单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 4141 - 4160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2024-09-28 |
cnnImpute: missing value recovery for single cell RNA sequencing data
2024-02-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53998-x
PMID:38365936
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于卷积神经网络（CNN）的方法cnnImpute，用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 提出了cnnImpute，一种新颖的基于卷积神经网络的方法，用于解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 未提及 | 开发一种有效的方法来恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4142 | 2024-09-28 |
Crosstalk Between Cancer-associated Fibroblasts and Myeloid Cells Shapes the Heterogeneous Microenvironment of Gastric Cancer
2024, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 研究探讨了胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞与骨髓细胞之间的相互作用及其对微环境异质性的影响 | 首次识别了两种癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在EMT和脂质代谢中的作用，以及肿瘤浸润性骨髓细胞的功能多样性 | 研究主要基于生物信息学分析和单细胞RNA测序数据，实验验证部分有限 | 深入了解胃癌微环境的异质性，为精准治疗提供新思路 | 胃癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和骨髓细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及八个细胞群体的单细胞图谱 | NA | NA | NA | NA |
| 4143 | 2024-09-28 |
Identify BCAT1 plays an oncogenic role and promotes EMT in KIRC via single cell RNA-seq and experiment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1446324
PMID:39324007
|
研究论文 | 本研究探讨了BCAT1在肾透明细胞癌（KIRC）中的致癌作用及其通过上皮间质转化（EMT）促进肿瘤侵袭和转移的机制 | 首次系统研究了BCAT1在KIRC中的致癌作用及其通过EMT促进肿瘤侵袭和转移的机制 | NA | 探讨BCAT1在肾透明细胞癌（KIRC）中的致癌作用及其机制 | BCAT1在KIRC中的功能和机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE159115单细胞转录组数据，并进行了临床组织样本的Western Blotting和免疫组化染色 | NA | NA | NA | NA |
| 4144 | 2024-09-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the communications between tumor microenvironment components and tumor metastasis in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445555
PMID:39324133
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的通信机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的复杂通信机制 | 研究仅基于特定数据集，结果的普适性有待进一步验证 | 探索骨肉瘤的转移机制，为癌症治疗开辟新途径 | 骨肉瘤中的肿瘤微环境成分与肿瘤转移 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE152048、GSE14359和GSE49003数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4145 | 2024-09-27 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
|
研究论文 | 研究了PFKFB3表达的β细胞在糖尿病中的功能障碍及其与能量保存和正向上位性的关系 | 揭示了PFKFB3通过与抗凋亡基因的相互作用，促进糖尿病中功能障碍β细胞的长期存活，并提出了通过抑制PFKFB3来清除这些细胞以恢复葡萄糖耐量的方法 | NA | 探讨PFKFB3在糖尿病中如何掩盖功能障碍β细胞的竞争特性 | PFKFB3表达的β细胞及其在糖尿病中的功能障碍 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自nPOD T2D胰腺的PFKFB3阳性β细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4146 | 2024-09-27 |
Practical Compass of Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Oct, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00840-4
PMID:38019344
|
综述 | 本文提供了从处理fastq数据集到绘制图表和绘制轨迹的基本过程的逐步指导 | 本文介绍了用户友好的scRNA-seq包，用于配体-受体相互作用和轨迹分析 | 更新最新信息对许多研究人员来说很困难 | 提供单细胞RNA-seq数据分析的实用指南 | 单细胞RNA-seq数据分析的基本过程和工具 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4147 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid: Insights into pathogenesis and therapy on bullous formation
2024-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19924
PMID:38433529
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4148 | 2024-09-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals surface markers of primordial germ cells in chicken and zebra finch
2024-Sep-26, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-024-02186-7
PMID:39325237
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的表面标记物 | 发现了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物NEGR1、SLC34A2和ESYT3，这些标记物在后期发育阶段和生殖组织中持续表达 | 现有的分离方法在效率和适用性方面存在局限，特别是SSEA-1的特异性在后期发育阶段下降 | 揭示鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物，以解决现有分离方法的局限性 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4149 | 2024-09-27 |
High infiltration of immune cells with lower immune activity mediated the heterogeneity of gastric adenocarcinoma and promoted metastasis
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37092
PMID:39319155
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析胃腺癌的转移特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了低免疫活性的免疫细胞高浸润与胃腺癌异质性和转移的关系 | 研究仅限于体外实验验证，缺乏体内实验数据 | 探索胃腺癌的转移特征 | 胃腺癌的免疫细胞和基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7697个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4150 | 2024-09-27 |
A Quantitative Computational Framework for Allopolyploid Single-Cell Data Integration and Core Gene Ranking in Development
2024-Sep-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msae178
PMID:39213378
|
研究论文 | 开发了一种名为“伪基因组分化量化”（pgDQ）的定量计算框架，用于量化和追踪异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 提出了pgDQ方法，能够直接在细胞水平上量化和追踪亚基因组分化，并能与单细胞RNA测序数据得出的细胞分化轨迹进行比较 | 未提及 | 探讨异源多倍体发育过程中不同基因组融合对发育的影响 | 异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4151 | 2024-09-26 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
|
研究论文 | 研究探讨了Kmt2c基因半合子缺失小鼠的转录组失调和自闭症样行为，并发现LSD1抑制剂可以改善这些行为 | 首次揭示了Kmt2c基因半合子缺失导致的神经发育缺陷的分子机制，并证明了LSD1抑制剂在治疗这些缺陷中的有效性 | 研究主要集中在成年小鼠，未探讨LSD1抑制剂对幼年小鼠的影响 | 探讨Kmt2c基因半合子缺失如何导致神经发育缺陷及其治疗方法 | Kmt2c基因半合子缺失小鼠及其行为和转录组变化 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年和新生小鼠脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4152 | 2024-09-27 |
Irradiated tumor cell-released microparticles enhance the therapeutic efficacy of PD-1 inhibitors by promoting M1-TAMs polarization in NSCLC brain metastases
2024-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217133
PMID:39079563
|
研究论文 | 研究探讨了放射治疗后肿瘤细胞释放的微粒子（RT-MPs）如何通过促进M1型肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的分化，增强PD-1抑制剂在非小细胞肺癌脑转移中的治疗效果 | 首次研究了RT-MPs在跨越血脑屏障后，通过改变TAMs的微环境，从M2型转变为M1型，从而增强免疫治疗效果 | 研究基于动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探索提高非小细胞肺癌脑转移患者对免疫治疗反应的新方法 | 放射治疗后肿瘤细胞释放的微粒子（RT-MPs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞数据 | 动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4153 | 2024-09-27 |
The Impact of Low Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569988
PMID:38106143
|
研究论文 | 研究低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响 | 首次全面分析了低蛋白饮食对肾脏发育的影响，特别是对分支形态发生和肾元形成过程中细胞和分子变化的影响 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨低蛋白饮食对胎儿肾脏发育的影响及其分子和细胞机制 | 胎儿肾脏的发育过程，特别是肾元的形成 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，光学投影断层扫描，共聚焦显微镜 | NA | 图像，基因表达数据 | 小鼠模型中的多个发育阶段样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4154 | 2024-09-27 |
Dermal fibroblasts retain site-specific transcriptomic identity in keloids
2024-Aug-17, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2024.08.002
PMID:39322512
|
研究论文 | 研究探讨了瘢痕疙瘩中成纤维细胞是否保留了部位特异性的转录组身份 | 首次揭示了瘢痕疙瘩中不同部位的成纤维细胞保留了独特的解剖学相关的基因表达谱 | 研究仅限于瘢痕疙瘩中的成纤维细胞，未涉及其他皮肤细胞类型 | 评估不同解剖部位的瘢痕疙瘩中是否存在空间异质性和部位特异性 | 瘢痕疙瘩中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 139个瘢痕疙瘩皮肤组织和19个瘢痕疙瘩成纤维细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4155 | 2024-09-27 |
Early-stage lung cancer is driven by a transitional cell state dependent on a KRAS-ITGA3-SRC axis
2024-Jul, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00113-5
PMID:38755258
|
研究论文 | 研究探讨了KRAS突变在肺腺癌早期发展中的作用及其与ITGA3-SRC轴的关系 | 通过单细胞RNA测序揭示了AT2细胞在早期肺腺癌中的过渡状态，并发现KRAS突变通过ITGA3-SRC轴影响这一状态 | 研究主要基于AT2-间充质器官共培养、小鼠和早期肺腺癌患者的样本，可能需要更多临床样本验证 | 探讨KRAS突变在肺腺癌早期发展中的作用及其与ITGA3-SRC轴的关系 | AT2细胞、小鼠、早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | AT2-间充质器官共培养、小鼠和早期肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4156 | 2024-09-27 |
Lysophospholipid Acyltransferase 9 Promotes Emphysema Formation via Platelet-activating Factor
2024-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0253OC
PMID:38377392
|
研究论文 | 研究LPLAT9通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 首次揭示了LPLAT9在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的作用及其通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨LPLAT9在COPD发病机制中的作用 | LPLAT9基因表达、单细胞RNA测序数据、肺泡巨噬细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LPLAT9敲除小鼠和对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4157 | 2024-09-27 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: a single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588047
PMID:38617282
|
研究论文 | 研究了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的动态变化 | 样本量较小，仅包括三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | 探讨急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的响应机制 | 急性SIV感染的猕猴中枢神经系统中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 4158 | 2024-09-27 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the role of intermediate monocytes in aneurysmal subarachnoid hemorrhage
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1401573
PMID:39318997
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的单核细胞，揭示了中间单核细胞在神经炎症中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后中间单核细胞在神经炎症中的关键作用 | 研究样本量较小，仅包括两名男性患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血后神经炎症的机制 | 单核细胞及其亚群在动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共17,242个细胞，包括7,224个脑脊液细胞和10,018个外周血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4159 | 2024-09-26 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing identifies POSTN as a potential biomarker and therapeutic target for rheumatoid arthritis
2024-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148798
PMID:39067546
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，通过生物信息学分析和分子对接验证，识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 识别类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 类风湿性关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4160 | 2024-09-26 |
Immunoinhibitory effects of hypoxia-driven reprogramming of EGR1hi and EGR3 positive B cells in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2024-Nov, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 研究探讨了在鼻咽癌微环境中，缺氧条件下EGR1和EGR3阳性B细胞的免疫抑制作用及其机制 | 首次揭示了EGR1和EGR3在缺氧条件下对Breg细胞分化的调控作用，并阐明了其通过MAPK途径和免疫抑制因子表达影响肿瘤微环境的机制 | 研究主要基于单细胞转录组测序和移植实验，缺乏体内实验验证 | 探讨鼻咽癌微环境中Breg细胞的分化及其免疫抑制机制 | 鼻咽癌微环境中的Breg细胞及其在缺氧条件下的分化和调控机制 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类鼻咽癌样本 | NA | NA | NA | NA |