单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-07 |
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-08-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2026-05-23 |
Optimization of mouse kidney digestion protocols for single-cell applications
2024-07-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过比较三种小鼠肾脏单细胞消化方案，评估其对细胞异质性的影响，为单细胞研究提供方案选择指导 | 首次系统评估已发表的单细胞悬液制备方案，并比较其在小鼠肾脏细胞产量和异质性方面的差异 | 仅检测了三种方案，且未涉及其他可能影响消化效率的因素（如酶浓度、孵育时间），未进行体内验证 | 优化小鼠肾脏单细胞消化方案，为单细胞技术（如流式细胞术、单细胞RNA测序）提供高质量细胞悬液 | 小鼠肾脏细胞（包括白细胞、血管细胞、肾单位上皮细胞、足细胞、成纤维细胞） | 单细胞生物学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自雄性和雌性C57BL/6小鼠的肾脏样本 | Miltenyi Biotec | 单细胞RNA测序 | Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒 | 三种方案：scRNAseq方案、Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒、实验室自建方案 |
| 383 | 2026-05-23 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过转录组测序研究高脂饮食对脂肪和肠系膜内皮细胞线粒体基因表达的影响及其在肥胖中表型趋同的机制 | 首次揭示肥胖通过下调PPAR-γ导致脂肪动脉和毛细血管内皮细胞氧化磷酸化基因表达减少，进而使肠系膜与脂肪内皮细胞发生表型趋同 | NA | 探究肥胖如何影响内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，以及人类内脏脂肪组织 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | 测序数据 | 小鼠（正常饮食组和高脂饮食组）及人类内脏脂肪组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2026-05-23 |
Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，评估了妊娠-泌乳周期中乳腺脂肪垫的胶原动力学，发现免疫细胞异位表达胶原并参与细胞间相互作用 | 首次揭示妊娠阶段免疫细胞（包括淋巴系和髓系细胞）能异位产生I型和III型胶原，并显著增强细胞间胶原相互作用，为免疫细胞参与乳腺细胞外基质调控提供新证据 | 仅基于已有scRNA-Seq数据的二次分析，缺乏体内功能验证实验 | 探究妊娠-泌乳周期中乳腺胶原动态变化及免疫细胞在其中的作用 | 妊娠-泌乳周期中的乳腺脂肪垫组织及免疫细胞（淋巴系和髓系细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，基于公开scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2026-05-23 |
Exploring myometrial microenvironment changes at the single-cell level from nonpregnant to term pregnant states
2024-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建非孕期和足月孕期女性子宫肌层的单细胞转录组图谱，揭示细胞微环境变化 | 首次在单细胞水平上揭示非孕期与足月孕期子宫肌层的微环境变化，特别是平滑肌细胞亚群比例改变和M2巨噬细胞增加 | 未提及具体局限性信息 | 探索人类子宫肌层从非孕期到足月孕期在单细胞水平上的微环境变化 | 非孕期和足月孕期女性的子宫肌层组织 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 12个人类子宫肌层组织样本，87,845个高质量单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，10x Visium空间转录组学平台 |
| 386 | 2026-05-23 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
|
研究论文 | 揭示L-岩藻糖对树突状细胞功能和极化的促进作用，及其在肿瘤免疫治疗中的潜在应用 | 首次发现膳食糖L-岩藻糖能增强树突状细胞的免疫刺激活性，促进其抗原摄取和加工，并调节T细胞活化 | 尚未明确L-岩藻糖增强DC功能的具体分子机制和信号通路 | 探索L-岩藻糖增强树突状细胞功能以提升抗肿瘤免疫应答的潜力 | 小鼠树突状细胞及黑色素瘤和乳腺癌模型中的瘤内树突状细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤和乳腺癌荷瘤小鼠模型的样本 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 387 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析硼缺乏条件下豌豆芽发育及细胞类型特异性响应 | 首次在单细胞水平揭示豌豆茎尖不同细胞类型对硼缺乏的差异化响应机制，并构建茎尖分生组织发育轨迹及其转录因子互作网络 | 本研究仅关注硼缺乏单一胁迫条件，未涉及其他营养胁迫或联合胁迫效应 | 探究营养胁迫（硼缺乏）如何影响植物生长发育的分子机制 | 豌豆（Pisum sativum）茎尖分生组织细胞 | 数字病理学 | 植物营养胁迫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个细胞簇，来源为硼缺乏条件下生长的豌豆茎尖 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2026-05-22 |
The contribution of the sphingosine 1-phosphate signaling pathway to chronic kidney diseases: recent findings and new perspectives
2024-12, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-03029-5
PMID:39384640
|
综述 | 本文综述了鞘氨醇-1-磷酸信号通路在慢性肾病和肾纤维化中的最新发现和研究前景 | 系统总结了S1P信号在多种特定慢性肾病（如糖尿病肾病、狼疮性肾炎、局灶节段性肾小球硬化症、法布里病和IgA肾病）中的作用，并探讨了S1P作为疾病进展生物标志物的潜力以及空间转录组学等先进技术的应用 | 文章未提及自身局限性，但作为综述，可能受限于现有研究的数量和质量 | 分析S1P信号通路在慢性肾病发病机制和肾纤维化中的最新研究进展，并探讨其作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | 慢性肾病，包括糖尿病肾病、狼疮性肾炎、局灶节段性肾小球硬化症、法布里病和IgA肾病 | 机器学习 | 慢性肾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2026-05-22 |
Host-pathogen interactions in the Plasmodium-infected mouse liver at spatial and single-cell resolution
2024-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51418-2
PMID:39160174
|
研究论文 | 结合空间转录组学与单核RNA测序，解析疟原虫感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作 | 首次在空间和单细胞分辨率下揭示疟疾感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作，发现了感染相关脂质代谢变化、不同肝小叶区域的炎症程序差异以及‘炎症热点’区域 | 研究未提供具体局限性信息 | 探索疟原虫感染过程中宿主反应在复杂肝组织中的协调机制 | 伯氏疟原虫感染的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 疟疾 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达数据（空间转录组和单核RNA测序） | 多时间点的小鼠肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学，单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组，10x Chromium用于单核RNA测序 |
| 390 | 2026-05-22 |
Deciphering cell-cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network
2024-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51329-2
PMID:39155292
|
研究论文 | 提出DeepTalk方法，利用子图图注意力网络整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，在单细胞分辨率下推断细胞间通讯 | 首次将子图图注意力网络应用于空间转录组学，实现单细胞分辨率的细胞间通讯推断，并能在多平台数据集上表现优异 | 未提及具体局限性，但依赖于scRNA-seq和ST数据的整合质量，可能对数据噪声敏感 | 开发一种通用方法，在单细胞分辨率下准确推断空间细胞间通讯 | 细胞间通讯、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 图注意力网络 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个跨平台数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 391 | 2026-05-22 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和靶向DamID技术，揭示Glass和Pointed转录因子协同激活果蝇眼盘中的神经元身份 | 首次发现Glass和Pointed在基因组中共享许多结合位点，并通过中间转录因子Scratch和Scrape协同激活多层转录网络，诱导神经元分化 | 研究仅限于果蝇模型，未在哺乳动物系统中验证该机制的保守性 | 阐明EGFR信号通过转录因子Pointed与眼特异性转录因子Glass协同作用，促进果蝇眼盘光感受器神经元分化的机制 | 果蝇眼盘和翅盘中的发育中光感受器细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 靶向DamID, 转录组学 | 不适用 | 基因表达数据 | 果蝇眼盘和翅盘组织（具体样本量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 392 | 2026-05-22 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-08-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
|
综述 | 综述硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理和药理作用，并探讨多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新技术在该领域的应用前景 | 系统总结了硫化氢通过过硫化修饰调控蛋白质的新机制，并强调了多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新兴技术在硫化氢药理学研究中的应用潜力 | 未明确提及具体局限性，但隐含指出硫化氢在心脏代谢疾病中的作用机制仍需进一步阐明，且相关技术仍面临挑战 | 探讨内源性硫化氢的生理作用及各种硫化氢供体在心脏代谢疾病中的药理角色，并评估新兴技术在该领域的应用前景 | 心脏代谢疾病，包括其细胞、动物和临床研究层面 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学、肠道菌群分析、类器官分析、单细胞测序 | NA | 文本， 图像， 序列数据 | NA | 10x Genomics， Illumina | 单细胞RNA测序， 多组学， 肠道菌群分析， 类器官分析 | 10x Chromium， Illumina NovaSeq | 用于单细胞测序和基于测序的多组学分析 |
| 393 | 2026-05-22 |
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241289961
PMID:39313491
|
研究论文 | 对膝骨关节炎中疼痛敏感基因作为治疗靶点进行了全面分析 | 系统分析了疼痛敏感相关基因在膝骨关节炎中的作用，并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞亚群中的异质性表达 | NA | 分析膝骨关节炎中疼痛敏感基因的角色及其作为治疗靶点的潜力 | 膝骨关节炎中的疼痛敏感相关基因 | 机器学习 | 膝骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 基因表达数据 | 使用GSE114007和GSE169077数据集进行差异表达分析，以及GSE152805、GSE133449和GSE104782数据集进行单细胞RNA测序分析 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2026-05-22 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性早期类风湿关节炎患者单核细胞和T细胞中干扰素-γ应答基因的上调 | 首次在单细胞水平上系统比较ACPA阳性与阴性早期RA患者的外周免疫细胞差异，发现IFN-γ应答基因在单核细胞和T细胞中特异性上调 | NA | 探究ACPA阳性与阴性早期RA患者免疫系统的差异 | 抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性与阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据，血清细胞因子数据 | 37,318个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 395 | 2026-05-22 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病的免疫代谢改变，并识别出亚型和潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组学分析将2型糖尿病患者分为三种免疫代谢亚型，并利用机器学习模型基于代谢特征进行分类，结合转录因子和药物富集分析发现潜在治疗靶点 | 样本量相对较小（37例患者和11例健康对照），且研究仅基于外周血单个核细胞，未涉及组织驻留免疫细胞或代谢器官的微环境 | 阐明2型糖尿病中免疫细胞在单细胞水平的代谢异质性及其与疾病亚型的关联，并探索潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 37例T2DM患者和11例健康对照的PBMCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2026-05-21 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-12-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本研究设计并制备了一种3D打印的PGCL@PLA/10CSPL复合支架，装载纤连蛋白1用于治疗椎间盘退变 | 首次将单细胞转录组分析鉴定的纤连蛋白1装载于具有电活性的3D打印复合支架中，用于促进异常髓核退变加速和骨融合 | NA | 开发一种新型支架系统用于椎间盘退变治疗，以恢复椎间盘高度和生物力学功能 | 人类正常和退变髓核的单细胞转录组数据，以及3D打印复合支架的体内外性能 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组分析，3D打印 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞转录组数据集（正常和退变髓核样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 397 | 2026-05-21 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱细胞术分析IDH分层的人原发性和复发性胶质瘤的免疫图谱 | 首次揭示了IDH状态和复发相关的免疫微环境差异，发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群，并建立了胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量有限，仅包含48例人胶质瘤；研究结果需在更大队列中验证 | 解析IDH基因型分层的人原发性和复发性胶质瘤的免疫景观及其影响因素 | 48例人胶质瘤样本中的免疫细胞 | 自然语言处理 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序， 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据， 免疫细胞计数数据 | 144,678个单细胞和超过200万个免疫细胞，来自48例人胶质瘤 | NA | 单细胞RNA测序， 光谱流式细胞术 | NA | NA |
| 398 | 2026-05-21 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Transcriptomic Signatures in a Mouse Model of Pediatric Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis
2024-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.08.008
PMID:39222909
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术揭示儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组特征 | 首次利用空间转录组学技术表征儿童MASH小鼠模型的肝脏转录组图谱，并鉴定出细胞色素p450 2E1在门静脉周围区域的表达上调与疾病发病机制相关 | 未提及 | 探索儿童MASH的发病机制 | C57BL/6J小鼠 | 数字病理学 | 儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及WD+CCl处理组小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 399 | 2026-05-21 |
Pathogenic mechanisms, diagnostic, and therapeutic potential of microvesicles in diabetes and its complications
2024-11, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2024.110168
PMID:39349130
|
综述 | 综述了微囊泡在糖尿病及其并发症（如肾病、视网膜病变、心肌病和神经病变）发病机制中的新兴作用，并探讨其作为生物标志物和治疗工具的潜力 | 全面分析微囊泡通过携带蛋白质、脂质、mRNA和miRNA调节炎症、氧化应激、免疫反应和组织重塑等关键过程，在糖尿病进展中的作用，并提出其作为药物递送系统的治疗潜力 | 微囊泡的分离与表征困难，其分子机制理解不足，临床试验验证仍面临挑战，需改进分离纯化方法并借助单细胞RNA测序和蛋白质组学等先进技术 | 探讨微囊泡在糖尿病及其并发症中的致病机制、诊断和治疗潜力 | 微囊泡在糖尿病及并发症（肾病、视网膜病变、心肌病、神经病变）中的作用 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2026-05-21 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-10-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
|
研究论文 | 对Ucp1-iCre敲入小鼠进行表征，揭示其在雄性生殖细胞中的重组活性，并验证其作为产热脂肪组织条件基因操作工具的潜力 | 首次系统鉴定Ucp1-iCre敲入小鼠品系，明确其相较于传统Ucp1-Cre品系具有更低的异位活性，同时发现雄性生殖细胞中意外的高频重组活性 | 未深入探讨雄性生殖细胞重组对后代表型的长期影响，且雌性小鼠无类似现象的原因未阐明 | 评估Ucp1-iCre敲入小鼠作为产热脂肪组织特异性基因操作工具的实用性和局限性 | Ucp1-iCre敲入小鼠（雄性和雌性）及Rosa-tdTomato报告小鼠 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析、Cre-loxP重组系统 | NA | 基因表达数据、图像（报告基因荧光） | 涉及Ucp1-iCre雄性和雌性小鼠，与Rosa-tdTomato报告小鼠交配后的后代分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组分析用于检测精子细胞中Ucp1 mRNA表达 |