本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4261 | 2024-09-27 |
Lysophospholipid Acyltransferase 9 Promotes Emphysema Formation via Platelet-activating Factor
2024-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0253OC
PMID:38377392
|
研究论文 | 研究LPLAT9通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 首次揭示了LPLAT9在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用及其通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探讨LPLAT9在COPD发病机制中的作用 | LPLAT9基因表达、单细胞RNA测序数据、肺泡巨噬细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LPLAT9敲除小鼠和对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4262 | 2024-09-27 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: a single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588047
PMID:38617282
|
研究论文 | 研究了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的动态变化 | 样本量较小,仅包括三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | 探讨急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的响应机制 | 急性SIV感染的猕猴中枢神经系统中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 4263 | 2024-09-27 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the role of intermediate monocytes in aneurysmal subarachnoid hemorrhage
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1401573
PMID:39318997
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的单核细胞,揭示了中间单核细胞在神经炎症中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后中间单核细胞在神经炎症中的关键作用 | 研究样本量较小,仅包括两名男性患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血后神经炎症的机制 | 单核细胞及其亚群在动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共17,242个细胞,包括7,224个脑脊液细胞和10,018个外周血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4264 | 2024-09-26 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing identifies POSTN as a potential biomarker and therapeutic target for rheumatoid arthritis
2024-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148798
PMID:39067546
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,通过生物信息学分析和分子对接验证,识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 识别类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 类风湿性关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4265 | 2024-09-26 |
Immunoinhibitory effects of hypoxia-driven reprogramming of EGR1hi and EGR3 positive B cells in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2024-Nov, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 研究探讨了在鼻咽癌微环境中,缺氧条件下EGR1和EGR3阳性B细胞的免疫抑制作用及其机制 | 首次揭示了EGR1和EGR3在缺氧条件下对Breg细胞分化的调控作用,并阐明了其通过MAPK途径和免疫抑制因子表达影响肿瘤微环境的机制 | 研究主要基于单细胞转录组测序和移植实验,缺乏体内实验验证 | 探讨鼻咽癌微环境中Breg细胞的分化及其免疫抑制机制 | 鼻咽癌微环境中的Breg细胞及其在缺氧条件下的分化和调控机制 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类鼻咽癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4266 | 2024-09-26 |
Deciphering cuproptosis-related signatures in pediatric allergic asthma using integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq analysis
2024-Oct, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2024.2349596
PMID:38687912
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,揭示了儿童过敏性哮喘中铜死亡相关基因的特征 | 首次通过机器学习模型筛选出五个重要变量,用于预测儿童过敏性哮喘 | 研究样本量较小,需要进一步验证模型的泛化能力 | 探讨铜失衡是否会导致儿童过敏性哮喘中的铜死亡现象 | 儿童过敏性哮喘患者的铜死亡相关基因和免疫细胞浸润情况 | 生物信息学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | 涉及两个数据集(GSE40732和GSE40888)和单细胞RNA测序数据(GSE193816) | NA | NA | NA | NA |
| 4267 | 2024-09-26 |
A necroptosis-regulated model from single-cell analysis that predicts survival and identifies the Pivotal role of MAGEA6 in hepatocellular carcinoma
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37711
PMID:39315163
