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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4181 | 2024-10-02 |
The Role of Activator Protein-1 Complex in Diabetes-Associated Atherosclerosis: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0167
PMID:38905153
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研究论文 | 研究了激活蛋白-1复合物在糖尿病相关动脉粥样硬化中的作用,通过单细胞RNA测序揭示了其在动脉粥样硬化病理中的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序识别出激活蛋白-1复合物作为糖尿病相关动脉粥样硬化的新靶点,并验证了其抑制剂T-5224在糖尿病Apoe-/-小鼠模型中的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床试验中验证 | 探索糖尿病相关动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4182 | 2024-10-02 |
Pan-cancer integrative analyses dissect the remodeling of endothelial cells in human cancers
2024-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae231
PMID:39345334
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研究论文 | 本文通过整合575名癌症患者的单细胞RNA测序数据,分析了19种实体肿瘤类型中肿瘤内皮细胞(TECs)的表型多样性 | 揭示了TECs在泛癌视角下的组成和功能异质性,并发现了两种主要亚型:tip细胞和veins细胞,它们在空间组织模式和功能上表现出显著差异 | NA | 深入理解肿瘤内皮细胞的异质性及其在抗血管生成疗法和免疫疗法中的作用 | 肿瘤内皮细胞(TECs)及其在不同癌症类型中的表型多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 575名癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4183 | 2024-10-02 |
StableMate: a statistical method to select stable predictors in omics data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae130
PMID:39345755
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研究论文 | 本文介绍了一种名为StableMate的统计方法,用于在组学数据中选择稳定的预测因子 | StableMate通过跨异质数据集的变量选择过程,解决了组学数据复杂性和变异性导致的关联缺乏可重复性和可解释性的问题 | NA | 开发一种能够在不同环境中选择稳定预测因子的统计方法,以提高生物学关联的可重复性和可解释性 | 乳腺癌RNA测序数据、结肠癌宏基因组数据和胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 回归分析 | 回归框架 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4184 | 2024-10-02 |
Arrestin beta-2 deficiency exacerbates periodontal inflammation by mediating activating transcription factor 6 activation and abnormal remodelling of the extracellular matrix
2024-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13952
PMID:38267365
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研究论文 | 研究了arrestin beta-2 (ARRB2)在牙周炎进展中的具体作用及其机制 | 揭示了ARRB2通过抑制ATF6信号通路介导的细胞外基质重塑对牙周组织的保护作用 | NA | 探讨ARRB2在牙周炎进展中的作用及其机制 | 牙周炎患者和健康对照者的牙周组织 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、Western blotting、免疫组织化学染色 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4185 | 2024-10-02 |
Macrophages Promote Atherosclerosis Development by Inhibiting CD8T Cell Apoptosis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2024/1929766
PMID:39345351
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞通过抑制CD8T细胞凋亡促进动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示了巨噬细胞通过C1q-C1qbp轴抑制CD8T细胞凋亡,从而促进动脉粥样硬化发展的机制 | 研究主要基于小鼠模型,需进一步在人体中验证 | 探讨巨噬细胞与CD8T细胞相互作用在动脉粥样硬化发展中的作用 | 巨噬细胞和CD8T细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, ChIP-qPCR, 蛋白质印迹, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4186 | 2024-10-02 |
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18158
PMID:39346086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了人乳头瘤病毒(HPV)感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响,特别是上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 | 首次系统分析了HPV阳性及阴性宫颈癌样本中单细胞RNA测序数据,揭示了HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 研究样本仅来自Gene Expression Omnibus数据库,可能存在数据偏差;未涉及临床验证 | 探索HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响,为优化宫颈癌的预防筛查和个性化治疗提供新的分子基础 | HPV阳性及阴性宫颈癌样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12,431个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4187 | 2024-10-02 |
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1410373
PMID:39346737
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研究论文 | 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 | 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509,并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证其疗效 | 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用,以增强抗肿瘤免疫效果 | TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4188 | 2024-10-02 |
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1451461
PMID:39346775
|
综述 | 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制,并比较了不同基因表达模型的优缺点 | 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结,并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 | 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 | 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型,并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 | 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 | NA | NA | 单细胞测序、多组学整合 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4189 | 2024-10-02 |
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1461424
PMID:39346916
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研究论文 | 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用,通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 | 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 | NA | 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 | 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4190 | 2024-10-01 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-Oct, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析,比较了在自身免疫介导的神经炎症模型中,反应性室管膜细胞和星形胶质细胞的转录组特征 | 揭示了在多种神经炎症背景下,室管膜细胞和星形胶质细胞反应性状态的保守基因特征 | 尚未探索驱动室管膜细胞反应性的机制及其下游功能后果 | 研究室管膜细胞在神经炎症中的反应性状态及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的反应性转录组特征 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4191 | 2024-10-01 |
Exploring the heterogeneity of interstitial cells of Cajal and their properties in gastrointestinal mesenchymal tumors applying single-cell RNA sequencing analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01372-8
PMID:39331193
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析探索胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性及其特性 | 揭示了胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性和干细胞特性,并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的特性和分子机制 | 胃肠间质瘤中的间质细胞Cajal | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 34,861个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4192 | 2024-10-01 |
Exploring copper metabolism-induced cell death in gastric cancer: a single-cell RNA sequencing study and prognostic model development
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01374-6
PMID:39331287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胃癌中铜代谢诱导的细胞死亡,并开发基于铜代谢相关基因表达的预后模型 | 首次在单细胞水平上研究铜代谢在胃癌中的作用,并开发了基于铜代谢相关基因的预后模型 | NA | 研究胃癌中铜代谢的作用,并开发预后模型 | 胃癌组织和正常组织的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和随机生存森林 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4193 | 2024-10-01 |
Identification of immune patterns in idiopathic pulmonary fibrosis patients driven by PLA2G7-positive macrophages using an integrated machine learning survival framework
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73625-z
PMID:39333367
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研究论文 | 本研究通过集成机器学习生存框架,识别特发性肺纤维化患者中由PLA2G7阳性巨噬细胞驱动的免疫模式 | 首次通过免疫相关风险评分(IRS)识别PLA2G7作为特发性肺纤维化的新型生物标志物,并验证了塞来昔布与PLA2G7的有效结合 | NA | 识别特发性肺纤维化患者中的新免疫模式和生物标志物,以改善早期诊断和干预 | 特发性肺纤维化患者及其免疫微环境 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞测序 | 集成机器学习框架 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4194 | 2024-10-01 |
Deciphering the role of sphingolipid metabolism in the immune microenvironment and prognosis of esophageal cancer via single-cell sequencing and bulk data analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01379-1
PMID:39333432
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量数据分析,揭示了鞘脂代谢在食管癌免疫微环境和预后中的作用 | 结合单细胞和转录组数据,提供了与鞘脂代谢相关的可靠预后模型,并为食管鳞状细胞癌的免疫治疗和药物治疗提供了遗传学层面的指导 | NA | 探讨鞘脂代谢在食管鳞状细胞癌中的作用及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌的鞘脂代谢相关基因及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO和TCGA的数据,分析了97个基因在食管鳞状细胞癌上皮细胞中的表达 | NA | NA | NA | NA |
| 4195 | 2024-10-01 |
Construction of store-operated calcium entry-related gene signature for predicting prognosis and indicates immune microenvironment infiltration in stomach adenocarcinomas
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73324-9
PMID:39333689
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研究论文 | 研究构建了与存储操作钙进入相关的基因签名,用于预测胃腺癌的预后并指示免疫微环境浸润 | 首次系统研究了存储操作钙进入(SOCE)在胃腺癌(STAD)中的预后和免疫学价值 | NA | 开发一个风险模型,探索SOCE签名与临床特征、预后、肿瘤微环境(TME)以及对免疫治疗、化疗和靶向药物反应的相关性 | 胃腺癌(STAD)患者的SOCE相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA、GEO(GSE84437和GSE159929)、cBioPortal和TIMER数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4196 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型,用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制,将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力,显著提高了计算效率,并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型,以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4197 | 2024-10-01 |
Oncogenic ACSM6 impairs CD8+ T cell-based immune response in bladder cancer
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00657-y
PMID:39334304
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研究论文 | 研究了致癌基因ACSM6在膀胱癌中对CD8+ T细胞免疫反应的影响 | 发现ACSM6通过抑制CD8 T细胞的趋化性和肿瘤杀伤能力,导致非炎症性免疫微环境,从而影响膀胱癌的免疫治疗效果 | NA | 探讨ACSM6在膀胱癌免疫治疗中的作用及其作为预测膀胱癌进展的生物标志物的潜力 | 膀胱癌中的ACSM6表达及其对CD8+ T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4198 | 2024-10-01 |
Single-cell sequencing to multi-omics: technologies and applications
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00643-4
PMID:39334490
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在多组学中的应用 | 介绍了单细胞多组学技术的发展及其在生物学研究和临床应用中的最新进展 | 讨论了单细胞多组学技术的局限性和面临的挑战 | 探讨单细胞测序技术在多组学中的应用及其在生物学研究和临床中的潜力 | 单细胞RNA测序及其与其他多组学的结合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4199 | 2024-10-01 |
Functional heterogeneity of cancer-associated fibroblasts with distinct neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00656-z
PMID:39334513
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研究论文 | 研究了食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术,揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞在术前治疗后的显著变化,并发现了与不良治疗反应相关的功能性成纤维细胞亚群 | 研究样本来自单一临床试验,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自术前抗PD1联合治疗临床试验的食管鳞状细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4200 | 2024-10-01 |
YTHDF1 in periaqueductal gray inhibitory neurons contributes to morphine withdrawal responses in mice
2024-Sep-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03634-2
PMID:39304892
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研究论文 | 本文研究了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的作用,及其对小鼠吗啡戒断反应的影响 | 首次揭示了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达上调与吗啡戒断反应的关系,并探讨了其通过调节NF-κB表达和磷酸化来调控吗啡戒断反应的机制 | 研究仅限于小鼠模型,且未探讨YTHDF1在其他脑区或人类中的作用 | 探讨YTHDF1在吗啡戒断反应中的作用及其机制 | YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达及其对吗啡戒断反应的影响 | NA | NA | 腺相关病毒转染、单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57/BL6小鼠或转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |