单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-08-06 |
Single-cell profiling reveals a conserved role for hypoxia-inducible factor signaling during human craniotomy infection
2024-11-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101790
PMID:39426374
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类开颅术后感染中缺氧诱导因子信号传导的保守作用 | 首次对人类开颅术后感染组织进行单细胞转录组分析，发现粒细胞系髓源性抑制细胞可能来源于迁移的中性粒细胞，并鉴定出保守的缺氧诱导因子信号特征 | 研究仅基于回顾性数据和小鼠模型验证，需要更多前瞻性研究确认其临床转化价值 | 探讨人类开颅术后感染的细胞和分子特征，特别是缺氧诱导因子信号的作用 | 人类开颅术后感染组织及小鼠金黄色葡萄球菌开颅感染模型 | 单细胞转录组学 | 开颅术后感染 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2500例开颅手术的回顾性队列及患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2026-08-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404775121
PMID:39471215
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康绝经前女性子宫细胞，构建了包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了39种细胞亚型的一致注释系统 | 首次整合多个数据集构建正常子宫细胞图谱，解决命名冲突并提出共识注释系统，识别多种潜在祖细胞 | 未提及 | 描绘健康绝经前女性子宫的细胞异质性和动态变化，为子宫功能及疾病研究提供基础 | 健康绝经前女性的子宫内膜和肌层细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康绝经前个体，超过50,000个细胞，并与15名个体的公共数据联合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-08-06 |
Storm: Incorporating transient stochastic dynamics to infer the RNA velocity with metabolic labeling information
2024-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012606
PMID:39556617
|
研究论文 | 提出一种名为Storm的动力学方法，通过求解随机微分方程，利用代谢标记信息推断RNA速度，适用于瞬态过程的时间分辨单细胞RNA测序数据 | 该方法解决了先前方法在瞬态过程中的不足，直接处理计数数据，并放宽参数恒定假设，实现基因-细胞特异性的转录/剪接速率估计 | 未在文中明确说明局限性 | 开发一种能够从代谢标记scRNA-seq数据中推断RNA速度和动力学参数的随机方法，以分析瞬态转录调控 | 时间分辨的单细胞RNA测序数据（tscRNA-seq） | 单细胞转录组学 | 不涉及具体疾病 | 代谢标记scRNA-seq | 随机微分方程模型 | 单细胞基因表达计数数据 | 未在摘要中说明 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2026-08-06 |
scGRN-Entropy: Inferring cell differentiation trajectories using single-cell data and gene regulation network-based transfer entropy
2024-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012638
PMID:39585902
|
研究论文 | 提出scGRN-Entropy方法，利用单细胞数据和基因调控网络中的传递熵推断细胞分化轨迹 | 该方法通过整合基因表达空间的静态关系和基因调控网络（GRN）空间的动态变化，改进了分化轨迹推断的准确性 | 文中未提及明显局限性 | 提高从单细胞RNA测序数据推断细胞分化轨迹和伪时间的准确性 | 细胞分化过程 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 最小生成树算法 | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2026-08-06 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-10, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
|
综述 | 本文回顾了研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的当前和未来方法，并比较了人类研究与动物模型的优缺点。 | 强调单细胞RNA测序在分析眼内液体低细胞产量样本中的优势，并提倡结合历史病理数据和人类免疫表型与动物研究进行转化医学研究。 | 当前单细胞RNA测序技术成本高且劳动密集，且人类研究多局限于组织学或液体取样，可能无法完全反映眼内免疫反应的复杂性。 | 探索人类葡萄膜炎眼内免疫反应的研究方法，并推动超越动物模型的转化研究。 | 人类葡萄膜炎患者的眼内组织和液体样本，包括眼内液体、外周血及病理标本。 | 数字病理学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织病理学 | NA | 图像，文本 | 不适用（综述性文章，未报告具体样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2026-08-06 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
|
研究论文 | 本研究通过3D生物打印共培养胶质母细胞瘤与间充质基质细胞，探讨血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次利用3D生物打印技术重建胶质母细胞瘤与血管周围微环境细胞的共培养模型，并证实该模型能恢复肿瘤趋化因子谱的多样性，揭示了血管周围微环境细胞在调节胶质瘤趋化因子微环境中的关键作用 | 研究仅基于两种胶质母细胞瘤细胞系和间充质基质细胞，可能不能完全代表体内肿瘤微环境的复杂性，且未深入探讨具体分子机制 | 探究胶质母细胞瘤肿瘤微环境中血管周围微环境细胞对趋化因子表达的贡献，并验证3D生物打印共培养模型在模拟肿瘤微环境中的效用 | 胶质母细胞瘤细胞系U-251和DK-MG，间充质基质细胞，以及公开的胶质母细胞瘤组织转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系和一种间充质基质细胞 | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-08-06 |
Metabolic reprogramming and heterogeneity during the decidualization process of endometrial stromal cells
2024-07-30, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01763-y
PMID:39080628
|
研究论文 | 本研究整合月经周期子宫内膜和孕早期母胎界面的单细胞RNA测序数据，解析基质成纤维细胞在蜕膜化过程中的代谢特征和异质性 | 首次利用scRNA-seq数据全面描绘人子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中的代谢动态景观，揭示氨基酸和鞘脂代谢增加及代谢异质性 | 基于公共数据集的二次分析，缺乏体内功能验证，跨物种比较可能受进化差异影响 | 阐明人子宫内膜蜕膜化过程中基质细胞的代谢重编程和异质性 | 人子宫内膜基质成纤维细胞、蜕膜细胞，以及猪、牛、小鼠的子宫组织数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个公共scRNA-seq数据集，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2026-08-06 |
Glioma hexokinase 3 positively correlates with malignancy and macrophage infiltration
2024-06, Metabolic brain disease
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11011-023-01333-0
PMID:38687460
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析及多组学数据，全面评估了己糖激酶3在胶质瘤中的表达分布及其与巨噬细胞浸润和肿瘤微环境的关系 | 首次全面研究HK3与胶质瘤肿瘤微环境特性的关联，揭示其与巨噬细胞浸润的正相关性及对免疫抑制微环境的诱导作用 | 摘要中未提及研究局限性 | 探讨HK3在胶质瘤中的表达、预后意义及其与巨噬细胞浸润和肿瘤微环境的关系 | 胶质瘤患者样本及多种癌症类型的泛癌数据 | 生物信息学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据, 基因组数据 | 基于多个公共数据库（GTEx, CCLE, TCGA, CGGA）和TIMER网站的预测数据 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 449 | 2026-08-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583985
PMID:38559249
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康绝经前女性子宫的细胞异质性和动态变化，构建了包含超过167K细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了39种亚型的共识注释系统。 | 创新点在于提供了全面的正常子宫细胞图谱，解决了先前研究中的命名冲突，并识别出多种潜在祖细胞，包括跨谱系多能基质祖细胞。 | 研究样本量有限，且未包含多种病理状态，可能限制了对疾病相关变化的全面理解。 | 旨在描绘健康绝经前女性子宫的细胞组成和动态变化，为子宫功能及其疾病的基础研究提供参考。 | 健康绝经前女性的子宫内膜和肌层细胞，以及产后和绝经后子宫样本。 | 单细胞组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 5名健康绝经前个体（超过50,000个细胞）及先前发表的15名受试者数据，总计超过167K细胞，另包括1个产后和1个绝经后样本 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 450 | 2026-08-06 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
|
研究论文 | 本文提出了一种基于效应量谱的多物种单细胞转录组数据分析方法，作为传统差异表达分析的替代方案，用于整合小样本和多生物数据。 | 该方法利用效应量谱替代基于p值的传统差异分析，并基于效应量指标建立谱图，以连接不同物种的细胞类型簇，尤其在批次效应主导的小样本多物种研究中显示出优势。 | 文章未明确说明方法的局限性，但可能包括对效应量谱的阈值选择依赖性和在极端小样本或强批次效应下的稳健性仍需进一步验证。 | 证明基于效应量谱的方法在多物种单细胞RNA测序数据整合中，尤其是在小样本和批次效应存在时，是传统差异表达分析的有效替代方案。 | 人类和牛外周血单核细胞，以及来自多个物种的已发表scRNA-seq数据集，包括结核分枝杆菌刺激的细胞。 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据（单细胞转录组） | 人类和牛外周血单核细胞的小样本数据，具体数量未在摘要中提供。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-08-06 |
Glyoxalase 1: Emerging biomarker and therapeutic target in cervical cancer progression
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299345
PMID:38870176
|
研究论文 | 本研究评估了乙二醛酶1在宫颈癌中的表达及功能，表明其上调与癌症进展相关，并作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次结合免疫组化、体外实验、单细胞RNA测序和公共基因表达数据综合分析GLO1在宫颈癌中的作用，揭示其在糖酵解代谢中的参与 | 研究样本量有限，且未深入探讨GLO1在临床应用中具体机制 | 探究GLO1在宫颈癌进展中的表达和功能，评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 宫颈癌患者样本和HeLa细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序、基因集变异分析、微阵列数据分析 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 58名宫颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2026-08-05 |
Deciphering cuproptosis-related signatures in pediatric allergic asthma using integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq analysis
2024-10, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2024.2349596
PMID:38687912
|
研究论文 | 利用整合的单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，解码儿童过敏性哮喘中的铜死亡相关特征 | 首次在儿童过敏性哮喘中系统分析铜死亡相关基因表达及免疫细胞浸润，并结合多种机器学习算法构建预测模型 | 未明确提及局限性 | 探讨铜稳态失衡是否导致儿童过敏性哮喘的铜死亡，并构建诊断预测模型 | 儿童过敏性哮喘患者样本及公共数据集 | 生物信息学、机器学习 | 过敏性哮喘 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、加权基因共表达网络分析、机器学习算法 | SVM、RF、XGBoost、GLM | 基因表达数据 | 包含GSE40732、GSE40888和GSE193816数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2026-08-05 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-06-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和过继转移实验，发现小鼠肾移植耐受中，移植物内浸润的细胞毒性CD8+ T细胞被重编程为衰竭/调节性表型，由IFN-γ介导，这一过程依赖于调节性三级淋巴器官的形成。 | 首次揭示肾移植耐受中细胞毒性CD8+ T细胞的功能障碍作为一种保护性机制，并命名为“防御性耐受”，且与肿瘤内的免疫逃逸机制相似。 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性；且CD8+ T细胞在耐受维持中的非必需性需更多探讨。 | 阐明肾移植耐受中浸润的细胞毒性CD8+ T细胞功能重编程的机制及其在移植耐受和肿瘤免疫抵抗中的意义。 | 小鼠肾移植模型中的移植物、浸润的CD8+ T细胞、调节性三级淋巴器官，以及肿瘤组织中的类似细胞类型。 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、过继转移 | 未明确指定 | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肾移植和肿瘤模型的样本；具体数量未在标题和摘要中给出。 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 454 | 2026-08-05 |
An attenuated lymphocytic choriomeningitis virus vector enhances tumor control in mice partly via IFN-I
2024-06-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178945
PMID:38861331
|
研究论文 | 本研究报道了一种基于减毒淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（r3LCMV）的非裂解性病毒载体在小鼠肿瘤模型中展现出显著的抗肿瘤效果，并揭示了其部分通过I型干扰素（IFN-I）发挥作用的机制。 | 首次报道了减毒LCMV载体r3LCMV在多种肿瘤模型中具有强效抗肿瘤效果，并在免疫缺陷小鼠中仍有效，提示多种途径参与，且诱导训练免疫，并通过单细胞RNA测序揭示IFN-I的关键作用。 | 研究主要基于小鼠模型，其抗肿瘤效果在人类中的适用性及安全性仍需进一步验证。 | 评估基于减毒淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的病毒载体在小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制。 | 小鼠肿瘤模型及多种免疫缺陷小鼠（Rag1-/-和MyD88-/-） | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种肿瘤模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2026-08-05 |
The cycling and aging mouse female reproductive tract at single-cell resolution
2024-02-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.01.021
PMID:38325365
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学系统描绘了小鼠雌性生殖道在动情周期、蜕膜化和衰老过程中的细胞及基因表达变化，揭示了成纤维细胞在组织重塑中的核心作用，并提出了周期性重塑驱动衰老相关纤维化和慢性炎症的模型。 | 首次以单细胞分辨率全面解析小鼠雌性生殖道各器官（卵巢、输卵管、子宫、宫颈、阴道）在动情周期各阶段、蜕膜化及衰老过程中的形态和基因表达变化，并揭示成纤维细胞在组织重塑中的器官特异性作用，提出并验证了周期性重塑导致衰老相关纤维化的新模型。 | 研究基于小鼠模型，其发现可能不完全适用于人类；化学消融周期性实验可能引入非生理性干扰；具体分子机制和临床转化仍需进一步研究。 | 系统表征小鼠雌性生殖道在生殖周期和衰老过程中的细胞和分子变化，并探讨周期性重塑对器官衰老的影响。 | 小鼠雌性生殖道组织，包括卵巢、输卵管、子宫、宫颈和阴道。 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 衰老相关疾病（如纤维化、慢性炎症） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、形态学图像 | 不同动情周期阶段、蜕膜化和衰老过程中的小鼠雌性生殖道组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3‘文库制备，10x Visium空间转录组学（具体版本未提及） |
| 456 | 2026-08-04 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
|
研究论文 | 介绍了一种名为IN-DEPTH的同一张切片空间多组学整合方法，并结合SGCC分析，揭示了EBV阳性与阴性弥漫大B细胞淋巴瘤中肿瘤微环境的空间重组和免疫调节轴 | 提出IN-DEPTH方法，实现了同一张切片上单细胞空间蛋白质组学和转录组学的无缝整合，且不损失RNA信号；引入k-带限谱图互相关（SGCC）用于整合空间多组学分析，支持多模态洞察 | 摘要中未提及明确的局限性，可能包括方法的可扩展性或对特定平台依赖等 | 开发一种资源高效、可扩展的空间多组学方法，以解析肿瘤微环境中的空间组织和细胞间相互作用 | 淋巴组织和EBV阳性及阴性弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）肿瘤微环境 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL） | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | SGCC（谱图跨相关） | 空间转录组和蛋白质组数据、图像 | 样本包括淋巴组织和DLBCL肿瘤样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 457 | 2026-08-04 |
Unraveling the molecular architecture of autoimmune thyroid diseases at spatial resolution
2024-07-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50192-5
PMID:39003267
|
研究论文 | 利用空间转录组学解析自身免疫性甲状腺疾病（如格雷夫斯病和桥本甲状腺炎）的分子结构、细胞异质性及空间分布 | 首次在空间分辨率下揭示AITD中受损的抗原呈递甲状腺滤泡细胞（CD74和MIF高表达）及两种成纤维细胞亚群（ADIRF肌成纤维细胞和炎性成纤维细胞）的分布，并发现窗孔状PLVAP血管在GD中增加 | 未提供具体样本量及功能验证实验，仅基于转录组数据推断细胞亚群功能 | 探索自身免疫性甲状腺疾病中甲状腺组织内不同细胞类型（如滤泡细胞、基质细胞、免疫细胞）的分子结构、异质性和空间位置，以揭示疾病发病机制 | 自身免疫性甲状腺疾病（格雷夫斯病和桥本甲状腺炎）患者的甲状腺组织样本 | 空间转录组学 | 自身免疫性甲状腺疾病（包含格雷夫斯病和桥本甲状腺炎） | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA（未报告具体样本数量） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 458 | 2026-08-04 |
Therapeutic potential of the secreted Kazal-type serine protease inhibitor SPINK4 in colitis
2024-07-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50048-y
PMID:38997284
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现SPINK4在结肠炎中动态变化，并验证其作为IBD血清标志物及治疗靶点的潜力 | 首次揭示SPINK4在结肠炎中的动态调控机制，证明其通过Kazal样基序调节EGFR-Wnt/β-catenin和Hippo通路促进杯状细胞分化，并与TNF-α抑制剂英夫利昔单抗具有协同治疗潜力 | 未明确提及研究局限性 | 探索SPINK4在结肠炎中的治疗潜力及其作为IBD生物标志物的可行性 | 结肠炎小鼠模型及IBD患者 | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals plasmid constrains bacterial population heterogeneity and identifies a non-conjugating subpopulation
2024-07-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49793-x
PMID:38997267
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了质粒对细菌群体异质性的影响，并鉴定出一个不转录接合转移基因的亚群。 | 首次利用微生物分裂-池连接转录组学在单细胞水平揭示质粒对细菌亚群形成的约束作用，并识别出非接合亚群。 | 摘要中未提及局限性。 | 探究质粒与宿主相互作用对细菌群体转录异质性的影响。 | 同源细菌群体及其携带的质粒。 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（微生物分裂-池连接转录组学） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2026-08-04 |
A fibroblast-dependent TGF-β1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis promotes epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-07-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174598
PMID:38980870
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官模型，揭示了成纤维细胞依赖的TGF-β1/sFRP2非经典Wnt信号轴在特发性肺纤维化中促进上皮化生的机制 | 首次发现sFRP2是TGF-β1的新型成纤维细胞靶基因，并阐明其通过非经典Wnt信号激活AEC2向基底细胞转化的机制 | 研究主要基于离体模型和活检组织，体内动态过程仍需进一步验证 | 阐明肺泡成纤维细胞与上皮细胞之间的相互作用在肺纤维化上皮化生中的机制，并评估EGCG的治疗潜力 | 间质性肺病患者的活检组织、非患病供体组织、AEC2-成纤维细胞共培养类器官和精密切割肺切片 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 包含ILD患者、非患病供体和终末期ILD患者的活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |