单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4361	2024-09-05	Oncogenic Cell Tagging and Single-Cell Transcriptomics Reveal Cell Type-Specific and Time-Resolved Responses to Vhl Inactivation in the Kidney 2024-Jun-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3248 PMID:38502859	研究论文	本研究通过肿瘤细胞标记和单细胞转录组学技术，纵向研究了von Hippel Lindau (VHL)肿瘤抑制基因失活对肾脏细胞类型特异性及时间解析反应的影响。	本研究采用了一种实验策略，即在细胞自然环境中生成携带遗传改变的细胞，进行标记并随时间分析，以理解致癌过程。	NA	旨在定义肿瘤发生初期的细胞反应，以理解癌症的起始。	von Hippel Lindau (VHL)肿瘤抑制基因失活对肾脏细胞的影响。	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
4362	2024-09-05	Identification and functional activity of Nik related kinase (NRK) in benign hyperplastic prostate 2024-03-09, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05048-3 PMID:38459501	研究论文	本研究旨在识别良性增生前列腺中的差异表达基因（DEGs），并探讨Nik相关激酶（NRK）在良性前列腺增生（BPH）中的作用	首次发现NRK在良性增生前列腺中显著上调，并与前列腺基质细胞的增殖、凋亡、细胞周期、迁移、纤维化和上皮-间质转化（EMT）过程相关	NA	识别良性增生前列腺中的差异表达基因，并探讨NRK在BPH中的作用	良性前列腺增生（BPH）中的差异表达基因和Nik相关激酶（NRK）的功能	数字病理学	前列腺疾病	RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-PCR、western-blot、免疫组化染色、流式细胞术、伤口愈合实验、Transwell实验、CCK-8实验	NA	RNA	四个数据集，包括三个批量RNA测序和一个单细胞RNA测序数据集
4363	2024-09-05	ROCK1 is a multifunctional factor maintaining the primordial follicle reserve and follicular development in mice 2024-01-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.00019.2023 PMID:37661919	研究论文	研究揭示了ROCK1在维持小鼠原始卵泡储备和卵泡发育中的重要作用	发现ROCK1通过HIPPO信号通路调节原始卵泡储备和卵泡发育，为维持女性生殖生理提供了新的见解	NA	探讨ROCK1在原始卵泡发育和维持中的作用	小鼠的原始卵泡和卵泡发育	NA	NA	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
4364	2024-09-05	Advances in cellular and tissue-based imaging techniques for sarcoid granulomas 2024-01-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.00507.2023 PMID:37955119	综述	本文综述了用于观察和表征结节病肉芽肿的细胞和组织成像技术的进展	介绍了最新的空间转录组学和基质辅助激光解吸电离质谱成像（MALDI-MSI）等前沿技术	NA	旨在揭示结节病研究的发展方向	结节病肉芽肿的成像和表征	数字病理学	结节病	空间转录组学，基质辅助激光解吸电离质谱成像（MALDI-MSI）	NA	图像	NA
4365	2024-09-05	Comprehensive Analysis of Ligand-receptor Interactions in Colon Adenocarcinoma to Identify of Tumor Microenvironment Oxidative Stress and Prognosis Model 2024, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0929867331666230821092346 PMID:37605402	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了结肠腺癌中的配体-受体相互作用，并基于此开发了一个预后模型	首次基于配体-受体对开发了结肠腺癌的预后模型，并揭示了不同分子亚型的临床和分子特征	NA	探讨配体-受体相互作用在结肠腺癌中的功能，并开发基于此的预后模型	结肠腺癌中的配体-受体相互作用及其对预后的影响	数字病理学	结肠腺癌	单细胞RNA测序	LASSO	RNA测序数据	涉及结肠腺癌的单细胞RNA测序数据
4366	2024-09-05	A novel missense variant in PNLDC1 associated with nonobstructive azoospermia 2024, Journal of genetics IF:1.4Q4 PMID:39223739	研究论文	本文通过家系外显子测序研究了一个近亲结婚家庭中的非阻塞性无精症（NOA），旨在确定导致特发性NOA的遗传变异，以辅助未来的临床遗传诊断和治疗策略	发现了一个与NOA相关的新型错义变异PNLDC1 Gly237Asp，该变异位于CAF1域的保守区域，可能导致局部结构不稳定和蛋白质磷酸化位点的改变	NA	确定导致特发性非阻塞性无精症的遗传变异	一个近亲结婚家庭中的非阻塞性无精症患者	NA	男性不育症	外显子测序，Sanger测序，单细胞RNA测序	NA	基因序列数据	一个家庭中的三名NOA患者
4367	2024-09-05	Elucidating the role of tumor-associated ALOX5+ mast cells with transformative function in cervical cancer progression via single-cell RNA sequencing 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1434450 PMID:39224598	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肿瘤相关ALOX5+肥大细胞在宫颈癌进展中的作用及其机制。	首次鉴定了宫颈癌中具有转化功能的肿瘤相关肥大细胞亚群C2 ALOX5+ MCs，并揭示了其在肿瘤分化关键阶段的作用。	研究仅基于十份宫颈癌肿瘤样本的数据，可能需要更多样本以验证结果的普遍性。	探索肥大细胞与宫颈癌肿瘤微环境相互作用的机制，为宫颈癌的预防、诊断和治疗提供科学依据。	宫颈癌细胞及其微环境中的肥大细胞亚群。	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	93,524个高质量细胞
4368	2024-09-04	Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature 2024 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100539 PMID:39220810	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者玻璃体中的炎症T细胞特征。	首次在疾病状态下对人类玻璃体进行单细胞转录组学表征，展示了PDR玻璃体主要由T细胞组成，其活性和比例与外周血中的T细胞不同，且玻璃体中几乎没有中性粒细胞。	NA	旨在通过阐明PDR患者玻璃体的单细胞景观，识别可靶向的细胞类型和相应的信号通路。	增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者的玻璃体和外周血。	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	5名成年患者的6只眼睛的玻璃体细胞和外周血单个核细胞（PBMCs）。
4369	2024-09-04	SCG2 mediates blood-brain barrier dysfunction and schizophrenia-like behaviors after traumatic brain injury 2024-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401117R PMID:39225388	研究论文	研究通过单细胞RNA测序评估创伤性脑损伤后额叶皮层细胞的转录变化，并探讨了SCG2在TBI诱发的精神分裂症中的介导作用及其机制。	首次揭示了SCG2通过CypA-MMP-9信号通路触发血脑屏障破坏，并提供了治疗TBI后精神障碍的新疗法。	NA	探究创伤性脑损伤后神经功能障碍的机制及其与精神分裂症样行为的关系。	创伤性脑损伤后的额叶皮层细胞及SCG2的作用。	神经科学	精神分裂症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
4370	2024-09-04	Single-cell transcriptomics reveals tumor-infiltrating B cell function after neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in non-small cell lung cancer 2024-Sep-02, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad138 PMID:37931147	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了12名III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞，探讨了新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其与新辅助化疗免疫治疗效果的关系	研究样本量有限，且仅限于III期非小细胞肺癌患者	探讨非小细胞肺癌中新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12名III期非小细胞肺癌患者
4371	2024-09-04	Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1 2024-Sep, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003 PMID:39053388	research paper	本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和匹配的T细胞受体序列（TCR）数据，深入探讨了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的特征及其与疾病的相关性	发现了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的异质性，并进一步细分为GZMKGZMB子集和GZMKGZMB子集，后者在HIV-1感染者中显著富集	NA	探讨HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的表型和功能特征及其与疾病的相关性	HIV-1感染者中的GZMKCD8 T细胞	免疫学	HIV-1感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
4372	2024-09-04	Unraveling flavivirus pathogenesis: from bulk to single-cell RNA-sequencing strategies 2024-Sep-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology DOI:10.4196/kjpp.2024.28.5.403 PMID:39198221	综述	本文综述了从批量到单细胞RNA测序策略在解析黄病毒发病机制中的应用	介绍了病毒包含的单细胞RNA测序（viscRNA-seq）这一创新技术，解决了非多聚腺苷酸黄病毒基因组带来的挑战	NA	探讨RNA测序技术在细胞系实验和黄病毒感染患者研究中的应用，加速有效诊断和治疗的发展	黄病毒及其与宿主的相互作用	生物信息学	NA	RNA测序（RNA-seq）	NA	转录组数据	NA
4373	2024-09-04	Exploring the potential mechanisms of Rehmannia glutinosa in treating sepsis based on network pharmacology 2024-Aug-31, BMC infectious diseases IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12879-024-09796-x PMID:39217296	研究论文	本研究利用网络药理学方法探索地黄在治疗脓毒症中的潜在作用机制	通过RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接和分子动力学模拟等技术，全面分析了地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制	NA	探索地黄在治疗脓毒症中的作用机制	地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制	药物学	脓毒症	RNA测序、分子对接、分子动力学模拟	NA	RNA序列数据	23名脓毒症患者和10名健康个体的外周血样本
4374	2024-09-04	Microglia LILRB4 upregulation reduces brain damage after acute ischemic stroke by limiting CD8+ T cell recruitment 2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03206-4 PMID:39217343	研究论文	本研究探讨了微胶质细胞中LILRB4上调通过限制CD8+ T细胞招募减少急性缺血性卒中后脑损伤的作用及其机制	首次揭示了LILRB4在微胶质细胞中通过调节CD8+ T细胞浸润和激活在卒中后免疫反应中的关键作用	研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证	研究LILRB4在急性缺血性卒中后调节免疫反应及其对脑损伤的保护作用	微胶质细胞中的LILRB4及其对CD8+ T细胞招募的影响	神经科学	卒中	空间转录组学分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色	NA	转录组数据	使用LILRB4条件性敲除(LILRB4-KO)和过表达转基因(LILRB4-TG)小鼠进行研究
4375	2024-09-04	Single-cell sequencing reveals glial cell involvement in development of neuropathic pain via myelin sheath lesion formation in the spinal cord 2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03207-3 PMID:39217340	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了脊髓中的少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与髓鞘损伤的关系	首次详细描述了少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与其他胶质细胞的相互作用，并提出了潜在的治疗靶点	研究仅在 mice 模型上进行，结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证	探索神经病理性疼痛发展中少突胶质细胞的功能及其与其他胶质细胞的相互作用	少突胶质细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞在神经病理性疼痛中的作用	数字病理学	神经病理性疼痛	单细胞测序	NA	细胞	使用慢性束缚损伤（CCI）模型的小鼠脊髓组织
4376	2024-09-04	V1bR enhances glucose-stimulated insulin secretion by paracrine production of glucagon which activates GLP-1 receptor 2024-Aug-31, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-024-01288-4 PMID:39217353	研究论文	本研究探讨了精氨酸加压素（AVP）及其受体V1bR对胰岛素分泌和血糖稳态的调节机制	发现AVP通过V1bR激活α细胞分泌胰高血糖素，进而通过旁分泌方式激活β细胞上的GLP-1R，促进葡萄糖依赖的胰岛素分泌	研究未详细说明AVP对胰岛素分泌的具体分子机制	揭示AVP/V1bR与胰高血糖素/GLP-1R之间的相互作用，为开发新的血糖控制疗法提供机制基础	精氨酸加压素（AVP）、V1bR受体、α细胞和β细胞	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	未具体说明样本数量
4377	2024-09-04	Dynamic upregulation of retinoic acid signal in the early postnatal murine heart promotes cardiomyocyte cell cycle exit and maturation 2024-08-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70918-1 PMID:39215116	研究论文	本文研究了新生小鼠心脏中视黄酸信号的动态上调如何促进心肌细胞退出细胞周期并成熟	首次揭示了新生期心脏中心肌细胞成熟过程中视黄酸信号的作用	NA	探讨视黄酸信号在新生期心脏发育中对心肌细胞增殖和成熟的影响	新生小鼠心脏中的心肌细胞和心脏成纤维细胞	NA	NA	单细胞转录组分析、免疫组织化学、RNA测序	NA	mRNA表达数据	新生小鼠和新生大鼠的心肌细胞及人类心肌细胞
4378	2024-09-04	Novel insights into vancomycin-loaded calcium sulfate and negative pressure wound therapy in preventing infections in open fractures 2024-Aug-29, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1 DOI:10.1186/s13018-024-04931-5 PMID:39198853	研究论文	本研究探讨了万古霉素负载硫酸钙（VLCS）和负压伤口疗法（NPWT）在开放性骨折中预防感染的作用，并评估了它们对巨噬细胞行为的影响。	研究发现VLCS和NPWT能够促进巨噬细胞向M2极化，增强感染抵抗力和愈合效果，尤其是在联合使用时效果更佳。	NA	研究VLCS和NPWT在开放性骨折中预防感染的效果及其对巨噬细胞行为的影响。	开放性骨折患者的巨噬细胞行为及其在VLCS和NPWT治疗下的变化。	数字病理学	创伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	开放性骨折患者的巨噬细胞样本
4379	2024-09-04	Single-cell transcriptome sequencing reveals altered peripheral blood immune cells in patients with severe tuberculosis 2024-Aug-29, European journal of medical research IF:2.8Q2 DOI:10.1186/s40001-024-01991-5 PMID:39198909	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序揭示了严重结核病患者外周血免疫细胞的变化	首次详细描述了不同阶段结核感染中循环细胞亚群的特征和功能，特别是严重结核病患者中CD8+ T细胞的高交互强度	研究仅限于外周血免疫细胞的分析，未涉及其他组织或器官的免疫细胞变化	探讨结核病患者外周血免疫细胞的变化及其对疾病严重程度的影响	健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞	数字病理学	结核病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	包括健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞样本
4380	2024-09-04	Investigating the role of senescence biomarkers in colorectal cancer heterogeneity by bulk and single-cell RNA sequencing 2024-08-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70300-1 PMID:39209895	研究论文	本研究通过批量和单细胞RNA测序探讨了细胞衰老标志物在结直肠癌异质性中的作用	开发了一个与衰老相关的模型来计算衰老相关评分，全面探索每个结直肠癌样本的异质性，并通过单细胞分析和免疫荧光染色验证了不同衰老相关模型基因富集组间的免疫细胞浸润差异	NA	探索细胞衰老对结直肠癌预后、肿瘤微环境和治疗的影响	结直肠癌样本的异质性和细胞衰老标志物	数字病理学	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA	多个结直肠癌样本