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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4101 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
|
研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本,需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本,以及胆结石小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4102 | 2024-09-30 |
KNSTRN Is a Prognostic Biomarker That Is Correlated with Immune Infiltration in Breast Cancer and Promotes Cell Cycle and Proliferation
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10615-2
PMID:38198023
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研究论文 | 本研究分析了KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、与免疫浸润的相关性及其调控细胞周期的作用 | 首次揭示了KNSTRN在乳腺癌中的生物学功能及其作为预后标志物的潜力 | 主要依赖于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨KNSTRN在乳腺癌中的表达及其生物学功能 | KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、免疫浸润相关性及细胞周期调控 | NA | 乳腺癌 | 基因集富集分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas、Gene Expression Omnibus、TIMER和The Human Protein Atlas数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4103 | 2024-09-30 |
Integrated multi-omics analyses reveal the pro-inflammatory and pro-fibrotic pulmonary macrophage subcluster in silicosis
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116899
PMID:39181076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了硅肺病中促进炎症和纤维化的肺巨噬细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了硅肺病中Mmp12hi巨噬细胞亚群的异质性和空间定位 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨硅肺病中肺巨噬细胞的表型和功能异质性 | 硅肺病小鼠模型中的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 硅肺病小鼠模型和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4104 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing of estrual mice reveals PM2.5-induced uterine cell heterogeneity and reproductive toxicity
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116968
PMID:39236655
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响 | 首次揭示了PM2.5暴露导致子宫细胞异质性和生殖毒性的细胞机制,特别是NK细胞中IL-17信号通路的抑制 | 研究仅限于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响及其生殖毒性的机制 | 小鼠子宫细胞群和基因表达 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4105 | 2024-09-30 |
SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
2024-Sep-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4942
PMID:39331720
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研究论文 | 介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架,用于整合单细胞转录组学和空间转录组学数据,以探索肿瘤微环境的空间结构 | SpaTopic通过主题建模将肿瘤微环境划分为具有一致细胞组织的空间域,提高了空间结构注释的性能,并能准确预测三级淋巴结构和肿瘤边界 | NA | 开发一种新的分析框架,用于探索、比较和解释肿瘤空间转录组学数据 | 肿瘤微环境的空间结构 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题建模 | 转录组数据 | 涉及多种肿瘤类型 | NA | NA | NA | NA |
| 4106 | 2024-09-30 |
Single-cell sequencing suggests a conserved function of Hedgehog-signalling in spider eye development
2024-Sep-26, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00230-6
PMID:39327634
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序数据重新分析,揭示了Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的保守功能 | 本文首次发现Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用,并展示了其在蜘蛛中的保守性 | 本文主要基于已发表的单细胞测序数据进行分析,未进行新的实验验证 | 探讨Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用及其保守性 | 蜘蛛眼睛发育过程中的基因表达调控网络 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个蜘蛛物种的胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4107 | 2024-09-30 |
POU4F3 is a Sensitive and Specific Marker of Merkel Cell Carcinoma
2024-Sep-26, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100627
PMID:39341281
|
研究论文 | 研究确定了POU4F3作为Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | 首次发现POU4F3作为Merkel细胞癌的特异性标记物,并验证了其在区分Merkel细胞癌与其他类似肿瘤中的应用 | 研究样本主要集中在TCGA数据集和其他公开数据集,可能存在数据偏倚 | 寻找和验证Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | Merkel细胞癌及其类似肿瘤 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序 | NA | RNA | 9264个实体肿瘤和超过600,000个单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4108 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing revealed the roles of macromolecule epidermal growth factor receptor (EGFR) in the hybrid sterility of hermaphroditic Argopecten scallops
2024-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136062
PMID:39341320
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了巨分子表皮生长因子受体(EGFR)在雌雄同体扇贝杂交不育中的作用 | 首次在杂交扇贝的性腺中进行全面的单细胞RNA测序,揭示了EGFR在杂交不育中的关键作用 | NA | 探讨EGFR在雌雄同体扇贝杂交不育中的遗传机制 | 雌雄同体扇贝的杂交不育性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌雄同体扇贝的杂交不育性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4109 | 2024-09-30 |
nsDCC: dual-level contrastive clustering with nonuniform sampling for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae477
PMID:39327063
|
研究论文 | 提出了一种名为nsDCC的双层对比聚类方法,结合非均匀采样技术用于单细胞RNA测序数据分析 | 引入双层对比聚类方法,结合实例级和聚类级对比,同时优化降维和聚类任务,并通过非均匀采样和注意力机制增强模型性能 | NA | 开发一种新的方法来优化单细胞RNA测序数据的降维和聚类任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 对比聚类模型 | RNA测序数据 | 涉及真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 4110 | 2024-09-30 |
Innate immune responses against mRNA vaccine promote cellular immunity through IFN-β at the injection site
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51411-9
PMID:39191748
|
研究论文 | 研究了mRNA疫苗注射部位的免疫反应,特别是通过IFN-β促进细胞免疫的过程 | 首次详细描述了mRNA疫苗注射部位的免疫反应机制,特别是注射部位成纤维细胞对mRNA的响应以及IFN-β信号在增强抗原特异性细胞免疫反应中的作用 | 研究仅限于BALB/c雌性小鼠模型,可能无法完全代表所有人群的免疫反应 | 探讨mRNA疫苗注射部位的免疫反应机制,特别是IFN-β在促进细胞免疫中的作用 | mRNA疫苗注射部位的免疫反应,特别是成纤维细胞和树突状细胞的响应 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | BALB/c雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 4111 | 2024-09-30 |
Maximizing single cell dissociation protocol for individual zebrafish embryo
2024-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2024.102958
PMID:39329153
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鱼胚胎单细胞分离协议 | 提出了针对小鱼胚胎的高质量单细胞悬液分离方法 | NA | 优化单细胞分离技术,以研究细胞异质性和细胞状态 | 小鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单个小鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 4112 | 2024-09-30 |
Natural hydrogen gas and engineered microalgae prevent acute lung injury in sepsis
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101247
PMID:39328786
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研究论文 | 研究探讨了天然氢气和工程微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 提出了DQB@C作为一种新型生物纳米系统,具有治疗脓毒症相关急性肺损伤的巨大潜力 | NA | 整合氢气和生物纳米微藻,扩展脓毒症的治疗选择 | 研究氢气和微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 生物医学工程 | 脓毒症 | 磷酸蛋白质组学、代谢组学和蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4113 | 2024-09-30 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveal immune-related biomarkers in postmenopausal osteoporosis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38022
PMID:39328516
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研究论文 | 研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了绝经后骨质疏松症中的免疫相关生物标志物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据,识别出六个免疫相关差异表达基因(IR-DEGs),并构建了绝经后骨质疏松症的分子亚型和诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的数据,缺乏临床样本的验证 | 探讨绝经后骨质疏松症的免疫调节机制和早期诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序 | 随机森林(RF)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)和LASSO回归模型 | RNA | 训练组使用GSE56815数据集,验证组使用GSE2208数据集,涉及单细胞RNA测序数据分析11个不同的细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 4114 | 2024-09-30 |
NOX2 mediates NLRP3/ROS facilitating nasal mucosal epithelial inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38029
PMID:39328569
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研究论文 | 本研究探讨了NOX2在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)中通过NLRP3/ROS途径促进鼻黏膜上皮炎症的机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示了NOX2在CRSwNP中通过ROS积累和NLRP3炎症小体激活的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据,缺乏体内实验验证 | 探讨氧化应激在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)鼻黏膜上皮细胞中的机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)的鼻黏膜上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HRA000772数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4115 | 2024-09-30 |
Non-thermal atmospheric pressure plasma induces selective cancer cell apoptosis by modulating redox homeostasis
2024-Sep-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01810-8
PMID:39327567
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研究论文 | 研究非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 首次详细探讨了非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 研究仅限于HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞,未涵盖其他类型的癌细胞 | 探索非热等离子体诱导选择性细胞死亡的机制及其在癌症治疗中的应用 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | 非热等离子体处理、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4116 | 2024-09-30 |
Beyond the bulk: overview and novel insights into the dynamics of muscle satellite cells during muscle regeneration
2024-Sep-26, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00354-1
PMID:39327631
|
综述 | 本文综述了肌肉卫星细胞在肌肉再生过程中的动态变化,并介绍了单细胞技术在研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,揭示了肌肉再生过程中肌肉卫星细胞的动态异质性 | NA | 综述肌肉卫星细胞在肌肉再生中的作用,并探讨单细胞技术带来的新见解 | 肌肉卫星细胞及其在肌肉再生中的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4117 | 2024-09-30 |
Ketamine ameliorates post-traumatic social avoidance by erasing the traumatic memory encoded in VTA-innervated BLA engram cells
2024-Sep-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.06.026
PMID:39032491
|
研究论文 | 研究探讨了氯胺酮通过消除中脑腹侧被盖区(VTA)投射到基底外侧杏仁核(BLA)的记忆细胞中的创伤记忆,减轻创伤后社交回避的作用 | 首次揭示了氯胺酮在记忆再巩固窗口期内通过减少BLA记忆细胞的活性和数量,有效缓解创伤后社交回避,并发现多巴胺D2受体在这一过程中的关键作用 | 研究仅在急性社会挫败应激(SDS)小鼠模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨氯胺酮在创伤后应激障碍(PTSD)治疗中的作用机制 | 创伤后社交回避及相关的记忆细胞 | 神经科学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4118 | 2024-09-30 |
Single-cell dissection of the human blood-brain barrier and glioma blood-tumor barrier
2024-Sep-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.07.026
PMID:39191260
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研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序技术分析了人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人脑血脑屏障的分子图谱,并揭示了胶质母细胞瘤中血脑屏障的异常特征 | 研究样本仅限于13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织 | 探究人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征,并研究其在胶质母细胞瘤中的异常变化 | 人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织,共103,230个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4119 | 2024-09-30 |
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-Sep-09, Aging
DOI:10.18632/aging.206105
PMID:39264584
|
研究论文 | 开发了一个细胞再生图谱,利用网络生物学方法识别再生策略的主调控因子 | 提出了SINGULAR系统,通过单细胞RNA测序和网络生物学方法,系统分析多种再生策略在多个器官中的效果 | 目前仅限于分析已知的再生策略,未来需要验证和扩展到更多策略 | 解决当前再生策略效果有限且机制不明的问题,设计更全面的细胞再生策略 | 多种器官的细胞再生策略及其分子机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络生物学 | 基因表达数据 | 多个器官的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4120 | 2024-09-30 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: A single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Sep, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012168
PMID:39283947
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研究论文 | 研究了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次在急性SIV感染的恒河猴中枢神经系统中进行了单细胞RNA测序,揭示了微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的不同亚群及其在感染期间的动态变化 | 样本量较小,仅包括三只感染SIV的恒河猴和三只未感染的对照组 | 探讨急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的动态变化及其与神经退行性疾病的潜在关联 | 急性SIV感染的恒河猴中枢神经系统中的微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三只感染SIV的恒河猴和三只未感染的对照组 | NA | NA | NA | NA |