅骨修复中的作用	首次详细探讨了PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨愈合过程中的贡献	NA	探究PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨修复中的作用	PDGFRα阳性间充质细胞	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	细胞	使用Pdgfrα-CreERTM;mT/mG报告动物模型进行研究
4617	2024-08-19	Exploring the molecular mechanisms and shared potential drugs between rheumatoid arthritis and arthrofibrosis based on large language model and synovial microenvironment analysis 2024-08-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69080-5 PMID:39147768	研究论文	本研究基于大型语言模型和滑膜微环境分析，探索类风湿性关节炎和关节纤维化的分子机制及潜在共享药物	本研究采用文本挖掘方法和药物再定位技术，发现并验证了针对类风湿性关节炎和关节纤维化的新型潜在药物	NA	旨在全面分析类风湿性关节炎和关节纤维化之间的关系，并识别新的临床用药	类风湿性关节炎和关节纤维化	NA	类风湿性关节炎，关节纤维化	文本挖掘，单细胞测序	NA	基因表达数据	5个批量测序数据集和4个单细胞测序数据集
4618	2024-08-19	Janus liposozyme for the modulation of redox and immune homeostasis in infected diabetic wounds 2024-Aug, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-024-01660-y PMID:38740936	研究论文	本文报道了一种名为Janus脂酶的新型治疗剂，用于治疗糖尿病伤口感染并促进伤口愈合	开发了一种包含脂质体样硒酶的Janus脂酶，用于清除活性氧（ROS）以恢复组织氧化还原和免疫稳态，并结合光动力疗法治疗感染	NA	研究Janus脂酶在治疗糖尿病伤口感染和促进伤口愈合中的应用	糖尿病伤口感染及伤口愈合过程	NA	糖尿病	光动力疗法	NA	RNA序列	使用T细胞缺陷的Rag1小鼠和迷你猪进行实验
4619	2024-08-19	Complex immune microenvironment of chordoma: a road map for future treatment 2024-Jun-21, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-009313 PMID:38908855	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序等技术，深入分析了脊索瘤的复杂免疫微环境，并探讨了免疫治疗在该疾病中的应用前景	首次采用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，结合CellChat和基因集变异分析，全面解析了脊索瘤的免疫微环境	研究样本量较小，仅包括126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据	探讨脊索瘤的免疫微环境特征及其对免疫治疗效果的影响	脊索瘤的免疫微环境及其对患者预后的影响	数字病理学	脊索瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA	126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据
4620	2024-08-18	Effects of HOX family regulator-mediated modification patterns and immunity characteristics on tumor-associated cell type in endometrial cancer 2024-08-14, Molecular biomedicine IF:6.3Q1 DOI:10.1186/s43556-024-00196-w PMID:39138733	研究论文	本研究分析了HOX基因在子宫内膜癌中对多种细胞类型表达机制及肿瘤微环境细胞浸润发展的潜在作用	开发了一种新的评分系统来量化子宫内膜癌中的个体HOX模式，并揭示了HOX基因在肿瘤发展和免疫反应中的关键作用	NA	探讨HOX基因在子宫内膜癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响	子宫内膜癌患者的转录组数据和临床信息	数字病理学	子宫内膜癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	529名子宫内膜癌患者