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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-11-03 |
Expression of novel androgen receptors in three GnRH neuron subtypes in the cichlid brain
2024-11, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13429
PMID:38986626
|
研究论文 | 本研究通过多种技术方法揭示了慈鲷鱼脑中三种GnRH神经元亚型表达新型雄激素受体的特异性模式 | 首次在慈鲷鱼中明确区分了ar1和ar2基因在三种GnRH神经元亚型中的差异表达,揭示了GnRH1神经元存在遗传学上不同的亚型 | 研究仅针对A. burtoni物种,结果在其他硬骨鱼中的普适性需要进一步验证 | 探究雄激素受体基因在GnRH神经元中的特异性表达模式 | 慈鲷鱼(A. burtoni)脑中的三种GnRH神经元亚型(GnRH1、GnRH2、GnRH3) | 神经科学 | NA | 免疫组织化学, 原位杂交链式反应(HCR), 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 422 | 2025-11-03 |
In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals
2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01308-6
PMID:38890526
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研究论文 | 本研究通过化学混合物在小鼠心脏中原位将心脏成纤维细胞重编程为心肌细胞 | 首次在全心脏水平使用化学混合物CRFVPTM实现原位成纤维细胞向心肌细胞转分化,并采用组织透明化技术进行三维观察 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索化学诱导原位心脏成纤维细胞向心肌细胞转分化的可行性 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织透明化技术, 3D成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 两种品系的基因示踪小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CUBIC组织透明化技术 |
| 423 | 2025-11-03 |
Establishment of a conditionally reprogrammed primary eccrine sweat gland culture for evaluation of tissue-specific CFTR function
2024-Nov, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2024.06.013
PMID:38969603
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研究论文 | 建立条件性重编程的原代外泌汗腺培养体系,用于评估组织特异性CFTR功能 | 首次报道应用条件性重编程和单细胞RNA测序技术研究显微解剖的外泌汗腺 | 样本量有限,仅包含非CF供体和少数CF患者 | 表征外泌汗腺离子转运特性并评估CFTR调节剂疗效 | 外泌汗腺细胞和鼻上皮细胞 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 短路电流测量, 条件性重编程培养 | 原代细胞培养模型 | 基因表达数据, 电生理数据 | 非CF皮肤供体和两名CF患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-11-03 |
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-Nov, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.07.010
PMID:39089570
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学方法,揭示心肌梗死中巨噬细胞不会转化为成纤维细胞,但会表达促纤维化的基质细胞蛋白 | 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术,明确证明心肌梗死中的巨噬细胞不会转分化为成纤维细胞,同时发现其表达多种促纤维化基质蛋白的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究心肌梗死中巨噬细胞是否会发生成纤维细胞转化及其在细胞外基质表达中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对照组和心肌梗死组小鼠的CSF1R+髓系细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-11-03 |
Spatial transcriptomics reveals organized and distinct immune activation in cutaneous granulomatous disorders
2024-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.021
PMID:39098508
|
研究论文 | 通过空间转录组学揭示皮肤肉芽肿性疾病中免疫激活的空间组织模式 | 首次在皮肤肉芽肿性疾病中应用空间转录组学技术,揭示了不同类型疾病特有的空间组织化免疫激活模式 | 样本量有限,仅包含四种皮肤肉芽肿性疾病 | 理解皮肤肉芽肿性疾病的空间基因表达特征 | 皮肤结节病、环状肉芽肿、脂质坏死病和坏死性黄色肉芽肿患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤肉芽肿性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | CS、GA、NL、NXG病例组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-11-03 |
Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320330
PMID:39234691
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性 | 首次将GeoMx空间分析平台与全转录组图谱结合,在保留细胞间信号的同时实现斑块细胞形态和空间分辨的转录组分析 | 样本量较小(每组5例患者),仅使用尸检来源的冠状动脉 | 研究稳定和不稳定斑块中血管微环境的分子特征 | 尸检获取的冠状动脉粥样硬化斑块 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,空间反卷积分析 | NA | 空间转录组数据,组织形态学数据 | 10例患者(稳定斑块组5例,不稳定斑块组5例) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间分析平台与全转录组图谱 |
| 427 | 2025-11-03 |
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01215-0
PMID:39300319
|
研究论文 | 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点,双向调节CD4+T细胞的抗肿瘤免疫 | 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点,通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域染色质状态,双向调控Tconv细胞的抗肿瘤免疫功能 | NA | 探索肝细胞癌中CD4+T细胞的表观遗传调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肝细胞癌浸润的常规CD4+T细胞(Tconvs) | 表观遗传学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2025-11-03 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的调控作用 | 首次揭示LAIT疗法通过调节γδT细胞转录组增强抗肿瘤免疫的机制,发现LAIT独特地增加IL17-producing γδT细胞比例 | 研究仅在小鼠乳腺癌模型中进行,尚未在人体直接验证 | 探究激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞功能动态的影响 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤浸润γδT细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组、PTT组、GC组和LAIT组的小鼠肿瘤样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2025-11-03 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示甲氨蝶呤在系统性炎症下通过损害肺泡上皮细胞干性加重间质性肺病 | 首次在单细胞水平揭示甲氨蝶呤通过损害肺泡上皮细胞干性加重肺纤维化的机制 | 基于小鼠模型的研究结果需在人类患者中进一步验证 | 探究甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病的影响 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-11-02 |
Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.044
PMID:39454576
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据差异表达分析的矩量法框架工具Memento | 开发了可同时分析均值表达、变异性和基因相关性的稳健高效差异分析工具,可扩展至数百万细胞和数千样本 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中区分生物和技术变异源、评估细胞组间定量比较统计显著性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩量法框架 | 基因表达数据 | 70,000气管上皮细胞、160,000 CRISPR-Cas9扰动T细胞、120万外周血单核细胞、5000万细胞CELLxGENE数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2025-10-31 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomic data
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592851
PMID:38765956
|
研究论文 | 开发了一个名为scBSP的快速准确工具,用于从空间转录组数据中识别空间可变基因 | 实现了稀疏矩阵运算,显著提高了计算效率和内存使用,能在10秒内处理包含19,950个基因和181,367个点的高清空间转录组数据 | NA | 开发高效识别空间可变基因的计算工具 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 稀疏矩阵运算 | 空间转录组数据 | 19,950个基因,181,367个点,可达数百万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-30 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.08.607264
PMID:39149388
|
研究论文 | 开发了一种无需超参数调优的广义对比主成分分析方法,用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了超参数自由的广义对比PCA方法,解决了传统对比PCA需要手动调参且无法对称比较两个实验条件的问题 | 论文未明确说明方法在极端高维情况下的计算效率限制或对特定数据分布的适用性限制 | 开发一种能够对称比较两个高维数据集的降维方法,提取条件特异性模式 | 高维生物数据,包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序,神经生理记录分析 | 广义对比PCA | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
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研究论文 | 本研究使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET成像技术,可视化免疫检查点抑制剂引起的动脉粥样硬化炎症反应 | 首次开发非侵入性方法检测ICI治疗引起的动脉粥样硬化炎症,揭示IFNγ信号在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探索免疫检查点抑制剂引起动脉粥样硬化的机制并开发可视化检测方法 | Apoe-/-和Ldlr-/-基因敲除小鼠 | 分子影像学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 影像数据、分子数据、单细胞测序数据 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | 64Cu-DOTA-ECL1i PET示踪剂 |
| 434 | 2025-10-27 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood mononuclear cells indicates impaired immune and inflammatory responses in alcohol-associated hepatitis
2024-Jan, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2023.110735
PMID:38040543
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示酒精性肝炎患者外周血单个核细胞的免疫和炎症反应受损机制 | 首次结合单细胞转录组、细胞表面蛋白和淋巴细胞抗原受体分析,系统揭示AH患者PBMC中各细胞亚型的协同免疫应答异常 | 样本量有限,未包含不同疾病阶段的纵向数据 | 探究酒精性肝炎中免疫失调和炎症反应的分子机制 | 酒精性肝炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、抗原受体数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-23 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了人类血管壁中早期间充质祖细胞的分布特征和功能特性 | 首次详细描绘了人类血管外膜干细胞微环境,发现CD201(PROCR)高表达定义了更原始的间充质祖细胞亚群 | NA | 表征人类血管周围祖细胞的表型、潜能和微解剖分布 | 人类血管组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-22 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
|
研究论文 | 开发了一种通用版本的LIPSTIC技术,用于记录体内免疫细胞间的物理相互作用 | 将LIPSTIC技术从依赖特定CD40L-CD40通路扩展到可记录任何受体-配体介导的细胞间相互作用 | NA | 开发能够普遍记录体内免疫细胞相互作用的技术 | 免疫细胞与非免疫细胞间的物理相互作用 | 免疫学 | NA | LIPSTIC技术,单细胞转录组学 | NA | 细胞相互作用数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2025-10-21 |
FixNCut: A Practical Guide to Sample Preservation by Reversible Fixation for Single Cell Assays
2024-Sep-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5063
PMID:39315321
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研究论文 | 本文提供了FixNCut可逆固定方案的优化实用指南,用于单细胞分析中的样本保存 | 开发了可逆固定策略,将样本采集与下游应用分离,避免应激或坏死相关伪影 | NA | 建立可逆固定方案以改善单细胞分析中的样本保存 | 生物样本(组织和细胞悬液) | 单细胞分析 | NA | 可逆固定技术 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-19 |
Smyd3-mediated immuno-modulation in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma mouse models
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110854
PMID:39310755
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Smyd3 ASOs治疗的小鼠口腔癌模型,揭示Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌中的免疫调节功能及联合治疗耐药机制 | 首次在体内模型中证明Smyd3通过表观遗传调控I型IFN反应基因影响肿瘤免疫微环境,并系统解析了Smyd3 ASOs与抗PD-1联合治疗的耐药机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类患者中验证;耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌免疫调节中的作用及联合治疗耐药机制 | 小鼠口腔癌模型MOC1肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,反义寡核苷酸技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 439 | 2025-10-18 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析视网膜神经节细胞的多样性和空间分布特征 | 首次结合MERFISH空间转录组学和免疫组化共染色技术,系统分析视网膜神经节细胞在二维空间中的分布模式及其与血管的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类视网膜数据验证有限 | 探究视网膜神经节细胞的空间分布规律及其与局部微环境的关系 | 小鼠和人类视网膜神经节细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | MERFISH空间转录组学, 免疫组化共染色 | 计算配准方法 | 空间转录组数据, 图像数据 | 45种小鼠视网膜神经节细胞类型 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像基础的空间转录组学技术 |
| 440 | 2025-10-18 |
Dysregulation of cell state dynamics during early stages of serous endometrial carcinogenesis
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585274
PMID:38562813
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了浆液性子宫内膜癌发生早期阶段的细胞状态动态失调机制 | 首次在SEC小鼠模型中系统描述了正常、癌前和发育异常子宫内膜的细胞类型和状态变化,发现了44个潜在早期诊断标志基因 | 研究基于小鼠模型,在人类中的临床验证仍需进一步研究 | 探索浆液性子宫内膜癌发生早期的分子和细胞动力学机制 | 小鼠子宫内膜组织(正常、癌前和发育异常阶段) | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |