单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7467 篇文献，本页显示第 4581 - 4600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4581 | 2024-09-11 |
Integrating single-cell transcriptomics to reveal the ferroptosis regulators in the tumor microenvironment that contribute to bladder urothelial carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427124
PMID:39238647
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，通过非负矩阵分解（NMF）聚类分析，揭示了膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中铁死亡调控因子及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 首次通过单细胞转录组数据识别出膀胱癌肿瘤微环境中与铁死亡相关的新型细胞亚型，并发现ACSL4+CAFs和SDC1作为重要的膀胱癌生物标志物 | 本研究主要基于单细胞转录组数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探讨铁死亡在膀胱癌肿瘤微环境中的调控机制及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的细胞亚型及其与铁死亡的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4582 | 2024-09-11 |
The landscape of miRNA-mRNA regulatory network and cellular sources in inflammatory bowel diseases: insights from text mining and single cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454532
PMID:39238649
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研究论文 | 本研究通过文本挖掘和单细胞RNA测序分析，构建了炎症性肠病中的miRNA-mRNA调控网络，并确定了关键miRNA的细胞来源及其在疾病发病机制中的作用 | 本研究通过整合多个数据库的预测和实验验证结果，构建了全面的miRNA-mRNA调控网络，并结合大规模单细胞RNA测序数据，确定了miRNA的细胞来源及其与临床状态和功能变化的关联 | 研究主要依赖于已发表的文献和现有数据库，可能存在样本多样性、平台变异性和批次效应等限制 | 构建全面的miRNA-mRNA调控网络，确定关键miRNA在炎症性肠病发病机制中的细胞来源和功能 | 炎症性肠病（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）中的miRNA-mRNA调控网络及其细胞来源 | 基因组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据和基因表达数据 | 两个大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4583 | 2024-09-11 |
Obtention of viable cell suspensions from breast cancer tumor biopsies for 3D chromatin conformation and single-cell transcriptome analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1420308
PMID:39239354
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研究论文 | 本文介绍了一种从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液的优化方案，并利用这些细胞悬液进行了3D染色质构象和单细胞转录组分析 | 提出了一种成本效益高的优化方案，能够从乳腺癌肿瘤活检中简单高效地获取高存活率细胞悬液 | 样本处理仍然是主要挑战，包括样本采集前的治疗、组织获取量、运输以及无法处理新鲜样本等问题 | 开发一种优化方案，从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液，以进行个性化肿瘤分子特征分析 | 乳腺癌肿瘤活检样本 | NA | 乳腺癌 | Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4584 | 2024-09-11 |
MS4A1-PTGS2 axis induces taurine metabolic reprogramming to exacerbate abdominal aortic aneurysm progression
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.99659
PMID:39239552
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研究论文 | 本研究揭示了牛磺酸代谢重编程在腹主动脉瘤（AAA）发展和进展中的关键作用 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），首次将代谢变化与细胞外基质（ECM）和血管平滑肌细胞（SMCs）的功能联系起来，并引入了创新的代谢谱分析技术，识别出AAA中的差异代谢物，为非手术干预提供了潜在的生物标志物和治疗靶点 | NA | 研究腹主动脉瘤（AAA）的发展和进展机制 | 腹主动脉瘤（AAA）的细胞和分子机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA，代谢物 | 使用小鼠模型（GSE152583数据集）和人类AAA组织样本进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 4585 | 2024-09-11 |
HMGB2 drives tumor progression and shapes the immunosuppressive microenvironment in hepatocellular carcinoma: insights from multi-omics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415435
PMID:39247201
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了HMGB2在肝细胞癌中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次揭示了HMGB2在肝细胞癌进展和免疫抑制微环境中的关键作用 | NA | 优化肝细胞癌管理策略并提高患者预后 | HMGB2在肝细胞癌中的表达及其对免疫抑制微环境的影响 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | RNA | 多个肝细胞癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 4586 | 2024-09-11 |
Identification and Validation of Cytotoxicity-Related Features to Predict Prognostic and Immunotherapy Response in Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/3468209
PMID:39247556
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，识别并验证了与细胞毒性相关的特征，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于细胞毒性相关特征构建了透明细胞肾细胞癌的生存预测模型，并评估了其对免疫治疗反应的预测能力 | 本研究仅基于GSE224630数据集进行分析，未来需要更多数据集验证模型的普适性 | 开发一种基于细胞毒性相关特征的透明细胞肾细胞癌生存预测模型，并评估其对免疫治疗反应的预测能力 | 透明细胞肾细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 11个透明细胞肾细胞癌亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 4587 | 2024-09-11 |
Tuberculosis to lung cancer: application of tuberculosis signatures in identification of lung adenocarcinoma subtypes and marker screening
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97898
PMID:39247607
|
研究论文 | 研究探讨了肺结核与肺腺癌之间的关联，并利用肺结核特征识别肺腺癌亚型和筛选标记物 | 首次全面利用肺结核特征进行生物信息学分析，识别肺腺癌亚型，并预测预后和潜在标记物 | NA | 阐明肺结核在肺腺癌发展中的作用，并识别肺腺癌亚型和潜在标记物 | 肺结核和肺腺癌的差异表达基因，以及肺腺癌的分子亚型和预后模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 共识聚类分析，RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 六个队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4588 | 2024-09-11 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals MMP mediated expression patterns by distinct tumor microenvironment immune profiles in cervical cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96429
PMID:39247608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，分析了宫颈癌中MMP介导的表达模式与肿瘤微环境免疫特征的关系 | 首次综合分析了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了MMP在宫颈癌中的表达模式与肿瘤微环境免疫特征的关联 | NA | 阐明宫颈癌中MMP表达的景观和评分，并探讨其与肿瘤微环境免疫特征的关系 | 宫颈癌中的MMP表达模式及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4589 | 2024-09-11 |
IL-6 signaling accelerates iron overload by upregulating DMT1 in endothelial cells to promote aortic dissection
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99511
PMID:39247821
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研究论文 | 研究IL-6信号通路如何通过上调内皮细胞中的DMT1来加速铁过载，从而促进主动脉夹层 | 首次揭示了IL-6信号通路通过上调DMT1表达来加速铁过载，从而促进主动脉夹层的机制 | NA | 探讨IL-6信号通路在主动脉夹层形成中的作用机制 | 内皮细胞中的铁离子运输和主动脉夹层 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4590 | 2024-09-10 |
Single-cell analysis reveals the disparities in immune profiles between younger and elder patients
2024-Sep-08, European geriatric medicine
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s41999-024-01032-8
PMID:39244673
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年非小细胞肺癌患者之间的免疫特征差异 | 揭示了老年患者与年轻患者在肿瘤微环境中的免疫细胞组成和功能通路的显著差异 | NA | 旨在解码年轻和老年肺癌患者之间肿瘤微环境的差异 | 年轻和老年非小细胞肺癌患者的免疫特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 96,491个老年患者细胞和169,207个年轻患者细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4591 | 2024-09-10 |
Defining cell type-specific immune responses in a mouse model of allergic contact dermatitis by single-cell transcriptomics
2024-Aug-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94698
PMID:39213029
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，研究了小鼠过敏性接触性皮炎模型中细胞类型特异性免疫反应 | 揭示了过敏性接触性皮炎中不同细胞类型的特异性免疫反应，并识别了真皮成纤维细胞在塑造1型皮肤炎症中的关键作用 | NA | 研究过敏性接触性皮炎中细胞类型特异性免疫反应 | 小鼠过敏性接触性皮炎模型中的免疫细胞和皮肤常驻细胞 | 单细胞转录组学 | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类过敏性接触性皮炎皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4592 | 2024-09-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
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研究论文 | 研究使用CRISPR-CasRx技术干扰Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因在小鼠中的表达，以降低眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次使用CasRx技术干扰与房水循环相关的基因，显著降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 研究仅在雌性小鼠中进行，结果的普遍性有待验证 | 探索通过基因干扰降低眼内压并保护视网膜神经节细胞的新方法 | 雌性小鼠的眼内压和视网膜神经节细胞 | 基因编辑 | 青光眼 | CRISPR-CasRx | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4593 | 2024-09-10 |
Data normalization for addressing the challenges in the analysis of single-cell transcriptomic datasets
2024-May-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10364-5
PMID:38711017
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综述 | 本文综述了单细胞转录组数据分析中的数据标准化方法 | 本文详细讨论了不同标准化方法的分类及其优缺点 | 没有一种标准化方法在所有情况下都表现最佳，需要根据具体指标评估 | 指导读者选择最合适的数据标准化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4594 | 2024-09-10 |
Inhibition of heme oxygenase 1 alleviates thoracic aortic aneurysm via restoration of extracellular matrix
2024-01-29, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149405
PMID:38147696
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研究论文 | 研究探讨了血红素氧合酶1（HO-1）在胸主动脉瘤（TAA）中的作用及其通过抑制HO-1减轻TAA的机制 | 首次揭示了HO-1阳性巨噬细胞在TAA中的重要作用，并证明了通过抑制HO-1可以减轻TAA并恢复细胞外基质（ECM） | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏更大规模的人类临床试验验证 | 探讨HO-1在胸主动脉瘤中的作用及其潜在的治疗机制 | 胸主动脉瘤（TAA）及其相关细胞和分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、组织学检测 | NA | RNA序列、蛋白质表达数据 | 113,800个胸主动脉细胞样本，BAPN诱导的TAA小鼠模型及TAA患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4595 | 2024-09-09 |
Enhanced cytokine signaling and ferroptosis defense interplay initiates obesity-associated pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217162
PMID:39127339
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研究论文 | 研究揭示了肥胖与胰腺导管腺癌之间的机制联系，发现肥胖患者的血清改变了胰腺导管上皮细胞的炎症细胞因子信号和铁死亡防御机制 | 首次发现肥胖患者的血清通过增强白细胞介素34表达和铁死亡防御之间的相互作用，促进了胰腺导管腺癌的发生 | 研究主要基于细胞培养和小鼠模型，需要进一步的人体临床验证 | 探讨肥胖与胰腺导管腺癌之间的分子机制 | 胰腺导管上皮细胞、肥胖患者血清、小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及不同代谢状态的人类血清样本和肥胖小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4596 | 2024-09-09 |
Survival benefit and spatial properties of tertiary lymphoid structures in esophageal squamous cell carcinoma with neoadjuvant therapies
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217178
PMID:39142497
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的生存益处和空间分布 | 首次探讨了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的成熟度和空间分布，并发现成熟的三级淋巴结构是食管鳞状细胞癌的独立预后因素 | 研究样本仅限于359名食管鳞状细胞癌患者，可能存在样本量不足的问题 | 探讨三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的临床相关性和空间分布 | 食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的三级淋巴结构 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 359名食管鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4597 | 2024-09-09 |
Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in metastatic renal cell carcinoma and effect of anti-angiogenesis therapy in the pancreas metastatic lesion
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217193
PMID:39159881
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性，并评估了抗血管生成治疗的效果 | 首次通过单细胞RNA测序详细解析了胰腺转移灶的肿瘤微环境，并探讨了抗血管生成治疗的影响 | 研究样本量有限，可能影响结果的普适性 | 揭示转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性及其治疗效果 | 转移性肾细胞癌的胰腺转移灶及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括大量原发和转移性病灶样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4598 | 2024-09-09 |
ALOX15+ M2 macrophages contribute to epithelial remodeling in eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.04.019
PMID:38705258
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研究论文 | 研究探讨了ALOX15+ M2巨噬细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）上皮重塑中的作用 | 首次揭示了ALOX15+ M2巨噬细胞在eCRSwNP上皮重塑中的特定作用及其机制 | 研究主要基于体外实验和空间转录组分析，缺乏体内实验验证 | 探究ALOX15+ M2巨噬细胞在eCRSwNP上皮重塑中的作用及其机制 | 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中的上皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 空间转录组学和单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类鼻上皮细胞（hNECs）和巨噬细胞系THP-1的共培养系统 | NA | NA | NA | NA |
| 4599 | 2024-09-09 |
The nasal basal cell population shifts toward a diseased phenotype with impaired barrier formation capacity in allergic rhinitis
2024-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.04.021
PMID:38705259
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研究论文 | 研究过敏性鼻炎中鼻腔基底细胞群体向疾病表型的转变及其屏障形成能力受损的情况 | 首次详细研究了过敏性鼻炎中基底细胞的行为变化及其与慢性屏障破坏机制的关系 | 研究主要集中在鼻腔基底细胞的转录组和功能变化，未涉及其他可能影响屏障功能的细胞类型 | 研究过敏性鼻炎中基底细胞亚型及其在健康对照组中的差异 | 鼻腔基底细胞及其在过敏性鼻炎中的表型和功能变化 | 数字病理学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA | 非过敏性和屋尘螨过敏的过敏性鼻炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4600 | 2024-09-09 |
scRNA-seq reveals the landscape of immune repertoire of PBMNCs in iMCD
2024-Sep, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03128-8
PMID:39147879
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系，并识别了潜在的治疗靶点 | NA | 阐明iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系，并识别潜在的治疗靶点 | iMCD患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | Castleman病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |