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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3701 | 2024-11-18 |
A Dual-Payload Antibody-Drug Conjugate Targeting CD276/B7-H3 Elicits Cytotoxicity and Immune Activation in Triple-Negative Breast Cancer
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4099
PMID:39186778
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研究论文 | 研究开发了一种双载荷抗体药物偶联物(DualADC),用于治疗三阴性乳腺癌(TNBC),通过靶向CD276/B7-H3诱导细胞毒性和免疫激活 | 首次开发了一种双载荷抗体药物偶联物,结合了传统的细胞毒性载荷和免疫调节的Toll样受体7/8激动剂,有效杀伤多种TNBC亚型并增强肿瘤微环境中的免疫功能 | NA | 开发一种新的抗体药物偶联物,用于治疗难治性转移性三阴性乳腺癌 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | NA | 乳腺癌 | 抗体药物偶联物(ADC) | NA | RNA测序、多重细胞因子分析、组织学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3702 | 2024-11-18 |
Identification of feature genes in intestinal epithelial cell types
2024-Nov-15, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00208-8
PMID:39542983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人和小鼠肠道不同细胞类型的特征基因,并通过免疫荧光染色和CRISPR/Cas9敲除技术探讨了这些基因在调节肠道上皮细胞增殖和分化中的作用 | 本研究不仅报道了多种肠道上皮细胞类型的新标记物,还阐明了相关基因在决定上皮细胞命运和维持干细胞稳态中的作用 | NA | 深入探索肠道上皮细胞的代表性标记物和转录因子,以进行全面的细胞命运轨迹分析 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 基因表达数据 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3703 | 2024-11-18 |
A multimodal zebrafish developmental atlas reveals the state-transition dynamics of late-vertebrate pluripotent axial progenitors
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.047
PMID:39454574
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研究论文 | 本文介绍了Zebrahub,一个整合了单细胞测序时间序列数据和光片显微镜重建的斑马鱼胚胎发育动态图谱 | Zebrahub提供了高分辨率和深入的分子洞察力,通过在十个发育阶段对单个胚胎进行测序,并重建细胞轨迹,同时包含一个交互式工具来导航复杂的细胞流动和谱系 | NA | 阐明生物体发育过程,全面理解细胞谱系在空间、时间和分子域中的变化 | 斑马鱼胚胎发育中的神经-中胚层前体细胞(NMPs)和联合肾-造血干细胞前体细胞的起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序,光片显微镜 | NA | 单细胞数据 | 十个发育阶段的单个斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 3704 | 2024-11-18 |
Machine learning-driven discovery of novel therapeutic targets in diabetic foot ulcers
2024-Nov-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00955-z
PMID:39543487
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研究论文 | 利用机器学习方法识别糖尿病足溃疡(DFU)中的治疗反应基因 | 首次通过机器学习方法识别出与DFU相关的关键基因SCUBE1和RNF103-CHMP3,并探讨了其在免疫调节和细胞通讯中的作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证,并探索其在临床治疗中的应用潜力 | 通过机器学习方法识别糖尿病足溃疡中的潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的转录组数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的转录组数据,以及单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3705 | 2024-11-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of the cellular ecosystem of primary hepatocellular carcinoma
2024-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03574-0
PMID:39543644
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在原发性肝细胞癌(HCC)细胞生态系统中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了HCC细胞生态系统的复杂性和异质性 | NA | 理解HCC的发展并识别新的治疗靶点 | HCC细胞及其非恶性基质细胞的异质性和相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3706 | 2024-11-18 |
Comparison of functional characterization of cancer stem cells in different tumor tissues of pseudomyxoma peritonei
2024-Nov-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05730-6
PMID:39543711
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研究论文 | 本研究比较了伪黏液瘤腹膜(PMP)患者不同肿瘤组织中癌症干细胞(CSCs)的功能特征 | 首次比较了PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的增殖、迁移和抗炎能力 | 样本量较小,未涉及长期疗效和临床应用 | 研究PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的生物学特性 | PMP患者的癌症干细胞(CSCs) | 数字病理学 | 腹膜肿瘤 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 涉及PMP患者的不同肿瘤组织中的CSCs | NA | NA | NA | NA |
| 3707 | 2024-11-18 |
Transcriptome-based network analysis related to regulatory T cells infiltration identified RCN1 as a potential biomarker for prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-14, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00404-x
PMID:39543725
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研究论文 | 研究通过转录组网络分析识别与调节性T细胞浸润相关的RCN1作为透明细胞肾细胞癌的潜在预后生物标志物 | 开发了一个与调节性T细胞浸润相关的预后模型,并发现RCN1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值 | NA | 识别透明细胞肾细胞癌的预后标志物和治疗靶点 | 调节性T细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 生物信息学 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 转录组数据 | TCGA-KIRC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3708 | 2024-11-18 |
Jag1 insufficiency alters liver fibrosis via T cell and hepatocyte differentiation defects
2024-Nov, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00145-8
PMID:39358604
|
研究论文 | 研究Jag1不足如何通过T细胞和肝细胞分化缺陷影响肝纤维化 | 首次揭示了Jag1不足导致的肝细胞和T细胞分化缺陷与肝纤维化之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 探讨Jag1不足对肝纤维化的影响及其机制 | Jag1小鼠模型、T细胞、肝细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | RNA | 涉及Jag1小鼠和患者肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3709 | 2024-11-18 |
Integrated single-cell transcriptomic analyses identify a novel lineage plasticity-related cancer cell type involved in prostate cancer progression
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105398
PMID:39418984
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组分析,识别出一种与前列腺癌进展相关的新型细胞类型,该细胞类型具有谱系可塑性 | 首次识别出一种新型谱系可塑性相关的前列腺癌细胞类型,并揭示其在肿瘤进展中的关键作用 | NA | 识别并验证与前列腺癌进展相关的谱系可塑性相关细胞类型 | 前列腺癌细胞及其谱系可塑性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3314个样本和222,529个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3710 | 2024-11-18 |
The development and application of cleavage under targets and tagmentation (CUT&Tag) technology
2024, Journal of biological methods
DOI:10.14440/jbm.2024.0017
PMID:39544184
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综述 | 本文综述了CUT&Tag技术的发展及其在表观遗传学中的应用 | CUT&Tag技术能够快速检测染色质修饰和转录因子,并已适应于同时检测多种表观遗传修饰 | NA | 提供CUT&Tag及其衍生技术在表观遗传调控中的最新发展和应用概述 | 染色质结构、基因转录调控、表观遗传修饰 | 表观遗传学 | NA | CUT&Tag | NA | 基因组数据 | 不同物种的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3711 | 2024-11-17 |
RB1 Mutations Induce Smoking-Related Bladder Cancer by Modulating the Cytochrome P450 Pathway
2024-Dec, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24409
PMID:39239764
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研究论文 | 研究探讨了RB1基因突变如何通过调节细胞色素P450途径促进吸烟相关的膀胱癌发生 | 首次揭示了RB1突变在吸烟相关膀胱癌中的作用机制,并阐明了其通过抑制细胞色素P450途径和调节肿瘤免疫微环境来驱动肿瘤发生 | 研究主要基于TCGA数据集和细胞实验,缺乏临床样本的验证 | 探讨吸烟引起的RB1突变与膀胱癌发生之间的关系及其分子机制 | RB1基因突变、细胞色素P450途径、膀胱癌细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据集和细胞实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3712 | 2024-11-17 |
STGAT: Graph attention networks for deconvolving spatial transcriptomics data
2024-Dec, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108431
PMID:39461117
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研究论文 | 本文提出了一种名为STGAT的图注意力网络方法,用于解卷积空间转录组数据 | STGAT通过生成伪空间转录组数据和构建综合图,利用图注意力网络动态分配权重,显著提高了细胞类型组成的预测准确性 | NA | 提高空间转录组数据分析的分辨率和准确性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据的整合与解卷积 | 数字病理学 | NA | 图注意力网络 | 图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3713 | 2024-11-17 |
Integrating transcriptomic data and digital pathology for NRG-based prediction of prognosis and therapy response in gastric cancer
2024-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2426758
PMID:39527470
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研究论文 | 本文研究了非凋亡性细胞死亡相关基因(NRG)在胃癌(GC)中的预后和治疗反应预测作用,并开发了一种基于深度学习的模型 | 首次将转录组数据与数字病理学结合,构建NRG特征并开发深度学习模型,用于胃癌患者的预后和治疗反应预测 | NA | 研究非凋亡性细胞死亡相关基因在胃癌中的预后和治疗反应预测作用 | 胃癌患者的转录组数据和数字病理学图像 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | ResNet50 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3714 | 2024-11-17 |
Galectin-9 Mediates the Functions of Microglia in the Hypoxic Brain Tumor Microenvironment
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3878
PMID:39207402
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研究论文 | 研究探讨了Galectin-9在缺氧脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的影响 | 揭示了Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞的独特功能,并发现Gal-9高表达的小胶质细胞具有炎症激活和较高的细胞死亡率,而Gal-9低表达的小胶质细胞则具有更强的吞噬能力 | 研究主要基于小鼠模型和人类胶质母细胞瘤的bulk RNA测序数据,可能需要进一步的人类临床数据验证 | 阐明Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的调控作用,并探讨其作为治疗靶点的潜力 | Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞和巨噬细胞的功能影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠脑肿瘤模型和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3715 | 2024-11-17 |
SPathDB: a comprehensive database of spatial pathway activity atlas
2024-Nov-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1041
PMID:39546631
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研究论文 | 介绍了一个名为SPathDB的综合数据库,用于解析空间通路活动图谱 | 首次构建了一个包含大量空间转录组数据和生物通路的数据库,提供了对空间异质性功能活动的交互分析和可视化 | NA | 揭示驱动空间异质性的功能特征和理解复杂的生物过程 | 人类和小鼠的空间转录组数据及生物通路 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 转录组数据 | 1689868个空间点,来自84个空间转录组数据集的695个切片,涉及36种组织和疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 3716 | 2024-11-17 |
Profound cellular defects attribute to muscular pathogenesis in the rhesus monkey model of Duchenne muscular dystrophy
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.041
PMID:39305903
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研究论文 | 研究揭示了在杜氏肌营养不良(DMD)的恒河猴模型中,肌肉病理发生与细胞缺陷之间的关系 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了DMD恒河猴模型中肌肉组织的细胞和分子变化,发现了免疫细胞景观的改变、纤维化纤维脂肪前体细胞(FAPs)的谱系进展方向逆转以及FAPs和肌肉干细胞(MuSCs)对TGF-β的抵抗性 | NA | 阐明在病理条件下肌肉组织中多种细胞类型的细胞和分子变化 | 杜氏肌营养不良(DMD)的恒河猴模型中的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3717 | 2024-11-17 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of quinoa salt bladders
2024-Nov-13, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-024-00189-3
PMID:39532803
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了藜麦盐囊泡的发育轨迹和转录调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序构建了藜麦盐囊泡的细胞图谱,并识别了13个不同的细胞集群,揭示了盐囊泡发育过程中的关键调控因子 | 研究主要集中在藜麦盐囊泡的发育机制,未涉及其在实际农业生产中的应用 | 揭示藜麦盐囊泡的发育机制及其在盐胁迫下的耐受性 | 藜麦盐囊泡的发育过程及其转录调控网络 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 藜麦幼叶来源的原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 3718 | 2024-11-17 |
Single-cell transcriptomics reveals the molecular basis of human iPS cell differentiation into ectodermal ocular lineages
2024-Nov-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07130-4
PMID:39532995
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了人类诱导多能干细胞(hiPSCs)分化为眼外胚层谱系的分子基础 | 本文揭示了眼外胚层细胞在SEAM形成过程中的发育轨迹,并展示了从多能性到组织特化和分化的进展 | NA | 研究人类诱导多能干细胞分化为眼外胚层谱系的分子机制 | 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)分化为眼外胚层谱系的分子基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 12周内的多个时间点样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3719 | 2024-11-17 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals tumor cell heterogeneity and underlying molecular program in uveal melanoma
2024-Nov-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05831-2
PMID:39533334
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析揭示了葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及其潜在的分子机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性,并开发了一种基于机器学习的9基因签名用于患者分层 | 研究仅限于17个肿瘤样本,样本量较小,可能影响结果的普适性 | 揭示葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及其对患者分层的潜在影响 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞及其分子特征 | 数字病理学 | 眼癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 37,660个恶性细胞来自17个葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3720 | 2024-11-17 |
m5C related-regulator-mediated methylation modification patterns and prognostic significance in breast cancer
2024-11-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77389-4
PMID:39523404
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,筛选与乳腺癌进展相关的m5C调控因子,并分析其临床价值 | 首次在单细胞水平揭示m5C调控因子在乳腺癌中的失调机制及其在癌变和进展中的关键作用 | 需要更多独立数据集进行外部验证,以增强研究结果的可靠性 | 评估m5C调控因子在乳腺癌中的表达及其与肿瘤微环境、临床病理特征和预后的相关性 | m5C调控因子在乳腺癌中的作用及其临床意义 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的单细胞和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |