单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 4501 - 4520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4501 | 2024-09-07 |
Single-cell transcriptome atlases of soybean root and mature nodule reveal new regulatory programs that control the nodulation process
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100984
PMID:38845198
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序和分子图谱技术，分析了成熟大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并鉴定了新的调控基因 | 首次对成熟大豆根瘤细胞的转录组进行精确表征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并发现了新的调控基因 | NA | 研究大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示氮固定过程中的新调控机制 | 大豆根和成熟根瘤细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4502 | 2024-09-07 |
A single-cell transcriptome atlas reveals the trajectory of early cell fate transition during callus induction in Arabidopsis
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100941
PMID:38720464
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研究论文 | 研究报告了拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的单细胞转录组时间序列实验，构建了愈伤组织诱导过程的详细单细胞转录组图谱 | 首次揭示了LRPI-like细胞和QC-like细胞在愈伤组织形成早期的细胞命运转变轨迹，并识别了调控这些细胞的转录因子和基因表达特征 | NA | 揭示拟南芥愈伤组织诱导过程中细胞异质性和细胞命运转变的机制 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中的单细胞转录组 | 植物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4503 | 2024-09-07 |
Pericytes recruited by CCL28 promote vascular normalization after anti-angiogenesis therapy through RA/RXRA/ANGPT1 pathway in lung adenocarcinoma
2024-Jul-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03135-3
PMID:39075504
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研究论文 | 研究了CCL28在抗血管生成治疗后通过RA/RXRA/ANGPT1途径促进肺腺癌血管正常化的分子机制 | 首次详细报道了抗血管生成治疗后血管正常化的分子机制 | NA | 探讨抗血管生成治疗后肿瘤血管正常化的分子机制 | 肺腺癌细胞和人源及鼠源的肺腺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序、免疫荧光、多重免疫组化、磁激活细胞分选、实时定量PCR、Western blotting、LC-MS技术、ChIP-qPCR | NA | 细胞、组织 | 人源肺腺癌细胞系A549和鼠源肺腺癌细胞系LLC，以及临床活检样本和原代肺腺癌肿瘤组织中的周细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4504 | 2024-09-07 |
Communication between alveolar macrophages and fibroblasts via the TNFSF12-TNFRSF12A pathway promotes pulmonary fibrosis in severe COVID-19 patients
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05381-7
PMID:39075394
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研究论文 | 研究探讨了TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19患者中促进肺纤维化的机制 | 首次揭示了TNFSF12-TNFRSF12A通路在肺泡巨噬细胞和成纤维细胞间通信中的关键作用 | 研究仅限于体外实验和单细胞RNA测序分析，缺乏体内实验验证 | 探讨严重COVID-19患者中肺纤维化的细胞通信机制 | 肺泡巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 严重COVID-19患者和健康对照的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4505 | 2024-09-07 |
ST-SCSR: identifying spatial domains in spatial transcriptomics data via structure correlation and self-representation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae437
PMID:39228303
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研究论文 | 提出了一种名为ST-SCSR的新算法，用于在空间转录组数据中识别空间域，该算法结合了局部信息、全局信息和空间域的相似性 | ST-SCSR通过矩阵三因子分解同时分解表达谱和空间网络，融合了表达和空间特征，并通过局部保留和稀疏约束增强了图的质量 | NA | 开发一种新的算法来解决现有空间域识别方法中忽略局部信息和空间域关系的问题 | 空间转录组数据中的空间域 | 生物信息学 | NA | 矩阵三因子分解 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4506 | 2024-09-07 |
Advanced sequencing-based high-throughput and long-read single-cell transcriptome analysis
2024-05-14, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00105b
PMID:38669201
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综述 | 本文综述了基于高级测序技术的高通量和长读长单细胞转录组分析方法 | 介绍了下一代测序（NGS）和第三代测序（TGS）技术在解决单细胞转录组分析中低丰度和异质性问题方面的进展 | NA | 探讨单细胞转录组分析在揭示细胞类型、状态及其在发育、健康和疾病中的相互作用中的重要性 | 单细胞转录组 | 基因组学 | NA | NGS, TGS | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4507 | 2024-09-07 |
Proteomic analysis of serum small extracellular vesicles identifies diagnostic biomarkers for neuroblastoma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1367159
PMID:39228987
|
研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 首次通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别出神经母细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 需要进一步的临床验证和大规模样本研究以确认这些生物标志物的诊断效用 | 识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 血清中的小细胞外囊泡 | 蛋白质组学 | 神经母细胞瘤 | 无标签蛋白质组学、多反应监测、Western blot分析 | NA | 蛋白质数据、RNA-seq数据 | 104个差异表达蛋白质，26个潜在生物标志物 | NA | NA | NA | NA |
| 4508 | 2024-09-07 |
Single-cell RNA sequencing in endometrial cancer: exploring the epithelial cells and the microenvironment landscape
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1425212
PMID:39229264
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，探讨了肿瘤细胞和微环境的复杂性 | 本文强调了单细胞RNA测序技术在揭示子宫内膜癌肿瘤细胞和微环境复杂性方面的贡献 | 本文指出了单细胞RNA测序研究中存在的技术偏差和样本量限制，并强调需要更大规模的研究来涵盖更广泛的子宫内膜癌组织学亚型 | 本文旨在通过综述单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，推动对该复杂疾病的理解 | 本文主要研究对象是子宫内膜癌的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 本文未具体提及样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 4509 | 2024-09-07 |
Effects of Leydig cell elimination on testicular interstitial cell populations: characterization by scRNA-seq and immunocytochemical techniques
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1423801
PMID:39229372
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研究论文 | 研究了睾丸间质细胞群在莱迪细胞消除后的变化，并通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术进行了表征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术详细表征了成年大鼠睾丸间质细胞的类型及其动态变化，并分析了莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 研究仅限于成年大鼠，结果可能不适用于其他物种 | 表征睾丸间质细胞的类型及其动态变化，并分析莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 成年大鼠的睾丸间质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术 | NA | 转录组数据 | 成年大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4510 | 2024-09-06 |
Time-resolved scRNA-seq reveals transcription dynamics of polarized macrophages with influenza A virus infection and antigen presentation to T cells
2024-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2024.2387450
PMID:39129565
|
研究论文 | 本研究利用时间分辨单细胞测序技术结合代谢RNA标记，揭示了流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化 | 本研究首次采用时间分辨单细胞测序技术，捕捉了传统scRNA-seq方法所缺乏的转录活动的时间维度，并揭示了M2极化巨噬细胞是支持流感A病毒成功复制的唯一状态 | NA | 研究流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化及其对T细胞抗原呈递能力的影响 | 骨髓来源巨噬细胞在流感A病毒感染后的转录动态变化及其对CD4和CD8 T细胞的抗原呈递能力 | 数字病理学 | 流感 | 时间分辨单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4511 | 2024-09-06 |
Comprehensive scRNA-seq analysis to identify new markers of M2 macrophages for predicting the prognosis of prostate cancer
2024-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2398195
PMID:39221762
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析识别M2巨噬细胞的新标记物，用于预测前列腺癌的预后 | 首次通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析（WGCNA）整合M2巨噬细胞的标记基因和枢纽基因，筛选出前列腺癌的预后基因签名 | 研究主要基于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 探讨M2巨噬细胞在前列腺癌中的预后价值 | M2巨噬细胞及其相关基因在前列腺癌中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 2431个M2巨噬细胞标记基因和650个枢纽基因 | NA | NA | NA | NA |
| 4512 | 2024-09-06 |
Enhanced desmosome assembly driven by acquired high-level desmoglein-2 promotes phenotypic plasticity and endocrine resistance in ER+ breast cancer
2024-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217179
PMID:39154704
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研究论文 | 本研究探讨了desmoglein-2在ER+乳腺癌内分泌治疗耐药性和细胞可塑性中的作用 | 首次揭示了DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的关键作用，并提出了DSG2标志物可能用于治疗干预 | 研究主要基于体外和异种移植模型，需要进一步的临床验证 | 探讨DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的作用机制 | ER+乳腺癌细胞和异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了fulvestrant耐药的ER+乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4513 | 2024-09-06 |
A novel in vitro tubular model to recapitulate features of distal airways: The bronchioid
2024-Sep-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00562-2024
PMID:39231631
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型体外管状模型，用于再现远端气道的特征 | 开发了一种名为bronchioid的模型，通过封装人支气管成体干细胞在海藻酸盐凝胶管状支架中，成功模拟了小气道的结构和功能 | 需要精细控制收缩水平以建立具有生理相关形状和大小的bronchiole模型 | 旨在克服当前体外培养系统的局限性，建立一种能够再现小气道结构和功能的模型 | 人支气管成体干细胞和小气道的结构与功能 | 数字病理学 | NA | 3D成像、基因表达分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从临床样本中提取的人支气管成体干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4514 | 2024-09-06 |
Identification of Therapy-Induced Clonal Evolution and Resistance Pathways in Minimal Residual Clones in Multiple Myeloma through Single-Cell Sequencing
2024-Sep-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0545
PMID:38900040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化和耐药途径 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析多发性骨髓瘤患者治疗前后的骨髓样本，揭示了治疗后转录组进化的三种主要轨迹，并发现了遗传和非遗传因素在驱动克隆进化中的显著相关性 | 样本量相对较小，且仅限于骨髓样本，可能无法全面反映所有患者的治疗反应 | 深入理解多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 38个骨髓样本，包括1个意义未明的单克隆丙种球蛋白病、19个诊断时的多发性骨髓瘤患者、17个治疗后的多发性骨髓瘤患者和1个健康供体 | NA | NA | NA | NA |
| 4515 | 2024-09-06 |
RAB13 regulates macrophage polarization in sepsis
2024-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71771-y
PMID:39223234
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研究论文 | 研究RAB13在脓毒症患者外周血中的核心靶点作用及其分子功能和可能的机制 | 首次揭示RAB13在脓毒症中的潜在核心靶点作用，并通过单细胞测序和细胞实验验证了其促进巨噬细胞向M2表型分化的功能 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者和健康对照组，未来需扩大样本量并纳入更多疾病状态以验证结果的普适性 | 探讨RAB13在脓毒症中的分子功能及其可能的机制 | 脓毒症患者的外周血和单核细胞 | NA | 脓毒症 | RNA-seq, 10×单细胞测序 | NA | RNA | 脓毒症患者21例，健康个体9例 | NA | NA | NA | NA |
| 4516 | 2024-09-06 |
Hematopoiesis after anti-CD117 monoclonal antibody treatment in the settings of wild-type and Fanconi anemia mice
2024-Sep-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.284275
PMID:38572555
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研究论文 | 研究抗CD117单克隆抗体在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血作用 | 发现抗CD117单克隆抗体ACK2在治疗后不会引起短期DNA损伤，并且在范可尼贫血小鼠中增加了集落形成，表明其对造血干细胞的潜在靶向作用 | 未完全探索这些治疗的短期和长期效应 | 评估抗CD117单克隆抗体ACK2在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血效应 | 野生型和范可尼贫血小鼠 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和范可尼贫血小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4517 | 2024-09-06 |
The immune microenvironment of steatotic hepatocellular carcinoma: Current findings and future prospects
2024-Sep-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000516
PMID:39225682
|
研究论文 | 本文综述了非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）的免疫微环境，并探讨了利用单细胞RNA测序、空间转录组学和质谱成像等前沿技术解析其复杂性 | 本文介绍了利用代谢抑制剂、表观遗传抑制剂和免疫调节剂等新型治疗手段，以改善MASH-HCC对PD-1抑制剂的反应 | 本文主要基于临床前模型讨论治疗创新，尚未涉及临床试验数据 | 探讨MASH-HCC的免疫微环境及其对免疫检查点抑制剂的反应，并提出个性化治疗策略 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）及其免疫微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱成像 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4518 | 2024-09-06 |
NKG2C/KLRC2 tumor cell expression enhances immunotherapeutic efficacy against glioblastoma
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009210
PMID:39214651
|
研究论文 | 研究探讨了NKG2C/KLRC2在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达及其对免疫治疗效果的影响 | 发现NKG2C/KLRC2在肿瘤细胞中的高表达与PD-1单克隆抗体治疗效果的增强相关，提示其可能作为免疫检查点抑制剂治疗的预测生物标志物 | 研究结果需要在未来的前瞻性试验中进一步验证 | 探讨NKG2C/KLRC2在GBM中的表达及其对免疫微环境的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其免疫微环境 | 免疫学 | 神经系统肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括大量和单细胞RNA测序的GBM数据集，以及来自两个临床试验的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4519 | 2024-09-06 |
scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Aug-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03345-0
PMID:39152499
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研究论文 | 提出了一种名为scParser的稀疏表示学习方法，用于可扩展的单细胞RNA测序数据分析 | scParser模型能够揭示基因表达如何影响表型的关键机制，并能识别出对疾病发病机制有贡献的细胞亚群中的生物过程 | NA | 开发一种可扩展的方法，用于整合分析单细胞RNA测序数据，并理解不同细胞群体中生物条件的异质性效应 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 稀疏表示学习 | scParser | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4520 | 2024-09-06 |
Periodontal Ligament Cell Apoptosis Activates Lepr+ Osteoprogenitors in Orthodontics
2024-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241262706
PMID:39104161
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研究论文 | 研究了正畸牙齿移动过程中牙槽骨重塑的潜在机制，特别是Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞的作用 | 首次报道了正畸牙齿移动过程中压缩侧的骨形成现象，并揭示了PDLC凋亡激活Lepr+成骨前体细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类中验证 | 探讨正畸牙齿移动过程中新骨形成的潜在机制 | Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析、荧光标记技术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型和体外细胞培养 | NA | NA | NA | NA |