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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 4561 - 4580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4561 | 2024-10-12 |
Macrophage profiling in atherosclerosis: understanding the unstable plaque
2024-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01023-z
PMID:38244055
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 重新定义了传统的巨噬细胞模型，引入了基于深度无偏单细胞方法的多种免疫和非免疫细胞群 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的表型和功能特性，以及单细胞RNA测序研究在免疫学方面的进展 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4562 | 2024-10-12 |
Identification of a senescence-related transcriptional signature to uncover molecular subtypes and key genes in hepatocellular carcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311696
PMID:39383169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，分析了肝细胞癌患者的基因表达特征，识别出与衰老相关的分子亚型和关键基因 | 本研究开发了一个肝细胞癌特异性的细胞衰老风险模型，并识别出G6PD作为潜在的衰老相关靶点 | 由于肿瘤异质性和缺乏通用的细胞衰老标志物，准确测量不同类型肿瘤中的细胞衰老水平具有挑战性 | 研究肝细胞癌中与衰老相关的分子特征 | 肝细胞癌患者的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4563 | 2024-10-12 |
Integrating transcriptomics, eQTL, and Mendelian randomization to dissect monocyte roles in severe COVID-19 and gout flare
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1385316
PMID:39385934
|
研究论文 | 本文通过整合转录组学、eQTL和孟德尔随机化方法，探讨了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的作用 | 本文首次综合利用单细胞RNA测序、大规模全基因组关联研究和表达数量性状位点数据，分析了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的分子机制 | 本文主要依赖于现有数据集的分析，缺乏实验验证 | 阐明单核细胞在痛风和COVID-19中的分子基础，以开发更有效的治疗方法 | 单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的功能 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及严重COVID-19、痛风和正常对照组的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4564 | 2024-10-12 |
Batch-effect correction in single-cell RNA sequencing data using JIVE
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae134
PMID:39387061
|
研究论文 | 本文提出了一种增强的JIVE方法，用于大规模单细胞RNA测序数据的批次效应校正 | 本文改进了JIVE方法，使其适用于大规模单细胞数据，并引入了新的应用场景 | NA | 解决单细胞RNA测序分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | JIVE | 基因表达数据 | 多个单细胞测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4565 | 2024-10-11 |
Machine learning based on biological context facilitates the identification of microvascular invasion in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Oct-10, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgae052
PMID:39086220
|
研究论文 | 本研究利用随机森林模型构建了一个预测微血管侵犯（MVI）的模型，并揭示了其生物学基础 | 本研究首次结合单细胞转录组测序、全外显子测序和蛋白质组测序，构建了一个高准确性的MVI预测模型，并揭示了MVI相关的生物学机制 | 本研究仅限于肝内胆管癌，未涵盖其他类型的癌症 | 开发一个高准确性的微血管侵犯预测模型，并揭示其生物学机制 | 肝内胆管癌中的微血管侵犯 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序、全外显子测序、蛋白质组测序 | 随机森林模型 | 基因组数据、蛋白质组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4566 | 2024-10-11 |
The axis of tumor-associated macrophages, extracellular matrix proteins, and cancer-associated fibroblasts in oncogenesis
2024-Oct-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03518-8
PMID:39375726
|
综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生中的相互关系 | 利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞外基质蛋白的多样性及其在细胞间信号传导中的作用 | 需要整合单细胞数据并建立一个连贯的框架 | 探讨肿瘤微环境中细胞外基质蛋白、肿瘤相关巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用 | 肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4567 | 2024-10-11 |
Phenotype remodelling of HNSCC cells in the muscle invasion environment
2024-Oct-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05607-8
PMID:39375763
|
研究论文 | 研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞在肌肉侵袭环境中的表型重塑及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次揭示了肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用，并发现了G0S2作为肌肉侵袭性癌细胞的新标记物 | NA | 研究肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞及其在肌肉侵袭环境中的表型变化 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间RNA测序（ST） | NA | RNA测序数据 | 共使用了来自多个数据集的168个样本，包括scRNA-seq数据（N=55）、空间RNA-seq数据（N=4）和转录组数据（N=109） | NA | NA | NA | NA |
| 4568 | 2024-10-11 |
Absent, but not glucocorticoid-modulated, corticotropin-releasing hormone (Crh) regulates anxiety-like behaviors in mice
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614550
PMID:39386648
|
研究论文 | 研究探讨了皮质酮释放激素（Crh）在调节小鼠焦虑样行为中的作用，特别是在下丘脑-垂体-肾上腺（HPA）轴中的作用 | 发现下丘脑Crh的表达在原发性肾上腺功能不全或地塞米松（DEX）治疗下并不改变小鼠的焦虑行为 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Crh在下丘脑-垂体-肾上腺轴中的作用及其对焦虑样行为的影响 | 小鼠的焦虑样行为和下丘脑Crh的表达 | NA | NA | 空间转录组学和ELISA | NA | 行为数据和生物标志物 | 野生型（WT）小鼠、原发性肾上腺功能不全（KO）小鼠和Crh全局缺失（KO）小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4569 | 2024-10-11 |
Tobacco smoking is associated with sex- and plaque-type specific upregulation of CRLF1 in atherosclerotic lesions
2024-10, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 研究探讨了烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因表达的影响，并分析了性别和斑块类型的特异性上调 | 首次揭示了烟草吸烟导致的动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因的性别和斑块类型特异性上调 | 研究样本量相对较小，且仅限于颈动脉斑块 | 探讨烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块基因表达的影响及其性别特异性 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 625个颈动脉斑块（151个女性和474个男性） | NA | NA | NA | NA |
| 4570 | 2024-10-11 |
Combined inhibition of CTPS1 and ATR is a metabolic vulnerability in p53-deficient myeloma cells
2024-Oct, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70016
PMID:39380841
|
研究论文 | 研究评估了在p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞中，CTPS1和ATR的联合抑制是否会导致代谢上的可操作弱点 | 首次展示了CTPS1和ATR的联合抑制在p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞中诱导细胞死亡的协同效应 | NA | 探索p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞的代谢弱点，并评估CTPS1和ATR联合抑制的治疗潜力 | p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 24个患者样本，10个STP-B处理的多发性骨髓瘤细胞系，以及NCI-H929异种移植的NOD-scid IL2Rgamma小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4571 | 2024-10-11 |
Spatial transcriptomics reveals modulation of transcriptional networks across brain regions after auditory threat conditioning
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614979
PMID:39386587
|
研究论文 | 研究通过空间转录组学分析揭示了听觉威胁条件反射后大脑区域间转录网络的调节 | 首次通过空间转录组学技术全面分析了听觉威胁条件反射后大脑区域间的基因表达差异及其转录连接性 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨听觉威胁条件反射后大脑区域间的基因表达变化及其转录网络的调节 | 小鼠大脑的皮质和皮质下区域 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 RNAseq 分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4572 | 2024-10-11 |
Collaborative Structure-Preserved Missing Data Imputation for Single-Cell RNA-Seq Clustering
2024 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3404013
PMID:38776196
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ColImpute的协作结构保持缺失数据插补方法，用于单细胞RNA-seq聚类分析 | 本文提出了一种新的协作结构保持缺失数据插补方法ColImpute，通过集成聚类结构保持插补模块和子空间聚类模块，实现了缺失数据插补和细胞亚型识别的协同训练 | NA | 提高单细胞RNA-seq数据中缺失值插补的准确性，并改善细胞类型识别的效果 | 单细胞RNA-seq数据中的缺失值插补和细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4573 | 2024-10-11 |
scVSC: Deep Variational Subspace Clustering for Single-Cell Transcriptome Data
2024 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3405731
PMID:38801694
|
研究论文 | 提出了一种基于深度表示神经网络的无监督聚类算法scVSC，用于单细胞转录组数据分析 | 将变分推断引入子空间模型，对潜在空间施加正则化约束，防止过拟合 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类准确性和运行效率 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度变分子空间聚类模型 | 转录组数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4574 | 2024-10-11 |
scATAcat: cell-type annotation for scATAC-seq data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae135
PMID:39380946
|
研究论文 | 提出了一种名为scATAcat的新方法，利用批量ATAC-seq数据作为原型来注释scATAC-seq数据 | scATAcat方法的创新之处在于利用已知的批量ATAC-seq数据作为原型，而不是依赖基因表达模式 | 文章未明确提及scATAcat方法的局限性 | 开发一种新的方法来注释scATAC-seq数据中的细胞类型 | scATAC-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | NA | scATAC-seq数据 | 多个数据集，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4575 | 2024-10-11 |
Distinct melanocyte subpopulations defined by stochastic expression of proliferation or maturation programs enable a rapid and sustainable pigmentation response
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002776
PMID:39163475
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序研究了人类和斑马鱼皮肤中黑色素细胞的分化与增殖程序的分离现象 | 首次揭示了黑色素细胞中分化与增殖程序的随机表达机制，并通过系统方法构建了基因调控网络 | 研究主要集中在体外培养的黑色素细胞，对体内环境的适用性有待验证 | 探讨紫外线辐射下皮肤色素沉着反应的分子机制 | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 基因调控网络 | RNA+ATAC | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4576 | 2024-10-11 |
Single-cell RNA sequencing unveils unique transcriptomic signatures of endothelial cells and role of ENO1 in response to disturbed flow
2024-Jan-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318904121
PMID:38261622
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞在不同流体剪切力下的独特转录组特征，并探讨了ENO1在响应扰流中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了扰流和脉动剪切力对内皮细胞转录组的影响，并揭示了ENO1在响应扰流中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证结果 | 探讨不同流体剪切力对内皮细胞转录组的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞及其在扰流和脉动剪切力下的转录组变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个内皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4577 | 2024-10-11 |
Machine learning-based discovery of UPP1 as a key oncogene in tumorigenesis and immune escape in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475206
PMID:39380997
|
研究论文 | 本文通过机器学习方法发现UPP1基因在胶质瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 本文首次将UPP1识别为胶质瘤发生和免疫逃逸的关键驱动基因 | NA | 揭示胶质瘤发生和进展的分子机制，以改进治疗和患者预后 | 胶质瘤样本的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 大规模胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4578 | 2024-10-10 |
VSIG4 induces the immunosuppressive microenvironment by promoting the infiltration of M2 macrophage and Tregs in clear cell renal cell carcinoma
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113105
PMID:39260310
|
研究论文 | 本文研究了VSIG4在透明细胞肾细胞癌中通过促进M2巨噬细胞和Tregs的浸润来诱导免疫抑制微环境的作用 | 发现了新的免疫检查点靶点VSIG4，并探讨了其在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗耐药性的关系 | NA | 探索透明细胞肾细胞癌中的新型免疫治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌中的免疫相关基因VSIG4及其在免疫抑制微环境中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 多组学数据分析、病理学审查、批量转录组数据、单细胞测序、Western blotting、免疫组化、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、病理图像 | 训练组：36个正常组织和267个透明细胞肾细胞癌组织；验证组：36个正常组织和266个透明细胞肾细胞癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 4579 | 2024-10-10 |
Sequencing-based study of neural induction of human dental pulp stem cells
2024-Nov, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01121-7
PMID:39210197
|
研究论文 | 本研究评估了通过神经诱导的人类牙髓干细胞（DPSCs）获得的神经谱系细胞的细胞成分和分化途径 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）详细研究了DPSCs的神经诱导特性及其分化状态 | 研究主要集中在体外培养的DPSCs，未涉及体内实验 | 评估人类牙髓干细胞在神经诱导后的细胞成分和分化途径 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）及其神经诱导后的细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4580 | 2024-10-10 |
Label-free high-throughput impedance-activated cell sorting
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00487f
PMID:39315634
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研究论文 | 提出了一种基于阻抗检测和双膜泵的无标记、高通量、高精度的细胞分选系统 | 利用FPGA的低延迟特性，实现了实时双频单细胞阻抗检测，并实现了高吞吐量和高精度的单颗粒分选 | NA | 开发一种无标记、高通量、高精度的细胞分选系统，以应用于早期癌症诊断、细胞分化研究、药物筛选和单细胞测序等领域 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞 | NA | NA | 阻抗检测 | NA | 细胞 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞，每秒处理5 × 10个细胞，实验中Jurkat和MDA-MB-231细胞的吞吐量达到每秒1000个细胞 | NA | NA | NA | NA |