单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7512 篇文献，本页显示第 3981 - 4000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3981 | 2024-09-21 |
A human stomach cell type transcriptome atlas
2024-Feb-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01812-5
PMID:38355543
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研究论文 | 本文通过整合相关分析方法，利用未分选的胃RNAseq数据，预测了人类胃细胞类型的转录组特征 | 首次详细描述了胃细胞类型的基因富集谱，并发现了与胃癌进展相关的非编码基因 | NA | 识别细胞类型特异性基因及其在不同条件下的修饰，以增进对人类健康和疾病的理解 | 胃细胞类型的转录组特征 | NA | 胃癌 | RNA-seq | NA | RNA | 359名个体 |
| 3982 | 2024-09-20 |
Hsp90aa1/JUN/Ccl2 regulatory axis mediates migration and differentiation of NSPCs, promoting the onset and progression of early post-ischemic stroke epilepsy
2024-Oct-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106635
PMID:39128813
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研究论文 | 研究揭示了Hsp90aa1/JUN/Ccl2轴在调节神经干细胞/祖细胞迁移和分化中的作用，促进缺血性卒中后早期癫痫的发生和发展 | 首次揭示了Hsp90aa1/JUN/Ccl2轴在神经干细胞/祖细胞迁移和分化中的关键作用，并探讨了其在缺血性卒中后早期癫痫发生和发展中的潜在影响 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，缺乏更大规模和多样化的样本验证 | 探讨缺血性卒中后早期癫痫的发病机制 | 神经干细胞/祖细胞及其相关基因Hsp90aa1、JUN和Ccl2 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组测序和生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3983 | 2024-09-20 |
PTN from Leydig cells activates SDC2 and modulates human spermatogonial stem cell proliferation and survival via GFRA1
2024-Sep-16, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-024-00546-6
PMID:39285301
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研究论文 | 研究探讨了睾丸间质细胞通过PTN激活SDC2，从而调控人类精原干细胞增殖和生存的机制 | 揭示了人类精原干细胞调控的新机制，并提出了潜在的治疗男性不育的靶点 | 仅在约50%的细胞中观察到PTN和SDC2的共定位 | 探讨人类精原干细胞发育的机制及其在男性不育中的潜在作用 | 人类精原干细胞及其在男性精子发生中的作用 | 细胞生物学 | 男性不育 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO数据库中的GSE149512和GSE112013数据集 |
| 3984 | 2024-09-20 |
Single-cell analysis via manifold fitting: A framework for RNA clustering and beyond
2024-Sep-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2400002121
PMID:39226348
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAMF的框架，通过流形拟合技术提高单细胞RNA测序数据的聚类精度和可视化效果 | 提出了scAMF框架，通过流形拟合模块有效去噪单细胞RNA测序数据，提高了聚类效率和数据可视化清晰度 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的分析精度和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 流形拟合 | RNA数据 | 25个公开的单细胞RNA测序数据集，涵盖多种测序平台、物种和器官类型 |
| 3985 | 2024-09-20 |
Qki5 safeguards spinal motor neuron function by defining the motor neuron-specific transcriptome via pre-mRNA processing
2024-Sep-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401531121
PMID:39226364
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研究论文 | 本文研究了RNA结合蛋白Qki5通过调节前mRNA加工过程，保护脊髓运动神经元功能并定义运动神经元特异性转录组 | 首次揭示了Qki5在运动神经元特异性转录组形成中的关键作用，并通过实验验证了其在运动神经元保护和疾病发病机制中的重要性 | NA | 探讨Qki5在运动神经元疾病中的分子机制及其对运动神经元功能的影响 | 脊髓运动神经元及其特异性转录组 | 数字病理学 | 运动神经元疾病 | RNA测序 (RNA-seq), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 3986 | 2024-09-20 |
ScRNA-seq reveals the spatiotemporal distribution of camptothecin pathway and transposon activity in Camptotheca acuminata shoot apexes and leaves
2024 Sep-Oct, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.14508
PMID:39295090
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了喜树（Camptotheca acuminata）的顶芽和叶片的细胞类型及其在喜树碱合成途径和转座子活动中的时空分布 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了喜树碱合成途径和转座子活动在喜树顶芽和叶片中的时空分布特征 | NA | 探讨喜树碱合成途径和转座子活动在喜树顶芽和叶片中的时空分布特征 | 喜树（Camptotheca acuminata）的顶芽和叶片 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过60,000个细胞 |
| 3987 | 2024-09-20 |
Combined single cell and spatial transcriptome analysis reveals hedgehog pathway-related genes as potential therapeutic targets for cervical cancer
2024-Aug-28, Cancer treatment and research communications
DOI:10.1016/j.ctarc.2024.100841
PMID:39293140
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学分析，揭示了刺猬信号通路相关基因作为宫颈癌潜在治疗靶点的可能性 | 首次整合单细胞测序和空间转录组学数据，深入研究了刺猬信号通路在宫颈癌中的作用，并发现了MYH9在宫颈癌中的关键作用 | NA | 揭示刺猬信号通路相关基因在宫颈癌中的潜在治疗靶点 | 宫颈癌组织中的刺猬信号通路相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3988 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis
2024-Aug-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51201-3
PMID:39187486
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫配子体发育过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，定义了恶性疟原虫配子体发育过程中雄性和雌性细胞的转录程序，并预测了潜在的驱动基因 | NA | 阐明在没有性染色体的情况下，恶性疟原虫雄性和雌性配子体如何分化 | 恶性疟原虫的配子体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3989 | 2024-09-20 |
Activation of Nrf2 inhibits atherosclerosis in ApoE-/- mice through suppressing endothelial cell inflammation and lipid peroxidation
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103229
PMID:38870781
|
研究论文 | 研究Nrf2在ApoE-/-小鼠中通过抑制内皮细胞炎症和脂质过氧化来抑制动脉粥样硬化的作用 | 首次探讨了内皮Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其激活机制，并提出了Nrf2作为治疗动脉粥样硬化的新策略 | NA | 探讨Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | ApoE-/-小鼠和内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE-/-小鼠和Cdh5CreCas9floxed-stopApoE-/-小鼠 |
| 3990 | 2024-09-20 |
Therapy-induced senescence through the redox lens
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103228
PMID:38865902
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综述 | 本文综述了治疗诱导的衰老肿瘤细胞通过活性氧（ROS）及其相关的氧化还原信号网络在肿瘤复发和疾病复发中的作用 | 本文探讨了ROS和氧化还原状态动态在微调稳态过程中驱动治疗诱导的细胞命运向衰老建立的作用，并提供了干预策略的见解，特别是利用调节氧化还原和抗氧化途径的senotherapeutics | NA | 探讨治疗诱导的衰老通过氧化还原视角的作用机制，并评估其对肿瘤起始和复发的潜在影响 | 治疗诱导的衰老肿瘤细胞、活性氧（ROS）、氧化还原信号网络、衰老相关分泌表型（SASP） | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3991 | 2024-09-20 |
The role of the fibroblast in Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma
2024-Jul-01, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000001032
PMID:38626060
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综述 | 本文综述了间质和癌症相关成纤维细胞在Barrett食管和食管腺癌中的作用，并探讨了针对这些细胞的转化前景 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了间质在发育信号传导和癌症启动中的新兴作用，并提出了针对癌症相关成纤维细胞的潜在治疗策略 | NA | 探讨间质和癌症相关成纤维细胞在Barrett食管和食管腺癌中的作用 | Barrett食管和食管腺癌中的间质和癌症相关成纤维细胞 | NA | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3992 | 2024-09-20 |
Small nucleolar RNA host gene 18 controls vascular smooth muscle cell contractile phenotype and neointimal hyperplasia
2024-May-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae055
PMID:38498586
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研究论文 | 研究探讨了SNHG18在调节血管平滑肌细胞收缩表型和损伤诱导的新内膜增生中的作用 | 首次揭示了SNHG18在血管疾病中的功能，特别是其在调节血管平滑肌细胞收缩表型和预防损伤诱导的新内膜增生中的作用 | NA | 探索SNHG18在血管平滑肌细胞收缩表型和损伤诱导的新内膜形成中的作用 | SNHG18、血管平滑肌细胞、新内膜增生 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组数据分析 | NA | RNA | 小鼠和人类动脉样本 |
| 3993 | 2024-09-20 |
A Large-Scale Meta-Analysis Reveals Positive Feedback between Macrophages and T Cells That Sensitizes Tumors to Immunotherapy
2024-02-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2006
PMID:38117502
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研究论文 | 本研究通过大规模的元分析揭示了巨噬细胞和T细胞之间的正反馈机制，增强了肿瘤对免疫治疗的敏感性 | 本研究发现了与ICI治疗结果相关的可靠标志物，包括肿瘤突变负荷、IFNG和PDCD1表达，以及巨噬细胞和T细胞之间的相互作用 | 本研究依赖于大规模的多组学数据，可能存在数据异质性和样本偏倚的问题 | 旨在通过大规模元分析发现预测免疫检查点抑制剂治疗反应的可靠生物标志物 | ICI治疗的3037名患者，涉及14种实体瘤的遗传和/或转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 多组学分析 | 多变量模型 | 遗传和转录组学数据 | 3037名ICI治疗的患者 |
| 3994 | 2024-09-20 |
scKWARN: Kernel-weighted-average robust normalization for single-cell RNA-seq data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae008
PMID:38237908
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scKWARN的单细胞RNA-seq数据稳健归一化方法 | scKWARN通过核加权平均技术，不依赖于特定的数据分布或计数-深度关系，能够有效校正已知或隐藏的技术混杂因素 | NA | 开发一种新的单细胞RNA-seq数据归一化方法，以校正技术偏差并保留生物异质性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 核加权平均 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 3995 | 2024-09-20 |
Deciphering colorectal cancer radioresistance and immune microrenvironment: unraveling the role of EIF5A through single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1466226
PMID:39290702
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研究论文 | 研究探讨了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的关键作用，并验证了其在调节肿瘤免疫微环境中的功能 | NA | 研究EIF5A在结直肠癌放疗反应中的作用及其对肿瘤干细胞和肿瘤免疫微环境的影响 | EIF5A基因在结直肠癌放疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA | NA |
| 3996 | 2024-09-19 |
Shexiang Tongxin dropping pill ameliorates microvascular obstruction via downregulating ALOX12 after myocardial ischemia-reperfusion
2024-Dec-01, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2024.132481
PMID:39179033
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研究论文 | 研究了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞 | 首次揭示了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞的具体作用和机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在临床患者中验证 | 阐明麝香通心滴丸在心肌缺血-再灌注诱导的微血管功能障碍中的作用及其潜在机制 | 小鼠心脏功能和微血管阻塞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 蛋白质组学和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 小鼠心脏和心脏微血管内皮细胞 |
| 3997 | 2024-09-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals a distinct profile of bone immune microenvironment and decreased osteoclast differentiation in type 2 diabetic mice
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101145
PMID:39281831
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研究论文 | 研究揭示了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的单细胞转录组特征，并发现其骨免疫微环境的变化和破骨细胞分化的减少 | 首次详细描绘了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的全局转录组图谱，揭示了骨免疫微环境在基因水平上的独特变化 | NA | 探讨2型糖尿病对骨组织的影响及其细胞和分子机制 | 2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 |
| 3998 | 2024-09-19 |
A novel study on CXXC5: unraveling its regulatory mechanisms in hematopoietic stem cell biology through proteomics and gene editing
2024-Oct, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01540-8
PMID:39150611
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研究论文 | 本研究探讨了CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 通过单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑和蛋白质组学分析，揭示了CXXC5在造血干细胞生物学中的重要作用 | NA | 研究CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9、蛋白质组学分析 | NA | RNA、蛋白质 | 从骨髓样本中分离的造血干细胞 |
| 3999 | 2024-09-19 |
The interaction of innate immune and adaptive immune system
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.714
PMID:39286776
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综述 | 本文详细剖析了先天免疫系统和适应性免疫系统的组成和功能，强调了它们在生理和病理环境中的协同作用 | 揭示了先天免疫和适应性免疫之间更复杂的相互作用，并提供了新的见解 | NA | 增强对先天免疫和适应性免疫复杂相互作用的理解，并提供新的视角 | 先天免疫系统和适应性免疫系统的相互作用 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 4000 | 2024-09-19 |
3D spheroid culture synchronizes heterogeneous MSCs into an immunomodulatory phenotype with enhanced anti-inflammatory effects
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110811
PMID:39286508
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研究论文 | 研究通过3D球状培养将异质性间充质干细胞（MSCs）同步化为具有增强抗炎作用的免疫调节表型 | 首次发现3D球状培养可以将异质性MSCs同步化为统一的免疫抑制表型，并显著增强其抗炎效果 | NA | 探索3D球状培养对MSCs表型和功能的影响 | 间充质干细胞（MSCs）及其在3D球状培养下的表型和功能变化 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 异质性MSCs在2D和3D培养条件下的细胞样本 |