单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7511 篇文献，本页显示第 4501 - 4520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4501 | 2024-08-26 |
Mitochondrial DNA Leakage Promotes Persistent Pancreatic Acinar Cell Injury in Acute Pancreatitis via the cGAS-STING-NF-κB Pathway
2024-Aug-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02132-0
PMID:39180578
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研究论文 | 研究探讨了线粒体DNA泄漏通过cGAS-STING-NF-κB途径在急性胰腺炎中促进胰腺腺泡细胞损伤的作用 | 首次研究了cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的潜在炎症机制 | NA | 探讨cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的机制 | 急性胰腺炎患者的血浆和胰腺腺泡细胞 | NA | 急性胰腺炎 | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 血浆, 细胞 | 50名急性胰腺炎患者和10名健康捐赠者的血浆, 以及小鼠和细胞模型 |
| 4502 | 2024-08-26 |
Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes
2024-Aug-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.038
PMID:39047727
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研究论文 | 本文通过整合来自19种主要癌症类型的649名患者的单细胞RNA测序数据，建立了一个全面的人类B细胞资源，并揭示了肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征的显著异质性 | 本文首次识别出应激反应记忆B细胞和肿瘤相关非典型B细胞（TAABs），这两种肿瘤富集亚群具有预后潜力，并在泛癌种中共享 | NA | 深入理解B细胞在癌症发展中的作用 | 肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 649名患者 |
| 4503 | 2024-08-26 |
Prognositic value of anoikis and tumor immune microenvironment-related gene in the treatment of osteosarcoma
2024-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了与肿瘤免疫微环境相关的细胞凋亡（anoikis）基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 首次在骨肉瘤中研究了anoikis及其与肿瘤免疫微环境的关系，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 阐明anoikis及肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 骨肉瘤患者及其肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 51个与肿瘤微环境密切相关的关键anoikis相关基因（ANRGs） |
| 4504 | 2024-08-25 |
A highly neutralizing human monoclonal antibody targeting a novel linear epitope on staphylococcal enterotoxin B
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2024.2360338
PMID:38857905
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs中鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487，并通过X射线晶体学和功能研究验证了其高效中和SEB的能力 | 本研究首次鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487，并揭示了其通过别构效应而非竞争受体结合位点来中和SEB的机制 | NA | 研究旨在发现和验证一种新型的人源单克隆抗体，用于中和SEB的毒性及其引起的感染 | SEB毒素及其引起的中毒性休克综合征 | NA | 中毒性休克综合征 | 单细胞测序，X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs |
| 4505 | 2024-08-25 |
Association Between COVID-19 and Neurological Diseases: Evidence from Large-Scale Mendelian Randomization Analysis and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-03975-2
PMID:38300446
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，探讨了COVID-19与神经系统疾病之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，揭示了SARS-CoV-2感染与癫痫和躁狂等神经系统疾病的因果关系 | 研究未观察到COVID-19对其他特征的显著影响 | 评估SARS-CoV-2感染与神经系统疾病之间的因果关系，并分析SARS-CoV-2在细胞水平的潜在入侵途径 | SARS-CoV-2感染与神经系统疾病的关系 | NA | 神经系统疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 23种细胞亚型 |
| 4506 | 2024-08-25 |
Global transcription regulation revealed from dynamical correlations in time-resolved single-cell RNA sequencing
2024-Aug-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.002
PMID:39121860
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞RNA测序数据，利用代谢标记协议和细胞周期报告系统，开发了一种随机基因表达模型，以揭示细胞生长和分裂过程中细胞大小和细胞周期依赖的转录动力学机制 | 本研究开发了一种高度可扩展的近似贝叶斯计算方法，能够校正技术变异并准确量化细胞周期中绝对爆发频率、爆发大小和降解率，以及转录速率与细胞大小的关系 | NA | 揭示单细胞中全局转录调控的动态机制 | 单细胞转录组动态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机模型 | RNA测序数据 | NA |
| 4507 | 2024-08-25 |
Denoiseit: denoising gene expression data using rank based isolation trees
2024-Aug-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05899-z
PMID:39169300
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DenoiseIt的方法，用于从基因表达数据中去除潜在的异常基因，以构建一个更稳健的基因集，从而提高下游基因表达分析的质量。 | DenoiseIt采用了一种反向搜索方法，结合非负矩阵分解和隔离森林来识别和去除异常基因，与传统的正向基因搜索方法不同。 | NA | 开发一种新的方法来提高基因表达数据分析的质量，通过去除异常基因来增强生物标志物的识别。 | 基因表达数据中的异常基因 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解，隔离森林 | NA | 基因表达数据 | 应用了来自TCGA和COVID-19队列的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
| 4508 | 2024-08-25 |
Integrated bioinformatics analysis and experimental validation reveal the relationship between ALOX5AP and the prognosis and immune microenvironment in glioma
2024-Aug-21, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01991-8
PMID:39169376
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研究论文 | 本文通过综合生物信息学分析和实验验证，揭示了ALOX5AP与胶质瘤预后及免疫微环境之间的关系 | 首次详细探讨了ALOX5AP在胶质瘤中的表达及其与免疫微环境和预后的关联 | NA | 研究ALOX5AP在胶质瘤中的作用及其作为预后和免疫治疗反应预测标志物的潜力 | ALOX5AP在胶质瘤中的表达及其与免疫微环境和预后的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 多重免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据 | 使用了胶质瘤组织微阵列进行验证 |
| 4509 | 2024-08-25 |
Single-cell transcriptome analysis revealed heterogeneity in glycolysis and identified IGF2 as a therapeutic target for ovarian cancer subtypes
2024-Jul-31, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12688-7
PMID:39085784
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中糖酵解的异质性，并确定IGF2为治疗卵巢癌亚型的潜在靶点 | 开发了基于糖酵解评分的新型卵巢癌亚型，并建立了稳定的预后模型 | NA | 探索卵巢癌的分子机制和个性化治疗途径 | 卵巢癌及其亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85种机器学习组合 |
| 4510 | 2024-08-25 |
Immunosuppressive CD29+ Treg accumulation in the liver in mice on checkpoint inhibitor therapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330024
PMID:37770128
|
研究论文 | 本研究使用流式细胞术和单细胞RNA测序技术，探讨了免疫检查点抑制剂治疗前后小鼠肝脏中调节性T细胞（Tregs）的特征和变化 | 发现肝脏中的CD29+ Tregs在免疫检查点抑制剂治疗后数量翻倍，且这种扩张并非由PD-1表达的Tregs主导，而是CD29+ Tregs的特异性反应 | NA | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对肝脏中调节性T细胞的影响及其在肿瘤免疫抵抗中的作用 | 小鼠肝脏中的调节性T细胞（Tregs）及其亚群CD29+ Tregs | 免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠肝脏和脾脏中的Tregs |
| 4511 | 2024-08-25 |
Prediction Model for Therapeutic Responses in Ovarian Cancer Patients using Paclitaxel-resistant Immune-related lncRNAs
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于紫杉醇耐药免疫相关长链非编码RNAs（lncRNAs）的卵巢癌患者治疗反应预测模型 | 首次构建了包含9个紫杉醇耐药免疫相关lncRNAs的预测模型，用于预测卵巢癌患者的免疫治疗和化疗反应及预后 | NA | 开发一种预测卵巢癌患者治疗反应的模型 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | RNA序列数据 | 186个差异表达的紫杉醇耐药lncRNAs和225个免疫相关lncRNAs |
| 4512 | 2024-08-25 |
Multi-transcriptomics analysis of microvascular invasion-related malignant cells and development of a machine learning-based prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1436131
PMID:39176099
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索肝细胞癌中与微血管侵犯相关的恶性细胞，并开发了一种基于机器学习的预后模型 | 本研究首次通过综合多组学分析揭示了与微血管侵犯相关的恶性细胞的生物学功能，并开发了一种新的预后模型 | NA | 探索肝细胞癌中微血管侵犯的机制并开发预后模型 | 肝细胞癌中的微血管侵犯相关恶性细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq | 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 使用TCGA和HCCDB的bulk RNA-seq数据，GEO数据库的单细胞RNA-seq数据，以及CNCB数据库的空间转录组数据 |
| 4513 | 2024-08-25 |
Revealing the regulation of allergic asthma airway epithelial cell inflammation by STEAP4 targeting MIF through machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1427352
PMID:39176391
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和单细胞测序分析，揭示了STEAP4通过调控MIF在过敏性哮喘气道上皮细胞炎症中的作用。 | 首次发现STEAP4在过敏性哮喘中的作用，并通过机器学习和单细胞测序技术验证了其调控MIF的机制。 | 研究主要基于数据库中的微阵列数据和动物模型，尚未在人体中进行直接验证。 | 探索过敏性哮喘气道上皮细胞炎症的调控机制。 | 过敏性哮喘患者的气道上皮细胞。 | 机器学习 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 微阵列数据 | 包括哮喘患者和健康个体的气道上皮样本，以及哮喘小鼠模型。 |
| 4514 | 2024-08-24 |
Identification and experimental validation of immune-related gene PPARG is involved in ulcerative colitis
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167300
PMID:38880160
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研究论文 | 本研究旨在深入理解溃疡性结肠炎（UC）的免疫学特征，并识别有价值的诊断和治疗生物标志物 | 通过生物信息学技术，本研究首次确定了PPARG作为UC的关键生物标志物，并验证了其在UC中的作用及其与巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 深入理解溃疡性结肠炎的免疫学特征并识别生物标志物 | 溃疡性结肠炎及其相关免疫基因PPARG | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序技术 | DNN | 基因表达数据 | UC数据集来自GEO数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 4515 | 2024-08-24 |
Exploring the role of DNMT1 in dental papilla cell fate specification during mouse tooth germ development through integrated single-cell transcriptomics and bulk RNA sequencing
2024-Sep, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2024.06.010
PMID:38942194
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组学和批量RNA测序技术，探索了DNMT1在小鼠牙胚发育中牙乳头细胞命运决定的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序相结合的方法，揭示了DNMT1在早期成牙本质细胞发育中的关键调控作用 | 研究主要集中在胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞，未来研究可以扩展到不同发育阶段和不同物种 | 探究牙齿发育过程中牙间充质细胞的调控机制，特别是成牙本质细胞分化和表观遗传调控的作用 | 小鼠牙胚中的牙间充质细胞和成牙本质细胞分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | 单细胞调控网络推理和聚类（SCENIC） | RNA | 胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞和分离的牙间充质细胞 |
| 4516 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.005
PMID:39059207
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了衰老肾脏早期阶段T细胞的分子表型和组成变化 | 首次详细描述了衰老肾脏中T细胞的分子状态变化和极化现象，并识别出特定亚群的T细胞 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类肾脏衰老的具体情况 | 探究肾脏衰老早期阶段免疫细胞的变化及其分子机制 | 衰老小鼠肾脏中的T细胞和其他免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 4517 | 2024-08-24 |
Resolution of Acinar Dedifferentiation Regulates Tissue Remodeling in Pancreatic Injury and Cancer Initiation
2024-Sep, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.04.031
PMID:38729450
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研究论文 | 本文通过比较转录组分析研究了胰腺损伤和癌症起始过程中腺泡细胞去分化调控的机制。 | 发现Sox4基因在胰腺腺泡细胞去分化过程中起到抑制作用，并揭示了其在维持组织稳态和肿瘤退化中的新功能。 | NA | 探讨胰腺腺泡细胞去分化在胰腺损伤和癌症起始中的作用及机制。 | 胰腺腺泡细胞去分化过程中的Sox4基因及其调控机制。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 4518 | 2024-08-24 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本文研究了抑制肾素表达的调控机制，通过使用不同抑制剂处理As4.1细胞，并利用ATAC-seq、单细胞RNA测序等技术分析了肾素表达的表观遗传调控。 | 首次揭示了肾素表达在细胞中从活跃状态转变为准备状态的表观遗传调控机制，并识别了与肾素调控相关的转录因子基序和基因。 | 研究主要集中在As4.1细胞模型上，可能需要进一步在其他细胞类型或体内模型中验证这些发现。 | 探究肾素表达的表观遗传调控机制及其在细胞功能转换中的作用。 | As4.1细胞（源自小鼠近球小体的肿瘤细胞，持续表达肾素）。 | NA | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 处理和对照的As4.1细胞的生物学重复样本 |
| 4519 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis" [Mol. Immunol. 172 (2024) 85-95]
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.013
PMID:39088936
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4520 | 2024-08-24 |
Single-cell Transcriptomics, Web-based Systems Pharmacology and Integrated Transcriptomics Network Analysis Identified Diagnostic Targets and Drug Candidates for Type 2 Diabetes
2024-Aug-22, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、基于网络的系统药理学和综合转录组网络分析，为2型糖尿病（T2D）识别新的治疗靶点和开发新的诊断模型 | 通过单细胞聚类分析，识别了正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本之间的七个亚群，并筛选出27个关键基因作为T2D的诊断靶点，同时发现MME与DB05490之间具有强结合力，为T2D的治疗提供了有效的候选药物 | NA | 发现2型糖尿病（T2D）的新治疗靶点并开发新的诊断模型 | 2型糖尿病（T2D）的治疗靶点和诊断模型 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本 |