单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 3901 - 3920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3901 | 2024-11-06 |
In situ tissue profile of rat trigeminal nerve in trigeminal neuralgia using spatial transcriptome sequencing
2024-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001110
PMID:38270619
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组测序技术分析了三叉神经痛大鼠模型中三叉神经组织的细胞间相互作用 | 揭示了三叉神经节对施万细胞脱髓鞘和再髓鞘化反应的影响机制，并发现了新的重要靶基因和调控通路 | NA | 探讨三叉神经痛中不同类型细胞间的相互作用，特别是脱髓鞘对三叉神经节的影响及其内在机制 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织 | NA | 三叉神经痛 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达矩阵 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3902 | 2024-11-06 |
Six3 and Six6 jointly control diverse target genes in multiple cell populations over developmental trajectories of mouse embryonic retinal progenitor cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0308839
PMID:39446806
|
研究论文 | 研究了Six3和Six6转录因子在鼠胚胎视网膜祖细胞发育轨迹中对多种细胞群体目标基因的共同调控作用 | 首次揭示了Six3和Six6在视网膜祖细胞发育过程中对多种细胞群体目标基因的共同调控机制 | 仅限于鼠胚胎视网膜祖细胞的研究，未涉及其他物种或组织 | 探讨组织特异性祖细胞在器官发生中生成成体组织的分子机制 | 鼠胚胎视网膜祖细胞及其发育轨迹 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 控制组和Six3与Six6复合突变鼠胚胎眼杯样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3903 | 2024-11-06 |
Tertiary lymphoid structure-related score as a predictor for survival prognosis and immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483497
PMID:39493749
|
研究论文 | 研究构建了一个基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，并验证了其在预测头颈部鳞状细胞癌患者生存预后和免疫治疗反应中的有效性 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，缺乏大规模临床验证 | 研究旨在开发一种新的预测模型，用于评估三级淋巴结构的存在及其在头颈部鳞状细胞癌患者中的预后和免疫治疗反应 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其三级淋巴结构 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | 评分模型 | 基因数据、单细胞数据 | 23个三级淋巴结构相关基因，头颈部鳞状细胞癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3904 | 2024-11-06 |
eMCI: An Explainable Multimodal Correlation Integration Model for Unveiling Spatial Transcriptomics and Intercellular Signaling
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0522
PMID:39494219
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为eMCI的可解释多模态相关性集成模型，用于揭示空间转录组学和细胞间信号传导 | eMCI通过融合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现了对空间表达模式和细胞间通信的复杂关系的全面分析 | NA | 开发一种新的集成分析框架，以更好地解析空间转录组并阐明细胞间信号传导机制 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 数据融合 | 包括斑马鱼黑色素瘤、大豆根瘤成熟和人类胚胎肺在内的3个跨物种数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3905 | 2024-11-06 |
Prognostic and therapeutic potential of gene profiles related to tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18401
PMID:39494300
|
研究论文 | 本研究开发了一种新的三级淋巴结构（TLS）量化系统，用于预测结直肠癌的预后和治疗反应，并全面描绘了TLS的景观 | 首次建立了TLS评分系统，并验证了其在预测免疫治疗效果中的有效性 | NA | 探讨三级淋巴结构在结直肠癌中的预后和治疗潜力 | 结直肠癌患者的三级淋巴结构及相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 1184名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3906 | 2024-11-04 |
Deciphering craniopharyngioma subtypes: Single-cell analysis of tumor microenvironment and immune networks
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111068
PMID:39483146
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了颅咽管瘤（包括成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型）的肿瘤微环境和免疫网络 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤的细胞组成、肿瘤组织多样性和细胞间相互作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示颅咽管瘤的细胞组成和免疫网络 | 成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3907 | 2024-11-04 |
Investigation of human aging at the single-cell level
2024-Nov, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102530
PMID:39395577
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 本文讨论了多种单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用，并探讨了多组学层在单细胞中的结合以及与空间转录组学和质谱等先进方法的整合 | NA | 探讨单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 人类衰老的机制和相关疾病 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3908 | 2024-11-04 |
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76044-2
PMID:39482351
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了早发性舌癌的分子机制 | 首次成功整合了来自FF和FFPE样本的空间转录组学数据，并揭示了早发性舌癌的独特特征 | 样本量较小，仅包括9名患者 | 探讨早发性舌癌的分子机制及其与老年患者的差异 | 早发性舌癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9名舌鳞状细胞癌患者，分为年轻组（5名）和老年组（4名） | NA | NA | NA | NA |
| 3909 | 2024-11-04 |
Characterization of metastasis-specific macrophages in colorectal cancer for prognosis prediction and immunometabolic remodeling
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77248-2
PMID:39487182
|
研究论文 | 本研究开发了一种预测结直肠癌肝转移和预后的预测模型，通过识别特定的巨噬细胞亚群 | 首次基于EEF1G+巨噬细胞基因特征构建了8基因风险模型EMGS，用于预测结直肠癌肝转移患者的预后 | 研究主要基于公开数据库的数据，缺乏临床验证 | 预测结直肠癌肝转移患者的预后并识别潜在的治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者的巨噬细胞亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE231559、TCGA和GEO数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3910 | 2024-11-04 |
Mechanism differences in the start time of sublingual immunotherapy in a mouse allergic airway inflammation model
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78062-6
PMID:39487347
|
研究论文 | 研究了在过敏性气道炎症小鼠模型中，舌下免疫疗法（SLIT）的启动时间机制差异 | 首次详细研究了SLIT在预防性和治疗性模型中的时机差异及其对免疫耐受的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估SLIT在预防性和治疗性模型中的疗效及其机制 | 过敏性气道炎症小鼠模型中的SLIT效果 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序 | NA | RNA序列和T细胞受体序列 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3911 | 2024-11-04 |
Genetic association between epilepsy and gliomas: Insights from Mendelian randomization and single-cell transcriptomic analyses
2024-Nov-01, Epilepsy & behavior : E&B
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.yebeh.2024.110114
PMID:39488096
|
研究论文 | 研究探讨了癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析揭示了癫痫与胶质瘤之间的潜在因果关系 | NA | 探讨癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 癫痫与胶质瘤的遗传变异及其在胶质瘤进展中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE221534数据集进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 3912 | 2024-11-04 |
SPP1+ macrophages and FAP+ fibroblasts promote the progression of pMMR gastric cancer
2024-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76298-w
PMID:39482333
|
研究论文 | 研究了错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了pMMR胃癌中GC2细胞、SPP1+巨噬细胞和FAP+成纤维细胞在促进肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅限于特定类型的胃癌患者 | 探讨错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 33个新鲜组织样本，来自25名患者，包括10个正常组织、6个dMMR肿瘤组织和17个pMMR肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 3913 | 2024-11-04 |
Hyperuricemia suppresses lumican, exacerbating adverse remodeling after myocardial infarction by promoting fibroblast phenotype transition
2024-Oct-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05778-4
PMID:39482719
|
研究论文 | 研究尿酸血症通过抑制lumican表达加剧心肌梗死后不良重塑的机制 | 首次揭示了尿酸血症通过减少lumican表达促进心肌梗死后纤维母细胞表型转变，从而加剧不良心脏重塑 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在临床患者中验证 | 探讨尿酸血症在心肌梗死病理过程中的作用及其机制 | 尿酸血症对心肌梗死后心脏重塑的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blotting、实时定量PCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 痛风患者、心衰患者和小鼠模型的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3914 | 2024-11-04 |
Development of a humanized mouse model with functional human materno-fetal interface immunity
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176527
PMID:39435662
|
研究论文 | 开发了一种具有功能性人类母胎界面免疫的人源化小鼠模型 | 通过busulfan预处理，成功构建了怀孕的人类免疫系统（HIS）小鼠模型，该模型在母胎界面重构了多谱系的人类免疫子集 | NA | 研究人类母胎界面免疫的功能和特征 | 人类母胎界面免疫 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3915 | 2024-11-04 |
Contrasting the development of larval and adult body plans during the evolution of biphasic lifecycles in sea urchins
2024-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203015
PMID:39465623
|
研究论文 | 研究了海胆在双相生命周期中幼体和成体体型的发育过程 | 使用单细胞RNA测序分析了加速的非摄食型幼体发育模式，并发现了与摄食型幼体相比的细胞类型特化变化 | NA | 探讨双相生命周期中幼体和成体发育的调控机制 | 海胆Heliocidaris erythrogramma的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 从胚胎到变态前一天的海胆Heliocidaris erythrogramma幼体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3916 | 2024-11-04 |
A Part-to-Whole Circular Cell Explorer
2024-Oct-14, ArXiv
PMID:39483344
|
研究论文 | 设计了一种交互式可视化分析系统，用于解决现有空间转录组学方法中的感知问题，并增加了过滤、钻取和聚类分析功能 | 提出了一种新的交互式可视化分析系统，解决了现有方法中的感知问题，并增加了多种分析功能 | NA | 帮助研究人员深入理解组织内复杂生物过程的分子机制 | 空间转录组学中的细胞测量数据，如基因表达和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3917 | 2024-11-04 |
scCaT: An explainable capsulating architecture for sepsis diagnosis transferring from single-cell RNA sequencing
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012083
PMID:39432561
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scCaT的深度学习框架，用于脓毒症诊断，结合了胶囊架构和Transformer模型，利用单细胞RNA测序数据进行建模，并将其迁移到批量RNA数据上 | scCaT框架通过胶囊架构将基因按生物功能分组，提供了基因表达编码的可解释性，并利用Transformer作为解码器进行脓毒症患者和对照组的分类 | NA | 开发一种可解释的深度学习模型，用于脓毒症诊断，并将其从单细胞RNA测序数据迁移到批量RNA数据 | 脓毒症患者和对照组的分类 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | Transformer | RNA测序数据 | 单细胞测试集和七个批量RNA队列 | NA | NA | NA | NA |
| 3918 | 2024-11-04 |
Graph contrastive learning as a versatile foundation for advanced scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae558
PMID:39487083
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的新框架scSimGCL，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | scSimGCL结合了细胞-细胞图结构和对比学习，显著提升了细胞聚类的性能 | NA | 开发一种简单而有效的框架，用于生成高质量的表示，以实现稳健的细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 图对比学习 | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3919 | 2024-11-04 |
NKG2C and NKG2A coexpression defines a highly functional antiviral NK population in spontaneous HIV control
2024-Sep-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182660
PMID:39288262
|
研究论文 | 本研究全面分析了长期病毒控制下的HIV精英控制者（ECs）的NK细胞库，发现NKG2C+CD57+记忆样NK细胞在ECs中显著富集，并揭示了这些细胞在抗HIV感染中的关键作用 | 首次揭示了NKG2C和NKG2A共表达的记忆样NK细胞在HIV控制中的重要作用，并发现了这些细胞独特的转录特征 | 研究主要集中在NK细胞的功能和表型分析，未涉及其他免疫细胞的相互作用 | 探讨NK细胞在HIV精英控制者中的作用及其机制 | HIV精英控制者的NK细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | HIV精英控制者和未感染个体的NK细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3920 | 2024-11-04 |
Human breastmilk memory T cells throughout lactation manifest activated tissue-oriented profile with prominent regulation
2024-Sep-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181788
PMID:39435660
|
研究论文 | 研究分析了母乳中记忆T细胞在哺乳期的特征及其在免疫调节中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序和流式细胞术对母乳中的T细胞进行全面表征，揭示了其独特的组织适应性和免疫调节功能 | 研究主要集中在母乳T细胞的表型和功能分析，未深入探讨其在新生儿免疫支持中的具体机制 | 探讨母乳中不同免疫活性成分对新生儿免疫的贡献 | 母乳中的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表面标记数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |