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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-03-21
Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition
2024-07, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了聚集自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境组成的相关性 首次探讨了聚集自噬信号在多发性骨髓瘤免疫微环境中的作用及其与疾病预后的关联 研究样本量相对较小,且主要依赖公共数据库数据进行验证 探究聚集自噬信号在多发性骨髓瘤免疫微环境中的角色及其预后价值 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本及健康对照样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,批量RNA测序 非负矩阵分解 RNA表达谱数据 7个多发性骨髓瘤骨髓样本和7个健康骨髓样本,共12,187个单细胞 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
22 2026-03-21
Single-cell analysis of Crohn's disease: Unveiling heterogeneity and evaluating ustekinumab outcomes
2024-07, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析克罗恩病的细胞异质性,并评估乌司奴单抗的治疗效果 利用单细胞RNA测序技术揭示克罗恩病中成纤维细胞和T细胞的关键相互作用及转录特征,为疾病机制和治疗靶点提供新见解 NA 解析克罗恩病的细胞复杂性,识别关键细胞群及其转录特征 克罗恩病患者与健康对照的炎症组织 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序 Seurat RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-03-21
Insights into the heterogeneity of the tumor microenvironment in lung adenocarcinoma and squamous carcinoma through single-cell transcriptomic analysis: Implications for distinct immunotherapy outcomes
2024-06, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌和肺鳞癌肿瘤微环境的异质性,并探讨了其对免疫治疗结果差异的影响 首次通过单细胞RNA测序结合批量转录组和多重免疫荧光验证,系统比较了LUAD和LUSC的肿瘤微环境差异,并发现了与免疫治疗反应相关的特定细胞亚群和基因表达特征 样本量相对较小(38例NSCLC患者),且验证队列可能受到中心特异性因素影响 探究肺腺癌和肺鳞癌肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗结果差异的影响机制 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是肺腺癌(LUAD)和肺鳞癌(LUSC)亚型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,批量转录组分析,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,批量转录组数据,图像数据 38例NSCLC患者(单细胞队列),外加验证队列(批量转录组和mIF) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学(通过mIF间接相关) NA NA
24 2026-03-21
The profile of cytokines against bacterial infection in dental pulp
2024-06, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组测序数据,分析了健康与炎症牙髓组织中细胞因子的表达特征,揭示了不同细胞类型在细菌感染下的响应机制 首次在单细胞水平上系统总结了健康与炎症牙髓中各类细胞的细胞因子分泌谱,并揭示了牙髓作为封闭环境模型在细菌感染研究中的独特价值 研究基于公共GEO数据集,可能受限于样本来源和测序深度,且未进行实验验证 探究牙髓细胞在细菌感染过程中通过细胞因子响应的机制 健康与炎症状态的人类牙髓组织 单细胞转录组学 牙髓炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组表达矩阵 从GEO数据集下载的健康与炎症牙髓组织单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-03-21
YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis
2024-05, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中通过AKT/β-catenin轴促进肿瘤干细胞性和顺铂不敏感性的作用 揭示了YBX1作为调控肝内胆管癌干细胞性和化疗耐药的关键分子,并阐明了其通过AKT/β-catenin轴的作用机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证有限,且未涉及其他化疗药物的敏感性 探究YBX1在肝内胆管癌干细胞性和顺铂敏感性中的调控作用及分子机制 肝内胆管癌细胞系、临床组织样本及小鼠模型 肿瘤生物学 肝内胆管癌 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 集落形成实验, 球体形成实验, 体内肿瘤生长实验 NA RNA-seq数据, 临床数据, 实验数据 三个bulk和单细胞RNA-seq数据集, 临床样本, 细胞系及小鼠模型 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
26 2026-03-21
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of neutrophils in non-small cell lung cancer
2024-05, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 识别了四种主要的肿瘤相关中性粒细胞亚群,包括一个促进肿瘤形成的终末分化状态,并揭示了其与巨噬细胞的密切关联及糖酵解活性增强 研究基于公共数据库数据,可能受样本来源和数量的限制,未进行实验验证 探究非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 肿瘤相关中性粒细胞和来自血液的多形核中性粒细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2026-03-21
Comprehensive profiling of endocrine metabolism identifies a novel signature with robust predictive value in ovarian cancer
2024-05, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过分析卵巢癌的单细胞RNA测序数据,基于分泌信号通路构建了一个四基因签名,用于预测卵巢癌的预后和免疫治疗反应 首次从分泌信号通路角度构建卵巢癌预后模型,并验证其在免疫治疗预测中的价值 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证 开发卵巢癌的预后预测模型并评估其与免疫治疗反应的关系 卵巢癌患者 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 单核苷酸变异主成分分析 随机森林 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-03-21
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2024-04-16, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本文重新分析了先前关于小鼠非神经元神经节细胞中HSV-1潜伏的单细胞RNA测序数据,并指出该结论基于存在缺陷的数据集 通过重新分析scRNA-Seq数据,揭示了非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA的检测是由于脱靶引物效应,并发现数据集中存在广泛的神经元破坏和细胞游离RNA污染 研究基于对已有数据的再分析,未进行新的实验验证,且主要关注小鼠模型,可能不直接适用于人类 验证HSV-1是否能在非神经元细胞中建立潜伏感染,挑战现有关于HSV-1潜伏仅限于神经元的观点 小鼠神经节中的细胞,包括神经元和免疫细胞 单细胞转录组学 疱疹病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于先前研究的小鼠神经节细胞scRNA-Seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-03-21
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-03, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据和RNA表达谱,构建了一个基于15个PANoptosis相关基因的风险评分模型,用于预测肺腺癌患者的预后并指导临床治疗策略 首次在肺腺癌中系统探索PANoptosis相关基因的预后价值,并构建了基于PANoptosis的风险评分模型,该模型与肿瘤免疫、基因突变和临床药物敏感性相关 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床应用价值 探索PANoptosis相关基因在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的关联 肺腺癌患者 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序,RNA表达谱分析 LASSO-Cox回归风险模型 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
30 2026-03-21
Characterization of the m6A/m1A/m5C/m7G-related regulators on the prognosis and immune microenvironment of glioma by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-02, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,分析了m6A/m1A/m5C/m7G相关调节因子在胶质瘤预后和免疫微环境中的作用 首次整合了m6A、m1A、m5C和m7G四种RNA甲基化调节因子,在胶质瘤中分析其与预后和肿瘤内异质性的关系 NA 研究RNA甲基化调节因子对胶质瘤预后和免疫微环境的影响 胶质瘤患者样本 生物信息学 胶质瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 机器学习方法, 多元Cox回归分析 RNA测序数据 三个内部单细胞RNA测序数据集和一个公开批量RNA测序数据队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
31 2026-03-21
Identification and exploration of aging-related subtypes and distinctive role of SERPINE1 in heart failure based on single-cell and bulk RNA sequencing data
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据,探索了衰老相关基因在心力衰竭中的作用,并识别了新的诊断生物标志物和分子亚型 结合单细胞和bulk RNA测序数据,首次识别了SERPINE1在心力衰竭中的关键作用,并揭示了其与衰老相关亚型、免疫浸润和代谢微环境的关联 研究样本量有限(仅20个血液样本用于RT-qPCR验证),且未进行大规模临床验证 探索心力衰竭的新诊断生物标志物、分子分型和治疗策略 心力衰竭患者和正常对照的血液样本及测序数据 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR 诊断模型 RNA测序数据, 基因表达数据 未明确总测序样本数,但包括10名正常对照和10名心力衰竭患者的血液样本用于验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
32 2026-03-21
Peroxisome proliferator-activated receptors signature reveal the head and neck squamous cell carcinoma energy metabolism phenotype and clinical outcome
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过多数据集分析揭示了过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)相关基因在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)中的作用,构建了预后模型并探讨了其与能量代谢和免疫治疗响应的关联 首次在HNSC中利用单细胞RNA测序数据全面分析PPAR相关基因特征,构建了基于七个PPAR相关基因的高精度预后模型,并发现这些基因能区分HNSC的能量代谢异质性 研究主要基于公共数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且未进行实验验证PPAR相关基因的具体功能机制 探究PPAR相关基因在HNSC中的表达特征、预后价值及其与能量代谢和免疫微环境的关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSC)患者样本,包括肿瘤组织和正常组织 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析,功能富集分析 LASSO回归,Cox回归模型 RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 多个公共数据集(TCGA-HNSC, GSE41613, GSE139324, PRJEB23709, IMVigor),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-03-21
Cross-talk of pyroptosis-based subtypes, the development of a risk classifier and immune responses in cervical cancer
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分型,开发了一个风险分类器,并探讨了其与免疫应答的关系 首次基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分子分型,并构建了一个包含四个基因(PEG3、FSCN1、CDH3和SLC2A1)的风险分类器,同时揭示了不同风险组间的免疫微环境差异 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证;单细胞测序分析可能受限于样本量和细胞类型覆盖 探索焦亡在宫颈癌中的预后价值及其对免疫代谢的调控作用 宫颈癌患者样本和细胞系 生物信息学与计算生物学 宫颈癌 单细胞测序、PCR、CIBERSORT算法、无监督聚类分析、逐步Cox回归 风险分类器(基于Cox回归) 基因表达数据、单细胞测序数据、临床生存数据 两个独立队列共501例宫颈癌样本(C1组259例,C2组242例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-03-21
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway activation in lung adenocarcinoma by KRAS mutation
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 首次在单细胞水平上结合KRAS突变状态分析PI3K/AKT/mTOR通路活性,并识别出GRB2+上皮细胞亚群作为关键靶点 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 探究KRAS突变对肺腺癌中PI3K/AKT/mTOR信号通路活性的影响机制 肺腺癌患者单细胞RNA测序数据及TCGA数据集中的基因表达和突变谱 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 Seurat包、主成分分析、AUCell评分、基因集富集分析、inferCNV包 单细胞RNA测序数据、基因表达谱、突变谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-03-21
COL3A1-positive endothelial cells influence LUAD prognosis and regulate LUAD carcinogenesis by NCL-PI3K-AKT axis
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了COL3A1阳性内皮细胞在肺腺癌发生发展及免疫微环境形成中的关键作用,并鉴定出关键靶基因NCL通过PI3K-AKT通路调控癌细胞凋亡与增殖 首次在单细胞水平系统解析了COL3A1阳性内皮细胞亚群在肺腺癌中的独特功能,发现其通过NCL-PI3K-AKT轴调控肿瘤发生的新机制 研究样本量较小(16例),功能验证主要在细胞系水平进行,缺乏体内实验验证 探究肺腺癌中内皮细胞异质性及其在肿瘤发生和微环境形成中的作用机制 肺腺癌患者样本(16例)及A549、NCI-H1299肺腺癌细胞系 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序,伪时间分析,细胞通讯分析,基因调控网络分析,流式细胞术,Western blot,EdU染色,Ki-67染色 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据 16例肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-03-21
Cytotoxic T-lymphocytes in acute myeloid leukemia: Monitoring prognosis and guiding treatment choice
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)在急性髓系白血病(AML)中的作用,并基于其细胞遗传学标志物构建了一个随机森林模型,用于预后分层和治疗选择指导 通过单细胞RNA测序数据识别了CTLs在AML细胞通讯中的核心作用,并利用随机森林模型基于CTLs标志基因进行预后评估和免疫治疗响应预测 研究基于公开数据集GSE116256,样本来源和数量可能有限,且模型需进一步验证 理解CTLs在AML预后监测和临床治疗响应中的作用,并开发预测模型 急性髓系白血病(AML)患者 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 随机森林 单细胞RNA测序数据 基于GSE116256数据集,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-03-21
Machine learning reveals PANoptosis as a potential reporter and prognostic revealer of tumour microenvironment in lung adenocarcinoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多种细胞死亡模式构建PANoptosis基因集,利用单细胞RNA-seq数据分析肺腺癌样本,建立风险模型并验证其预后价值及与肿瘤微环境的关联 首次将铁死亡、铜死亡、焦亡、坏死性凋亡和双硫死亡整合为PANoptosis基因集,并应用于肺腺癌的单细胞分析,揭示了其与肿瘤免疫微环境的潜在联系 研究仅基于11个肺腺癌样本的单细胞数据,样本量较小,且细胞验证仅限于两种肺腺癌细胞系 探究PANoptosis在肺腺癌中的表达模式及其作为预后生物标志物和肿瘤微环境调节因子的潜力 肺腺癌患者样本及两种肺腺癌细胞系 机器学习 肺腺癌 单细胞RNA测序 LASSO回归、COX回归 单细胞RNA-seq数据 11个肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-03-21
Immune infiltration and clinical significance analyses of the cancer-associated fibroblast-related signature in skin cutaneous melanoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究构建了一个与癌症相关成纤维细胞(CAF)相关的10基因特征模型,用于预测皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的预后、免疫景观及对化疗/免疫疗法的反应 基于单细胞转录组分析和加权基因共表达分析,首次构建了针对皮肤黑色素瘤的CAF相关预后特征模型,并揭示了其与免疫抑制及治疗反应的关系 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;模型在外部独立队列中的验证尚不充分 建立CAF相关特征模型,为皮肤黑色素瘤患者的预后评估和治疗方案选择提供新视角 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞转录组分析,加权基因共表达分析(WGCNA) 预后特征模型(10基因模型) 基因表达数据 TCGA-SKCM队列中的样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-03-21
Exploring the mechanism underlying the therapeutic effects of butein in colorectal cancer using network pharmacology and single-cell RNA sequencing data
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序数据,探索了紫铆因在结直肠癌中的治疗机制,并识别出UBE2C作为潜在的生物标志物 首次将网络药理学与单细胞RNA测序分析相结合,系统性地揭示紫铆因在结直肠癌中的作用机制,并利用机器学习筛选出关键生物标志物UBE2C 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏体内或体外实验的直接验证,且单细胞数据样本来源和数量有限 阐明紫铆因在结直肠癌中的治疗作用机制,并寻找潜在的生物标志物 结直肠癌相关的基因、信号通路和细胞类型 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序、网络药理学、机器学习、差异表达分析、WGCNA 机器学习(未指定具体模型)、MCODE、ROC曲线分析 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 使用了GSE38026、GSE222300(单细胞数据集)和GSE40967(外部验证数据集)等多个公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-03-21
Prognosis and therapy in thyroid cancer by gene signatures related to natural killer cells
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了与自然杀伤细胞相关的基因风险特征,用于预测甲状腺癌的预后 首次利用自然杀伤细胞相关基因KLF2、OSTF1和TAPBP构建甲状腺癌预后风险特征,为甲状腺癌的预后评估和治疗提供了新视角 研究样本量有限,仅基于TCGA-THCA队列和少量单细胞数据,需要进一步的外部验证 开发与自然杀伤细胞相关的可靠风险特征,以预测甲状腺癌的预后和指导免疫治疗 甲状腺癌患者,包括7个单细胞RNA测序样本和502个批量RNA测序患者数据 生物信息学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO Cox回归模型 RNA测序数据 7个单细胞样本和502个批量RNA测序患者 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
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