单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 4581 - 4600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4581 | 2024-09-04 |
Decoding single-cell molecular mechanisms in astrocyte-to-iN reprogramming via Ngn2- and Pax6-mediated direct lineage switching
2024-Jul-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01989-z
PMID:39068473
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研究论文 | 本研究通过Ngn2和Pax6介导的直接谱系转换，探讨了星形胶质细胞向诱导神经元（iN）重编程的单细胞分子机制 | 本研究揭示了星形胶质细胞向诱导神经元重编程的关键基因和通路，为优化重编程过程提供了新的见解 | NA | 阐明星形胶质细胞向诱导神经元重编程的分子动力学 | 星形胶质细胞和诱导神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用10×Genomics平台进行了单细胞RNA测序，涉及的细胞数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4582 | 2024-09-04 |
CHAI: consensus clustering through similarity matrix integration for cell-type identification
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae411
PMID:39207729
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研究论文 | 本文介绍了CHAI方法，通过集成相似性矩阵的共识聚类技术来识别单细胞RNA测序数据的细胞类型 | CHAI方法集成了七种最先进的聚类方法，并展示了在多个基准数据集上的优越性能 | NA | 解决在单细胞RNA测序数据中选择最佳聚类方法的问题 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 多个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4583 | 2024-09-04 |
Systemic and skin-limited delayed-type drug hypersensitivity reactions associate with distinct resident and recruited T cell subsets
2024-Jul-23, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178253
PMID:39042477
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研究论文 | 本研究利用先进技术探讨了不同类型的药物过敏反应中皮肤驻留记忆T细胞（TRMs）和招募T细胞亚群的起源、表型和功能 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和细胞内转录组和表位的测序（CITE-Seq）以及T细胞受体测序（TCR-Seq），揭示了系统性和皮肤局限性药物过敏反应中T细胞亚群的差异 | NA | 探究不同严重程度的药物过敏反应中致病性T细胞的起源、表型和功能 | 皮肤驻留记忆T细胞（TRMs）和招募T细胞亚群 | 免疫学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），细胞内转录组和表位的测序（CITE-Seq），T细胞受体测序（TCR-Seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4584 | 2024-09-04 |
Disease-specific T cell receptors maintain pathogenic T helper cell responses in postinfectious Lyme arthritis
2024-Jul-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179391
PMID:38963700
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、高通量T细胞受体（TCR）测序和单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了来自欧洲抗生素耐药性莱姆关节炎（ARLA）患者关节中的CD4+ Th细胞，旨在揭示疾病特异性Th细胞的分子程序。 | 研究发现了在ARLA患者中特异性的TCR-β基序，并将其与特定的HLA-DRB1*11或*13等位基因相关联，这些等位基因在欧洲患者中更为常见，为ARLA的诊断提供了新的生物标志物。 | 研究主要集中在欧洲患者群体，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他地区或不同遗传背景的患者。 | 阐明抗生素耐药性莱姆关节炎中疾病特异性Th细胞的分子机制。 | 来自欧洲ARLA患者关节中的CD4+ Th细胞。 | 免疫学 | 莱姆关节炎 | 流式细胞术、高通量T细胞受体（TCR）测序、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | T细胞受体（TCR）序列、RNA序列 | 来自欧洲ARLA患者的关节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4585 | 2024-09-04 |
DIS3 ribonuclease is essential for spermatogenesis and male fertility in mice
2024-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202579
PMID:38953252
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研究论文 | 本文研究了RNA外泌体相关DIS3核糖核酸酶在维持精子发生和雄性生育力中的关键作用 | 首次揭示了DIS3核糖核酸酶在精子发生中的关键作用，特别是在维持精子干细胞稳态和促进生殖细胞分化方面 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人类研究来验证这些发现 | 探讨DIS3核糖核酸酶在精子发生和雄性生育力中的作用 | 精子干细胞和生殖细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 建立了雄性生殖细胞Dis3条件性敲除小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4586 | 2024-09-04 |
De novo identification of CD4+ T cell epitopes
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02255-0
PMID:38658646
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研究论文 | 本文介绍了使用SABR-IIs平台进行CD4 T细胞抗原发现的方法，该平台能够展示共价连接的肽段并诱导信号传导 | 开发了一种新的SABR-IIs平台，用于快速、灵活、可扩展和多功能的CD4 T细胞配体从头鉴定 | NA | 探索和鉴定CD4 T细胞的抗原特异性 | CD4 T细胞及其抗原识别 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4587 | 2024-09-04 |
CHAI: Consensus Clustering Through Similarity Matrix Integration for Cell-Type Identification
2024-Mar-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585758
PMID:38562750
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研究论文 | 本文介绍了CHAI方法，通过集成相似矩阵的共识聚类来识别单细胞RNA测序数据的细胞类型 | CHAI采用了一种众包方法，结合了七种最先进的聚类方法的结果，提供了改进的性能，并支持多组学数据的集成 | NA | 解决在单细胞RNA测序数据分析中选择最佳聚类方法的挑战 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | 多种基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4588 | 2024-09-04 |
Reclassify High-Grade Serous Ovarian Cancer Patients Into Different Molecular Subtypes With Discrepancy Prognoses and Therapeutic Responses Based on Cancer-Associated Fibroblast-Enriched Prognostic Genes
2024, Biomedical engineering and computational biology
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11795972241274024
PMID:39221174
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研究论文 | 本研究基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因，将高级别浆液性卵巢癌患者重新分类为具有不同预后和治疗反应的分子亚型 | 首次基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因对高级别浆液性卵巢癌患者进行重新分类，并发现这些亚型对传统化疗和免疫治疗的反应存在差异 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 旨在通过癌症相关成纤维细胞富集的预后基因，筛选出预后不良和治疗反应不佳的高级别浆液性卵巢癌患者 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其治疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织样本来自TCGA和GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 4589 | 2024-09-03 |
Dynamic changes in pyroptosis following spinal cord injury and the identification of crucial molecular signatures through machine learning and single-cell sequencing
2024-Aug-26, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2024.116449
PMID:39217701
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后细胞焦亡的动态变化，并通过机器学习和单细胞测序技术识别了关键的分子特征 | 本文首次通过机器学习算法和单细胞测序数据分析，揭示了脊髓损伤后细胞焦亡的时序动态变化和关键分子特征 | NA | 阐明脊髓损伤后细胞焦亡的主要细胞类型和相关关键基因 | 脊髓损伤后的细胞焦亡及其相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了BV2细胞和脊髓组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4590 | 2024-09-03 |
Dissociation of Human and Mouse Tumor Tissue Samples for Single-cell RNA Sequencing
2024-Aug-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66766
PMID:39221955
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研究论文 | 本文介绍了一种快速通用的组织解离协议，用于从人和小鼠肿瘤组织样本中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）。 | 开发了一种快速通用的解离协议，适用于多种类型的人和小鼠肿瘤样本，确保了单细胞悬液的纯净和活力。 | 解离过程可能影响单细胞的交叉污染和数据质量，以及可能导致敏感细胞群的消除和应激反应基因的上调。 | 旨在克服现有解离技术的局限性，提高单细胞RNA测序的质量和可靠性。 | 人及小鼠的肿瘤组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 多种类型的人和小鼠肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4591 | 2024-09-03 |
[Recent advances in capillary electrophoresis-mass spectrometry analysis of trace biomolecules]
2024, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.24036
PMID:39218679
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综述 | 本文综述了毛细管电泳-质谱（CE-MS）在痕量生物分子分析中的最新进展，特别是单细胞分析方面 | 结合高灵敏度的纳米电喷雾电离质谱（MS）和在线样品预浓缩方法，能够检测到纳摩尔至亚纳摩尔级别的生物分子 | NA | 探讨和总结CE-MS在痕量生物分子分析中的应用，特别是单细胞分析 | 痕量生物分子，特别是单细胞中的代谢物、蛋白质、脂质等 | 分析化学 | NA | 毛细管电泳（CE）、纳米电喷雾电离质谱（MS） | NA | 生物分子 | 单细胞级别 | NA | NA | NA | NA |
| 4592 | 2024-09-02 |
PPIC-labeled CAFs: Key players in neoadjuvant chemotherapy resistance for gastric cancer
2024-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102080
PMID:39116799
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研究论文 | 本文研究了胃癌中与新辅助化疗耐药性相关的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特定亚群，特别是PPIC标记的CAFs。 | 首次揭示了PPIC标记的CAF亚群在胃癌新辅助化疗耐药性中的关键作用，并探讨了其可能的信号通路机制。 | 需要进一步研究PPIC标记的CAF在胃癌药物耐药性中的确切机制。 | 探讨胃癌中新辅助化疗耐药性的机制，特别是与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的关系。 | 胃癌患者的新辅助化疗耐药性和癌症相关成纤维细胞（CAFs）。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 109例耐药组和55例敏感组胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4593 | 2024-09-02 |
Navigating the Landscape of Intestinal Regeneration: A Spotlight on Quiescence Regulation and Fetal Reprogramming
2024-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23176
PMID:38267367
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综述 | 本文综述了肠道再生过程中静息状态调节和胎儿重编程的关键作用 | 强调了静息干细胞和复苏干细胞在肠道再生中的重要性，并探讨了其潜在的临床应用 | NA | 探讨肠道再生过程中干细胞的调控机制及其临床应用潜力 | 肠道组织再生中的静息干细胞和复苏干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 类器官系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4594 | 2024-09-02 |
μ-Opioid receptor transcriptional variants in the murine forebrain and spinal cord
2024-Aug-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148890
PMID:39187136
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研究论文 | 本文通过长读RNA测序、空间和单细胞转录组学技术，全面研究了小鼠中枢神经系统中μ-阿片受体编码基因Oprm1的转录变体 | 发现了小鼠Oprm1基因的主要转录本具有一个长的3'非翻译区，这与人类OPRM1主要转录本同源，并编码相同的保守C端氨基酸序列 | NA | 探索Oprm1基因在小鼠中枢神经系统中的转录变体及其功能意义 | 小鼠的前脑和脊髓中的μ-阿片受体转录变体 | 分子生物学 | NA | 长读RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列 | 小鼠的丘脑、纹状体、皮质和脊髓组织 | NA | NA | NA | NA |
| 4595 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
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综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制，以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用，以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展，但耐药机制仍然是一个挑战，需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制，以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4596 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性，强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性，且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能，并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4597 | 2024-09-02 |
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-Aug, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108832
PMID:38936066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吸烟相关肺气肿中M2巨噬细胞比例的增加，并发现circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化，从而参与吸烟诱导的肺气肿。 | 本研究首次揭示了circADAMTS6在吸烟相关肺气肿中的新机制，即通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探索吸烟诱导肺气肿的分子机制，并寻找潜在的诊断和治疗标志物。 | 吸烟相关肺气肿中的M2巨噬细胞极化和circADAMTS6的作用机制。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4598 | 2024-09-02 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals a Positive Correlation between Ferroptosis and Beta-Cell Dedifferentiation in Type 2 Diabetes
2024-Jul-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081687
PMID:39200152
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了铁死亡与2型糖尿病中β细胞去分化之间的潜在关联 | 首次揭示了铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化过程中的作用，并识别了关键的转录因子和长非编码RNA | 研究仅基于公共数据集，未进行体内实验验证所有发现 | 探究铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化中的作用 | 2型糖尿病患者的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4599 | 2024-09-02 |
Identifying cell states in single-cell RNA-seq data at statistically maximal resolution
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012224
PMID:38995959
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法Cellstates，用于在单细胞RNA测序数据中以统计上最大分辨率识别细胞状态 | Cellstates工具直接操作原始数据，自动确定最佳分区和聚类数量，无需可调参数，并且能够从第一原理推导出唯一解 | NA | 旨在解决在单细胞RNA测序数据中准确识别不同基因表达状态的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4600 | 2024-09-02 |
MR1-restricted T cell clonotypes are associated with "resistance" to Mycobacterium tuberculosis infection
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166505
PMID:38716731
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研究论文 | 研究探讨了MR1限制性T细胞克隆型与抵抗结核分枝杆菌感染之间的关系 | 发现MR1限制性T细胞克隆型与抵抗结核分枝杆菌感染有关，揭示了人类MR1T细胞TCR谱系的捐赠者特异性多样性 | NA | 研究MR1限制性T细胞与抵抗结核分枝杆菌感染的关联 | MR1限制性T细胞克隆型及其与结核分枝杆菌感染的关系 | NA | 结核病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 18,251个MR1T细胞，来自8名捐赠者 | NA | NA | NA | NA |