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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-10 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 利用多组学整合分析揭示肺组织中Asorin在肺动脉高压中的保护作用 | 首次通过最大规模的PAH肺组织生物库多中心数据整合，结合转录组、基因组、单细胞和药理学分析，发现ASPN基因在PAH中的保护性角色并验证其治疗潜力 | 未明确提及限制，但可能涉及样本量虽大但仍有限，后续需进一步动物和人体验证 | 通过多组学整合阐明肺动脉高压（PAH）的病理机制，并识别潜在保护性靶点 | 人类PAH肺组织样本（96例患者和52例对照）及Sugen-缺氧大鼠模型 | 机器学习 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 贝叶斯调控网络, 药物转录组学 | 贝叶斯调控网络 | 基因表达数据, 基因组数据, 单细胞数据, 临床表型数据 | 96例PAH肺组织样本和52例对照肺组织样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 22 | 2026-05-10 |
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97662
PMID:39324575
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研究论文 | 发现肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）通过GDNF-BDNF轴感知并修复周围神经损伤 | 首次揭示FAPs在周围神经再生中的先前未被认识的作用，以及其通过GDNF-BDNF轴响应损伤的分子机制 | 未提及明显局限性 | 研究FAPs如何感知解剖上遥远的周围神经损伤及其对神经再生的直接贡献 | 肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）和周围神经损伤 | NA | 周围神经损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（包括年轻和年老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-10 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 提出结合细胞形态与空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI | 首次将组织学特征（细胞形态）与空间转录组数据整合，无需配对scRNA-seq数据即可分析肿瘤微环境 | 未提及跨平台兼容性和大规模验证中的计算开销 | 开发无需单细胞测序数据即可分析肿瘤微环境的端到端集成工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变组织样本 | 数字病理学， 计算机视觉， 机器学习 | 胃癌， 肺癌， 膀胱癌 | 空间转录组测序 | NA | 图像数据， 空间转录组数据 | 多种肿瘤组织（胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-05-10 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其通过调控巨噬细胞极化抑制牙槽骨丢失的机制 | 首次探讨JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调控作用及其对牙槽骨丢失的保护机制 | 研究结果主要基于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体体内直接验证；且样本量较小 | 探究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调控牙周炎的潜在机制 | 人牙龈组织样本（健康与炎症各9例）、小鼠牙周炎模型、巨噬细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组化、Western blotting、免疫荧光染色、siRNA转染 | NA | 基因表达数据、组织样本数据 | 9例健康牙龈组织、9例炎症牙龈组织；小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-05-10 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析人牙槽骨炎症微环境中肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱以阐明其自然转归的潜在结局 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人牙槽骨不同类型肉芽组织的单细胞图谱，揭示了炎症肉芽组织在自然消退后与修复性肉芽组织在细胞组成和基因表达上的相似性，并鉴定了与炎症调控和血管生成相关的关键基因（如Igbp5、Zfp36、Timp3等） | 未提供明确的局限性描述 | 探究人牙槽窝肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱，以揭示炎症微环境中肉芽组织自然转归的潜在结局 | 人牙槽窝肉芽组织样本（来自牙周炎拔牙后行延迟位点保存或自体牙移植的12名患者） | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、HE染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个牙槽窝肉芽组织样本，共捕获20,448个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
|
research paper | 利用单细胞和空间转录组学技术，构建了健康与干燥综合征（SjD）患者唾液腺的细胞图谱，发现GZMK+CD8+ T细胞靶向特定的浆液黏液腺泡细胞亚群，揭示了SjD的病理机制 | 首次鉴定出新的浆液黏液腺泡细胞类型，并发现GZMK+CD8+ T细胞在SjD中特异性靶向该细胞群体，展示了免疫反应对高分泌腺泡细胞的影响 | NA | 阐明Sjögren病中免疫反应对唾液腺细胞类型的影响及具体细胞亚群的病理学作用 | 人类小唾液腺组织中的细胞类型，包括腺泡细胞和免疫细胞 | machine learning, digital pathology | Sjögren病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类小唾液腺组织样本（健康与SjD患者） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 27 | 2026-05-10 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-04, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文提出一个多物种、多组学的元分析框架，以促进心血管再生靶点的发现 | 提出基于单细胞RNA测序技术的多物种、多组学元分析框架，整合跨物种、跨发育阶段的心脏健康与损伤研究数据，驱动心血管再生新靶点的发现 | NA | 提出策略性框架以识别促进心血管再生的新靶点 | 健康与受伤心脏的多物种研究，涵盖不同发育阶段 | 机器学习和生物信息学 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序 | 元分析框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-05-09 |
ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01002-1
PMID:38769144
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研究论文 | 介绍ProBac-seq这一利用液滴微流控和大寡核苷酸探针集的细菌单细胞RNA测序方法 | 通过使用mRNA特异性探针克服细菌mRNA无poly-A尾、转录本不稳定及细菌形态与现有技术不兼容的问题，实现高质量单细胞基因表达数据 | 未明确提及局限性，但方法依赖探针设计和大规模寡核苷酸合成，可能成本较高 | 提供一种适用于细菌的单细胞RNA测序方法，以研究细菌细胞异质性和基因表达状态 | 细菌细胞，如大肠杆菌或其他可通过原位杂交分析的单细胞生物 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 液滴微流控 | NA | 基于液滴微流控的细菌单细胞RNA测序平台 |
| 29 | 2026-05-09 |
The transcriptome of CD14 + CD163 - HLA-DR low monocytes predicts mortality in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Sep-11, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.08.07.24311386
PMID:39211854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞中CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，发现其能够预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的230个基因表达特征可独立预测IPF死亡率，并验证了T细胞共刺激基因的低表达与高风险相关 | 样本量相对较小，且研究主要基于外周血和支气管肺泡灌洗液，未全面探索肺组织中其他免疫细胞的贡献 | 确定与特发性肺纤维化（IPF）死亡率相关的免疫细胞特异性转录组特征 | 416例IPF患者来自六个队列，外加一个独立验证队列（38例），包括外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据（单细胞RNA测序数据） | 初始队列18例（包括IPF、COVID-19、COVID-19后间质性肺病和对照组），验证队列416例来自六个队列，独立验证38例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-09 |
The aminophospholipid transporter, ATP8B3, as a potential biomarker and target for enhancing the therapeutic effect of PD-L1 blockade in colon adenocarcinoma
2024-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110907
PMID:39074670
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，发现ATP8B3在结肠腺癌中可作为潜在生物标志物，抑制ATP8B3可降低PD-L1表达并增强免疫治疗效果 | 首次揭示ATP8B3在结肠腺癌中调控PD-L1表达及免疫抑制微环境的作用，并提出联合ATP8B3抑制剂与免疫疗法的新策略 | 由于MSS亚型微环境中缺乏免疫杀伤细胞，ATP8B3高表达未能增加该类患者对PD-L1抑制剂的敏感性 | 探究ATP8B3作为结肠腺癌潜在生物标志物及增强PD-L1阻断治疗效果的靶点 | 结肠腺癌患者及细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA, shRNA, 蛋白质印迹分析, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 免疫浸润数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-09 |
Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers
2024-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110942
PMID:39326641
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示周细胞相关基因表达特征，用于预测实体癌预后和治疗反应 | 首次识别肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因，并基于其中5个关键基因构建预后风险模型，可准确预测肝癌和肺癌的预后及治疗反应 | 仅验证了肝癌和肺癌中的发现，未在其他实体瘤中进行广泛验证 | 探究肿瘤微环境中血管周细胞对癌症进展的影响，并构建基于周细胞的预后预测模型 | 实体癌（肝癌和肺癌）患者 | 机器学习 | 肝癌, 肺癌 | 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | 预后风险模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA及GEO数据库中的多个样本集（具体数量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2026-05-09 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2024-08-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51450-2
PMID:39198404
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和分子病理学比较人类前列腺癌与基因工程小鼠模型，揭示MYC驱动的肿瘤微环境变化 | 首次利用单细胞RNA测序结合基因工程小鼠模型，揭示MYC信号激活如何直接或间接重编程肿瘤微环境，以及人类与小鼠模型之间的平行变化 | 未提及具体局限性 | 研究MYC驱动前列腺癌进展中肿瘤微环境的重编程机制 | 人类前列腺癌组织和基因工程小鼠模型的前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类前列腺癌组织样本和基因工程小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-09 |
Innate immune responses against mRNA vaccine promote cellular immunity through IFN-β at the injection site
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51411-9
PMID:39191748
|
研究论文 | 通过生成综合的单细胞转录组图谱，研究mRNA疫苗在小鼠注射部位引发的先天免疫反应，特别是IFN-β信号在促进细胞免疫中的作用 | 首次揭示注射部位成纤维细胞在mRNA疫苗免疫反应中的关键作用，发现成纤维细胞特异性对mRNA组分响应产生IFN-β，并证明IFN-β信号对增强抗原特异性细胞免疫至关重要 | 研究仅基于雌性BALB/c小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证；未深入探讨IFN-β信号的持续时间及长期免疫效果 | 阐明mRNA疫苗注射部位早期免疫反应的分子机制，特别是先天免疫与适应性免疫的衔接过程 | 雌性BALB/c小鼠注射部位组织及引流淋巴结 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎（COVID-19） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性BALB/c小鼠注射部位及引流淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘测序平台 |
| 34 | 2026-05-09 |
Plasma proteomics of acute tubular injury
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51304-x
PMID:39191768
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研究论文 | 利用SomaScan蛋白质组学平台鉴定急性肾小管损伤的血浆生物标志物，并结合多组学分析验证 | 首次在经活检确诊的肾病患者中系统鉴定与急性肾小管损伤严重程度相关的156种血浆蛋白，并阐明骨桥蛋白等关键标志物的生物学通路 | 可能缺乏外部验证队列中差异人群的普适性分析，且单细胞测序与血浆蛋白的相关性需进一步功能验证 | 发现与急性肾小管损伤相关的非侵入性血浆生物标志物 | 急性肾小管损伤患者及对照人群的血浆样本 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、临床队列数据 | 434例活检确诊肾病患者（发现队列）、44例（KPMP验证）、4610例（ARIC验证）、268例（CHROME验证） | SomaLogic | 蛋白质组学 | SomaScan | SomaScan蛋白质组学平台用于血浆蛋白定量分析 |
| 35 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis
2024-08-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51201-3
PMID:39187486
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫配子体形成过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序 | 首次利用单细胞RNA-seq解析恶性疟原虫在缺乏性染色体情况下的雄性和雌性配子体分化机制，预测了候选驱动基因，并发现AP2-G5转录因子特异性调控雄性发育 | 未明确提及实验重复次数及统计方法，且结果依赖于报告基因系，可能无法完全反映自然感染条件下的细胞状态 | 阐明恶性疟原虫雄性和雌性配子体分化的转录程序及调控机制 | 恶性疟原虫配子体报告基因系细胞 | 单细胞转录组学 | 疟疾（恶性疟原虫感染） | 单细胞RNA-seq | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 基于FACS富集的恶性疟原虫配子体细胞（具体细胞数量未在摘要中说明） | 未明确提及 | 单细胞RNA-seq | 未明确提及 | 基于FACS的细胞富集后进行单细胞RNA-seq |
| 36 | 2026-05-09 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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研究论文 | 该文章结合空间转录组数据与分支形态发生的生命周期，发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、维甲酸等通路的调控下，节奏性地交替更新与分化阶段，并与肾脏分支形态发生同步 | 首次通过空间转录组学揭示肾单位祖细胞在微环境中节奏性交替更新与分化相，并阐明了Wnt/β-catenin与YAP信号时间重叠将分化信号转化为更新信号的机制 | 未详细说明样本量及体内验证的局限性 | 探究肾单位祖细胞如何协调自我更新与分化以匹配肾脏分支形态发生的节奏 | 小鼠肾脏发育中的肾单位祖细胞及人干细胞衍生的肾单位祖细胞类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-09 |
TooManyCellsInteractive: A visualization tool for dynamic exploration of single-cell data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae056
PMID:39172544
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研究论文 | 介绍TooManyCellsInteractive (TMCI)，一种基于浏览器的JavaScript应用，用于交互式探索单细胞数据中的细胞群体 | 提供直观界面可视化径向树表示的分层细胞亚群，支持多分辨率覆盖、过滤和比较生物学特征 | NA | 开发一种用户友好的可视化工具，促进大规模单细胞测序数据的探索 | 药物耐受持久性细胞中的泛癌分析数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-09 |
StereoSiTE: a framework to spatially and quantitatively profile the cellular neighborhood organized iTME
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae078
PMID:39452614
|
研究论文 | 提出StereoSiTE框架，结合开源生物信息学工具和自定义算法，从空间转录组数据中推断免疫肿瘤微环境（iTME）中细胞邻域（CN）的功能性空间细胞相互作用强度（SCII） | 首次提供综合性分析框架，充分利用空间信息来精确推断细胞邻域内的空间细胞相互作用强度，并成功识别出由中性粒细胞主导的细胞邻域及其在治疗后的免疫肿瘤微环境重塑作用 | 仅应用于异种移植模型，可能需要在临床样本中进一步验证；框架的通用性和可扩展性尚未在多种数据类型和条件下全面测试 | 开发一种能够全面利用空间转录组数据、精确分析免疫肿瘤微环境中细胞邻域和空间细胞相互作用的分析框架 | 异种移植模型中的空间转录组数据集 | 计算生物学, 生物信息学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-05-09 |
demuxSNP: supervised demultiplexing single-cell RNA sequencing using cell hashing and SNPs
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae090
PMID:39607981
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研究论文 | 提出一种名为demuxSNP的监督算法，结合细胞哈希和单核苷酸多态性进行单细胞RNA测序的多重样本拆分 | 首次使用监督学习方法，同时利用细胞哈希和SNP两种数据模态进行样本拆分，提高了低质量哈希数据的分类准确性并克服了类别不平衡问题 | 要求生物学样本具有遗传差异，且依赖高质量哈希数据初步推断基因型 | 改进单细胞RNA测序多重样本拆分的准确性和稳健性 | 模拟数据和肾细胞癌真实数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 细胞哈希, SNP分析 | 最近邻算法 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 模拟数据（含5-50%双细胞率）及真实肾细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-09 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
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研究论文 | 本文介绍了GADES，一个GPU加速的Kendall距离计算软件包，适用于大型或稀疏数据 | 提出利用GPU进行大规模并行Kendall-τ距离矩阵计算，通过特定内存管理突破GPU容量限制，并针对稀疏数据设计了额外加速算法 | 未提及具体局限性，可能依赖GPU硬件资源 | 开发高性能Kendall距离矩阵计算方法，实现大数据的高效处理 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 数值数据 | 模拟数据集和真实单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |