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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3981 2024-10-07
Integrating Multi-omics to Identify Age-Related Macular Degeneration Subtypes and Biomarkers
2024-Aug-07, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本文结合转录组测序和单细胞测序数据,探讨线粒体相关基因在年龄相关性黄斑变性中的作用 提出了深度子空间非负矩阵分解算法,对基因表达谱进行多层非线性变换,并利用患者年龄作为先验信息改变数据分布 NA 识别年龄相关性黄斑变性的亚型和生物标志物 年龄相关性黄斑变性 生物信息学 眼科疾病 转录组测序 (RNA-seq), 单细胞测序 (scRNA-seq) 深度子空间非负矩阵分解 (DS-NMF) 基因表达数据 NA NA NA NA NA
3982 2024-10-07
Inferring single-cell spatial gene expression with tissue morphology via explainable deep learning
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种基于视觉变换器(ViT)的框架SPiRiT,用于推断单细胞空间基因表达,并结合组织形态学信息 提出了SPiRiT框架,通过整合交叉验证和模型解释在超参数调优中,显著提高了预测准确性,并揭示了ViT模型用于预测基因表达的高分辨率高关注区域(HAR) NA 探索利用组织形态学信息推断单细胞空间基因表达的可行性 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片 数字病理学 乳腺癌 视觉变换器(ViT) 视觉变换器(ViT) 图像 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片,评估数据来自Xenium(10x Genomics)数据集 NA NA NA NA
3983 2024-10-06
Immune escape between endoplasmic reticulum stress-related cancer cells and exhausted CD8+T cells leads to neoadjuvant chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-Nov-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 研究探讨了新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响 揭示了新辅助化疗抵抗的机制,并提出了针对ERS标记HSP90B1和免疫逃逸标记MDK的治疗策略 研究样本量较小,仅涉及11名患者 探索新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的影响 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤细胞和CD8+T细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 11名高级别浆液性卵巢癌患者 NA NA NA NA
3984 2024-10-06
CALB2 drives pancreatic cancer metastasis through inflammatory reprogramming of the tumor microenvironment
2024-Oct-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 研究探讨了CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制 首次揭示了CALB2作为炎症重编程的关键调节因子,促进胰腺癌转移的机制,并提出了αCXCL14单克隆抗体与吉西他滨联合治疗的新策略 NA 探讨CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制,并开发针对性的治疗策略 胰腺导管腺癌(PDAC)及其相关成纤维细胞(CAFs)和患者来源的类器官(PDOs) 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、CUT&RUN测定、荧光素酶报告基因测定、RNA测序、功能获得或丧失测定 NA 基因表达数据 涉及人类PDAC样本、CAFs和PDOs的体外和体内共培养系统,以及免疫活性KPC类器官异种移植模型 NA NA NA NA
3985 2024-10-06
Exploring the prognostic value of BRMS1 + microglia based on single-cell anoikis regulator patterns in the immunologic microenvironment of GBM
2024-Oct, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和非负矩阵分解技术,探讨了胶质母细胞瘤(GBM)中BRMS1+小胶质细胞在免疫微环境中的预后价值 首次揭示了BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的重要作用,并提出其可能成为未来治疗的潜在靶点 NA 探讨BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的预后价值及其对免疫治疗的影响 胶质母细胞瘤(GBM)中的BRMS1+小胶质细胞及其在免疫微环境中的作用 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组RNA测序(stRNA-seq)、非负矩阵分解(NMF) NA 基因表达数据 使用了TCGA和CGGA数据集,具体样本数量未在摘要中提及 NA NA NA NA
3986 2024-10-06
Iron-laden macrophage-mediated paracrine profibrotic signaling induces lung fibroblast activation
2024-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 研究探讨了铁在肺纤维化中的作用,特别是巨噬细胞介导的机制 揭示了铁在巨噬细胞中积累引发脂质过氧化,从而放大TGF-β1产生,并通过旁分泌信号激活成纤维细胞的新机制 NA 研究铁代谢在肺纤维化中的作用及其机制 肺纤维化中的巨噬细胞和成纤维细胞 NA 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA 使用小鼠模型,包括博来霉素和胺碘酮诱导的肺纤维化模型 NA NA NA NA
3987 2024-10-06
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-Sep-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌的代谢景观 首次通过单细胞RNA测序技术展示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢活性差异,并识别了神经内分泌细胞的高代谢率 研究主要集中在前列腺癌的代谢特征,未涉及其他癌症类型的比较 揭示前列腺癌的代谢重编程机制及其在治疗中的应用潜力 前列腺癌中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 未具体说明样本数量 NA NA NA NA
3988 2024-10-06
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies a prognostic T-cell signature in colorectal cancer
2024-08-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别出结直肠癌中的预后T细胞特征 本研究创新性地利用单细胞测序数据,通过加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析,开发了一种基于六个T细胞相关基因的预后风险模型TRGS,相比现有免疫相关预后模型,具有更高的预测效能 NA 识别结直肠癌中的预后T细胞特征,优化患者对免疫治疗和化疗的反应 结直肠癌患者的T细胞特征及其预后影响 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序和批量RNA测序 加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析 基因表达数据 NA NA NA NA NA
3989 2024-10-06
Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues
2024-Aug-14, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 开发了一种名为scLinaX的方法,用于量化单细胞组学数据中的X染色体失活逃逸现象,揭示了不同细胞类型和组织间的异质性 首次开发了scLinaX方法,用于直接量化单细胞RNA测序数据中的失活X染色体相对基因表达,并扩展到10x多组学数据集 需要进一步验证和扩展到更多类型的细胞和组织中 研究X染色体失活逃逸现象在不同细胞类型和组织中的差异 X染色体失活逃逸现象及其在不同细胞类型和组织中的表现 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 多个器官的单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
3990 2024-10-06
A fibroblast-dependent TGF-β1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis promotes epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Jul-09, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究了纤维母细胞依赖的TGF-β1/sFRP2非经典Wnt信号轴在特发性肺纤维化中促进上皮化生的机制 发现了TGF-β1信号通过sFRP2激活非经典Wnt信号轴,促进特发性肺纤维化中的上皮化生 研究仅限于细胞和组织水平,未涉及临床试验 探讨特发性肺纤维化中纤维母细胞与上皮细胞相互作用的机制 特发性肺纤维化患者的肺组织和纤维母细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA 来自特发性肺纤维化患者和非疾病捐赠者的肺组织样本 NA NA NA NA
3991 2024-10-06
Multiomics identifies metabolic subtypes based on fatty acid degradation allocating personalized treatment in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本文通过多组学分析,基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类,并评估其指导个性化治疗的能力 本文首次基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类,并发现不同亚型对特定治疗的响应差异 本文的样本量较小,且主要基于已有的公开数据集进行分析,需要进一步的临床验证 开发基于脂肪酸降解途径的肝细胞癌分子分类,并评估其指导个性化治疗的能力 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境 数字病理学 肝癌 RNA测序、PCR阵列、脂质组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 41名肝细胞癌患者,其中17名接受PD-1治疗 NA NA NA NA
3992 2024-08-07
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3993 2024-10-06
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 NA 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 癌症研究 肝癌 RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA NA NA NA
3994 2024-10-06
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱,并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 研究仅限于慢性乙型肝炎患者,且样本量未明确提及,可能影响结果的普适性 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 数字病理学 肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
3995 2024-10-06
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
评论 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力,未提供具体的研究数据或方法 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 NA NA 干细胞3D方法 NA NA NA NA NA NA NA
3996 2024-10-06
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能,包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能,并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 研究依赖于公开数据,可能存在数据偏差;实验验证仅通过qRT-PCR进行,未涉及其他验证方法 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 数字病理学 肺癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 基于公开数据,具体样本数量未明确提及 NA NA NA NA
3997 2024-10-06
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞和批量转录组分析,开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型,揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性,并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性,并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习 转录组数据 NA NA NA NA NA
3998 2024-10-05
Advanced machine learning unveils CD8 + T cell genetic markers enhancing prognosis and immunotherapy efficacy in breast cancer
2024-Oct-01, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法,识别出与乳腺癌预后和免疫治疗效果相关的CD8+ T细胞基因标记 开发了一种新的CD8+ T细胞相关基因预后签名(CTRGPS),并验证了其在多个独立数据集中的预后价值 NA 探索CD8+ T细胞在乳腺癌中的作用,识别新的生物标志物以改善预后和治疗策略 CD8+ T细胞基因标记及其在乳腺癌中的预后和治疗效果 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习算法 基因数据 涉及七个独立公共数据集 NA NA NA NA
3999 2024-10-05
Exploring the potential mechanism of Radix Bupleuri in the treatment of sepsis: a study based on network pharmacology and molecular docking
2024-Oct-01, BMC complementary medicine and therapies IF:3.3Q1
研究论文 本研究利用网络药理学和分子对接技术探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 首次结合网络药理学和RNA-seq技术,系统分析了柴胡在脓毒症治疗中的活性成分和潜在靶点,并通过分子对接和分子动力学模拟验证了关键靶点的结合能力 样本量较小,且仅基于公共数据库的数据进行分析,缺乏临床试验验证 探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 柴胡的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点 网络药理学 脓毒症 RNA-seq 分子对接 基因表达数据 23名脓毒症患者和10名健康参与者 NA NA NA NA
4000 2024-10-05
Superior antitumor immune response achieved with proton over photon immunoradiotherapy is amplified by the nanoradioenhancer NBTXR3
2024-Oct-01, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 比较了光子放疗(XRT)和质子放疗(PRT)结合免疫检查点阻断(αPD1)在免疫放疗(IRT)中的疗效,并评估了纳米颗粒放射增敏剂NBTXR3的影响 发现质子放疗结合NBTXR3在治疗αPD1耐药肺癌中表现出优于光子放疗的效果,并能增强记忆性抗肿瘤免疫反应 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在临床试验中验证 探讨质子放疗与光子放疗在免疫放疗中的相对疗效,并评估NBTXR3的增效作用 αPD1耐药的肺癌(344SQR)小鼠模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA RNA 涉及多个小鼠模型和三种不同的肺癌细胞系 NA NA NA NA
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