单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4281	2024-09-08	Mapping the single cell spatial immune landscapes of the melanoma microenvironment 2024-Aug, Clinical & experimental metastasis IF:4.2Q2 DOI:10.1007/s10585-023-10252-4 PMID:38217840	研究论文	研究使用空间成像技术分析黑色素瘤微环境中的单细胞免疫景观	利用CyTOF-IMC等高维空间成像技术，以前所未有的分辨率识别复杂的细胞亚群和免疫细胞相互作用	NA	理解黑色素瘤微环境中基质、黑色素瘤细胞和免疫细胞类型之间的复杂相互作用及其与治疗反应的关联	黑色素瘤微环境中的单细胞空间免疫景观	数字病理学	黑色素瘤	CyTOF-IMC（飞行时间成像质谱流式细胞术）	NA	图像	NA
4282	2024-09-08	Plasmodium infection induces phenotypic, clonal, and spatial diversity among differentiating CD4+ T cells 2024-Jun-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114317 PMID:38848213	研究论文	研究了疟原虫感染诱导的CD4+ T细胞在分化过程中的表型、克隆性和空间多样性	首次观察到脾脏多克隆CD4 T细胞分化为Th1和Tfh样状态，并展示了TCR克隆频率与Th1分化之间的关系	研究主要集中在脾脏CD4 T细胞的分化和空间分布，未涵盖其他免疫细胞类型	探讨疟原虫感染下CD4+ T细胞的分化、克隆性和空间分布及其与免疫反应的关系	CD4+ T细胞的分化状态、克隆性和空间分布	免疫学	疟疾	空间转录组学	NA	转录组数据	未明确提及具体样本数量
4283	2024-09-08	Interferon-γ induces combined pyroptotic angiopathy and APOL1 expression in human kidney disease 2024-Jun-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114310 PMID:38838223	研究论文	研究探讨了干扰素-γ在人类肾脏疾病中的作用，特别是其诱导的焦亡性血管病变和APOL1表达	首次揭示了干扰素-γ信号通路在诱导焦亡性血管病变和APOL1表达中的双重作用，并提出了针对这一机制的治疗策略	研究主要基于体外实验和患者样本，缺乏体内实验验证	探讨干扰素-γ在肾脏疾病中的直接作用及其机制	人类肾脏类器官、原代内皮细胞和患者样本	NA	肾脏疾病	单细胞RNA测序、免疫印迹、定量荧光分析	NA	RNA	涉及COVID-19、蛋白尿性肾脏疾病和塌陷性肾小球病的患者样本
4284	2024-09-08	Unveiling the hidden role of disulfidptosis in kidney renal clear cell carcinoma: a prognostic signature for personalized treatment 2024-Jun, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-023-01933-2 PMID:38296888	研究论文	本研究探讨了硫化物凋亡相关生物标志物在肾透明细胞癌中的预后预测和个体化治疗中的作用	首次揭示了硫化物凋亡在肾透明细胞癌中的潜在作用，并构建了一个基于硫化物凋亡相关预后特征的模型	研究主要基于发现队列和外部验证队列，需要进一步的多中心验证	探索硫化物凋亡在肾透明细胞癌中的作用，并开发一个预后预测模型以指导个体化治疗	肾透明细胞癌患者及其预后和治疗反应	数字病理学	肾癌	单细胞转录组学、空间转录组学、定量RT-qPCR、免疫组化	机器学习模型	基因表达数据	发现队列和外部验证队列的肾透明细胞癌患者
4285	2024-09-08	A novel mitochondrial unfolded protein response-related risk signature to predict prognosis, immunotherapy and sorafenib sensitivity in hepatocellular carcinoma 2024-Jun, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-024-01945-6 PMID:38493408	研究论文	本文构建了一种基于线粒体未折叠蛋白反应（UPR）相关基因的风险特征，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后、免疫治疗反应和索拉非尼敏感性	首次基于UPR相关基因构建了HCC的预后风险特征，并研究了其对免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗反应的影响	NA	建立一种新的基于UPR相关基因的风险特征，用于预测HCC患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗反应	肝细胞癌（HCC）患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和索拉非尼敏感性	数字病理学	肝癌	LASSO回归分析、TIMER算法、免疫组化（IHC）、单细胞RNA测序、空间转录组分析	风险模型	转录组数据	TCGA和ICGC数据库中的转录组数据和临床信息
4286	2024-09-08	Universal recording of immune cell interactions in vivo 2024-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07134-4 PMID:38448581	研究论文	本文介绍了一种名为uLIPSTIC的新技术，用于在体内记录免疫细胞间的物理相互作用	开发了一种通用的LIPSTIC版本（uLIPSTIC），能够记录免疫细胞与非免疫细胞之间的物理相互作用，不受受体和配体类型的限制	NA	研究免疫细胞在体内的瞬时物理相互作用	免疫细胞与非免疫细胞的相互作用	免疫学	NA	LIPSTIC	NA	单细胞转录组学	NA
4287	2024-09-08	Cardiac reprogramming reduces inflammatory macrophages and improves cardiac function in chronic myocardial infarction 2024-01-01, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149272 PMID:37992523	研究论文	本文研究了心脏重编程对慢性心肌梗死后炎症巨噬细胞和心脏功能的影响	首次展示了心脏重编程可以减少心肌梗死后的炎症巨噬细胞，并改善心脏功能	尚未明确心脏重编程通过MGTH过表达影响炎症细胞的具体机制	探讨心脏重编程在慢性心肌梗死后减少炎症和改善心脏功能的作用	慢性心肌梗死后的心脏纤维母细胞和炎症细胞	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
4288	2024-09-08	Research progress and application strategies of sugar transport mechanisms in rice 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1454615 PMID:39233915	综述	本文综述了水稻中糖运输机制的遗传和分子基础及其调控	本文强调了质外体途径在水稻韧皮部装载中的主导作用，并总结了糖运输基因的调控途径	本文指出当前研究方法的不足，并讨论了先进的分析技术如质谱成像和单细胞RNA测序的潜在应用	本文旨在深入理解水稻中糖运输过程及其调控机制，为高产水稻育种提供指导	本文主要研究水稻中的糖运输机制及其相关蛋白质和基因	NA	NA	质谱成像和单细胞RNA测序	NA	NA	NA
4289	2024-09-08	Comprehensive analysis of hypoxia-related genes in diagnosis and immune infiltration in acute myocardial infarction: based on bulk and single-cell RNA sequencing data 2024, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2024.1448705 PMID:39234566	研究论文	本文通过批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了缺氧相关基因在急性心肌梗死诊断和免疫浸润中的作用	开发了一个基于缺氧相关基因的急性心肌梗死预测模型，并验证了其与免疫细胞浸润的强关联	NA	研究缺氧相关基因在急性心肌梗死中的作用及其与免疫细胞浸润的关系	急性心肌梗死患者及其缺氧相关基因	数字病理学	心血管疾病	RNA测序	随机森林模型	RNA	训练数据集GSE66360，验证数据集GSE48060，单细胞RNA数据集GSE163956
4290	2024-09-07	Identifying the importance of PCK1 in maintaining ileal epithelial barrier integrity in Crohn's disease 2024-Dec-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148872 PMID:39159791	研究论文	研究探讨了PCK1基因在克罗恩病中维持回肠上皮屏障完整性的重要性	首次揭示了PCK1基因在克罗恩病中对回肠上皮屏障的维持作用	研究样本量较小，且仅限于回肠组织	探讨克罗恩病患者肠道屏障功能障碍的关键基因	克罗恩病患者的回肠组织和Caco-2细胞系	NA	克罗恩病	单细胞RNA测序、基因芯片、免疫组化	NA	基因表达数据	11名克罗恩病患者和多个对照组的回肠组织样本
4291	2024-09-07	A nomoscore of four genes for predicting the rupture risk in abdominal aortic aneurysm patients with osteoarthritis 2024-Dec-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148877 PMID:39173977	研究论文	本研究旨在通过基因表达数据和机器学习算法，识别与腹主动脉瘤破裂风险相关的潜在生物标志物，并开发预测模型	本研究首次结合基因表达数据和单细胞RNA测序数据，利用机器学习算法识别出四个关键基因，并开发了一个高预测性能的诺模图	本研究主要基于已有的基因表达和单细胞RNA测序数据，未来需要在更多样本和临床数据中验证其有效性	发现并验证能够预测腹主动脉瘤破裂风险的潜在生物标志物	腹主动脉瘤患者及其破裂风险	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序	LASSO, 随机森林, SVM-RFE	基因表达数据	两个基因表达数据集（GSE98278, GSE51588）和两个单细胞RNA测序数据集（GSE164678, GSE152583）
4292	2024-09-07	RIPK3 causes mitochondrial dysfunction and albuminuria in diabetic podocytopathy through PGAM5-Drp1 signaling 2024-Oct, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.155982 PMID:39089491	研究论文	研究探讨了RIPK3在糖尿病肾病中的作用及其通过PGAM5-Drp1信号通路导致线粒体功能障碍和蛋白尿的机制	首次揭示了RIPK3在糖尿病肾病中通过PGAM5-Drp1信号通路导致线粒体功能障碍和蛋白尿的作用	研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人体临床验证	探讨RIPK3在糖尿病肾病中的作用及其机制	糖尿病肾病患者的肾脏和动物模型	NA	糖尿病	ELISA、单细胞RNA测序	NA	RNA	包括糖尿病患者和糖尿病小鼠模型
4293	2024-09-07	Dynamic changes of the immune microenvironment in the development of gastric cancer caused by inflammation 2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200849 PMID:39228396	研究论文	本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，探讨了胃癌发展过程中不同细胞类型的分子变化	首次系统分析了从非萎缩性胃炎到胃癌过程中免疫微环境的动态变化，并发现了IL-17信号通路和Th17细胞分化的显著上调	研究主要基于单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，缺乏体内实验验证	揭示胃癌发展过程中从癌前病变到胃癌的分子机制，为早期诊断和治疗提供依据	胃癌发展过程中的免疫微环境和信号通路变化	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个单细胞RNA测序数据集和The Cancer Genome Atlas的bulk RNA测序数据
4294	2024-09-07	Knocking Out CD70 Rescues CD70-Specific NanoCAR T Cells from Antigen-Induced Exhaustion 2024-Sep-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0677 PMID:38874582	研究论文	研究通过敲除CD70来提高CD70特异性纳米CAR T细胞在实体和液体恶性肿瘤治疗中的功能	通过CRISPR/Cas9技术敲除CD70，显著增强了CD70特异性纳米CAR T细胞在弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型中的功能，并保护其免受抗原诱导的耗竭	研究主要集中在体外和PDX模型中，尚未在临床试验中验证	优化CD70特异性CAR T细胞疗法，提高其在恶性肿瘤治疗中的疗效	CD70特异性纳米CAR T细胞及其在恶性肿瘤治疗中的应用	细胞疗法	淋巴瘤	CRISPR/Cas9	NA	单细胞转录组数据	涉及恶性横纹肌瘤类器官和弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型
4295	2024-09-07	Itm2a expression marks periosteal skeletal stem cells that contribute to bone fracture healing 2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI176528 PMID:39225088	研究论文	研究确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的膜蛋白标记物，并探讨了其在骨折愈合中的作用	首次确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的标记物，并展示了其在骨折愈合中的关键作用	研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证其在人类中的适用性	确定骨膜骨干细胞的标记物，并研究其在骨折愈合中的作用	骨膜骨干细胞及其在骨折愈合中的贡献	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	小鼠模型
4296	2024-09-07	Type 1 innate lymphoid cells: a biomarker and therapeutic candidate in sarcoidosis 2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI183708 PMID:39225095	研究论文	研究探讨了1型先天淋巴细胞（ILC1s）在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力	首次揭示了ILC1s在结节病中的特异性积累，并证明了CXCR4阻断可能作为治疗结节病的新方法	研究主要基于皮肤样本和小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证	探讨ILC1s在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力	结节病患者和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本	免疫学	结节病	单细胞RNA测序和空间转录组学	NA	转录组数据	结节病和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本
4297	2024-09-07	Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes 2024-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51761-4 PMID:39227568	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的发育、保守性和多样性	首次通过单细胞RNA测序技术对软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞进行了跨物种比较，揭示了淋巴细胞在不同物种中的相似转录特征和功能差异	研究仅限于特定的软骨鱼和硬骨鱼物种，可能无法完全代表所有软骨鱼和硬骨鱼的淋巴细胞特征	阐明不同物种间细胞结构和细胞类型进化的特征，以理解免疫系统功能和对疾病的易感性	软骨鱼（白斑竹鲨）和硬骨鱼（斑马鱼和中国舌鳎）的淋巴细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括白斑竹鲨、斑马鱼和中国舌鳎的免疫细胞样本
4298	2024-09-07	Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution 2024-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51763-2 PMID:39227584	研究论文	研究通过单细胞RNA测序揭示了七鳃鳗淋巴细胞的组织特异性异质性，并发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型	首次在七鳃鳗中发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型，这种细胞在表达造血基因方面与有颌脊椎动物的T细胞有显著差异	研究仅限于七鳃鳗，未涉及其他无颌脊椎动物，且样本量较小	探讨无颌脊椎动物适应性免疫系统的进化特征	七鳃鳗的鳃、肠道和血液中的淋巴细胞	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	七鳃鳗的鳃、肠道和血液样本
4299	2024-09-07	Multi-omics analyses reveal aberrant differentiation trajectory with WNT1 loss-of-function in type XV osteogenesis imperfecta 2024-Sep-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1 DOI:10.1093/jbmr/zjae123 PMID:39126373	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中导致的异常分化轨迹	首次整合多组学数据，揭示了WNT1在骨骼祖细胞分化和成熟中的调控机制	样本量较小，且仅来自中国南方地区	探讨WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中的分子机制及其对骨骼发育的影响	XV型成骨不全症患者及其骨骼样本	数字病理学	成骨不全症	多组学分析	NA	蛋白质组学数据、单细胞转录组数据	25名XV型成骨不全症患者和243名其他类型成骨不全症患者
4300	2024-09-07	Molecular Regulation of Cardiac Conduction System Development 2024-Sep, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-024-02094-7 PMID:38990492	综述	本文综述了心脏传导系统发育的分子调控机制	本文介绍了最新的单细胞转录组学研究成果，以更好地理解心脏传导系统的形态发生	NA	探讨心脏传导系统发育的分子调控机制	心脏传导系统的起搏细胞和传导心肌细胞	发育生物学	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	转录组	NA