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞分析的坏死性凋亡调控模型,用于预测肝细胞癌患者的生存情况,并揭示了MAGEA6在肝细胞癌中的关键作用 | 本研究首次开发了一种基于坏死性凋亡相关基因的风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后,并通过实验验证了MAGEA6在肝癌中的作用 | 本研究的样本量较小,且仅基于TCGA和ICGC数据库进行验证,未来需要更大规模的临床验证 | 开发一种新的坏死性凋亡相关基因风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌患者的预后预测和坏死性凋亡在肝癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 25个关键坏死性凋亡调控因子和168个坏死性凋亡相关基因,TCGA-LIHC数据集作为训练集,ICGC数据集用于验证 | NA | NA | NA | NA |
| 4268 | 2024-09-26 |
Meiotic chromatin-associated HSF5 is indispensable for pachynema progression and male fertility
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae701
PMID:39162221
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新的睾丸特异性蛋白HSF5,该蛋白通过染色质结合调控雄性减数分裂中的粗线期进展 | 首次发现HSF5在粗线期进展中的关键作用,并揭示了其与SMARCA5、SMARCA4和SMARCE1的生物学相互作用 | NA | 探讨HSF5在雄性减数分裂粗线期进展中的调控作用 | HSF5蛋白及其在减数分裂中的功能 | NA | NA | scRNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | Hsf5-/-个体 | NA | NA | NA | NA |
| 4269 | 2024-09-26 |
Patient-derived xenografts and single-cell sequencing identifies three subtypes of tumor-reactive lymphocytes in uveal melanoma metastases
2024-Sep-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91705
PMID:39312285
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型,识别并验证了葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞的三个亚型 | 首次结合单细胞测序和功能分析,揭示了葡萄膜黑色素瘤肝转移中肿瘤反应性T细胞的多样性 | 研究仅限于葡萄膜黑色素瘤肝转移,结果可能不适用于其他类型的黑色素瘤或其他器官的转移 | 通过识别和功能验证肿瘤反应性T细胞,提高葡萄膜黑色素瘤肝转移的免疫治疗效果 | 葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自患者的生物样本和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4270 | 2024-09-26 |
Single-Cell Sequencing: High-Resolution Analysis of Cellular Heterogeneity in Autoimmune Diseases
2024-Jun, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-024-09001-6
PMID:39186216
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的创新应用及其对疾病诊断和精准治疗的影响 | 单细胞测序技术能够以高分辨率分析细胞异质性,揭示驱动疾病进展的分子机制 | 尽管单细胞测序技术在自身免疫性疾病中有广泛应用,但仍存在一些局限性 | 研究单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的应用,以揭示其发病机制和治疗靶点 | 自身免疫性疾病中的细胞异质性和分子机制 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序技术,特别是单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组、表观基因组或转录组信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4271 | 2024-09-26 |
Multi-omics Analysis Identifies Hypoxia Subtypes and S100A2 as an Immunosuppressive Factor in Cervical Cancer
2024-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-023-01304-x
PMID:37648942
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析,在宫颈癌样本中识别出三种缺氧亚型,并发现S100A2作为免疫抑制因子 | 首次在宫颈癌中研究缺氧景观,并识别出S100A2作为缺氧诱导的免疫抑制因子 | NA | 研究宫颈癌中的缺氧亚型及其对免疫治疗反应的影响 | 宫颈癌样本及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据集的宫颈癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4272 | 2024-09-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals that MYBL2 in malignant epithelial cells is involved in the development and progression of ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438198
PMID:39136009
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了恶性上皮细胞中的MYBL2在卵巢癌发展和进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究了卵巢癌患者的细胞组成,并识别了关键的亚群和影响卵巢癌进展的转录因子 | 研究样本仅限于六名卵巢癌伴网膜转移的患者,可能影响结果的普适性 | 深入理解恶性上皮细胞在卵巢癌中的作用,并探讨卵巢癌免疫微环境和免疫耗竭的影响 | 卵巢癌患者的恶性上皮细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六名卵巢癌伴网膜转移的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4273 | 2024-09-26 |
γδ T-cells in human malignancies: insights from single-cell studies and analytical considerations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438962
PMID:39281674
|
综述 | 本文综述了单细胞研究在不同恶性肿瘤中对γδ T细胞的生物学特性和调控机制的见解 | 介绍了高分辨率单细胞测序技术在γδ T细胞研究中的应用 | γδ T细胞的低丰度使得其生物学特性仍不明确 | 探讨γδ T细胞在人类恶性肿瘤中的作用及其生物学机制 | γδ T细胞及其在不同恶性肿瘤中的效应子亚群和调控机制 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4274 | 2024-09-26 |
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414716
PMID:39315092
|
研究论文 | 研究探讨了铂类化疗对高级别浆液性卵巢癌患者单核细胞抗原呈递潜力的影响 | 首次揭示了铂类化疗通过转录上调MHC II类分子在单核细胞中诱导抗原呈递,而非通过表观遗传变化 | 研究仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,且样本量未明确 | 揭示肿瘤特异性转录和表观遗传变化,以及化疗如何重编程单核细胞 | 高级别浆液性卵巢癌患者的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4275 | 2024-09-26 |
Causal effects of systemic inflammatory proteins on Guillain-Barre Syndrome: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1456663
PMID:39315093
|
研究论文 | 本研究通过全基因组孟德尔随机化、单细胞RNA测序分析和网络药理学探讨了系统性炎症蛋白对吉兰-巴雷综合征的因果效应 | 首次通过孟德尔随机化分析确定了四种与吉兰-巴雷综合征因果相关的炎症蛋白,并结合单细胞RNA测序和分子对接技术预测了潜在的治疗靶点 | 研究样本仅限于欧洲血统的参与者,可能限制了结果的普适性 | 探讨系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系,并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系 | 生物信息学 | 神经疾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接技术 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 8293名欧洲血统的参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 4276 | 2024-09-25 |
AFSC: A self-supervised augmentation-free spatial clustering method based on contrastive learning for identifying spatial domains
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.09.005
PMID:39310278
|
研究论文 | 提出了一种基于对比学习的无数据增强自监督空间聚类方法AFSC,用于识别空间域 | 设计了无负样本或数据增强的对比学习模块,并结合空间信息和基因表达进行潜在表示学习 | 未提及 | 改进空间聚类方法以识别空间域 | 空间转录组数据中的空间域 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 自监督学习模型 | 基因表达数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4277 | 2024-09-25 |
UQCRB and LBH are correlated with Gleason score progression in prostate cancer: Spatial transcriptomics and experimental validation
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.026
PMID:39310280
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析前列腺癌组织中不同病理结构与Gleason评分进展的关系,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的作用 | 首次通过空间转录组学技术分析前列腺癌组织中Gleason评分进展相关的分子事件,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于TCGA-PRAD数据集和实验验证,未来需在更多样本和临床数据中进一步验证 | 探讨前列腺癌中Gleason评分进展相关的分子机制 | 前列腺癌组织及其Gleason评分进展相关的基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同病理结构的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4278 | 2024-09-25 |
Deciphering the cellular and molecular landscapes of Wnt/β-catenin signaling in mouse embryonic kidney development
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.025
PMID:39310276
|
研究论文 | 研究探讨了Wnt/β-catenin信号通路在小鼠胚胎肾脏发育中的细胞和分子机制 | 首次详细分析了Wnt/β-catenin信号通路激活后在不同胚胎肾脏细胞类型中的基因表达变化,并鉴定了直接转录靶点 | 研究主要集中在体外实验,缺乏体内验证 | 揭示Wnt/β-catenin信号通路在胚胎肾脏发育中的具体作用 | 小鼠胚胎肾脏细胞和基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自小鼠胚胎肾脏的多个数据集,包括GSE131240、GSE20325、GSE39583和GSE39837 | NA | NA | NA | NA |
| 4279 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis provides novel insights into the role of apoptosis-related genes in muscle aging
2024-10, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2024.105499
PMID:38852373
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了22个与肌肉衰老相关的凋亡相关基因,并评估了它们的诊断价值 | 本研究仅基于GSE143704数据集,样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探讨细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用及其潜在的诊断价值 | 肌肉衰老患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肌肉衰老患者和年轻对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4280 | 2024-09-25 |
Mechanisms of radiation-induced tissue damage and response
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.725
PMID:39309694
|
综述 | 本文综述了辐射诱导组织损伤(RITI)的分子机制,并探讨了单细胞测序(Sc-seq)在揭示RITI分子机制和识别潜在预防靶点中的应用 | 利用单细胞测序技术深入解析了RITI的分子机制,并提出了基于Sc-seq的个性化治疗策略 | NA | 揭示辐射诱导组织损伤的分子机制,并探讨相应的预防和治疗策略 | 辐射诱导组织损伤及其分子机制 | NA | NA | 单细胞测序(Sc-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |