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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4521 | 2024-09-06 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-Aug, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,识别并验证了与膀胱癌肿瘤微环境相关的预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了膀胱癌的预后模型,并验证了其预测性能 | 研究主要基于公共数据库的数据,未来需进行体外验证 | 阐明膀胱癌进展中肿瘤微环境与细胞多样性的关系,并构建预后模型 | 膀胱癌的肿瘤微环境相关基因及预后模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的正常和肿瘤膀胱细胞数据,以及TCGA的病人随访数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4522 | 2024-09-06 |
Dystrophin deficiency impairs cell junction formation during embryonic myogenesis from pluripotent stem cells
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110242
PMID:39040067
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研究论文 | 研究了肌营养不良蛋白缺乏对人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了肌营养不良蛋白缺乏导致细胞在体节阶段分化为替代分支,并影响了细胞状态转换相关的细胞连接蛋白 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内模型 | 探讨肌营养不良蛋白缺乏对胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中的细胞连接形成 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 4523 | 2024-09-06 |
Single-cell decoding of drug induced transcriptomic reprogramming in triple negative breast cancers
2024-Jul-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03318-3
PMID:39026273
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研究论文 | 研究探讨了三阴性乳腺癌中单细胞转录组在药物诱导下的重编程机制 | 首次结合单细胞转录组和基因组拷贝数数据,揭示了药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的克隆响应和转录重编程 | 研究仅限于三阴性乳腺癌,且样本量相对较小 | 探讨药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的转录组重编程机制 | 三阴性乳腺癌细胞的单细胞转录组和基因组拷贝数数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53,641个过滤后的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4524 | 2024-09-06 |
A Novel Mechanism of MSCs Responding to Occlusal Force for Bone Homeostasis
2024-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241236120
PMID:38665065
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研究论文 | 研究了咬合力对骨稳态的影响机制,特别是MSC在失去咬合力后对牙槽骨的影响 | 首次揭示了咬合力通过Yap/Taz/Ptn轴调控MSC介导的血管生成,从而维持牙槽骨稳态的机制 | 研究仅在鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨失去咬合力后牙槽骨损失的机制 | 鼠牙槽骨中的非造血细胞(CD45细胞) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠牙槽骨中的非造血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4525 | 2024-09-06 |
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01837-8
PMID:36302966
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析了来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官对羟考酮和丁丙诺啡的不同转录反应 | 首次在单细胞水平上揭示了羟考酮和丁丙诺啡对iPSC衍生的脑类器官的不同转录反应,特别是丁丙诺啡对胶质细胞的显著影响和羟考酮诱导的I型干扰素信号 | 研究仅限于男性OUD患者,样本量较小,且仅进行了7天的药物处理 | 探讨阿片类药物对脑细胞类型功能的单细胞水平调控机制 | 来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官 | 单细胞转录组学 | 阿片类药物使用障碍 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | Seurat整合分析管道 | 转录组数据 | 3名男性OUD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4526 | 2024-09-06 |
BEST4+ cells in the intestinal epithelium
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00042.2024
PMID:38557358
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综述 | 本文综述了BEST4+细胞在人类肠上皮中的新发现及其潜在功能 | BEST4+细胞是单细胞转录组学揭示的一种新型成熟吸收细胞,具有独特的基因表达谱 | 大多数关于BEST4+细胞功能的假设缺乏功能验证,特别是由于小鼠中不存在BEST4+细胞 | 总结现有关于BEST4+细胞的文献,强调其在健康和疾病中肠上皮的预测作用 | BEST4+细胞及其在肠上皮中的功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类、猕猴、猪、斑马鱼和兔子的肠上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4527 | 2024-09-06 |
Distinct subpopulations of human subcutaneous adipose tissue precursor cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-04-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00726.2023
PMID:38581663
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人体皮下脂肪组织前体细胞的不同亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人体皮下脂肪组织前体细胞的不同亚群,并分析了这些亚群在不同部位的特异性表达 | 研究样本仅来自八名女性,且未涉及男性样本,可能存在性别差异的影响 | 探讨人体皮下脂肪组织前体细胞在不同部位的差异及其对脂肪生成的影响 | 人体皮下腹部和臀股部脂肪组织中的脂肪来源干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 八名女性 | NA | NA | NA | NA |
| 4528 | 2024-09-06 |
IL-36 Regulates Neutrophil Chemotaxis and Bone Loss at the Oral Barrier
2024-04, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231225413
PMID:38414292
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研究论文 | 研究探讨了IL-36家族在口腔屏障中调节中性粒细胞趋化性和骨丢失的机制 | 首次揭示了IL-36γ在口腔屏障中通过纤维母细胞促进中性粒细胞趋化性的作用,并阐明了其在牙周炎中的病理生理功能 | 研究主要集中在体外和体内实验,缺乏临床数据支持 | 探讨纤维母细胞在口腔屏障中驱动中性粒细胞趋化信号的特定调节机制 | IL-36家族在口腔屏障中的作用及其对中性粒细胞趋化性和骨丢失的影响 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和鼠类牙龈上皮细胞及鼠类中性粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4529 | 2024-09-06 |
CD52 mRNA expression predicts prognosis and response to immune checkpoint blockade in melanoma
2024-03, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13151
PMID:37975535
|
研究论文 | 研究CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应预测价值 | 首次分析了CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和预测免疫检查点阻断反应的作用,并探讨了其与不同免疫细胞亚群和免疫检查点表达的关系 | 研究样本量有限,且仅基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据,缺乏临床试验验证 | 探讨CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应的预测价值 | CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 445例未治疗的黑色素瘤患者和121例接受抗PD-1免疫检查点阻断的黑色素瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4530 | 2024-09-06 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于去除单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 首次提出了一种计算模型来研究单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应 | 未提及 | 研究单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据的集成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞RNA测序数据,单细胞ATAC测序数据 | 多个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4531 | 2024-09-06 |
IRF9 and STAT1 as biomarkers involved in T-cell immunity in atherosclerosis
2024, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39234946
|
研究论文 | 研究旨在识别与程序性细胞死亡(PCD)相关的生物标志物,并探索动脉粥样硬化的关键调控机制 | 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单细胞RNA测序数据,识别了与动脉粥样硬化相关的免疫细胞类型和关键基因 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据,缺乏实验验证 | 识别与动脉粥样硬化相关的生物标志物和调控机制 | 动脉粥样硬化和对照组的基因表达数据,以及单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GSE20129和GSE23746的基因表达数据,GSE159677的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4532 | 2024-09-05 |
Single-cell spatial transcriptomics in cardiovascular development, disease, and medicine
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101163
PMID:39224111
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研究论文 | 本文介绍了单细胞空间转录组学在心血管发育、疾病和医学中的应用,并强调了其在心血管研究中的最新进展。 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,提供了对心血管疾病发病机制的多维度、多层次、多视角和动态的理解。 | NA | 探讨单细胞空间转录组学技术在心血管疾病风险分层和个体化治疗中的应用。 | 心血管疾病的发病机制、细胞间相互作用以及疾病进展的时空特征。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4533 | 2024-09-05 |
Single-cell sequencing reveals that specnuezhenide protects against osteoporosis via activation of METTL3 in LEPR+ BMSCs
2024-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176908
PMID:39154827
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | 首次揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | NA | 阐明骨质疏松发病机制并提出新型治疗药物 | 骨质疏松和LEPR+ BMSCs | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠骨质疏松模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4534 | 2024-09-05 |
CelltypeR: A flow cytometry pipeline to characterize single cells from brain organoids
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110613
PMID:39224516
|
研究论文 | 本文开发了一个完整的流程,用于在复杂组织中可重复地表征细胞类型,特别是脑组织和诱导多能干细胞(iPSC)衍生的脑模型 | 结合流式细胞术(FC)抗体面板与计算流程CelltypeR,实现了数据对齐、无监督聚类优化、细胞类型注释和统计比较 | NA | 开发一个通用的方法,用于在复杂组织中可重复地识别细胞类型 | 人诱导多能干细胞衍生的中脑类器官中的主要脑细胞类型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 流式细胞术(FC), 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4535 | 2024-09-05 |
Gut Microbiota Defines Functional Direction of Colonic Regulatory T Cells with Unique TCR Repertoires
2024-Sep-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300395
PMID:39101764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了无特定病原体和无菌小鼠结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性,发现肠道微生物群影响结肠调节T细胞的功能方向和克隆型扩展 | 首次揭示了肠道微生物群与免疫细胞相互作用的新模块,该模块可能有助于开发治疗肠道炎症疾病的新疗法 | NA | 研究肠道微生物群如何改变结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性 | 结肠调节T细胞 | 免疫学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无特定病原体和无菌小鼠的结肠调节T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4536 | 2024-09-05 |
Glycolysis in Peritubular Endothelial Cells and Microvascular Rarefaction in CKD
2024-Sep-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000488
PMID:39226371
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研究论文 | 本研究探讨了慢性肾脏病(CKD)中肾小管周围内皮细胞的糖酵解代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | 首次揭示了肾小管周围内皮细胞中糖酵解失调是CKD中微血管稀疏的启动因素,并通过恢复糖酵解改善了微血管稀疏和纤维化病变。 | NA | 研究CKD中肾小管周围内皮细胞的代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | CKD患者的肾小管周围内皮细胞和CKD小鼠模型。 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序和代谢分析 | NA | 细胞代谢数据 | CKD患者和CKD小鼠模型的肾小管周围内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4537 | 2024-09-05 |
The heterogeneity of erythroid cells: insight at the single-cell transcriptome level
2024-Sep, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03903-9
PMID:38953986
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的最新进展及其对红细胞功能异质性、新亚群识别、不同红细胞谱系追踪和命运决定机制揭示的贡献 | 强调了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的应用,特别是在识别前所未知的细胞亚群、分析细胞异质性和单个细胞的转录组特征方面的优势 | NA | 系统总结单细胞转录组测序技术的最新发展及其对红细胞研究的影响 | 红细胞及其在血液中的异质性和功能 | 生命科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4538 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals heterogeneity in epithelial cells between high- and low-grade bladder urothelial carcinoma
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.078
PMID:38796363
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4539 | 2024-09-05 |
Aging-Associated Molecular Changes in Human Alveolar Type I Cells
2024-Sep, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.35534/jrbtm.2024.10012
PMID:39220636
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据,分析了老年人肺泡I型细胞的分子变化 | 首次详细描述了老年人肺泡I型细胞的分子变化,包括细胞衰老和趋化因子基因表达增加,以及上皮特征的减少 | 研究仅限于健康人肺部的数据,未涉及疾病状态下的情况 | 探讨年龄相关的人肺泡I型细胞分子变化机制 | 人肺泡I型细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4540 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironmental infiltration in non-small cell lung cancer with different responses to immunotherapy
2024-Sep, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3736
PMID:39228151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌中主要病理反应(MPR)和非主要病理反应(NMPR)样本的细胞组成,揭示了免疫治疗反应不同的肿瘤微环境差异 | 本研究发现了在MPR和NMPR样本中CD8+ T细胞群体的明显差异,并识别出一系列新的生物标志物,为预测治疗反应和克服免疫治疗耐药性提供了理论基础 | NA | 探索非小细胞肺癌中不同免疫治疗反应的肿瘤微环境差异 | 非小细胞肺癌中的主要病理反应(MPR)和非主要病理反应(NMPR)样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 包括四个主要MPR样本和八个主要NMPR样本 | NA | NA | NA | NA |