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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3841 | 2024-11-29 |
Tumor microenvironment and cancer metastasis: molecular mechanisms and therapeutic implications
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1442888
PMID:39600368
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境在癌症发展和转移中的重要作用,重点探讨了分子机制和治疗意义 | 本文通过多学科视角,强调了理解肿瘤微环境的分子基础对于开发更有效的癌症治疗方案的重要性,并指出了未来研究的方向 | NA | 探讨肿瘤微环境在癌症转移中的分子机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的关键成分,如癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞、细胞因子及细胞外基质 | NA | 癌症 | 单细胞分析、空间转录组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3842 | 2024-11-29 |
Identification and Validation of Senescence-Related Signature by Combining Single Cell and Bulk Transcriptome Data Analysis to Predict the Prognosis and Identify the Key Gene CAV1 in Pancreatic Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489985
PMID:39600676
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量转录组数据分析,识别和验证了与衰老相关的特征,用于预测胰腺癌的预后并鉴定关键基因CAV1 | 开发了一种新的衰老相关预后工具,用于胰腺癌患者分层,并识别了CAV1作为潜在的治疗靶点 | NA | 研究细胞衰老在胰腺癌肿瘤微环境中的作用,特别是其对预后和免疫治疗结果的影响 | 胰腺癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、RNA-seq | COX比例风险模型、LASSO回归 | 基因表达数据 | 三个患者队列:TCGA队列、PAAD-AU队列和PAAD-CA队列 | NA | NA | NA | NA |
| 3843 | 2024-11-29 |
Causal links of human serum metabolites on the risk of prostate cancer: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and metabolic pathway analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443330
PMID:39600951
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研究论文 | 本文通过孟德尔随机化研究探讨了人类血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序和代谢途径分析,揭示了三种血清代谢物与前列腺癌风险的因果关系 | 研究结果需要进一步的机制研究来阐明这些血清代谢物和代谢途径如何影响前列腺癌的发生和发展 | 探讨血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 血清代谢物与前列腺癌风险 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、代谢途径分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | 7824名欧洲人 | NA | NA | NA | NA |
| 3844 | 2024-11-27 |
FOS+ B cells: Key mediators of immunotherapy resistance in diverse cancer types
2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200895
PMID:39583007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析免疫治疗患者,探讨了FOS B细胞在多种癌症类型中作为免疫治疗抵抗关键介质的作用 | 发现了FOS B细胞与免疫治疗抵抗的关联,并揭示了其潜在机制,为预测治疗反应提供了新的生物标志物 | NA | 探讨FOS B细胞在免疫治疗抵抗中的作用及其潜在机制 | FOS B细胞在多种癌症类型中的作用 | NA | 多种癌症类型 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据 | 25名免疫治疗患者和1,253例多癌症免疫治疗转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 3845 | 2024-11-27 |
Analysis of population heterogeneity in CHO cells by genome-wide DNA methylation analysis and by multi-modal single-cell sequencing
2024-Dec-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.10.012
PMID:39488254
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研究论文 | 通过全基因组DNA甲基化分析和多模态单细胞测序分析CHO细胞的群体异质性 | 首次通过全基因组亚硫酸氢盐测序建立了CHO细胞的单碱基甲基化图谱,并揭示了DNA甲基化模式在CHO进化中的集群现象 | 研究仅限于CHO细胞系,未涉及其他细胞类型 | 探讨CHO细胞的非遗传机制,特别是DNA甲基化在细胞异质性中的作用 | CHO细胞的DNA甲基化和单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序和多模态单细胞测序 | NA | DNA甲基化数据和单细胞测序数据 | 8个独立的CHO细胞系和3个独立培养的9833个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 3846 | 2024-11-27 |
Predicting survival in bladder cancer with a novel apoptotic gene-related prognostic model
2024-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01575-z
PMID:39580765
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研究论文 | 本文建立了一种基于凋亡基因的新型膀胱癌预后模型,并通过多种分析方法验证了其预测生存率和免疫治疗反应的能力 | 首次基于凋亡基因建立了膀胱癌的预后模型,并验证了其在预测生存率和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 建立并验证一种基于凋亡基因的膀胱癌预后模型,评估其在预测患者生存率和免疫治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | mRNA表达数据 | TCGA和GEO数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3847 | 2024-11-27 |
Exploring new mechanisms in cancer molecular pathways and pathogenic cell transformation: PIP4K2A as a prognostic marker and therapeutic target in cutaneous malignant melanoma
2024-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01555-3
PMID:39579298
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研究论文 | 研究探讨了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 利用单细胞测序和机器学习技术,研究了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | NA | 探讨PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自皮肤黑色素瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3848 | 2024-11-27 |
Integration of the bulk transcriptome and single-cell transcriptome reveals efferocytosis features in lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy by combining deep learning
2024-Nov-23, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03571-3
PMID:39580462
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研究论文 | 本研究整合了大量转录组和单细胞转录组数据,通过深度学习揭示了肺腺癌预后和免疫治疗中的吞噬作用特征 | 开发了一种新的与吞噬作用相关的基因预后特征,能够准确预测肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | NA | 研究吞噬作用在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者及其相关基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | NA | 转录组数据 | 涉及TCGA、GEO和CTRP数据库中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3849 | 2024-11-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment niche transitions during the invasive and metastatic processes of ground-glass nodules and part-solid nodules in lung adenocarcinoma
2024-Nov-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02177-7
PMID:39580469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌中磨玻璃结节和部分实性结节在侵袭和转移过程中的免疫微环境转变 | 首次揭示了CXCL9+和TREM2+肿瘤相关巨噬细胞在不同阶段的显著富集变化,并发现GGN-LUAD在侵袭阶段表现出更强的免疫反应 | 样本量较小,仅包括8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD,可能影响结果的普适性 | 探索肺腺癌不同放射学表型的异质性及其影响肿瘤演变的关联因素 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和部分实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD,以及4例邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 3850 | 2024-11-27 |
Non-coding RNAs in oral cancer: Emerging biomarkers and therapeutic frontier
2024-Nov-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40096
PMID:39583806
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在口腔癌中的潜在诊断和治疗作用 | 结合空间转录组学和空间代谢组学与单细胞RNA测序,深入研究肿瘤微环境,提高诊断和治疗的精准度 | NA | 探讨非编码RNA作为口腔癌诊断和治疗工具的潜力 | 口腔癌及其相关非编码RNA | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3851 | 2024-11-27 |
Identification and analysis of a cell communication prognostic signature for oral squamous cell carcinoma at bulk and single-cell levels
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70166
PMID:39580787
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量测序数据分析,构建了一个新的免疫相关基因预后模型,用于预测口腔鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量测序数据,构建了一个免疫相关基因预后模型,并验证了FCRL4对口腔鳞状细胞癌细胞的影响 | 需要进一步的临床试验来验证模型的实际应用效果 | 开发一个能够有效预测口腔鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 口腔鳞状细胞癌的免疫微环境分析和预后模型构建 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序、批量测序、WGCNA分析、XGBoost | XGBoost | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 3852 | 2024-11-27 |
CD4+ T cells display a spectrum of recall dynamics during re-infection with malaria parasites
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49879-6
PMID:38944658
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研究论文 | 研究了在再次感染疟原虫时,CD4+ T细胞的回忆反应动态 | 首次详细描述了在再次感染疟原虫时,不同CD4 T细胞亚群的回忆反应多样性,并提供了用于研究基因表达动态和克隆关系的图形用户界面 | 研究仅在老鼠模型中进行,结果可能不完全适用于人类 | 探讨在再次感染疟原虫时,CD4+ T细胞的回忆反应及其多样性 | CD4+ T细胞及其在再次感染疟原虫时的反应 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、T细胞受体测序(TCR-seq)和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型中的CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3853 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过PTN信号通路调控肝细胞癌(HCC)细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本,未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集(GSE158723和GSE112271)以及来自HCC患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3854 | 2024-11-27 |
MUC1 and CREB3 are Hub Ferroptosis Suppressors for Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus Degeneration by Integrated Bioinformatics and Experimental Verification
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489052
PMID:39583856
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证,探讨了MUC1和CREB3作为核心铁死亡抑制因子在椎间盘退变中的作用 | 首次揭示了MUC1和CREB3作为椎间盘退变中的铁死亡抑制因子,并构建了药物和竞争性内源RNA网络 | 实验验证和单细胞RNA测序分析的样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探索铁死亡相关基因及其在椎间盘退变中的作用 | 椎间盘的髓核和纤维环 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 基因表达分析、GO和KEGG分析、LASSO和SVM-RFE算法、GSEA和GSVA分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 髓核和纤维环的基因表达数据来自Gene Expression Omnibus数据库,实验验证和单细胞RNA测序分析的具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 3855 | 2024-11-27 |
Prognostic features of bladder cancer based on five neddylation-related genes
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/RWCH7802
PMID:39584004
|
研究论文 | 研究基于五个neddylation相关基因的膀胱癌预后特征 | 首次探讨neddylation在膀胱癌发病和进展中的潜在影响 | NA | 探索neddylation在膀胱癌中的作用及其对发病和进展的影响 | 膀胱癌的预后特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因表达数据分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 11,361个差异表达基因和1,500个枢纽基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3856 | 2024-11-27 |
A Mendelian randomisation approach to explore genetic factors associated with erectile dysfunction based on pooled genomic data
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/GENV7771
PMID:39584007
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探索与勃起功能障碍相关的遗传因素 | 首次利用孟德尔随机化分析结合全血表达数量性状位点和GWAS数据,筛选出与勃起功能障碍高度相关的基因MDM4 | 研究样本主要来自芬兰数据库,可能存在地域和人群偏倚 | 探索勃起功能障碍的遗传因素,为个性化治疗提供依据 | 勃起功能障碍相关的遗传基因 | 遗传学 | 男性健康 | 孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 共95178个个体,包括1154个病例和94024个对照 | NA | NA | NA | NA |
| 3857 | 2024-11-27 |
Prognostic characteristics and drug sensitivity analysis of hepatocellular carcinoma based on histone modification-related genes: a multi-omics integrated study revealing potential therapeutic targets and individualized treatment strategies
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1489469
PMID:39584133
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研究论文 | 本研究整合多组学数据,分析了肝细胞癌中与组蛋白修饰相关的基因,并开发了一种基于组蛋白修饰的预后特征,揭示了潜在的治疗靶点和个性化治疗策略 | 首次通过多组学整合分析,定义了110个与组蛋白相关的基因,并开发了一种新的预后特征,为肝细胞癌的个性化治疗提供了新的见解 | 研究主要基于现有数据集,未来需要进一步的临床验证 | 探讨组蛋白修饰在肝细胞癌中的作用,并开发新的预后特征和治疗策略 | 肝细胞癌患者及其组蛋白修饰相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习 | 基因组数据、临床信息 | 多个队列的数据,包括单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 3858 | 2024-11-27 |
Multi-Omics Exploration of the Role of PTGS2 as a Hub Gene in Ferroptosis Within the Artery of Takayasu Arteritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S478413
PMID:39588139
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研究论文 | 本研究探讨了PTGS2作为Takayasu动脉炎中铁死亡相关枢纽基因的多组学作用 | 首次通过高通量和单细胞转录组学研究Takayasu动脉炎中的铁死亡机制,并识别出PTGS2作为核心基因 | 研究样本量较小,且缺乏动脉样本 | 探索Takayasu动脉炎中铁死亡的机制 | Takayasu动脉炎患者的动脉样本 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名Takayasu动脉炎患者和8名肾移植供体的样本,以及3个公共颈动脉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3859 | 2024-11-27 |
CXCR6 expression predicts prognosis and immunotherapeutic benefit in muscle-invasive bladder cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1498579
PMID:39588301
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研究论文 | 研究探讨了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的预测作用 | 首次系统研究了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的影响 | NA | 探讨CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗效果的预测价值 | 肌肉浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 391名肌肉浸润性膀胱癌患者的数据,212名来自GEO,131名来自本中心,195名来自IMvigor210队列,以及9名膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3860 | 2024-11-27 |
Periodontal ligament tissues support neutrophil differentiation and maturation processes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446541
PMID:39588378
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研究论文 | 研究牙周韧带组织支持中性粒细胞分化和成熟过程 | 首次揭示牙周韧带中中性粒细胞的异质性及其在成熟过程中的不同阶段 | 研究仅基于小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据,未涉及人类样本 | 探讨牙周韧带中中性粒细胞的分化和成熟过程 | 牙周韧带中的中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |