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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-03-06 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了抗原特异性浆细胞前体的发育动态和基因组编程,特别是长寿命骨髓浆细胞的生成机制 | 发现了浆细胞前体的双相生成模式,并识别出一个新的浆细胞过渡状态,该状态依赖于TIGIT的可诱导表达进行克隆扩增 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且样本规模可能有限 | 阐明浆细胞前体的发育动力学和基因组编程,特别是长寿命浆细胞的生成机制 | 小鼠模型中的抗原特异性浆细胞前体,包括脾脏和骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,B细胞抗原受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,B细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-03-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨了强效芳烃受体激动剂FICZ在刀豆蛋白A诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术,系统揭示了FICZ通过限制CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人体中验证;机制研究主要聚焦于免疫细胞亚群,对肝实质细胞的直接作用未充分探讨 | 阐明芳烃受体激活在自身免疫性肝炎中的保护作用机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 423 | 2026-03-06 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 本文介绍了一种基于人IL-6转基因NSG小鼠的异种移植模型,用于支持患者来源的多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的长期植入和研究 | 开发了人IL-6转基因NSG小鼠模型,首次可靠地支持恶性及癌前人类浆细胞的植入,包括从多种浆细胞疾病患者中获取的细胞 | 模型依赖于免疫缺陷小鼠,可能无法完全模拟人类免疫系统与骨髓瘤的相互作用,且样本来源和规模可能有限 | 建立一种有效的患者来源异种移植模型,用于多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的研究和临床前药物开发 | 患者来源的恶性及癌前人类浆细胞,包括来自未确定意义的单克隆丙种球蛋白病、复发前后多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和淀粉样轻链淀粉样变性患者的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2026-03-06 |
Technical optimization of spatially resolved single-cell transcriptomic datasets to study clinical liver disease
2024-02-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53993-2
PMID:38351241
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术,优化了临床肝病样本的处理和分析流程,生成了空间分辨的单细胞数据集 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序,在肝纤维化样本中建立了组织处理、数据分析和细胞互作评估的优化框架 | 样本量有限,空间转录组学尚未达到单细胞分辨率,且组织保存技术对数据有影响 | 优化空间分辨单细胞转录组数据集的技术流程,以研究临床肝病 | 来自组织学正常或晚期纤维化患者的匹配肝样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 匹配的肝样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202095
PMID:38063857
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研究论文 | 本文探讨了TFAP2同源基因通过调控ALX基因表达在小鼠和斑马鱼中面部发育中的作用 | 揭示了TFAP2家族成员通过直接激活ALX转录因子基因表达来调控脊椎动物中面部发育的保守遗传通路 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型,人类中面部发育的保守性需进一步验证 | 探究中面部发育中基因调控网络的连接与激活机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞 | 发育生物学 | 面部发育异常 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2026-03-05 |
snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses
2024-12-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04323-8
PMID:39725704
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研究论文 | 本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE结直肠癌肝转移样本进行单核RNA测序,以探索预后差异的潜在影响因素 | 首次在保存至少三年(多数超过五年)的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术,克服了长期保存导致的RNA降解挑战 | 样本量相对有限(18例),且仅针对结直肠癌肝转移,可能限制了结果的普适性 | 探究结直肠癌肝转移患者预后差异的细胞异质性基础 | 结直肠癌肝转移患者的长期保存FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例结直肠癌肝转移病例的多个病灶样本,共82,285个细胞 | NA | 单核RNA-seq | snRandom-seq | 专门针对FFPE样本的单核RNA测序技术 |
| 427 | 2026-03-05 |
Molecular Lineages and Spatial Distributions of Subplate Neurons in the Human Fetal Cerebral Cortex
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407137
PMID:39495628
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了人类胎儿大脑皮层中底板神经元的分子起源、谱系特化和空间分布特征 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统描绘了人类胎儿大脑皮层底板神经元的分子轨迹和空间景观,并识别了人类特异性基因和细胞外基质基因在其中的稳定表达模式 | 研究仅覆盖妊娠10至25周的胎儿样本,未涉及更早期或更晚期的发育阶段,且样本量有限 | 探究人类胎儿大脑皮层中底板神经元的起源、发育谱系及其在皮层神经发生和早期结构折叠中的作用 | 人类胎儿大脑皮层中的底板神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 妊娠10至25周的人类胎儿大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2026-03-05 |
Sirtuin1 Suppresses Calcium Oxalate Nephropathy via Inhibition of Renal Proximal Tubular Cell Ferroptosis Through PGC-1α-mediated Transcriptional Coactivation
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408945
PMID:39498889
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了Sirtuin1通过PGC-1α介导的转录共激活抑制肾近端小管细胞铁死亡,从而减轻草酸钙晶体诱导的肾损伤的机制 | 首次在草酸钙肾病模型中应用单细胞转录组测序技术,并揭示了Sirt1/PGC-1α/NRF2/GPX4信号轴在调控肾小管细胞铁死亡中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本或临床试验中得到验证 | 探究草酸钙晶体诱导肾损伤的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 草酸钙肾病小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 草酸钙肾病小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2026-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键调控靶点 | 首次在糖尿病小鼠心脏组织中构建单细胞转录图谱,识别了内皮细胞异质性并发现关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且病理阶段覆盖可能有限 | 探究糖尿病心脏血管内皮损伤的机制和细胞异质性 | 瘦素受体敲除(db/db)糖尿病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个病理阶段的db/db糖尿病小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2026-03-05 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,在氧诱导视网膜病变模型中,鉴定出血管内皮细胞特异性抗血管生成因子AIP1,并揭示其通过抑制NLRP12-ASC-caspase-8炎症小体介导的内皮细胞焦亡来调控病理性眼内血管生成 | 首次鉴定出AIP1作为血管内皮细胞特异性抗血管生成因子,并揭示了一个新的非经典炎症小体NLRP12-ASC-caspase-8在介导内皮细胞焦亡和促进视网膜新生血管形成中的作用机制 | NA | 探究炎症调控病理性眼内血管生成的分子机制 | 血管内皮细胞、氧诱导视网膜病变模型 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2026-03-05 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的高分辨率全基因组分子模式 | 发现牙齿形态发生中88%的谱系物种在初始牙蕾中已出现,而非传统认为的顺序出现;揭示了牙乳头的一种先前未被识别的萌芽样模式,以及釉质结在时空中的连续分化层次;建立了指导牙齿形态发生的调控网络,涉及机械转导信号 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空分子架构,包括谱系分配和细胞组织 | 牙齿形态发生过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2026-03-05 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
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研究论文 | 本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记方法,以解决稀有细胞群体表征的挑战 | 利用胆固醇修饰的寡核苷酸进行样本多重标记,提高了数据精度,并展示了该方法在识别非标记样本中的多重细胞方面的应用 | 未明确说明样本大小或技术适用范围,可能仅限于小鼠视网膜神经节细胞研究 | 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法,以高效表征稀有细胞群体并解析样本来源 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2026-03-05 |
Antigen specificity of clonally-enriched CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.07.611010
PMID:39282370
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中的CD8+ T细胞,揭示了其克隆扩增、抗原特异性及其与EB病毒抗原的关联 | 首次结合无偏倚和靶向抗原发现方法,鉴定出多发性硬化症来源的CD8+ T细胞克隆能识别EB病毒抗原及多种新型模拟表位 | 研究样本仅来自未接受治疗的患者,且样本量相对有限,未涵盖疾病不同阶段或治疗后的变化 | 探究多发性硬化症中CD8+ T细胞的克隆特性、功能及抗原特异性 | 多发性硬化症患者及对照参与者的脑脊液和血液样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 一组未接受治疗的多发性硬化症患者及对照参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议,支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程,以直接加载到10x Chromium控制器,有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法,克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 435 | 2026-03-05 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 本文提出了一种名为niche-DE的新统计方法,用于分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因,并开发了niche-LR方法来揭示配体-受体信号机制 | 首次专注于识别由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化,而非全局基因表达变异,适用于不同分辨率的空间转录组数据 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发统计方法以分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因和配体-受体信号机制 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | niche-DE, niche-LR | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 436 | 2026-03-04 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
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研究论文 | 本文介绍了一种从秀丽隐杆线虫中分离特定神经元类型以进行批量或单细胞RNA测序的详细实验方案 | 提供了一种针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的标准化分离流程,适用于幼虫和成年动物,结合了荧光激活细胞分选技术 | 该方案可能依赖于特定的荧光标记或遗传工具,且未在多种神经元类型或复杂条件下进行广泛验证 | 开发一种用于分离秀丽隐杆线虫特定神经元类型以进行基因表达分析的实验方案 | 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-03-04 |
Single-Cell Transcriptomic Dataset of RPGR-associated Retinitis Pigmentosa Patient-Derived Retinal Organoids
2024-11-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04124-z
PMID:39592612
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研究论文 | 本研究利用源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞(hiPSC)的视网膜类器官,通过单细胞RNA测序技术,构建了RPGR相关视网膜色素变性(XLRP)的单细胞转录组数据集,旨在探索疾病机制并为靶向治疗开发提供数据支持 | 首次在RPGR相关XLRP中,利用患者来源的视网膜类器官在四个关键发育时间点(40、90、150、200天)进行大规模单细胞转录组测序,生成了高质量、可靠的细胞类型注释数据集 | 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境;样本数量相对有限,且仅针对RPGR一种突变类型 | 探索RPGR基因突变导致光感受器功能障碍的分子机制,并为X连锁视网膜色素变性的靶向治疗开发提供数据资源和参考 | 源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞(hiPSC)的视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 71,096个细胞(对照组33,839个,RPGR突变组37,257个),覆盖四个发育时间点(40、90、150、200天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2026-03-04 |
Temporal single-cell RNA sequencing dataset of gastroesophagus development from embryonic to post-natal stages
2024-11-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04081-7
PMID:39550363
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研究论文 | 本文提供了一个小鼠从胚胎到出生后阶段的胃食管发育时间序列单细胞RNA测序数据集,用于研究胃食管鳞柱状交界处的转录动态 | 首次提供了覆盖胃食管发育全过程的全面单细胞RNA测序数据集,整合了外部数据集并通过类器官和动物模型验证,揭示了组织微环境中的发育模式和信号网络 | 数据集仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类胃食管疾病的复杂性,且未直接应用于癌症干预策略的开发 | 研究胃食管鳞柱状交界处的发育动态和稳态失调,以阐明癌症发病机制 | 小鼠的食管、胃和胃食管鳞柱状交界处在胚胎、新生儿和成年阶段的细胞 | 单细胞组学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠从胚胎到成年多个发育阶段的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 439 | 2026-03-04 |
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00479-4
PMID:39449067
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研究论文 | 本研究构建了涵盖人类从新生儿到超百岁老人生命周期的首个免疫细胞转录组图谱,通过生物信息学与机器学习方法揭示免疫细胞在生理和病理衰老过程中的变化 | 首次构建覆盖全生命周期的免疫细胞转录组图谱,开发了适用于单细胞和批量RNA-seq数据的生物年龄预测模型PHARE,并发现儿科COVID-19患者和冠状动脉疾病患者存在加速衰老现象 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全涵盖蛋白质组或表观遗传层面的衰老变化;样本年龄分布可能存在不均匀性 | 探究衰老如何塑造免疫细胞功能,为不同生命阶段的精准治疗提供依据 | 人类免疫细胞(涵盖新生儿至超百岁老人) | 机器学习 | 老年疾病 | RNA-seq | 机器学习模型(PHARE) | 转录组数据 | 涵盖从新生儿到超百岁老人的多年龄段人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2026-03-04 |
Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease
2024-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03122-3
PMID:38961225
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术,揭示了APOE4女性携带者中一种新型中性粒细胞亚群与认知障碍的关联,并提出了靶向IL-17F的治疗策略 | 首次在APOE4女性阿尔茨海默病患者中发现与认知障碍相关的特定中性粒细胞亚群,并阐明其通过IL-17F/IL-17RA轴抑制小胶质细胞功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类队列,需要在更大规模人群中验证;治疗策略的临床转化效果尚待评估 | 探究APOE4基因型在阿尔茨海默病中的性别特异性免疫机制 | APOE4携带者的中性粒细胞与小胶质细胞 | 单细胞组学与神经免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,多重流式细胞术 | NA | 转录组数据,流式细胞数据 | 两个独立的APOE4女性AD患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |