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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3801 | 2024-12-01 |
Molecular Signatures of Resilience to Alzheimer's Disease in Neocortical Layer 4 Neurons
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.03.621787
PMID:39574639
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研究论文 | 研究通过单细胞组学技术分析阿尔茨海默病中不同神经元的脆弱性和抗性特征 | 首次通过单核和空间转录组学技术,比较了阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域,识别出在初级视觉皮质层4中表达特定基因的抗性兴奋性神经元群体 | 研究主要集中在初级视觉皮质层4的神经元,未涵盖其他脑区的神经元抗性机制 | 探讨阿尔茨海默病中神经元的抗性机制 | 阿尔茨海默病中不同皮质区域层4神经元的抗性特征 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞组学技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域的神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3802 | 2024-11-19 |
General-purpose pre-trained large cellular models for single-cell transcriptomics
2024-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae340
PMID:39555105
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3803 | 2024-12-01 |
Population-Level Cell Trajectory Inference Based on Gaussian Distributions
2024-Nov-01, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111396
PMID:39595573
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI,通过高斯混合模型和期望最大化算法优化细胞群体,并结合RNA速度进行高斯过程回归分析 | 提出了一种新的基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI,该方法在处理高维、高噪声的单细胞数据时表现优异 | NA | 解决现有细胞轨迹推断方法在处理高维、高噪声单细胞数据时的不足 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 四个结构多样的模拟数据集和四个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3804 | 2024-12-01 |
Downregulation of Notch Signaling-Stimulated Genes in Neurovascular Unit Alterations Induced by Chronic Cerebral Hypoperfusion
2024-Nov, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70082
PMID:39607309
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研究论文 | 研究慢性脑低灌注(CCH)引起的神经血管单元(NVU)变化及其病理机制 | 揭示了CCH引起的NVU变化,特别是神经炎症相关基因的激活和Notch信号通路的下调 | NA | 探讨CCH引起的NVU变化的病理机制 | 小鼠模型中的脑微血管(BMV)和神经血管单元(NVU) | 数字病理学 | 脑血管疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3805 | 2024-12-01 |
Single-cell sequencing reveals cellular landscape alterations in the airway mucosa of patients with pulmonary long COVID
2024-Nov, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01947-2023
PMID:39326914
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜的细胞景观变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜中中性粒细胞的独特聚集及其在慢性小气道炎症中的作用 | 样本量较小,且仅限于加拿大温哥华地区的患者 | 阐明长期COVID患者肺部的重要细胞和分子驱动因素 | 长期COVID患者的气道黏膜细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 18名成年患者,其中9名长期COVID患者和9名对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 3806 | 2024-12-01 |
Metabolic Transcriptional Activation in Ulcerative Colitis Identified Through scRNA-seq Analysis
2024-Oct-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111412
PMID:39596612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了溃疡性结肠炎中的代谢转录激活 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了溃疡性结肠炎中代谢酶的差异表达,并建立了代谢表达评分模型 | 研究仅基于两个独立的数据集,样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探讨溃疡性结肠炎中代谢酶的表达变化及其对疾病的影响 | 溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | Elastic Net模型 | 转录组数据 | 两个独立数据集,共涉及溃疡性结肠炎和正常对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3807 | 2024-12-01 |
Empowering Precision Oncology: Advancing Cancer Research by Augmenting Single-cell RNA and Bulk RNA Sequencing for Confronting the Heterogeneity in Ovarian Cancer
2024 Jul-Sep, Journal of mid-life health
IF:1.2Q3
DOI:10.4103/jmh.jmh_93_23
PMID:39610955
|
研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序在卵巢癌分子水平上的应用 | 强调了scRNA-Seq在揭示卵巢肿瘤复杂细胞组成和表型可塑性中的关键作用,并展示了其在新生物标志物发现和治疗靶点识别中的应用 | NA | 通过增强对卵巢癌分子水平的理解,推动精准肿瘤学的发展 | 卵巢癌的分子特征和细胞异质性 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3808 | 2024-12-01 |
Strategies for arterial graft optimization at the single-cell level
2024-05, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00464-6
PMID:39195932
|
研究论文 | 通过分析不同动脉移植物的单细胞转录组,提出基于内乳动脉(ITA)的桡动脉(RA)和胃网膜右动脉(RGA)优化策略 | 首次通过单细胞转录组分析不同动脉移植物的细胞特征,并提出优化策略 | 研究仅限于细胞水平,未涉及临床试验验证 | 优化冠状动脉搭桥术中使用的动脉移植物 | 内乳动脉(ITA)、桡动脉(RA)和胃网膜右动脉(RGA) | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 不同动脉移植物的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3809 | 2024-12-01 |
A genome-wide CRISPR screen identifies BRD4 as a regulator of cardiomyocyte differentiation
2024-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00431-1
PMID:39196112
|
研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR筛选,揭示了BRD4在心肌细胞分化中的调控作用 | 首次揭示了BRD4在心肌细胞命运决定中的新角色,并发现SHF心脏前体细胞对BRD4的需求存在异质性 | NA | 研究BRD4在心肌细胞分化中的作用 | 人诱导多能干细胞(hiPSC)和心肌细胞(CM)的分化 | NA | 心血管疾病 | CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3810 | 2024-12-01 |
Bone morphogenic protein-4 availability in the cardiac microenvironment controls inflammation and fibrosis in autoimmune myocarditis
2024-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00432-0
PMID:39196111
|
研究论文 | 研究探讨了骨形态发生蛋白4(BMP4)在心脏微环境中的作用,揭示了其在控制自身免疫性心肌炎中的炎症和纤维化过程中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了BMP4在心脏组织稳态中的作用,并证明了通过抗体介导的BMP抑制剂中和可以改善心肌炎症 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞转录组学分析,可能需要进一步的临床验证 | 探讨BMP4在自身免疫性心肌炎中的分子机制及其在炎症和纤维化控制中的作用 | BMP4在心脏微环境中的作用及其对心肌炎和纤维化的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类心肌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3811 | 2024-12-01 |
Kupffer cells dictate hepatic responses to the atherogenic dyslipidemic insult
2024-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00448-6
PMID:39196121
|
研究论文 | 研究探讨了Kupffer细胞在应对动脉粥样硬化性血脂异常损伤中的作用 | 首次揭示了Kupffer细胞在肝脏对动脉粥样硬化性血脂异常损伤的早期响应中的关键作用,并展示了Kupffer细胞特异的转录程序 | 研究主要基于诱导模型,可能无法完全代表自然状态下的情况 | 探讨肝脏在动脉粥样硬化性血脂异常损伤中的响应机制 | Kupffer细胞在肝脏中的作用及其对血脂异常的响应 | NA | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3812 | 2024-12-01 |
Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02157-7
PMID:38233503
|
研究论文 | 本文介绍了一种简单、稳健且可推广的高通量单细胞测序方法,用于多样性微生物群体中的目标基因座测序 | 开发了一种名为DoTA-seq的新方法,利用简单的液滴微流控设备进行高通量单细胞测序,适用于多样性微生物群体 | NA | 研究微生物群体中的单细胞遗传异质性 | 人类和小鼠肠道微生物群中的抗生素抗性基因和质粒 | 基因组学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 基因组数据 | 超过10个抗生素抗性基因和质粒 | NA | NA | NA | NA |
| 3813 | 2024-12-01 |
SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02117-1
PMID:38049696
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SEVtras的算法,利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,从单细胞转录组中识别小细胞外囊泡(sEVs)并估计其分泌活性 | SEVtras算法能够高效地捕获含有sEVs的液滴,并表征特定细胞类型的分泌活性,为研究sEVs的异质性和细胞行为提供了新的工具 | NA | 开发一种高吞吐量技术来解析sEVs的复杂异质性并揭示其分泌机制 | 小细胞外囊泡(sEVs)及其在肿瘤进展中的作用 | 单细胞测序 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 四个肿瘤scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3814 | 2024-12-01 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomic and multilayer signaling networks in glioma reveal tumor progression stage
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1446903
PMID:39606019
|
研究论文 | 本文介绍了一种综合框架,利用单细胞RNA测序数据和多层信号网络模型研究胶质瘤进展阶段的分子变化 | 本文创新性地结合单细胞RNA测序数据和多层网络模型,揭示了胶质瘤进展阶段的关键分子关系和信号通路 | NA | 研究胶质瘤进展阶段的分子变化及其对治疗和预后的影响 | 胶质瘤的单细胞RNA测序数据和多层信号网络 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 多层网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3815 | 2024-12-01 |
Identification of altered immune cell types and molecular mechanisms in Alzheimer's disease progression by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1477327
PMID:39610716
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别阿尔茨海默病进展中改变的免疫细胞类型和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别阿尔茨海默病中特定的免疫细胞类型和差异表达基因,并发现UFC1可能作为潜在的生物标志物 | 研究主要基于已有的数据集,缺乏对新样本的验证 | 揭示阿尔茨海默病进展中的分子机制,寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病中的免疫细胞类型和差异表达基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE181279、GSE63060和GSE63061数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3816 | 2024-11-30 |
ROS-Induced Gingival Fibroblast Senescence: Implications in Exacerbating Inflammatory Responses in Periodontal Disease
2024-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02014-5
PMID:38630168
|
研究论文 | 研究探讨了细胞衰老在牙周疾病发病机制中的作用及其机制 | 首次揭示了氧化应激诱导的细胞衰老在牙周疾病中加剧炎症反应的作用 | 研究仅限于体外实验,缺乏体内验证 | 探讨细胞衰老在牙周疾病中的作用及其机制 | 牙龈成纤维细胞和内皮细胞 | NA | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和炎症牙龈组织中的牙龈成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3817 | 2024-11-30 |
Droplet-based single-cell sequencing: Strategies and applications
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108454
PMID:39271031
|
综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术的单细胞测序策略及其在基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学分析中的应用 | 液滴微流控技术显著提高了单细胞研究的通量、成本效益和自动化水平 | 讨论了基于液滴的单细胞测序在基础研究和商业应用中的挑战和未来展望 | 全面阐述液滴微流控辅助的单细胞组学方法 | 液滴微流控技术在单细胞测序中的策略和应用 | NA | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3818 | 2024-11-30 |
Immune checkpoint expression on tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) is dependent on HPV status in oropharyngeal carcinoma (OPSCC) - A single-cell RNA sequencing analysis
2024-Dec, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人乳头瘤病毒(HPV)状态对口咽鳞状细胞癌(OPSCC)中肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)免疫检查点分子表达的影响 | 本研究首次揭示了HPV状态与OPSCC中免疫检查点分子表达的复杂相互作用,并提出了基于HPV状态和免疫特征的个性化治疗策略 | 本研究的样本量较小,且仅限于OPSCC病例,未来需要更大规模的研究来验证结果 | 研究HPV状态对OPSCC中免疫检查点分子表达的影响,以确定可能补充抗PD1抗体的其他免疫检查点分子靶点 | 口咽鳞状细胞癌(OPSCC)中的肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和外周血单核细胞(PBMC) | 数字病理学 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat管道 | RNA测序数据 | 51例OPSCC病例和TCGA HNSCC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3819 | 2024-11-30 |
Unveiling FADS3 as a novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma through comprehensive RNA and single-cell sequencing
2024-Nov-27, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.010
PMID:39609202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3820 | 2024-11-30 |
GDNF family receptor alpha-like (GFRAL) expression is restricted to the caudal brainstem
2024-Nov-26, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102070
PMID:39608751
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研究论文 | 研究探讨了GDNF家族受体α样蛋白(GFRAL)在中枢神经系统和外周组织中的表达情况 | 通过高灵敏度和选择性技术,首次全面展示了GFRAL在脑干以外的其他脑区和外周组织中的表达情况 | 研究主要集中在小鼠和人类组织样本上,未涉及其他物种 | 探究GFRAL在外周组织和脑干以外脑区的表达情况 | GFRAL在不同组织中的表达细胞 | 神经科学 | NA | 单分子原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠和人类组织中收集了12种不同组织的样本 | NA | NA | NA | NA |