单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 4441 - 4460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4441 | 2024-10-20 |
Unravelling the Complexity of HNSCC Using Single-Cell Transcriptomics
2024-Sep-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16193265
PMID:39409886
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）研究中的应用 | scRNAseq技术能够详细描述肿瘤微环境（TME）中的细胞水平特征，为HNSCC的病因、诊断、预后和治疗提供了新的见解 | NA | 评估scRNAseq在解决HNSCC管理挑战中的效用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4442 | 2024-10-20 |
SELF-Former: multi-scale gene filtration transformer for single-cell spatial reconstruction
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae523
PMID:39413798
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的框架SELF-Former，用于单细胞空间重构任务 | 引入了基因过滤模块，显著提升了空间重构任务的准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据到空间转录组数据的空间重构问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | Transformer | Transformer | 基因表达数据 | 四个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4443 | 2024-10-20 |
SSR1 and CKAP4 as potential biomarkers for intervertebral disc degeneration based on integrated bioinformatics analysis
2024-Mar, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1309
PMID:38222802
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变潜在的生物标志物，并在体外进行了验证 | 本研究首次通过综合生物信息学方法鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变的潜在生物标志物，并在体外实验中验证了其诊断价值 | 本研究的样本量较小，且仅限于人类椎间盘组织，未来需要更大规模和多样本的验证 | 鉴定椎间盘退变的潜在生物标志物并验证其诊断价值 | 椎间盘退变相关的关键基因和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 脊柱疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、MCODE、LASSO算法、ROC曲线、免疫浸润分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 30个人类椎间盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4444 | 2024-10-20 |
Single-cell sequencing reveals increased LAMB3-positive basal keratinocytes and ZNF90-positive fibroblasts in autologous cultured epithelium
2024-01-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05747-5
PMID:38200141
|
研究论文 | 研究在无血清和无饲养层条件下培养的自体表皮移植的安全性和有效性，并与传统条件进行比较 | 发现无血清和无饲养层培养的表皮中LAMB3阳性基底角质形成细胞和ZNF90阳性成纤维细胞数量增加，这些细胞在色素再生中起关键作用 | 研究仅限于稳定期的白癜风患者，未涉及其他疾病或更广泛的患者群体 | 探讨无血清和无饲养层条件下自体表皮移植的安全性和有效性 | 自体表皮移植在无血清和无饲养层条件下的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 稳定期白癜风患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4445 | 2024-10-20 |
Profiling the heterogeneity of colorectal cancer consensus molecular subtypes using spatial transcriptomics
2024-Jan-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00488-4
PMID:38200223
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，解析了结直肠癌共识分子亚型的空间细胞和分子组成 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境中的细胞通讯事件 | NA | 进一步阐明结直肠癌的组成和结构，以推进个性化治疗 | 结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4446 | 2024-10-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor cell heterogeneity and immune microenvironment features of pituitary neuroendocrine tumors
2024-01-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01267-3
PMID:38167466
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了垂体神经内分泌肿瘤的细胞异质性和免疫微环境特征 | 揭示了垂体神经内分泌肿瘤的内在细胞异质性和肿瘤微环境特征，发现了一种新的具有侵袭性特征的皮质激素瘤亚型 | NA | 研究垂体神经内分泌肿瘤的细胞特征和免疫微环境 | 垂体神经内分泌肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4个正常样本和24个垂体神经内分泌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4447 | 2024-10-20 |
ZNF689 deficiency promotes intratumor heterogeneity and immunotherapy resistance in triple-negative breast cancer
2024-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00909-w
PMID:38168642
|
研究论文 | 研究探讨了ZNF689缺乏如何促进三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | 首次揭示了ZNF689缺乏通过激活LINE-1逆转录转座子加剧基因组不稳定性，从而促进肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中肿瘤内异质性与免疫治疗抵抗的关系及其关键决定因素 | 三阴性乳腺癌患者的多组学数据和免疫治疗数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学、流式细胞术 | NA | 多组学数据 | 260例来自本中心的患者、134例来自TCGA的患者和109例接受免疫治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4448 | 2024-10-20 |
scRNA+TCR-seq reveals the pivotal role of dual receptor T lymphocytes in the pathogenesis of Kawasaki disease and during IVIG treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1457687
PMID:39421738
|
研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和TCR-seq技术，分析了健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞，探讨了双受体T细胞在KD发病机制和IVIG治疗中的作用 | 首次揭示了双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的关键作用 | 样本量较小，仅包括3名健康对照和6名KD患者 | 探讨双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的作用 | 健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 川崎病 | scRNA-seq和TCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 3名健康对照和6名KD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4449 | 2024-10-20 |
The role of lactylation in plasma cells and its impact on rheumatoid arthritis pathogenesis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453587
PMID:39421742
|
研究论文 | 研究探讨了乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，首次揭示了乳酸化在浆细胞中的重要作用，并识别出七个核心乳酸化促进基因 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证 | 探索乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 浆细胞和类风湿性关节炎患者 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 10,163个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4450 | 2024-10-19 |
Revolutionizing prognostic predictions in colorectal cancer: Macrophage‑driven transcriptional insights from single‑cell RNA sequencing and gene co‑expression network analysis
2024-Dec, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14721
PMID:39411205
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，揭示了结直肠癌中巨噬细胞驱动的转录组特征，并构建了一个新的预后模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，识别了与巨噬细胞相关的预后生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | 研究结果需要进一步的前瞻性研究验证 | 提高结直肠癌免疫治疗的预后预测准确性 | 结直肠癌中的巨噬细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 基因表达数据 | 23个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4451 | 2024-10-19 |
Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response
2024-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067
PMID:39322177
|
研究论文 | 研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用 | NA | 研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4452 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration
2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2023.2275172
PMID:37902557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用 | 首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化 | NA | 研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物 | 椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 5种NP亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 4453 | 2024-09-27 |
Spatial transcriptomics of acute kidney injury
2024-Nov, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00899-x
PMID:39322738
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4454 | 2024-10-19 |
Ccl5+ Macrophages drive pro-inflammatory responses and neutrophil recruitment in sepsis-associated acute kidney injury
2024-Oct-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113339
PMID:39418726
|
研究论文 | 研究探讨了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症相关急性肾损伤中的促炎反应和嗜中性粒细胞招募的作用 | 首次揭示了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的促炎作用及其通过CCL5-CCR1配体受体对招募嗜中性粒细胞的影响 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 深入了解脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的作用 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4455 | 2024-10-19 |
Cancer-Associated Fibroblasts Expressing Sulfatase 1 Facilitate VEGFA-Dependent Microenvironmental Remodeling to Support Colorectal Cancer
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3987
PMID:39250301
|
研究论文 | 研究揭示了表达硫酸酯酶1（SULF1）的癌症相关成纤维细胞（CAF）在结直肠癌中的促肿瘤作用 | 首次发现SULF1+ CAF通过增强VEGFA的释放促进结直肠癌的微环境重塑和肿瘤进展 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要进一步的人体临床验证 | 探讨癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的分子机制及其治疗潜力 | 结直肠癌患者和表达SULF1的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及结直肠癌患者的单细胞测序数据和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4456 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of a necroptosis-associated diagnostic signature for myelodysplastic syndromes based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Oct-15, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-024-00335-x
PMID:39407301
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，全面分析了与坏死性凋亡相关的骨髓增生异常综合征诊断特征 | 开发了一种新的坏死性凋亡基因特征，用于早期区分和诊断骨髓增生异常综合征 | NA | 探讨坏死性凋亡在骨髓增生异常综合征中的作用和机制，并开发新的诊断特征 | 骨髓增生异常综合征患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 骨髓增生异常综合征患者和健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 4457 | 2024-10-19 |
BRD4 inhibitor reduces exhaustion and blocks terminal differentiation in CAR-T cells by modulating BATF and EGR1
2024-Oct-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00667-w
PMID:39407311
|
研究论文 | 研究探讨了BRD4抑制剂通过调节BATF和EGR1来减少CAR-T细胞的耗竭并阻止其终末分化 | 首次揭示了BRD4抑制剂通过下调BATF活性和表达以及上调EGR1活性和表达来减少CAR-T细胞的耗竭并阻止其终末分化 | 研究仅限于体外实验，未涉及临床试验 | 阐明BRD4抑制剂减少CAR-T细胞耗竭的机制 | CAR-T细胞和BRD4抑制剂 | 细胞治疗 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自白血病患者的耗竭T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4458 | 2024-10-19 |
Pyroptosis-related genes features on prediction of the prognosis in liver cancer: An integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38438
PMID:39416843
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞焦亡相关基因（PRG）对肝癌（LC）预后的影响 | 构建了一个基于细胞焦亡的风险评分模型，用于预测肝癌患者的预后，并发现该模型在区分高风险和低风险患者方面具有显著效果 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，未涉及临床试验验证 | 探讨细胞焦亡相关基因对肝癌预后的影响，并构建预测模型 | 肝癌患者的预后和细胞焦亡相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Lasso Cox回归 | RNA表达数据 | 421个样本（371个肿瘤样本和50个正常样本） | NA | NA | NA | NA |
| 4459 | 2024-10-19 |
Intratumoral STING agonist reverses immune evasion in PD-(L)1-refractory Merkel cell carcinoma: mechanistic insights from detailed biomarker analyses
2024-Oct-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009803
PMID:39401968
|
研究论文 | 本文报道了一例抗PD-L1耐药的Merkel细胞癌患者在接受STING激动剂和抗PD-1抗体联合治疗后，实现了持久的客观缓解，并进行了详细的生物标志物分析 | 首次揭示了STING激动剂在Merkel细胞癌中通过肿瘤微环境中的免疫和基质细胞间接发挥作用，而不一定需要癌细胞表达STING | 研究仅基于单个病例，需要进一步的临床试验验证 | 探讨STING激动剂在PD-(L)1耐药的Merkel细胞癌中的作用机制 | 抗PD-L1耐药的Merkel细胞癌患者及其肿瘤微环境 | NA | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、30参数流式细胞术、T细胞受体测序、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、免疫细胞数据、组织切片数据 | 1例患者，88例Merkel细胞癌肿瘤标本 | NA | NA | NA | NA |
| 4460 | 2024-10-19 |
Computational approach for decoding malaria drug targets from single-cell transcriptomics and finding potential drug molecule
2024-10-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-72427-7
PMID:39402081
|
研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞转录组数据的计算方法，用于识别疟疾药物靶点并预测潜在的药物分子 | 本文创新性地结合了互信息特征选择算法和分类算法，从单细胞转录组数据中筛选出关键蛋白质，并通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析确定重要靶点，最终利用深度学习技术预测潜在药物分子 | 本文仅针对恶性疟原虫进行了研究，未涵盖其他疟原虫种类 | 旨在通过单细胞转录组数据识别疟疾药物靶点，并预测潜在的新药物分子 | 恶性疟原虫的单细胞转录组数据及其蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 转录组数据 | 恶性疟原虫的有性和无性阶段样本 | NA | NA | NA | NA |