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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-23 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of nucleotide metabolism in colorectal cancer progression and tumor microenvironment
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05495-y
PMID:39075485
|
研究论文 | 整合单细胞与空间转录组学，揭示核苷酸代谢在结直肠癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次通过整合多种单细胞富集评分方法和空间转录组分析，识别出核苷酸代谢高表达的肿瘤细胞亚群（NUhighepi），并阐明其与成纤维细胞的互作机制，同时发现关键基因NME1在抑制转移中的作用 | 未说明具体局限性 | 深入理解核苷酸代谢在结直肠癌肿瘤细胞和肿瘤微环境中的功能 | 结直肠癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的成纤维细胞及免疫细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核苷酸代谢分析 | RCTD, stlearn, MISTy, 多种机器学习算法 | 单细胞数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 多个单细胞队列和多批量转录组队列（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-07-23 |
Communication between alveolar macrophages and fibroblasts via the TNFSF12-TNFRSF12A pathway promotes pulmonary fibrosis in severe COVID-19 patients
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05381-7
PMID:39075394
|
研究论文 | 研究严重COVID-19患者肺泡巨噬细胞与成纤维细胞通过TNFSF12-TNFRSF12A通路促进肺纤维化的机制 | 首次揭示了TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19相关肺纤维化中介导肺泡巨噬细胞-成纤维细胞通信的关键作用，并发现沉默TNFRSF12A可逆转纤维化效应 | NA | 探究TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19肺纤维化中肺泡巨噬细胞与成纤维细胞间通信的作用 | 严重COVID-19患者的肺泡巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 新型冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 严重COVID-19患者和健康对照者的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 23 | 2026-07-19 |
Interneuron diversity in the human dorsal striatum
2024-07-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50414-w
PMID:39039043
|
研究论文 | 利用单细胞核RNA测序和空间转录组学解析人类背侧纹状体中间神经元多样性 | 提出包含8个主要类别和14个亚类的纹状体中间神经元全面分类体系，整合转录组身份、空间表达谱及跨物种比较 | 未明确说明局限性 | 阐明人类背侧纹状体中间神经元的多样性及其转录组结构 | 死后人类尾状核和壳核样本 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | snRNA-seq, 空间转录组学, 定量荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 死后人类尸检样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 与10x Chromium单细胞核RNA测序和10x Visium空间转录组学兼容 |
| 24 | 2026-07-13 |
ASIC1/RIP1 accelerates atherosclerosis via disrupting lipophagy
2024-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.11.004
PMID:37931656
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研究论文 | 本研究揭示了ASIC1通过与RIP1相互作用抑制脂质自噬从而加速动脉粥样硬化的机制 | 首次阐明ASIC1通过RIP1/TFEB信号通路调控脂质自噬在动脉粥样硬化中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其潜在机制 | 人类和小鼠主动脉病变组织、RAW264.7和HTP-1巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类主动脉病变样本和ApoE-/-小鼠模型，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-07-10 |
Endoplasmic Reticulum Stress Induces ROS Production and Activates NLRP3 Inflammasome Via the PERK-CHOP Signaling Pathway in Dry Eye Disease
2024-12-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.34
PMID:39699913
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研究论文 | 本研究探讨内质网应激通过PERK-CHOP信号通路诱导ROS产生并激活NLRP3炎症小体在干眼症中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合体内外模型，揭示PERK-CHOP-TXNIP轴在干眼症中连接内质网应激与氧化应激及炎症的关键机制 | 未提及具体限制，如样本量较小或模型与人体差异等 | 研究内质网应激在干眼症发展中的潜在作用及其分子机制 | 干眼症小鼠模型、原代人角膜上皮细胞和永生化人角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、siRNA转染、免疫荧光、Western blotting、实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取干眼小鼠角膜组织scRNA-seq数据，以及东莨菪碱诱导的干眼小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat R程序分析从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 26 | 2026-07-11 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-12, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
|
研究论文 | 本研究调查了甘氨酸受体亚基α1、α2、α4和β在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达谱 | 首次系统分析了甘氨酸受体四个亚基在不同性别小鼠中枢神经系统中的单细胞和整体表达模式 | RNAscope检测到Glra4的表达，但qRT-PCR未能检测到，表明低丰度转录本的检测方法存在局限性 | 明确甘氨酸受体亚基在成年小鼠中枢神经系统中的分布和性别差异 | 成年雌性和雄性小鼠的中枢神经系统组织及部分内脏器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNAscope | NA | 转录组表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠多个脑区及脊髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-07-10 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
|
研究论文 | 开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法，用于人类和小鼠全脑空间转录组学比对 | 提出了一种自监督学习方法，通过异构图形神经网络同时编码空间转录组学中的点和基因，实现跨物种全脑比对，并揭示了保守脑区和同源基因表达模式 | NA | 推动人类和啮齿动物全脑空间转录组学研究方法的跨物种比对 | 人类和小鼠的全脑空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 异构图形神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-07-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
|
研究论文 | 利用CRISPR-CasRx技术靶向Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因，降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次利用CasRx RNA干扰工具结合shH10腺相关病毒，靶向调控房水循环相关基因，实现眼内压降低和视网膜神经节细胞保护，并通过单细胞测序阐明作用机制 | 研究仅限于雌性小鼠，未涉及其他性别或人类模型，且基因敲降效果的长期安全性未评估 | 探索基因治疗降低眼内压和延缓青光眼进展的新方法 | 雌性小鼠 | 基因治疗 | 青光眼 | CRISPR-CasRx, 腺相关病毒载体, 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠，具体数量未指定 | 未指定 | 单细胞测序 | 未指定 | 未指定 |
| 29 | 2026-07-10 |
Mapping the molecular landscape of Lotus japonicus nodule organogenesis through spatiotemporal transcriptomics
2024-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50737-8
PMID:39080318
|
研究论文 | 通过时空转录组学绘制百脉根根瘤器官发生的分子图谱 | 首次利用空间转录组学技术全面解析模式豆科植物百脉根根瘤发育过程中感染区和外围组织的发育轨迹，揭示了共生和物质交换的基因调控网络，并鉴定了转录因子LjNLP3在根瘤从分化到成熟转化中的关键作用 | 未提及具体限制 | 利用空间转录组学揭示百脉根根瘤器官发生的分子机制，为开发共生固氮作物提供数据支持 | 模式豆科植物百脉根（Lotus japonicus）的根瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-07-10 |
Anoikis and SPP1 in idiopathic pulmonary fibrosis: integrating bioinformatics, cell, and animal studies to explore prognostic biomarkers and PI3K/AKT signaling regulation
2024-06, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2315218
PMID:38318669
|
研究论文 | 整合生物信息学、细胞和动物实验，探索失巢凋亡和SPP1在特发性肺纤维化中的预后生物标志物及PI3K/AKT信号调控 | 首次通过失巢凋亡相关基因构建特发性肺纤维化的预后模型，并揭示SPP1通过PI3K/AKT通路调控肺纤维化的新机制 | 未提及具体样本量及外部验证队列 | 探究失巢凋亡在特发性肺纤维化中的相关性，识别相关生物标志物和信号通路 | 特发性肺纤维化患者及小鼠肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | Lasso回归、多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-07-10 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
|
研究论文 | 研究了蛋白磷酸酶在鸡视网膜中Müller胶质细胞转化为祖细胞过程中的调控作用 | 首次揭示了DUSP1/6和PP2C等蛋白磷酸酶在Müller胶质细胞重编程中的关键调控作用，并发现不同磷酸酶对细胞信号通路具有差异化调节 | 未对磷酸酶抑制在无损伤视网膜中的长期效果及分子机制进行深入探讨 | 探究蛋白磷酸酶对Müller胶质细胞来源祖细胞形成的调控机制 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞及其来源祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 正常和受损鸡视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-07-10 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
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研究论文 | 间歇性禁食通过促进3型先天淋巴细胞分泌IL-22从而诱导白色脂肪组织褐变 | 首次揭示肠道3型先天淋巴细胞在间歇性禁食诱导白色脂肪组织褐变中的关键作用，阐明了ILC3/IL-22/IL-22R信号轴参与间歇性禁食代谢益处的机制 | 尚未明确间歇性禁食如何具体调节ILC3细胞的芳香烃受体信号通路，以及树突状细胞和巨噬细胞与ILC3相互作用的详细分子机制 | 探究间歇性禁食促进白色脂肪组织褐变的细胞和分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及肠道免疫细胞 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对分选的肠道免疫细胞进行单细胞测序 |
| 33 | 2026-07-10 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序分析揭示昼夜节律通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次系统性地在泛癌水平上分析昼夜节律相关基因（CRGs）的表达、突变、甲基化及与免疫微环境的关系，并计算昼夜节律通路评分（CRS）以评估其作为免疫治疗标志物的潜力 | 仅依赖TCGA等公共数据库数据，缺乏大规模独立验证；未深入探讨CRGs调控肿瘤微环境的具体分子机制 | 探索昼夜节律相关基因在泛癌中的表达模式、预后价值及作为免疫治疗新靶点的可能性 | 泛癌（包括KIRC等多种肿瘤类型）的肿瘤样本及肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 泛癌（多类型肿瘤） | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化（IHC）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化数据、单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中多个肿瘤类型的大规模样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-07-10 |
The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315854
PMID:39705244
|
研究论文 | 研究发现保守性摆动尿苷tRNA硫醇酶Ctu1在血管生成和胚胎发育中起关键作用 | 首次在脊椎动物模型中揭示CTU1在血管生成和胚胎发育中的必要性 | 仅使用斑马鱼和人类内皮细胞模型，尚未涉及更复杂的哺乳动物模型或临床样本 | 确定Ctu1在血管生成和胚胎发育中的生物学功能 | 斑马鱼胚胎和人类内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎样本和人类内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达 |
| 35 | 2026-07-07 |
FCRL3 expression is upregulated and closely correlates with TIGIT expression in regulatory T cells of patients with systemic lupus erythematosus
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350739
PMID:38461541
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，发现系统性红斑狼疮患者调节性T细胞中FCRL3表达上调且与TIGIT表达正相关 | 首次揭示FCRL3与TIGIT在系统性红斑狼疮调节性T细胞中的共表达关系 | 未深入探讨FCRL3和TIGIT共表达的功能机制及临床意义 | 探究系统性红斑狼疮中FCRL3在调节性T细胞的表达及其与TIGIT的关联 | 系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序， 流式细胞术 | NA | 基因表达数据， 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-07-07 |
scNovel: a scalable deep learning-based network for novel rare cell discovery in single-cell transcriptomics
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae112
PMID:38555470
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研究论文 | 提出了scNovel，一个基于深度学习的可扩展神经网络，用于单细胞转录组学中发现新型稀有细胞 | 首次专门针对单细胞转录组中的新型稀有细胞发现设计深度学习网络，在AUROC性能上显著优于现有最优模型（平均AUROC超过94%，比第二好方法高16.26%） | 未明确说明局限性 | 开发一种可自动发现单细胞转录组中新型稀有细胞类型的方法 | 不同规模、协议和不平衡程度的单细胞转录组数据集，以及临床COVID-19数据集 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习神经网络 | 单细胞转录组数据 | 多种数据集，包括百万级规模的数据集及临床COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-07-07 |
PANoptosis, an indicator of COVID-19 severity and outcomes
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae124
PMID:38555477
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探索PANoptosis作为COVID-19严重程度和预后指标的潜力 | 首次将PANoptosis作为COVID-19严重程度和预后的生物标志物，并揭示其与炎症性单核细胞的关系及地塞米松的缓解机制 | 需要进一步研究阐明PANoptosis调控COVID-19免疫反应和预后的确切过程 | 探索PANoptosis作为COVID-19严重程度指标的可能性 | COVID-19患者支气管肺泡灌洗液和外周血单核细胞中的PANoptosis程度 | 机器学习 | 新冠病毒病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 在线单细胞RNA测序和批量RNA测序公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-07-07 |
SpatialcoGCN: deconvolution and spatial information-aware simulation of spatial transcriptomics data via deep graph co-embedding
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae130
PMID:38557675
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研究论文 | 提出深度图共嵌入框架SpatialcoGCN，用于空间转录组数据的去卷积和空间信息模拟 | 首次将深度图共嵌入框架应用于空间转录组数据的细胞类型去卷积和缺失转录本空间分布恢复，并基于此开发了空间信息感知的模拟方法SpatialcoGCN-Sim | 未提及 | 提高空间转录组数据的空间分辨率和检测转录本数量，开发高效的数据去卷积和模拟工具 | 空间转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 导管原位癌（人类） | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 模拟数据集、人类导管原位癌、发育中人类心脏和小鼠大脑的真实空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-07-07 |
HyGAnno: hybrid graph neural network-based cell type annotation for single-cell ATAC sequencing data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae152
PMID:38581422
|
研究论文 | 提出了一种基于混合图神经网络的细胞类型注释方法HyGAnno，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型标注 | 利用全基因组可及性峰特征而非仅基因表达或基因活性特征，并通过并行图神经网络在半监督方式下实现scRNA-seq参考到scATAC-seq目标的细胞类型信息转移；重建参考-目标细胞图以检测低预测可靠性的细胞 | 未在文中明确说明局限性 | 解决单细胞ATAC-seq数据因极端稀疏性和染色质可及性不一致导致的细胞类型注释不准确问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC测序 | 图神经网络 | 单细胞ATAC-seq数据及scRNA-seq参考数据 | 多种数据集评估 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-07-06 |
ADAMTS12 promotes fibrosis by restructuring extracellular matrix to enable activation of injury-responsive fibroblasts
2024-09-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170246
PMID:39286973
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研究论文 | 发现ADAMTS12通过重塑细胞外基质促进纤维化，并激活损伤反应性成纤维细胞 | 无偏见地鉴定出ADAMTS12为成纤维细胞特异性基因，结合空间转录组学和催化活性/非活性ADAMTS12表达揭示其通过切割HMCN1和重塑ECM驱动特定成纤维细胞亚群活化的机制 | 新识别的成纤维细胞群体在分化分子机制和纤维化作用上仍定义不清 | 研究ADAMTS12在纤维化中的作用及其调控成纤维细胞活化的分子机制 | 成纤维细胞、细胞外基质和纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、遗传命运追踪 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 人类和小鼠纤维化组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |