单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7461 篇文献,本页显示第 4081 - 4100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4081 2024-09-30
Single-nuclei transcriptome analysis of channel catfish spleen provides insight into the immunome of an aquaculture-relevant species
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文通过单核RNA测序技术分析了养殖相关物种——通道鲶鱼脾脏的转录组,揭示了其免疫系统的细胞组成和基因表达特征 首次对通道鲶鱼脾脏进行单核RNA测序,识别了多种免疫细胞亚群及其基因表达特征 研究仅限于通道鲶鱼脾脏,未涉及其他组织或物种 深入研究通道鲶鱼的免疫系统,特别是脾脏的免疫细胞组成和基因表达 通道鲶鱼脾脏的免疫细胞及其基因表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 从8,157个细胞中生成了278,717,872条reads,整合数据包括19,613个细胞和20,121个基因 NA NA NA NA
4082 2024-09-30
Specific cell subclusters of dental pulp stem cells respond to distinct pathogens through the ROS pathway
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 研究分析了牙髓干细胞在受到口腔真菌和细菌感染时的细胞和分子特性 发现了一个特定的牙髓干细胞亚群对不同病原体感染有特异性反应,并通过ROS途径激活MAPK和NF-κB通路引发免疫反应 NA 研究牙髓干细胞在不同病原体感染下的反应机制 牙髓干细胞及其在真菌和细菌感染下的反应 NA NA 单细胞mRNA测序 NA mRNA 6名健康受试者的阻生第三磨牙中的牙髓干细胞 NA NA NA NA
4083 2024-09-30
Monocytes as an early risk factor for acute graft-versus-host disease after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病(aGVHD)的早期风险因素 首次发现移植后第21天外周血单核细胞的显著增加和激活与aGVHD的发生密切相关 研究样本量较小,需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 识别异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病的潜在生物标志物,以预防和治疗该疾病 异基因造血干细胞移植后发生或未发生急性移植物抗宿主病的患者 NA 血液系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 涉及发生和未发生急性移植物抗宿主病的患者样本 NA NA NA NA
4084 2024-09-28
[Advances in the application of single-cell sequencing technology in the study of neonatal necrotizing enterocolitis]
2024-Oct-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4085 2024-09-28
Machine Learning Developed a MYC Expression Feature-Based Signature for Predicting Prognosis and Chemoresistance in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Oct, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究开发了一种基于MYC表达特征的签名,用于预测胰腺腺癌的预后和化疗耐药性 首次在胰腺腺癌中建立了基于MYC表达特征的风险模型,并发现了与MYC表达和患者生存密切相关的七个基因 研究主要基于TCGA和其他数据库的数据,缺乏临床验证 开发一种新的生物标志物,用于预测胰腺腺癌患者的预后和化疗耐药性 胰腺腺癌患者的基因表达数据和临床信息 数字病理 胰腺癌 LASSO回归分析 风险模型 基因表达数据 训练集包括TCGA数据库的胰腺腺癌患者数据,验证集包括GSE57495、GSE62452和ICGC-PACA数据库的数据 NA NA NA NA
4086 2024-09-28
The miR-203/ZBTB20/MAFA Axis Orchestrates Pancreatic β-Cell Maturation and Identity During Weaning and Diabetes
2024-Oct-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 研究报告了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在断奶和糖尿病期间调控胰腺β细胞成熟和身份的机制 揭示了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在营养过渡期间调控β细胞成熟的新机制,并提出了一种通过操纵该轴来增加功能性β细胞数量以缓解糖尿病的新策略 NA 探讨营养过渡与β细胞成熟之间的分子机制 胰腺β细胞的成熟过程 NA 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
4087 2024-09-28
Interactions between fibroblasts and monocyte-derived cells in chronic lung injuries induced by real-ambient particulate matter exposure
2024-Oct, Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis
研究论文 研究长期暴露于细颗粒物(PM)引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的相互作用 揭示了特定成纤维细胞和单核细胞来源细胞亚群在长期PM暴露下的显著增加及其促炎和促纤维化功能 仅在C57BL/6 J雄性小鼠中进行了实验,结果的普适性有待验证 探讨长期暴露于细颗粒物(PM)引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的多样性和功能 成纤维细胞、髓源抑制细胞(MDSCs)和间质巨噬细胞(IMs) NA 肺损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 16周暴露于石家庄市真实环境PM的C57BL/6 J雄性小鼠 NA NA NA NA
4088 2024-09-28
Single-cell mapping of peripheral blood mononuclear cells reveals key transcriptomic changes favoring coronary artery lesion in IVIG-resistant Kawasaki disease
2024-Sep-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉免疫球蛋白(IVIG)抵抗型川崎病(KD)患者的外周血单核细胞(PBMCs)的转录组特征 首次全面描绘了IVIG抵抗型KD患者PBMCs的整体转录组图谱,揭示了CD8+效应T细胞分化受阻以及髓系细胞与T细胞之间的关键相互作用 样本量较小,仅包括12名参与者 探索IVIG抵抗型KD患者外周血单核细胞的转录组特征,揭示其与冠状动脉病变的关系 IVIG抵抗型KD患者、IVIG反应型KD患者和健康对照的外周血单核细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 12名参与者,包括5名IVIG抵抗型KD患者、4名IVIG反应型KD患者和3名健康对照 NA NA NA NA
4089 2024-09-28
Macrophage-Expressed Coagulation Factor VII Promotes Adverse Cardiac Remodeling
2024-Sep-27, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究了巨噬细胞表达的凝血因子VII在心肌梗死后不良心脏重塑中的作用 首次揭示了外周TF-FVIIa-PAR2信号复合体在缺血性心脏病中驱动炎症性巨噬细胞极化的作用,并提出了针对这一信号复合体的治疗策略 研究主要基于小鼠模型,结果的临床转化和人类适用性尚需进一步验证 探讨凝血-炎症回路在心肌梗死后巨噬细胞重编程中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 心肌梗死后巨噬细胞的极化和心脏重塑 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、共聚焦显微镜、纵向监测 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、显微镜图像 使用永久性左前降支结扎的小鼠模型进行研究 NA NA NA NA
4090 2024-09-28
A Ctnnb1 enhancer transcriptionally regulates Wnt signaling dosage to balance homeostasis and tumorigenesis of intestinal epithelia
2024-Sep-25, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文研究了Ctnnb1增强子对Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的作用 发现了ieCtnnb1增强子在肠道稳态和肿瘤发生中的关键作用,揭示了增强子依赖的Wnt信号调控机制 NA 研究Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的机制 Ctnnb1增强子及其在肠道上皮中的功能 NA 结直肠癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
4091 2024-09-27
Kidney fibrosis molecular mechanisms Spp1 influences fibroblast activity through transforming growth factor beta smad signaling
2024-Sep-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序数据深入探讨了肾脏纤维化过程中纤维母细胞和肌纤维母细胞的关键作用,并揭示了Spp1基因通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞向肌纤维母细胞分化的机制 首次揭示了Spp1基因在肾脏纤维化中的关键作用及其通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞分化的机制 NA 探讨肾脏纤维化过程中的分子机制 肾脏纤维化过程中的纤维母细胞和肌纤维母细胞 NA 肾脏疾病 单细胞测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
4092 2024-09-28
Unraveling the impact of lysosomal dysfunction on myeloproliferative neoplasm
2024-Sep, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 研究溶酶体功能障碍对骨髓增殖性肿瘤的影响及其病理机制 首次探讨了溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤中的作用,并揭示了其通过诱导异常炎症促进肿瘤发展的机制 样本量较小,尤其是单细胞RNA测序的样本数量有限 阐明溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤发病机制中的作用 骨髓增殖性肿瘤患者和健康对照组 NA 血液肿瘤 全转录组测序、单细胞RNA测序 NA 基因型数据、转录组数据 190名骨髓增殖性肿瘤患者和461名健康对照组 NA NA NA NA
4093 2024-09-28
Gene Misexpression in a Smoc2+ve/Sox2-Low Population in Juvenile Prop1-Mutant Pituitary Gland
2024-Aug-27, Journal of the Endocrine Society IF:3.0Q2
研究论文 研究了Prop1突变小鼠垂体中Smoc2阳性/Sox2低表达细胞群体的基因错误表达 发现了Prop1突变小鼠垂体中Smoc2阳性/Sox2低表达细胞群体的基因错误表达,并探讨了Smoc2和Sox2在垂体发育中的作用 研究仅限于Prop1突变小鼠,未探讨其他突变类型对垂体发育的影响 阐明Prop1突变小鼠垂体发育中Smoc2和Sox2的作用及其对垂体疾病的影响 Prop1突变小鼠的垂体细胞 NA 垂体疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 野生型和Prop1突变P4雌性小鼠的垂体细胞 NA NA NA NA
4094 2024-09-28
Benchmarking Algorithms for Gene Set Scoring of Single-cell ATAC-seq Data
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本文系统地评估了十种基因集评分(GSS)工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 首次系统地比较了多种GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的表现,并提供了实用的选择指南 研究主要集中在GSS工具的性能评估,未深入探讨其生物学意义 评估现有GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 单细胞ATAC-seq数据和GSS工具 生物信息学 NA 单细胞ATAC-seq NA 基因集评分数据 多达十个单细胞ATAC-seq数据集 NA NA NA NA
4095 2024-09-28
Opportunities and Challenges in Advancing Plant Research with Single-cell Omics
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
综述 本文综述了单细胞组学技术在植物研究中的应用及其面临的挑战 介绍了单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学等技术在植物科学中的应用 单细胞技术在植物中的应用受到细胞结构的限制 探讨单细胞组学技术在植物系统中的进展、未来研究应用及其面临的挑战 植物细胞类型及其发育过程 NA NA 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
4096 2024-09-28
HCCDB v2.0: Decompose Expression Variations by Single-cell RNA-seq and Spatial Transcriptomics in HCC
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本文介绍了HCCDB v2.0数据库,该数据库整合了肝细胞癌(HCC)临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据,提供了对HCC分子特征的深入理解 提出了sc-2D指标,用于总结细胞类型特异性和失调基因表达模式,并整合了最新的单细胞和空间转录组数据 NA 通过整合大规模转录组数据,深入理解肝细胞癌的分子特征 肝细胞癌(HCC)临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 共整合了3917个bulk样本和1656个新样本,以及182,832个单细胞和69,352个空间位点 NA NA NA NA
4097 2024-09-28
cnnImpute: missing value recovery for single cell RNA sequencing data
2024-02-16, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种基于卷积神经网络(CNN)的方法cnnImpute,用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 提出了cnnImpute,一种新颖的基于卷积神经网络的方法,用于解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 未提及 开发一种有效的方法来恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 单细胞RNA测序数据中的缺失值 机器学习 NA 单细胞RNA测序 卷积神经网络(CNN) RNA测序数据 未提及 NA NA NA NA
4098 2024-09-28
Crosstalk Between Cancer-associated Fibroblasts and Myeloid Cells Shapes the Heterogeneous Microenvironment of Gastric Cancer
2024, Current genomics IF:1.8Q3
研究论文 研究探讨了胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞与骨髓细胞之间的相互作用及其对微环境异质性的影响 首次识别了两种癌症相关成纤维细胞亚型,并揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在EMT和脂质代谢中的作用,以及肿瘤浸润性骨髓细胞的功能多样性 研究主要基于生物信息学分析和单细胞RNA测序数据,实验验证部分有限 深入了解胃癌微环境的异质性,为精准治疗提供新思路 胃癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和骨髓细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及八个细胞群体的单细胞图谱 NA NA NA NA
4099 2024-09-28
Identify BCAT1 plays an oncogenic role and promotes EMT in KIRC via single cell RNA-seq and experiment
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了BCAT1在肾透明细胞癌(KIRC)中的致癌作用及其通过上皮间质转化(EMT)促进肿瘤侵袭和转移的机制 首次系统研究了BCAT1在KIRC中的致癌作用及其通过EMT促进肿瘤侵袭和转移的机制 NA 探讨BCAT1在肾透明细胞癌(KIRC)中的致癌作用及其机制 BCAT1在KIRC中的功能和机制 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了GSE159115单细胞转录组数据,并进行了临床组织样本的Western Blotting和免疫组化染色 NA NA NA NA
4100 2024-09-28
Single-cell RNA sequencing reveals the communications between tumor microenvironment components and tumor metastasis in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的通信机制 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的复杂通信机制 研究仅基于特定数据集,结果的普适性有待进一步验证 探索骨肉瘤的转移机制,为癌症治疗开辟新途径 骨肉瘤中的肿瘤微环境成分与肿瘤转移 数字病理学 骨癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及GSE152048、GSE14359和GSE49003数据集中的样本 NA NA NA NA
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