单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7512 篇文献，本页显示第 3921 - 3940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3921 | 2024-09-25 |
Pan-cancer analysis of the role of α2C-adrenergic receptor (ADRA2C) in human tumors and validation in glioblastoma multiforme models
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.98240
PMID:39308687
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研究论文 | 本文通过RNA测序数据和生物信息学方法，全面分析了α2C-肾上腺素受体（ADRA2C）在多种癌症中的作用，并在胶质母细胞瘤模型中进行了验证 | 首次进行了全面的泛癌分析，揭示了ADRA2C在不同癌症中的表达水平及其与临床阶段、预后和免疫浸润细胞的关系 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，缺乏体内实验的长期随访数据 | 探讨ADRA2C在泛癌中的作用及其作为癌症诊断、预后和治疗靶点的潜力 | α2C-肾上腺素受体（ADRA2C）在多种癌症中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型，包括乳腺癌、食管腺癌、肾癌和肺癌等 |
| 3922 | 2024-09-24 |
A Novel Tumor-Associated Neutrophil-Related Risk Signature Based on Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Analyses Predicts the Prognosis and Immune Landscape of Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100338
PMID:39308692
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞和批量RNA测序分析的新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征，用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 | 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据开发了肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征，并验证了其在多个队列中的预后预测能力 | NA | 开发一种新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征，用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 | 乳腺癌患者的预后和免疫景观 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | RNA | 多个队列的乳腺癌患者样本 |
| 3923 | 2024-09-25 |
Comprehensive analysis of macrophage-associated inflammatory genes in AMI based on bulk combined with single-cell sequencing data
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17981
PMID:39308815
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研究论文 | 本研究通过结合bulk和单细胞测序数据，全面分析了AMI中与巨噬细胞相关的炎症基因 | 本研究首次结合bulk和单细胞测序数据，系统分析了AMI中巨噬细胞相关的炎症基因，并筛选出关键基因Saa3、Ms4a4c、Acp5和Fcgr4 | 本研究主要基于现有数据库和动物实验，尚未在人体样本中验证这些基因的表达和功能 | 探讨AMI后巨噬细胞在炎症反应中的作用，并筛选潜在的生物标志物 | AMI后巨噬细胞相关的炎症基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、bulk RNA-seq、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 包括GSE163465、GSE236374、GSE183272和GSE114695数据集，以及AMI小鼠心肌组织 |
| 3924 | 2024-09-25 |
Revelation of comprehensive cell profiling of primary and metastatic tumour ecosystems in oral squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomic analysis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97404
PMID:39310253
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示口腔鳞状细胞癌原发和转移肿瘤生态系统的综合细胞图谱 | 发现了两种新型细胞类型（CD1C-CD141-树突状细胞和CD1C+_B树突状细胞），并确定了IL1RN和C15orf48作为新的标记物 | NA | 理解口腔鳞状细胞癌在单细胞水平上的细胞起源和基因表达特征 | 口腔鳞状细胞癌的原发和转移肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自口腔鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、放射治疗后的第二原发肿瘤等多种组织样本 |
| 3925 | 2024-09-25 |
Comprehensive analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data reveals Schlafen-5 (SLFN5) as a novel prognosis and immunity
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97975
PMID:39310264
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨了Schlafen家族基因在结直肠腺癌（COAD）中的诊断和预后潜力 | 首次揭示了SLFN5在COAD中的显著上调及其与不良预后和免疫反应的关系 | NA | 探索Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的诊断和预后潜力 | Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的表达及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌患者和正常组织的样本 |
| 3926 | 2024-09-25 |
Investigation and Confirmation of PYCARD as a Potential Biomarker for the Management of Psoriasis Disease
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S468746
PMID:39310902
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研究论文 | 本文探讨了坏死性凋亡相关基因在银屑病中的分子机制，并筛选出PYCARD作为潜在的银屑病生物标志物 | 首次将PYCARD确定为银屑病的潜在生物标志物，并通过多种实验验证了其在银屑病发展中的重要作用 | NA | 探索银屑病中坏死性凋亡相关基因的分子机制，并筛选潜在的生物标志物 | 银屑病患者和银屑病样皮炎小鼠模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 实时荧光定量PCR、Western blot、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE13355和GSE14905数据集中的银屑病差异表达基因，以及临床样本和动物实验 |
| 3927 | 2024-09-24 |
At the interface of tumor-associated macrophages and fibroblasts: immune-suppressive networks and emerging exploitable targets
2024-Sep-23, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1690
PMID:39311702
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综述 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）之间的相互作用及其在肿瘤微环境中的免疫抑制网络 | 利用单细胞RNA测序（sc-RNA seq）和空间转录组学技术，深入理解TAMs和CAFs之间的信号动态和空间分布 | NA | 研究TAMs和CAFs在实体肿瘤微环境中的相互作用，寻找新的治疗靶点 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（sc-RNA seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3928 | 2024-09-24 |
Single-cell RNA Sequencing Demonstrates the Heterogeneity of Different Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2024-Sep-23, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10922-2
PMID:39311993
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌不同分子亚型的异质性 | 揭示了不同TCGA分子亚型胃癌在单细胞水平的异质性，并识别了与预后相关的亚型特异性lncRNA | NA | 深入理解胃癌的异质性并预测患者预后 | 胃癌的不同分子亚型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 119,878个细胞 |
| 3929 | 2024-09-24 |
RGS19: A novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma revealed through comprehensive bulk and single-cell sequencing analysis
2024-Sep-21, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.09.057
PMID:39307631
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3930 | 2024-09-24 |
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-Sep-19, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2024.107588
PMID:39307100
|
研究论文 | 研究基于单细胞转录组数据分析弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因调控机制 | 首次全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因表达特征，并发现了ID3基因在T细胞耗竭中的关键作用 | 研究依赖于公开的单细胞转录组数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 深入理解弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的分子病理机制，寻找新的治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤中的T细胞耗竭及其相关基因表达特征 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞转录组数据 |
| 3931 | 2024-09-23 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建了与硫氧还蛋白相关的肝细胞癌预后标志物 | 首次构建了基于硫氧还蛋白相关基因的肝细胞癌预后模型，并探讨了高硫氧还蛋白组和低硫氧还蛋白组在肝细胞癌中的差异 | 研究仅基于TCGA和GSE14520数据集，样本量有限，需要进一步验证 | 探讨硫氧还蛋白相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者及其预后 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、加权共表达网络分析 | COX回归、Lasso回归 | 基因表达数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者 |
| 3932 | 2024-09-23 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了乳腺癌的代谢异质性和潜在的免疫治疗反应 | 首次全面阐明了乳腺癌在单细胞水平的转录组异质性，并揭示了癌症相关成纤维细胞在治疗抵抗中的作用 | 研究样本仅来自14名患者，可能影响结果的普适性 | 揭示乳腺癌的异质性及其与化疗抵抗和免疫治疗反应的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤样本及其单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 14名乳腺癌患者的样本 |
| 3933 | 2024-09-23 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing reveals the role of steroid hormone pathway during chicken primordial follicle formation
2024-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104090
PMID:39096826
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研究论文 | 研究通过时空单细胞RNA测序揭示了鸡原始卵泡形成过程中类固醇激素通路的作用 | 首次通过单细胞mRNA测序和空间转录组分析探索了鸡原始卵泡形成过程中的卵巢微环境和调控通路 | 研究仅限于鸡的卵巢组织，未涉及其他物种 | 揭示鸡原始卵泡形成过程中的分子调控机制 | 鸡的卵巢组织和原始卵泡形成过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 收集了2天、5.5天和10.5天孵化的鸡的左侧卵巢组织 |
| 3934 | 2024-08-07 |
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-Oct, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.05.032
PMID:38977075
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3935 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-Sep-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞作为减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞（IFNICs）在腹主动脉瘤发展中的作用，并发现其通过cGAS-STING和JAK-STAT通路促进I型干扰素的分泌 | 研究主要基于AngII诱导的ApoE-/-小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨腹主动脉瘤发展过程中细胞类型和信号通路的变化，为开发治疗手段提供依据 | 腹主动脉瘤及其破裂风险 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | AngII诱导的ApoE-/-小鼠的腹主动脉样本 |
| 3936 | 2024-09-23 |
Multi-omics features of immunogenic cell death in gastric cancer identified by combining single-cell sequencing analysis and machine learning
2024-09-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73071-x
PMID:39294296
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研究论文 | 本文通过结合单细胞测序分析和机器学习，识别了胃癌中免疫原性细胞死亡的多组学特征 | 本文创新性地利用机器学习框架整合101种算法，构建了与免疫原性细胞死亡相关的基因特征，并验证了这些基因与胃癌免疫微环境和侵袭转移的关系 | NA | 阐明免疫原性细胞死亡在胃癌中的精确作用 | 胃癌中的免疫原性细胞死亡相关基因及其与免疫微环境和侵袭转移的关系 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序分析、转录组测序分析、蛋白质组分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 大量临床样本 |
| 3937 | 2024-09-23 |
AtML: An Arabidopsis thaliana root cell identity recognition tool for medicinal ingredient accumulation
2024-Sep-16, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.09.010
PMID:39293728
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研究论文 | 本文开发了一种名为AtML的机器学习系统，用于识别拟南芥根细胞阶段并识别生物标志物，以促进对药用化合物积累机制的理解 | AtML系统通过完全的模型可解释性，识别了160个重要的标记基因，有助于细胞类型的注释 | NA | 开发一种工具，用于识别拟南芥根细胞阶段，并揭示药用化合物积累的机制 | 拟南芥根细胞及其药用化合物的合成与积累模式 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 机器学习系统 | 转录组数据 | 6000个细胞，来自六个细胞亚群 |
| 3938 | 2024-09-23 |
Altered Cell Clusters and Upregulated Aqp1 in Connexin 50 Knockout Lens Epithelium
2024-Sep-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.11.27
PMID:39287589
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研究论文 | 研究了连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞的异质性和细胞簇，并探讨了其下游靶点对晶状体稳态和生长的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞中差异表达基因，特别是Aqp1的上调 | 研究仅限于一个月大的Cx50KO和野生型小鼠，样本量较小 | 研究连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞的异质性和细胞簇，以及其对晶状体稳态和生长的影响 | 一个月大的连接蛋白50敲除和野生型小鼠的晶状体上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Cx50KO和野生型小鼠各一组 |
| 3939 | 2024-09-23 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals 2 Subtypes of Tumor Cells of Sclerosing Pneumocytoma With Distinct Molecular Features and Clinical Implications
2024-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100560
PMID:38972356
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了硬化性肺细胞瘤中两种具有不同分子特征和临床意义的肿瘤细胞亚型 | 首次提供了硬化性肺细胞瘤的单细胞转录组全面图谱，并鉴定出两种不同的肿瘤细胞亚型 | 样本量较小，仅涉及4个病例 | 阐明硬化性肺细胞瘤肿瘤细胞的分子特征，并加深对参与其形成和生物学行为的细胞过程的理解 | 硬化性肺细胞瘤及其对应的正常肺组织 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序和微阵列空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4例硬化性肺细胞瘤及其对应的正常肺组织 |
| 3940 | 2024-09-23 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-Aug-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
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研究论文 | 研究了果蝇眼盘中Glass和Pointed转录因子与EGFR信号的协同作用对神经元身份的促进作用 | 揭示了EGFR信号通过多层转录网络的协同激活机制诱导Glass表达细胞中神经元身份的形成 | NA | 探讨果蝇眼盘中外部信号与细胞内转录因子的整合如何指导前体细胞分化为特定细胞命运 | 果蝇眼盘中的光感受器R1-R7的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |