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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-06 |
scCRT: a contrastive-based dimensionality reduction model for scRNA-seq trajectory inference
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae204
PMID:38701412
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研究论文 | 提出了一种基于对比学习的降维模型scCRT，用于单细胞RNA测序数据的轨迹推断 | 整合了细胞级成对模块和集群级对比模块，充分利用上游分析的先验信息学习准确的细胞表示 | NA | 开发专门用于单细胞RNA测序轨迹推断的降维方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习降维模型 | 基因表达数据 | 54个真实数据集和81个合成数据集，总计135个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-10-06 |
scEWE: high-order element-wise weighted ensemble clustering for heterogeneity analysis of single-cell RNA-sequencing data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae203
PMID:38701413
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研究论文 | 提出一种基于高阶元素加权策略的单细胞RNA测序数据集成聚类方法scEWE | 提出高阶元素加权策略，为单个细胞分配不同的基聚类权重，并提取细胞间的高阶信息增强相似性关系表示能力 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的异质性分析性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-06 |
A New Method for Constructing Macrophage-Associated Predictors of Treatment Efficacy Based on Single-Cell Sequencing Analysis
2024 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000497
PMID:37982646
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研究论文 | 基于单细胞测序分析构建巨噬细胞相关治疗疗效预测因子的新方法 | 开发了基于单细胞测序的巨噬细胞相关风险评分(TRS)模型，能够预测结直肠癌患者的预后和治疗反应 | NA | 构建结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的预后预测模型并评估其治疗预测价值 | 结直肠癌患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2025-10-06 |
A low level of tumor necrosis factor α in tumor microenvironment maintains the self-renewal of glioma stem cells by Vasorin-mediated glycolysis
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae147
PMID:39093693
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤微环境中低水平TNFα通过Vasorin介导的糖酵解维持胶质瘤干细胞自我更新的机制 | 首次揭示低水平TNFα通过VASN介导的糖酵解促进胶质瘤干细胞自我更新的新机制 | 未明确说明样本规模和研究局限性 | 探索肿瘤微环境中TNFα对胶质瘤干细胞自我更新的调控作用及其临床意义 | 胶质瘤干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,RNA测序,单细胞RNA测序,质谱分析 | 体外和体内模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-06 |
Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis
2024-Oct, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02803-7
PMID:39095528
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研究论文 | 通过整合免疫转录组分析识别卵巢癌中由四种趋化因子主导的免疫活性亚型 | 首次在卵巢癌中发现由CXCL9、CXCL10、CXCL11和CXCL13四种趋化因子主导的免疫活性亚型，并揭示其与良好预后的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证；样本来源多样可能存在批次效应 | 探索卵巢癌中Th-1免疫反应与临床预后的关系，识别免疫活性亚型 | 卵巢癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 免疫特征分类模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，病理图像数据 | 2850个卵巢癌样本（来自19个数据集），39个单细胞测序样本，39个免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组分析，免疫组织化学 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
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研究论文 | 本研究揭示了嗜碱性粒细胞通过下调IL-17A表达在皮肤机械损伤后屏障功能恢复中的保护作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过拮抗IL-17A对表皮和脂质代谢基因表达的影响，促进皮肤屏障功能恢复 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中得到验证 | 探究皮肤机械损伤后屏障功能恢复的分子机制 | 小鼠皮肤机械损伤模型 | 免疫学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症小鼠模型和单细胞测序数据，揭示了Spock2作为内皮细胞关键时间序列基因在脓毒症心肌病中的保护作用 | 首次发现Spock2是脓毒症心肌病中内皮细胞的关键时间依赖性差异表达基因，并证实其具有抗凋亡保护功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类脓毒症患者中进行验证 | 探究脓毒症心肌病的发病机制 | 脓毒症小鼠模型和人类脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析, 时间序列分析, 免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | GSE171546和GSE207363数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae216
PMID:38725155
|
研究论文 | 开发了一个名为Escort的新框架，用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹属性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策选择的框架，减少了方法选择的不确定性 | NA | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择的不确定性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞早期神经元发育过程中的差异表达基因及其调控网络 | 首次在人类胚胎干细胞神经元分化过程中系统识别了539个差异表达基因，并构建了包含转录因子和miRNA的基因调控网络 | 研究仅基于体外培养的干细胞分化模型，未验证在体内环境中的适用性 | 阐明早期人类大脑发育的分子机制和转录调控动态 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化至神经元的细胞 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎干细胞分化第26天和第54天的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae233
PMID:38770716
|
研究论文 | 提出一种名为EMOGEA的RNA-seq数据分析框架，专门用于处理时序RNA-seq数据和低计数基因表达分析 | 开发了能够整合测量不确定性的分析框架，特别适用于监测动态现象，并能处理低计数转录本和小倍数变化的基因表达 | NA | 改进时序RNA-seq数据的分析方法，提高对动态基因调控过程的理解 | 时序RNA-seq数据，包括斑马鱼胚胎发育和小鼠植入前胚胎的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | EMOGEA框架 | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2025-10-06 |
Revealing cell-cell communication pathways with their spatially coupled gene programs
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae202
PMID:38706319
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研究论文 | 提出一种名为IGAN的新方法，通过空间相邻细胞间的基因关联网络推断细胞间通讯及其上下游通路 | 首次实现估计两个特定空间相邻单细胞间的基因关联网络，并构建全景细胞互作-通路图谱 | NA | 开发能够探索细胞间通讯上下游通路的新计算方法 | 空间相邻的单个细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基因关联网络 | 空间转录组数据 | 多个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data imputation using bi-level feature propagation
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae209
PMID:38706317
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据插值的双层特征传播方法 | 开发了scBFP方法，通过两步图特征传播同时利用基因-基因和细胞-细胞关系，避免影响非零值并减少噪声传播 | 未明确说明方法在极端稀疏数据或特定细胞类型中的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪声、丢失事件和稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图特征传播 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2025-10-06 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
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研究论文 | 本研究探讨了Jagged1在肥胖小鼠胰岛Notch信号激活和胰岛素分泌缺陷中的作用 | 首次证明β细胞Jagged1足以但非必要引起肥胖小鼠的胰岛Notch活性和胰岛素分泌缺陷 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的主要来源，机制仍需进一步阐明 | 研究Jagged1在肥胖诱导的β细胞功能障碍中的作用机制 | 高脂饮食喂养小鼠、瘦素受体缺陷小鼠、2型糖尿病患者胰岛 | 分子生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 葡萄糖耐量测试, 葡萄糖刺激胰岛素分泌测定 | 转基因小鼠模型, 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种小鼠模型和人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-06 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
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研究论文 | 本研究发现了COPD肺气肿特异性肺泡II型细胞亚群，并证明其再生能力受损 | 首次鉴定出位于扩张远端肺泡囊中的肺气肿特异性ATII细胞亚群(asATII细胞)，该细胞共表达肺泡标志物和气道俱乐部细胞标志物 | 研究主要基于单细胞测序和类器官实验，需要进一步体内功能验证 | 探究COPD中肺组织再生障碍的潜在驱动因素 | 人类和小鼠的肺泡II型细胞和气道俱乐部细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，谱系标记，肺泡类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据，空间定位数据 | 人类和小鼠COPD模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-06 |
Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202307-1310OC
PMID:38568479
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研究论文 | 本研究利用数字空间转录组技术识别肺动脉高压中血管病变的独特分子特征 | 首次在微观水平上系统比较IPAH不同类型血管病变的分子特征，发现丛状病变和IPAH外膜具有最显著的基因表达差异 | 样本量相对有限（IPAH=11，对照=5），仅分析了转录组水平的变化 | 验证IPAH血管病变表达独特分子谱的假设 | 特发性肺动脉高压患者的肺血管病变和对照肺动脉 | 数字病理 | 肺动脉高压 | 数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | IPAH肺组织11例，对照肺动脉5例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-06 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨利用系统生物学和单细胞测序技术识别候选基因，通过合成生物学方法协调植物生长、发育与环境响应的策略 | 提出整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学来解析基因多效性，建立基因型-表型关系的新方法 | NA | 开发通过工程化植物激素信号传导来协调植物生长、发育与环境响应的育种和基因工程策略 | 植物基因网络和信号通路 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, 基因编辑(CRISPR), 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-06 |
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42848
PMID:38508862
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研究论文 | 本研究探讨滑膜组织中氧脂素与血浆氧脂素的相关性及其与滑膜组织学模式的关系 | 首次系统分析炎症关节中滑膜氧脂素与血浆氧脂素的相关性，并发现5-脂氧合酶衍生的氧脂素在淋巴-髓系富集滑膜中特异性高表达 | 样本量有限（32例滑膜组织和26例配对血浆样本），仅纳入类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 确定炎症关节中滑膜氧脂素是否与血浆氧脂素及滑膜组织学模式相关 | 已确诊的类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 液相色谱-串联质谱法, 单细胞RNA测序 | NA | 生物分子数据, 基因表达数据 | 32例滑膜组织样本和26例配对血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-06 |
Molecular Changes Implicate Angiogenesis and Arterial Remodeling in Systemic Sclerosis-Associated and Idiopathic Pulmonary Hypertension
2024-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320005
PMID:38841857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者肺组织中血管细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示肺动脉高压中三种疾病相关内皮细胞亚群的特征及其分子调控机制 | 样本量有限（特发性肺动脉高压组仅3例），且使用离体肺组织可能无法完全反映疾病早期变化 | 阐明系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压的血管病理生物学机制 | 系统性硬化症相关肺动脉高压患者（16例）、特发性肺动脉高压患者（3例）和健康对照者（15例）的离体肺组织 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 34例人类肺组织样本（16例SSc-PH，3例IPAH，15例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-06 |
Expression of L1 Cell Adhesion Molecule, a Nephronal Principal Cell Marker, in Nephrogenic Adenoma
2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100540
PMID:38901674
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定L1CAM作为肾源性腺瘤的潜在生物标志物，并揭示了其与肾单位集合管主细胞的表达关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术发现L1CAM可作为肾源性腺瘤的特异性生物标志物，并建立了肾单位特异性标志物组合 | 样本量有限（35例患者样本），需要更大规模研究验证标志物的临床适用性 | 探索肾源性腺瘤的细胞起源并开发特异性诊断标志物 | 肾源性腺瘤患者组织样本及正常尿路上皮、前列腺组织等对照样本 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 35例肾源性腺瘤患者样本及多种对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-06 |
Identification of novel compound heterozygous ZFP36L2 variants implicated in oocyte maturation defects and female infertility
2024-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-024-03154-1
PMID:38829516
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研究论文 | 本研究通过鉴定ZFP36L2新型复合杂合变异并揭示其在卵母细胞成熟缺陷和女性不孕中的作用机制 | 首次发现ZFP36L2复合杂合变异与人类卵母细胞转录组改变的直接关联，并系统阐明其通过影响ZFP36L2-CNOT6L复合物功能和mRNA降解导致卵母细胞成熟缺陷的分子机制 | 研究样本量有限，功能验证主要在HeLa细胞和小鼠卵母细胞中进行，人类卵母细胞数据相对较少 | 探索卵母细胞成熟缺陷的发病机制 | 携带卵母细胞成熟缺陷的患者及其家系成员，HeLa细胞，小鼠和人类卵母细胞 | 生殖医学 | 女性不孕症 | 全外显子组测序，Sanger测序，实时RT-PCR，单细胞RNA测序，瞬时转染 | NA | 基因组数据，转录组数据，蛋白质相互作用数据 | 1名患者及其家系成员，HeLa细胞系，小鼠和人类卵母细胞样本 | NA | 全外显子组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |