单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-12-15 |
Methionine-driven YTHDF1 expression facilitates bladder cancer progression by attenuating RIG-I-modulated immune responses and enhancing the eIF5B-PD-L1 axis
2024-Dec-13, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01434-y
PMID:39672819
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研究论文 | 本研究探讨了蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响，发现蛋氨酸通过上调YTHDF1表达，抑制RIG-I介导的I型干扰素通路，并增强eIF5B-PD-L1轴，从而促进膀胱癌进展 | 首次揭示了蛋氨酸通过YTHDF1调控RIG-I和eIF5B-PD-L1轴，抑制膀胱癌免疫治疗的机制，并提出了靶向蛋氨酸 depletion 的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需进一步验证在人体中的有效性和安全性 | 探讨蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响及其分子机制 | 膀胱癌及其免疫治疗 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫沉淀、质谱分析 | NA | RNA | 包括MB49小鼠肿瘤模型和膀胱癌免疫治疗患者样本 |
| 382 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional changes in circulating immune cells from patients with severe asthma induced by biologics
2024-Dec-13, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01368-y
PMID:39672815
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者在接受生物制剂治疗后外周血免疫细胞的转录变化 | 首次揭示了靶向T2的生物制剂在治疗严重嗜酸性粒细胞性哮喘时对循环免疫细胞中NF-κB信号通路相关基因表达的抑制作用 | 样本量较小，且仅关注了特定类型的生物制剂，未来需要进一步研究以确定与治疗反应和长期结果相关的潜在生物标志物 | 描述靶向T2的生物制剂对血液免疫细胞基因表达的影响 | 严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8名接受生物制剂治疗的严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者的外周血单核细胞 |
| 383 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2024-Dec-13, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-12-15 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2024-Dec-13, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iFlpMosaics的工具包，用于多光谱条码标记和高通量比较分析突变细胞和野生型细胞 | iFlpMosaics工具包包含了一系列新的遗传工具和老鼠品系，能够实现重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪，并在相同的组织微环境中进行多色荧光标记的野生型和Cre突变细胞的追踪 | NA | 研究基因功能，比较突变细胞和正常细胞的差异 | 突变细胞和野生型细胞 | NA | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA | NA |
| 385 | 2024-12-15 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92091
PMID:39665620
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经元再生的化合物 | 利用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子 profiling，筛选并验证了两种促进体内神经发生的化合物 | 目前该过程的效率有限 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经元再生能力 | 小鼠Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 |
| 386 | 2024-12-15 |
Multiparameter imaging reveals clinically relevant cancer cell-stroma interaction dynamics in head and neck cancer
2024-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.046
PMID:39471809
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研究论文 | 本文报道了一种通过多参数成像量化头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中癌细胞与基质相互作用动态的方法 | 首次结合细胞状态标记与形态特征，以单细胞分辨率量化HNSCC的表型多样性，并揭示了部分上皮-间充质转化（pEMT）对疾病预后的影响 | NA | 研究癌细胞与基质相互作用对头颈部鳞状细胞癌表型多样性和临床特征的影响 | 头颈部鳞状细胞癌中的癌细胞与基质相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 多参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 387 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中，细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统，研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据，揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统，可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应，以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 |
| 388 | 2024-12-15 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01524-y
PMID:39661257
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态进化特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内实验验证 | 揭示脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 脂肪来源基质细胞及其向神经元分化的过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共收集了38,453个细胞，分为0-13个簇 |
| 389 | 2024-12-15 |
Identification of core immune-related genes CTSK, C3, and IFITM1 for diagnosing Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer through transcriptomic analysis
2024-Dec-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138645
PMID:39667460
|
研究论文 | 通过转录组分析识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因CTSK、C3和IFITM1 | 首次通过转录组分析识别出CTSK、C3和IFITM1作为幽门螺杆菌感染相关胃癌的关键免疫相关诊断基因，并构建了随机森林模型评估其诊断性能 | 研究主要基于GEO数据库的基因表达数据，缺乏临床样本的验证 | 识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因及其机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因 | 基因表达分析 | 胃癌 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、随机森林模型、单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因表达数据 | GEO数据库中的基因表达数据 |
| 390 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
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研究论文 | 本研究探讨了衣康酸（ITA）对实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的影响及其潜在机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡，从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制，并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 |
| 391 | 2024-12-15 |
Proximity sequencing for the detection of mRNA, extracellular proteins and extracellular protein complexes in single cells
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01030-x
PMID:39147984
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为邻近测序的步骤，用于在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和数百种细胞外膜上的蛋白质复合物 | 首次提出了一种能够在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和蛋白质复合物的邻近测序方法 | 该方法需要用户具备基本的分子生物学和单细胞测序经验，且实验过程需要大约16小时，分散在几天内完成 | 开发一种新的技术，能够在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和蛋白质复合物 | 单细胞中的mRNA、细胞外蛋白质和蛋白质复合物 | 分子生物学 | NA | 邻近测序 | NA | 蛋白质、mRNA | 单细胞 |
| 392 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用，并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本，未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱，识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本，共32,014个细胞 |
| 393 | 2024-12-15 |
Single-cell transcriptomic atlas of taste papilla aging
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14308
PMID:39169434
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了味蕾衰老的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了味蕾衰老过程中差异表达的基因及其功能，并识别了与衰老相关的转录枢纽 | 研究仅限于味蕾细胞，未涉及其他感官细胞或整体衰老机制 | 揭示味蕾衰老的分子和细胞特征 | 味蕾细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年和年轻味蕾细胞 |
| 394 | 2024-12-15 |
Unraveling the effects of prenatal anesthesia on neurodevelopment: A review of current evidence and future directions
2024-Dec, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2024.09.003
PMID:39276873
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综述 | 本文综述了当前关于产前麻醉对神经发育影响的证据，并提出了未来研究方向 | 引入脑类器官作为研究工具，结合单细胞测序技术，探索产前麻醉引发的潜在神经毒性机制 | 临床研究受伦理和技术限制，难以直接获取人类产前脑组织，导致结果与临床前数据存在差异 | 探讨产前麻醉对胎儿脑发育的影响，并总结现有证据 | 产前麻醉对人类胎儿脑发育的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-12-15 |
Reliable estrogen-related prognostic signature for uterine corpus endometrial carcinoma
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了子宫内膜癌中与雌激素相关的关键基因，并构建了预测患者预后的风险评分 | 首次基于8个与雌激素相关的基因构建了预测子宫内膜癌患者预后的风险评分，并验证了其可靠性和临床价值 | 研究仅基于公开数据集，未进行临床试验验证 | 探索子宫内膜癌中与雌激素相关的关键基因，并构建预测患者预后的风险评分 | 子宫内膜癌患者及其与雌激素相关的基因 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA, 单因素Cox回归分析, LASSO Cox回归分析, 多因素Cox回归分析, GO, KEGG, GSVA富集分析, CCK8检测 | Cox回归模型 | RNA数据 | 来自GEO, TCGA和Molecular Signature Database的子宫内膜癌scRNA-seq数据和bulk RNA数据 |
| 396 | 2024-12-15 |
Generation of a fluorescent hESC reporter line (Kle033-A-1) for the isolation of distinct midbrain progenitor cell types
2024-Dec, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2024.103523
PMID:39383604
|
研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9技术生成了一种荧光人胚胎干细胞系，用于分离两种潜在的中脑多巴胺能祖细胞Rgl1和ProgM | 利用CRISPR/Cas9技术生成荧光人胚胎干细胞系，用于分离特定的中脑多巴胺能祖细胞类型 | NA | 开发更精确的帕金森病细胞替代策略 | 中脑多巴胺能祖细胞Rgl1和ProgM | NA | 帕金森病 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 397 | 2024-12-15 |
Unraveling the immunomodulatory impact of hydroxychloroquine on peripheral T cells using single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103324
PMID:39405653
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了羟氯喹对T细胞的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了羟氯喹对T细胞的免疫调节机制，特别是其对效应CD8 T细胞的扩增和细胞毒性基因的上调作用 | 研究仅限于体外实验，尚未在临床试验中验证这些发现 | 探讨羟氯喹在T细胞中的免疫调节机制 | T细胞，特别是CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自系统性红斑狼疮患者的效应CD8 T细胞样本 |
| 398 | 2024-12-15 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于生物噪声解耦自动编码器和中心交叉损失的单细胞RNA测序数据批次效应校正模型 | 该模型通过自动编码器重构数据，并使用层次聚类树逐步合并小簇，结合中心交叉损失在嵌入空间中形成更紧凑的聚类，从而在不丢失稀有细胞类型的情况下有效消除批次效应 | NA | 解决现有批次校正方法在降维过程中可能丢失稀有细胞类型的问题 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | NA |
| 399 | 2024-12-15 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分推断的混合模型CopyMix，用于单细胞聚类和拷贝数分析，旨在解决现有方法中存在的聚类伪影问题 | CopyMix通过联合推断细胞簇及其拷贝数分布，避免了传统方法中预处理和后处理步骤引入的聚类伪影问题 | NA | 研究肿瘤异质性，通过单细胞测序技术揭示肿瘤细胞亚群的基因组特征 | 单细胞DNA测序数据中的拷贝数变异和细胞聚类 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞DNA测序 | 混合模型 | 拷贝数数据 | 生物数据和模拟数据 |
| 400 | 2024-12-15 |
Choroid Plexus as a Mediator of CNS Inflammation in Multiple Sclerosis
2024-Dec, Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England)
DOI:10.1177/13524585241292974
PMID:39503321
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综述 | 本文综述了脉络丛在多发性硬化症（MS）中枢神经系统炎症中的作用 | 本文探讨了脉络丛作为免疫反应的调控者，并通过脑脊液传播与MS相关的神经炎症的新观点 | NA | 探讨脉络丛在多发性硬化症中枢神经系统炎症中的作用 | 脉络丛及其在脑脊液中的作用 | NA | 多发性硬化症 | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学 | NA | 脑脊液样本 | NA |