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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
Single Cell Profiling in the Sox10 Dom/+ Hirschsprung Mouse Implicates Hoxa6 in Enteric Neuron Lineage Allocation
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613729
PMID:39345473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10 Dom/+小鼠模型，揭示了Hoxa6在肠神经系统神经元谱系分配中的作用 | 首次报道Hox基因参与肠神经元谱系多样化，发现Sox10 Dom/+突变导致新的祖细胞簇和神经元轨迹改变 | 研究仅限于小鼠模型，人类肠神经系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元亚型比例及其分子机制 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 杂交链式反应(HCR) | NA | 单细胞转录组数据 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-06 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析猪到人肾脏异种移植中的细胞动态变化和免疫反应 | 首次在猪到人肾脏异种移植中应用纵向单细胞转录组分析，揭示了时间分辨的细胞动态变化和免疫反应 | 仅分析了两例异种移植案例，样本量有限 | 研究异种移植过程中移植肾脏与受体之间的相互作用和免疫反应 | 猪肾脏异种移植受体和移植肾脏组织 | 单细胞生物学 | 器官移植 | 单细胞RNA测序, 纵向RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 2例猪到人肾脏异种移植案例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2025-10-06 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-08-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
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研究论文 | 本研究通过分析慢性HCV感染患者的B细胞受体库和单细胞转录组，揭示了表达病毒中和性抗原受体的B细胞具有淋巴瘤样转录组特征 | 首次发现表达IGHV1-69编码的HCV中和性抗原受体的B细胞在慢性HCV感染患者中表现出持续的致癌转录组特征，即使病毒清除后仍长期存在 | 研究样本量有限，体外信号传导实验可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究慢性HCV感染与B细胞异常增殖及淋巴瘤风险增加的机制关联 | 慢性HCV感染患者和经直接抗病毒治疗获得持续病毒学应答的患者 | 免疫学 | 丙型肝炎病毒感染 | B细胞受体测序，单细胞RNA测序，体外信号传导实验 | TKO模型 | 基因组测序数据，转录组数据 | 慢性HCV感染患者和HCV SVR患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-12, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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综述 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的应用与优势 | 首次系统评述单细胞和空间转录组学在植物-微生物共生研究中的创新应用，突破了传统RNA-seq技术的细胞分辨率限制 | 当前技术难以在同一细胞中同时捕获植物和微生物的转录本 | 研究植物与微生物之间的共生关系建立机制 | 植物-微生物共生体系 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术因丢失空间信息而存在的局限性，并提出整合空间转录组学数据的解决方案 | 提出通过空间信息指导单细胞分析的新思路，强调多技术整合的协同价值 | 当前单细胞分析流程无法完全恢复空间信息 | 分析单细胞RNA测序技术的局限性并探索空间信息整合方法 | 植物细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交 | NA | RNA测序数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
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研究论文 | 本研究揭示了Epsins通过调控主调控因子KLF4和OCT4来监督平滑肌细胞重编程的机制 | 首次发现Epsins通过不同方式调控OCT4和KLF4来引导平滑肌细胞向有益细胞类型重编程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其与冠状动脉疾病的关系 | 小鼠和人体的平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
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研究论文 | 本研究通过开发CPA-Perturb-seq多路复用单细胞扰动筛选技术，系统解析了42种切割加尾调控因子对多聚腺苷酸化位点选择的调控机制 | 首次将多路复用单细胞扰动筛选与3'单细胞RNA测序相结合，开发了APARENT-Perturb深度神经网络模型解析串联多聚腺苷酸化位点的顺式调控机制 | 研究仅针对42种已知的CPA调控因子，可能未涵盖所有相关调控因子 | 深入理解切割加尾机制调控多聚腺苷酸化位点选择的分子机制 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化位点及其调控因子 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 多路复用扰动筛选, 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42种CPA调控因子的扰动数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 3' scRNA-seq | NA | 3'单细胞RNA测序 |
| 408 | 2025-10-06 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
|
研究论文 | 利用空间转录组学研究番茄愈伤组织芽再生过程中不同细胞的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术研究植物芽再生过程，揭示不同细胞类型的分子特征 | NA | 提高对植物芽再生机制的理解 | 番茄愈伤组织中的芽原基和绿色组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
|
研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通过调控R2逆转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2逆转座子的主要抑制因子，并阐明其通过整合rDNA拷贝数监测与环境感知来调控生殖系基因组稳定性 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的保守性尚需验证 | 探究生殖系rDNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
|
研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据，揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接，并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性，需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病（精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症）及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | 富集分析，功能连接分析 | 基因组数据，转录组数据，fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq，功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
| 411 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
|
研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调，可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠)，样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
|
研究论文 | 通过基因组尺度代谢建模识别上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据，结合机制性计算模型揭示EMT过程中的时间动态代谢依赖关系 | 研究基于TGF-β刺激的细胞培养模型，可能无法完全反映体内EMT过程的复杂性 | 探索上皮-间质转化过程中的代谢网络重编程机制 | 上皮-间质转化过程中的细胞代谢变化 | 计算生物学 | 肺癌 | 基因组尺度代谢建模，时间序列转录组学，时间序列蛋白质组学，单细胞转录组学，CRISPR-Cas9筛选 | 机制性计算模型 | 转录组数据，蛋白质组数据，单细胞数据 | 多个细胞培养模型的EMT数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
Associations between cuprotosis-related genes and the spectrum of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease: An exploratory study
2024-12, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.15946
PMID:39285685
|
研究论文 | 本研究探索铜死亡相关基因与代谢功能障碍相关脂肪肝疾病谱系之间的关联 | 首次系统研究铜死亡相关基因在MAFLD不同疾病阶段（包括肝癌）中的表达变化和功能作用 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证实验 | 探索铜死亡相关基因在MAFLD疾病进展中的作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病患者和MAFLD相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | 逻辑回归分析，差异相关性分析 | 基因表达数据，临床数据 | MAFLD患者331例，MAFLD相关HCC患者271例，验证队列656例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-Dec, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00734-0
PMID:39706866
|
研究论文 | 提出一种名为基因信号模式分析(GSPA)的图信号处理方法，用于从单细胞数据中学习基因表征 | 首次系统性地构建了基因嵌入问题，并开发了基于细胞-细胞图上扩散小波字典的基因表征学习方法 | NA | 开发能够从单细胞数据中学习基因表征的计算方法 | 单细胞测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，图信号处理 | GSPA（基因信号模式分析） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
[Ionizing radiation-induced damage (IRD) to and repair mechanisms of the male reproductive system: Report of testicular function changes in a case of IRD]
2024-Aug, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40778793
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研究论文 | 研究电离辐射对睾丸结构和功能的损伤机制及L-肉碱的干预效果 | 首次结合单细胞转录组测序与动物模型验证，揭示电离辐射通过干扰Leydig细胞和巨噬细胞的脂代谢通路导致生殖损伤 | 仅基于单个病例报告和小鼠模型，样本量有限 | 探究电离辐射对男性生殖系统的损伤机制及防治策略 | 人类睾丸组织和小鼠模型 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 辐射剂量模拟, 精液分析, 激素检测, 电子显微镜 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 精液样本, 激素水平数据, 电子显微镜图像 | 1例人类病例+小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44210-1
PMID:38191471
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示前列腺癌进展中不同间充质细胞状态的关键作用 | 首次在跨物种水平系统鉴定前列腺癌间质细胞亚群，发现晚期小鼠疾病与人类骨转移的间质特征相似性，并建立超越Gleason评分的转移预测基因标签 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析前列腺癌肿瘤微环境中间充质细胞的分子特征及其在癌症进展中的作用 | 基因工程小鼠模型和人类前列腺癌样本中的间充质细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
WEST is an ensemble method for spatial transcriptomics analysis
2024-Nov-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100886
PMID:39515332
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研究论文 | 提出一种名为WEST的集成方法，用于提升空间转录组学数据分析的性能和鲁棒性 | 利用集成技术整合多种分析方法，在空间域检测方面提供更高的准确性和灵活性 | 未在文章中明确说明 | 开发能够有效整合基因表达和空间信息的空间转录组学数据分析方法 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 集成方法 | 空间转录组数据 | 合成数据集和真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
Sensitive Multiplexed MicroRNA Spatial Profiling and Data Classification Framework Applied to Murine Breast Tumors
2024-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01773
PMID:39044395
|
研究论文 | 开发了一种高灵敏度的多重microRNA空间分析方法和数据分类框架，并应用于小鼠乳腺肿瘤 | 结合滚环扩增技术和双扫描方法，在纳升孔阵列中实现7种miRNA的同时定量和空间检测，检测限达0.17 zeptomoles | NA | 开发高灵敏度的空间转录组学方法用于miRNA检测 | 小鼠乳腺肿瘤组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 滚环扩增, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 纳升孔阵列与嵌入式水凝胶柱 |
| 419 | 2025-10-06 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
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研究论文 | 评估纳米级与混合微/纳米级表面形貌对骨整合过程中细胞行为的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术鉴定体内植入物表面早期细胞群，并比较纯纳米级与混合微/纳米级表面形貌的差异 | 研究主要关注短期效应（21天内），长期效果需要进一步验证 | 研究不同表面形貌对骨整合过程中细胞功能的影响 | 间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 生物材料 | 骨科植入 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Spatially resolved analysis of pancreatic cancer identifies therapy-associated remodeling of the tumor microenvironment
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01890-9
PMID:39227743
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学分析胰腺癌肿瘤微环境在治疗过程中的重塑过程 | 开发了空间约束最优输运相互作用分析(SCOTIA)模型，整合空间距离和配体-受体基因表达来解析细胞间相互作用 | NA | 解析胰腺癌肿瘤微环境在放化疗治疗过程中的重塑机制 | 人类胰腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞空间转录组学 | 最优输运模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |