单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 7461 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-05-25
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发iAssembloids三维共培养系统并结合CRISPRi筛选,揭示神经元与胶质细胞相互作用机制 首次在三维类脑体结构中进行大规模CRISPRi筛选,发现GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激保护反应的新机制 未提及具体局限性 阐明神经元-胶质细胞相互作用在脑健康与疾病中的分子机制 人类诱导多能干细胞衍生的神经元和胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 CRISPRi筛选 na 单细胞转录组数据 未提及具体样本量 10x Genomics 单细胞转录组测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
362 2026-05-25
Spatial transcriptomics data and analytical methods: An updated perspective
2024-03, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 综述空间转录组学数据分析方法的最新进展与未来展望 系统总结了基于深度学习模型在空间转录组数据处理中的最新应用,并指出了提升生物学相关性的持续需求 未提供具体实验验证或量化比较不同方法的性能 探讨空间转录组学数据分析技术的现状及未来在生物医学中的应用前景 空间转录组数据及相关分析方法和数据库 数字病理学 NA 空间转录组学 深度学习 图像、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
363 2026-05-24
TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism
2024-11-11, Gut IF:23.0Q1
研究论文 研究TLR8激动剂selgantolimod通过IL-6依赖机制调节库普弗细胞分化状态并抑制HBV进入肝细胞的作用 首次揭示selgantolimod通过调节库普弗细胞分化状态间接抑制HBV进入肝细胞的新机制,并发现IL-6在其中起关键作用 未完全阐明库普弗细胞分化调控的分子机制,且未在体内模型中进行验证 阐明selgantolimod在肝脏微环境中诱导的转录组变化和细胞间通讯事件 人类肝脏中的库普弗细胞和肝细胞 自然语言处理 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 单细胞转录组数据、RNA测序数据 公开单细胞RNA-seq数据及HBV感染患者转录组数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
364 2026-05-24
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-11-11, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示角鲨烯环氧酶通过诱导CD8+ T细胞功能障碍和增强髓源性抑制细胞活性,促进代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝细胞癌的免疫抑制,并证明靶向SQLE可恢复抗PD-1疗效 首次阐明SQLE在MASH-HCC中通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍及MDSC激活的双重免疫抑制机制,并证实靶向SQLE可逆转抗PD-1治疗耐药 未明确SQLE调控胆固醇代谢的具体分子通路;动物模型可能无法完全模拟人类MASH-HCC的异质性 探究角鲨烯环氧酶在MASH-HCC肿瘤免疫微环境中的作用及其对抗PD-1免疫治疗的影响 肝细胞特异性Sqle转基因和敲除小鼠、原位及人源化小鼠模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术 基因敲除/转基因小鼠模型 基因表达数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
365 2026-05-24
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用空间转录组学技术绘制小鼠精子发生过程中生精上皮周期的转录组图谱,揭示支持细胞与生殖细胞的同步化机制 首次通过空间转录组学RNA SeqFISH+技术精确重构生精上皮周期的时空转录模式,发现支持细胞独立维持周期性转录动态,并鉴定出内在的视黄酸循环和转录因子网络 研究中未提供明确的局限性说明 阐明生精上皮周期中转录组的时空变化及支持细胞与生殖细胞的同步化机制 小鼠睾丸组织中的支持细胞和生殖细胞 空间转录组学 并非专指某种疾病 RNA SeqFISH+空间转录组学 NA 基因表达数据 216090个细胞,2638个基因 NA 空间转录组学 RNA SeqFISH+ RNA SeqFISH+技术用于小鼠睾丸组织的空间基因表达 profiling
366 2025-11-03
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-11, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学方法,揭示心肌梗死中巨噬细胞不会转化为成纤维细胞,但会表达促纤维化的基质细胞蛋白 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术,明确证明心肌梗死中的巨噬细胞不会转分化为成纤维细胞,同时发现其表达多种促纤维化基质蛋白的新功能 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究心肌梗死中巨噬细胞是否会发生成纤维细胞转化及其在细胞外基质表达中的作用 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 单细胞生物学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 对照组和心肌梗死组小鼠的CSF1R+髓系细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
367 2026-05-24
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-08-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用斑马鱼单细胞转录组学、谱系追踪和突变分析,揭示颅缝形成过程中调控骨形成的关键细胞转变 首次鉴定出颅缝中部间充质细胞亚群通过表达BMP拮抗剂(如grem1a)限制骨形成,从而确保颅缝正常形态的机制 未提及 探究颅缝在颅骨扩张过程中如何控制成骨活性以促进骨生长并防止异常骨融合 斑马鱼胚胎颅缝组织 单细胞转录组学 颅缝相关疾病 单细胞转录组测序、谱系追踪、突变分析 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼胚胎样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
368 2026-05-24
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-08-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发单细胞靶向长读长测序方法scTaILoR-seq,揭示卵巢癌转录变异 提出scTaILoR-seq技术,通过杂交捕获靶向一千多个基因,将每个细胞的中位数靶向转录本数提高29倍,结合长读长变异检测揭示表达SNV与可变转录结构的关联,并测量等位基因失衡 长读长测序通量较低且可能意外测序伪影,该方法可能仍受限于靶向基因的选择和捕获效率 开发并验证一种单细胞长读长靶向测序方法,用于研究RNA异构体及转录变异 卵巢癌细胞系和原发肿瘤样本 单细胞测序 卵巢癌 长读长测序、靶向杂交捕获 NA RNA序列 10,796个单细胞转录组(来自卵巢癌细胞系和原发肿瘤) NA 单细胞RNA测序 NA NA
369 2026-05-24
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 通过患者来源的类器官生物库,发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调是严重克罗恩病的新机制 首次发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调(DNA甲基化缺失)是克罗恩病发病的新型机制,并通过类器官-淋巴细胞共培养和基因敲除小鼠模型验证了功能影响 未明确提及 研究肠上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 来自168名患者(72名CD、23名UC、73名健康对照)的312个肠上皮类器官 机器学习 克罗恩病 DNA甲基化测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因编辑 机器学习模型 DNA甲基化数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 168名患者的312个肠上皮类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
370 2026-05-24
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究展示了人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植能够改善先天性巨结肠患者组织中的功能反应 首次证实人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞能够再定植并增加先天性巨结肠患者结肠组织的功能反应 NA 评估人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植对先天性巨结肠患者结肠组织的整合和功能影响 先天性巨结肠患者结肠组织样本,以及人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞 数字病理学 先天性巨结肠 单细胞RNA测序,蛋白质表达分析,钙成像,器官浴收缩性测试 NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,钙成像数据 先天性巨结肠患者结肠组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于分析细胞转录组特征
371 2026-05-24
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示胆囊癌发病过程中微环境动态变化及免疫调控因子OLFM4的作用 首次构建胆囊疾病多病理状态单细胞图谱,发现OLFM4通过MAPK-AP1轴上调PD-L1促进免疫逃逸,提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 部分发现需进一步在更大样本及临床队列中验证,体外和体内机制研究需补充更多分子细节 阐明胆囊癌及良性胆囊疾病的细胞生态系统和分子特征,为癌症预防和治疗提供新靶点 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及癌旁正常组织的细胞 机器学习 胆囊癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 230,737个细胞,来自15例胆囊癌、4例胆囊炎、3例胆囊息肉、5例胆囊腺瘤和16例癌旁正常组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
372 2026-05-24
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-03, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology IF:4.3Q1
综述 总结口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的研究进展 利用单细胞测序等新技术深入描述口服免疫治疗后的基因表达变化及其与脱敏和缓解等临床结局相关的分子特征,并鉴定了与疾病活动相关且受治疗影响的T辅助2A细胞类型 目前研究仍存在显著空白,需要更多关注长期和明确临床结局的免疫特征的研究,以全面理解过敏缓解的路径 研究口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的影响及其与临床结局的关系 食物过敏患者接受口服免疫治疗后的转录组变化及免疫机制 机器学习 食物过敏 单细胞测序,转录组测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
373 2026-05-24
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人神经母细胞瘤转移性骨髓,揭示微环境重塑和转移特征 首次通过单细胞水平比较分析有和无转移患者的骨髓微环境,揭示免疫细胞群体重塑、基因表达重编程及预后标志物 未提及具体限制 阐明神经母细胞瘤骨髓转移的细胞和分子机制,为开发新疗法提供依据 神经母细胞瘤患者的转移性骨髓样本 机器学习 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个患者样本,包括有和无转移的神经母细胞瘤患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
374 2026-05-24
Immunological characterization and comparison of children with COVID-19 from their adult counterparts at single-cell resolution
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序比较儿童与成人COVID-19患者的免疫特征 首次在单细胞分辨率下系统比较儿童和成人COVID-19患者的免疫细胞差异,揭示儿童更强的NK细胞毒性和较少的炎症反应 初步研究,样本量较小(15名儿童和18名成人) 阐明儿童COVID-19患者免于重症的免疫保护机制 COVID-19儿童和成人患者的外周血免疫细胞 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15名儿童(8名患者)和18名成人(13名患者) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
375 2026-05-24
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示重症急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 首次构建了重症急性胰腺炎患者外周血单核细胞的单细胞转录组图谱,并发现了一种高表达PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 样本量较小,仅7名未经治疗的重症急性胰腺炎患者,且健康对照数据来自公共数据库 了解重症急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其作用机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 重症急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 单细胞转录组学 重症急性胰腺炎 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 7名未治疗的重症急性胰腺炎患者,6名健康对照(来自GEO数据库) NA 单细胞RNA-seq NA NA
376 2026-05-23
Single-cell profiling of the peripheral blood immune landscape during mid- and late-stage pregnancy
2024-12-01, Physiological genomics IF:2.5Q2
研究论文 通过单细胞测序分析中晚期妊娠外周血免疫细胞图谱 首次揭示了HOPX+ CD4+ T细胞、ZNF683+CD8+ T细胞和KLRB1+CD8+ T细胞在妊娠中晚期显著差异,并发现了罕见XIST+ T细胞亚型在妊娠中可能参与免疫相关基因转录翻译调控和胰岛素信号通路 样本量较小,仅纳入3例中期和3例晚期妊娠女性,且未涉及早期妊娠对比或妊娠相关疾病研究 建立中晚期妊娠女性外周血单个核细胞免疫谱,为研究妊娠相关疾病提供基础 中晚期妊娠女性的外周血单个核细胞 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 6例妊娠女性(中期3例,晚期3例) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
377 2026-05-23
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-11-14, Molecular human reproduction IF:3.6Q1
综述 综述了母胎界面自然杀伤细胞的异质性及其在妊娠健康与疾病中的意义 通过总结基于表面标志物、功能分子、发育阶段的传统分类和单细胞RNA测序聚类方法,全面分析了子宫NK细胞亚群的异质性,并探讨了子宫内膜NK细胞向蜕膜NK细胞分化及不同dNK亚群的分化路径 综述中未提及具体实验验证或定量分析,可能存在文献选择性偏倚 理解母胎界面自然杀伤细胞的异质性,探讨其在妊娠健康与疾病中的作用 子宫自然杀伤细胞亚群,包括基于表面标志物、功能分子、发育阶段的传统分类和单细胞RNA测序聚类方法,以及妊娠相关疾病中NK细胞亚群的变化 机器学习和数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
378 2026-05-23
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis
2024-10-07, Gut IF:23.0Q1
研究论文 KLHL21通过维持STAT3信号平衡抑制胃肿瘤发生,其缺失促进PIK3CB mRNA翻译并激活STAT3,靶向STAT3可逆转癌前化生 发现KLHL21缺失通过稳定PABPC1-eIF4G复合物促进PIK3CB mRNA翻译,进而激活STAT3信号,首次揭示KLHL21在胃稳态中调控核糖体翻译的机制 未提及研究的具体局限性 探究KLHL21在胃黏膜化生向不典型增生转化过程中的分子机制及其对肿瘤发生的影响 胃组织标本、Mist1+细胞、KLHL21条件性敲除小鼠模型 分子生物学 胃癌 单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、核糖体测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、核糖体测序数据 胃癌患者组织样本(具体数量未提及)及小鼠模型样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序、核糖体测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序平台,Illumina NovaSeq进行核糖体测序
379 2026-05-23
Multicellular 3D bioprinted human gallbladder carcinoma forin vitromimicry of tumor microenvironment and intratumoral heterogeneity
2024-08-22, Biofabrication IF:8.2Q1
research paper 本研究利用三维生物打印技术构建多细胞人胆囊癌模型,模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 首次使用同心圆柱四培养模型重建胆囊癌组织中细胞的空间分布,并通过单细胞RNA测序揭示模型内存在两种不同的胆囊癌细胞亚型,验证了肿瘤内异质性的模拟 未提及具体局限性 构建高保真多细胞三维胆囊癌模型以模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 人胆囊癌细胞、内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 digital pathology 胆囊癌 三维生物打印, 单细胞RNA测序 三维共培养模型 基因表达数据, 图像数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
380 2026-05-23
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-08-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示ITGB6通过促进PF4+巨噬细胞浸润调控头颈癌对anti-CD276治疗的抵抗机制 首次发现ITGB6通过调控CX3CL1-CX3CR1轴介导PF4+巨噬细胞招募,进而影响anti-CD276治疗效果,并阐明其在anti-PD1治疗抵抗中的逆转作用 研究主要基于小鼠模型,结论在人类患者中的验证尚需进一步研究 探究头颈鳞癌对anti-CD276治疗产生抵抗的机制及潜在干预靶点 头颈鳞状细胞癌小鼠模型 机器学习 头颈癌 单细胞RNA测序,基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序数据 化学诱导和原位癌小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
回到顶部