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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4121 | 2024-09-26 |
Single-Cell Sequencing: High-Resolution Analysis of Cellular Heterogeneity in Autoimmune Diseases
2024-Jun, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-024-09001-6
PMID:39186216
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的创新应用及其对疾病诊断和精准治疗的影响 | 单细胞测序技术能够以高分辨率分析细胞异质性,揭示驱动疾病进展的分子机制 | 尽管单细胞测序技术在自身免疫性疾病中有广泛应用,但仍存在一些局限性 | 研究单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的应用,以揭示其发病机制和治疗靶点 | 自身免疫性疾病中的细胞异质性和分子机制 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序技术,特别是单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组、表观基因组或转录组信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4122 | 2024-09-26 |
Multi-omics Analysis Identifies Hypoxia Subtypes and S100A2 as an Immunosuppressive Factor in Cervical Cancer
2024-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-023-01304-x
PMID:37648942
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,在宫颈癌样本中识别出三种缺氧亚型,并发现S100A2作为免疫抑制因子 | 首次在宫颈癌中研究缺氧景观,并识别出S100A2作为缺氧诱导的免疫抑制因子 | NA | 研究宫颈癌中的缺氧亚型及其对免疫治疗反应的影响 | 宫颈癌样本及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据集的宫颈癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4123 | 2024-09-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals that MYBL2 in malignant epithelial cells is involved in the development and progression of ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438198
PMID:39136009
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了恶性上皮细胞中的MYBL2在卵巢癌发展和进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究了卵巢癌患者的细胞组成,并识别了关键的亚群和影响卵巢癌进展的转录因子 | 研究样本仅限于六名卵巢癌伴网膜转移的患者,可能影响结果的普适性 | 深入理解恶性上皮细胞在卵巢癌中的作用,并探讨卵巢癌免疫微环境和免疫耗竭的影响 | 卵巢癌患者的恶性上皮细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六名卵巢癌伴网膜转移的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 4124 | 2024-09-26 |
γδ T-cells in human malignancies: insights from single-cell studies and analytical considerations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438962
PMID:39281674
|
综述 | 本文综述了单细胞研究在不同恶性肿瘤中对γδ T细胞的生物学特性和调控机制的见解 | 介绍了高分辨率单细胞测序技术在γδ T细胞研究中的应用 | γδ T细胞的低丰度使得其生物学特性仍不明确 | 探讨γδ T细胞在人类恶性肿瘤中的作用及其生物学机制 | γδ T细胞及其在不同恶性肿瘤中的效应子亚群和调控机制 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4125 | 2024-09-26 |
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414716
PMID:39315092
|
研究论文 | 研究探讨了铂类化疗对高级别浆液性卵巢癌患者单核细胞抗原呈递潜力的影响 | 首次揭示了铂类化疗通过转录上调MHC II类分子在单核细胞中诱导抗原呈递,而非通过表观遗传变化 | 研究仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,且样本量未明确 | 揭示肿瘤特异性转录和表观遗传变化,以及化疗如何重编程单核细胞 | 高级别浆液性卵巢癌患者的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4126 | 2024-09-26 |
Causal effects of systemic inflammatory proteins on Guillain-Barre Syndrome: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1456663
PMID:39315093
|
研究论文 | 本研究通过全基因组孟德尔随机化、单细胞RNA测序分析和网络药理学探讨了系统性炎症蛋白对吉兰-巴雷综合征的因果效应 | 首次通过孟德尔随机化分析确定了四种与吉兰-巴雷综合征因果相关的炎症蛋白,并结合单细胞RNA测序和分子对接技术预测了潜在的治疗靶点 | 研究样本仅限于欧洲血统的参与者,可能限制了结果的普适性 | 探讨系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系,并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系 | 生物信息学 | 神经疾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接技术 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 8293名欧洲血统的参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 4127 | 2024-09-25 |
AFSC: A self-supervised augmentation-free spatial clustering method based on contrastive learning for identifying spatial domains
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.09.005
PMID:39310278
|
研究论文 | 提出了一种基于对比学习的无数据增强自监督空间聚类方法AFSC,用于识别空间域 | 设计了无负样本或数据增强的对比学习模块,并结合空间信息和基因表达进行潜在表示学习 | 未提及 | 改进空间聚类方法以识别空间域 | 空间转录组数据中的空间域 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 自监督学习模型 | 基因表达数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4128 | 2024-09-25 |
UQCRB and LBH are correlated with Gleason score progression in prostate cancer: Spatial transcriptomics and experimental validation
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.026
PMID:39310280
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析前列腺癌组织中不同病理结构与Gleason评分进展的关系,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的作用 | 首次通过空间转录组学技术分析前列腺癌组织中Gleason评分进展相关的分子事件,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于TCGA-PRAD数据集和实验验证,未来需在更多样本和临床数据中进一步验证 | 探讨前列腺癌中Gleason评分进展相关的分子机制 | 前列腺癌组织及其Gleason评分进展相关的基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同病理结构的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4129 | 2024-09-25 |
Deciphering the cellular and molecular landscapes of Wnt/β-catenin signaling in mouse embryonic kidney development
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.025
PMID:39310276
|
研究论文 | 研究探讨了Wnt/β-catenin信号通路在小鼠胚胎肾脏发育中的细胞和分子机制 | 首次详细分析了Wnt/β-catenin信号通路激活后在不同胚胎肾脏细胞类型中的基因表达变化,并鉴定了直接转录靶点 | 研究主要集中在体外实验,缺乏体内验证 | 揭示Wnt/β-catenin信号通路在胚胎肾脏发育中的具体作用 | 小鼠胚胎肾脏细胞和基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自小鼠胚胎肾脏的多个数据集,包括GSE131240、GSE20325、GSE39583和GSE39837 | NA | NA | NA | NA |
| 4130 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis provides novel insights into the role of apoptosis-related genes in muscle aging
2024-10, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2024.105499
PMID:38852373
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了22个与肌肉衰老相关的凋亡相关基因,并评估了它们的诊断价值 | 本研究仅基于GSE143704数据集,样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探讨细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用及其潜在的诊断价值 | 肌肉衰老患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肌肉衰老患者和年轻对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4131 | 2024-09-25 |
Mechanisms of radiation-induced tissue damage and response
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.725
PMID:39309694
|
综述 | 本文综述了辐射诱导组织损伤(RITI)的分子机制,并探讨了单细胞测序(Sc-seq)在揭示RITI分子机制和识别潜在预防靶点中的应用 | 利用单细胞测序技术深入解析了RITI的分子机制,并提出了基于Sc-seq的个性化治疗策略 | NA | 揭示辐射诱导组织损伤的分子机制,并探讨相应的预防和治疗策略 | 辐射诱导组织损伤及其分子机制 | NA | NA | 单细胞测序(Sc-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4132 | 2024-09-25 |
Investigation of the pharmacological mechanisms of Shenfu injection in acute pancreatitis through network pharmacology and experimental validation
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37491
PMID:39309824
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和实验验证探讨了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的药理机制 | 首次通过网络药理学和实验验证揭示了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的多成分、多靶点和多细胞特性 | NA | 探讨参附注射液在急性胰腺炎治疗中的潜在机制 | 参附注射液在急性胰腺炎中的作用机制 | NA | 急性胰腺炎 | 网络药理学、分子对接、单细胞转录组分析、HE染色、流式细胞术、Tunel染色、CCK-8检测、Western blot、ELISA | NA | 基因、蛋白质、细胞 | 体外实验涉及多种细胞类型,体内实验涉及急性胰腺炎大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4133 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the distinct features of colorectal cancer with or without Fusobacterium nucleatum infection in PD-L1 blockade therapy
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37511
PMID:39309908
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了在PD-L1阻断疗法下,有无Fusobacterium nucleatum感染的结直肠癌的特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Fusobacterium nucleatum感染对PD-L1阻断疗法在结直肠癌中作用的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证结果 | 探讨PD-L1阻断疗法在结直肠癌中的作用机制,特别是Fusobacterium nucleatum感染的影响 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的结直肠癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4134 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and multicellular community in primary hepatocellular carcinoma underlying microvascular invasion
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37233
PMID:39309949
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了原发性肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤内异质性和多细胞社区 | 首次对肝细胞癌中的微血管侵犯进行了详细的单细胞分析,揭示了免疫抑制生态系统和与微血管侵犯相关的上调信号 | 样本量较小,仅包括3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本 | 研究肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤微环境,为免疫治疗提供潜在靶点 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及其配对的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本,以及它们的配对非肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 4135 | 2024-09-25 |
Single-cell transcriptome and crosstalk analysis reveals immune alterations and key pathways in the bone marrow of knee OA patients
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110827
PMID:39310769
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,研究了膝骨关节炎患者骨髓抽吸物中的免疫变化和关键通路 | 本文首次深入研究了骨髓在膝骨关节炎中的免疫变化,不同于以往关注损伤部位或外周血的研究 | NA | 揭示膝骨关节炎患者骨髓中的免疫变化和关键通路 | 膝骨关节炎患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自随机临床试验(MILES: NCT03818737)的骨髓抽吸物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4136 | 2024-09-25 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of pancreatic neuroendocrine tumors under genomic instability and histological grading
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110836
PMID:39310774
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析了胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 揭示了肿瘤细胞在不同组织学分级和基因组不稳定性模式下激活的核心通路存在显著差异,并发现多种细胞类型可能参与肝转移过程 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 胰腺神经内分泌肿瘤细胞及其在不同分级和基因组不稳定性下的异质性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4137 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA-seq analysis of rat molars reveals cell identity and driver genes associated with dental mesenchymal cell differentiation
2024-Sep-11, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01996-w
PMID:39256700
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析大鼠磨牙,揭示了与牙髓间充质细胞分化相关的细胞身份和驱动基因 | 首次在大鼠磨牙的晚期钟形阶段使用单细胞RNA测序分析,揭示了牙髓间充质细胞的异质性和分化轨迹,并鉴定了新的细胞标记基因 | 研究仅限于大鼠磨牙的晚期钟形阶段,未涵盖其他物种或发育阶段 | 研究牙齿形态发生中的分子机制和信号通路,特别是牙髓间充质细胞的分化 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的牙髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的多个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4138 | 2024-09-25 |
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-Sep-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03823-x
PMID:39256463
|
研究论文 | 本文通过NFIB/SOX9过表达诱导多能干细胞分化为星形胶质细胞,并进行了单细胞转录组测序分析 | 建立了NFIB/SOX9诱导的星形胶质细胞分化路径的全面图谱,揭示了分化过程中的分子变化 | 对诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征的理解仍不完全 | 研究人类神经疾病并识别治疗靶点 | 多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 64,736个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4139 | 2024-09-25 |
Characterization of prostate macrophage heterogeneity, foam cell markers, and CXCL17 upregulation in a mouse model of steroid hormone imbalance
2024-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71137-4
PMID:39251671
|
研究论文 | 研究使用激素失衡小鼠模型,分析前列腺巨噬细胞异质性、泡沫细胞标志物及CXCL17上调 | 首次在激素失衡小鼠模型中详细描述了前列腺巨噬细胞的异质性,并确认了泡沫细胞在前列腺中的潜在病理作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 | 进一步表征激素失衡模型中前列腺的细胞异质性,并识别招募的泡沫细胞的特定转录组特征 | 前列腺巨噬细胞、泡沫细胞及其标志物 | NA | 前列腺增生 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | C57BL/6J雄性小鼠,植入睾酮和雌二醇缓释颗粒或假手术,共两周 | NA | NA | NA | NA |
| 4140 | 2024-09-25 |
Differential expression of small bowel TGFβ1 and TGFβ3 characterizes intestinal strictures in patients with fibrostenotic Crohn's disease
2024-Sep, Histochemistry and cell biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00418-024-02290-0
PMID:38705911
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研究论文 | 研究了TGFβ1和TGFβ3在小肠狭窄患者中的表达差异,以了解其在克罗恩病肠道纤维化中的作用 | 首次通过原位杂交和单细胞转录组学研究了TGFβ1和TGFβ3在小肠狭窄中的表达差异,揭示了TGFβ3在肠道纤维化中的潜在作用 | 研究仅限于小肠狭窄的黏膜和黏膜下层,未涉及其他组织或细胞类型 | 探讨TGFβ1和TGFβ3在克罗恩病小肠狭窄形成中的作用,为治疗提供理论依据 | 克罗恩病患者的小肠狭窄组织 | NA | 克罗恩病 | 原位杂交、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者的小肠狭窄组织与正常小肠组织 | NA | NA | NA | NA |