单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 3701 - 3720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3701 | 2024-08-07 |
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000560
PMID:37676248
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3702 | 2024-10-06 |
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000299
PMID:36683360
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 | 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 | NA | 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 | 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 | 癌症研究 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 3703 | 2024-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000524
PMID:37368993
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱，并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 研究仅限于慢性乙型肝炎患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 | 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3704 | 2024-10-06 |
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1467261
PMID:39364136
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评论 | 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 | 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 | 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力，未提供具体的研究数据或方法 | 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 | 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 | NA | NA | 干细胞3D方法 | NA | NA | NA |
| 3705 | 2024-10-06 |
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453220
PMID:39364403
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 | 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 | 研究依赖于公开数据，可能存在数据偏差；实验验证仅通过qRT-PCR进行，未涉及其他验证方法 | 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公开数据，具体样本数量未明确提及 |
| 3706 | 2024-10-06 |
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448662
PMID:39364414
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型，揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性，并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 | 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 | 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性，并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 3707 | 2024-10-05 |
Integrated Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Identify Diagnostic Biomarkers for Postmenopausal Osteoporosis
2024-Oct-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物，并构建了诊断模型 | NA | 探索绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、基因集富集分析 | NA | RNA | NA |
| 3708 | 2024-10-05 |
CCKBR+ cancer cells contribute to the intratumor heterogeneity of gastric cancer and confer sensitivity to FOXO inhibition
2024-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01360-z
PMID:39164456
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析胃腺癌患者的恶性上皮细胞，揭示了胃腺癌的异质性，并发现CCKBR+干细胞样癌细胞与不良分化和预后较差相关 | 首次揭示了FOXO抑制剂在减少CCKBR+胃腺癌器官形成和阻碍肿瘤进展中的作用，并阐明了FOXO-唾液酸转移酶轴在维持CCKBR+肿瘤细胞稳态和生长中的机制 | 研究样本量较小，仅涉及5名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨胃腺癌的异质性及其与CCKBR+干细胞样癌细胞的关系，并研究FOXO抑制剂在治疗中的潜在作用 | 胃腺癌患者的恶性上皮细胞和CCKBR+干细胞样癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序（scRNA-seq）、CUT&Tag测序、Lectin pulldown | NA | 转录组 | 5名胃腺癌患者，40个单细胞转录组样本 |
| 3709 | 2024-10-05 |
Advanced machine learning unveils CD8 + T cell genetic markers enhancing prognosis and immunotherapy efficacy in breast cancer
2024-Oct-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12952-w
PMID:39354417
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法，识别出与乳腺癌预后和免疫治疗效果相关的CD8+ T细胞基因标记 | 开发了一种新的CD8+ T细胞相关基因预后签名（CTRGPS），并验证了其在多个独立数据集中的预后价值 | NA | 探索CD8+ T细胞在乳腺癌中的作用，识别新的生物标志物以改善预后和治疗策略 | CD8+ T细胞基因标记及其在乳腺癌中的预后和治疗效果 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因数据 | 涉及七个独立公共数据集 |
| 3710 | 2024-10-05 |
Exploring the potential mechanism of Radix Bupleuri in the treatment of sepsis: a study based on network pharmacology and molecular docking
2024-Oct-01, BMC complementary medicine and therapies
IF:3.3Q1
DOI:10.1186/s12906-024-04637-5
PMID:39354431
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研究论文 | 本研究利用网络药理学和分子对接技术探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 | 首次结合网络药理学和RNA-seq技术，系统分析了柴胡在脓毒症治疗中的活性成分和潜在靶点，并通过分子对接和分子动力学模拟验证了关键靶点的结合能力 | 样本量较小，且仅基于公共数据库的数据进行分析，缺乏临床试验验证 | 探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 | 柴胡的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点 | 网络药理学 | 脓毒症 | RNA-seq | 分子对接 | 基因表达数据 | 23名脓毒症患者和10名健康参与者 |
| 3711 | 2024-10-05 |
Superior antitumor immune response achieved with proton over photon immunoradiotherapy is amplified by the nanoradioenhancer NBTXR3
2024-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02855-0
PMID:39354474
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研究论文 | 比较了光子放疗（XRT）和质子放疗（PRT）结合免疫检查点阻断（αPD1）在免疫放疗（IRT）中的疗效，并评估了纳米颗粒放射增敏剂NBTXR3的影响 | 发现质子放疗结合NBTXR3在治疗αPD1耐药肺癌中表现出优于光子放疗的效果，并能增强记忆性抗肿瘤免疫反应 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在临床试验中验证 | 探讨质子放疗与光子放疗在免疫放疗中的相对疗效，并评估NBTXR3的增效作用 | αPD1耐药的肺癌（344SQR）小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 涉及多个小鼠模型和三种不同的肺癌细胞系 |
| 3712 | 2024-10-05 |
Expression, DNA methylation pattern and transcription factor EPB41L3 in gastric cancer: a study of 262 cases
2024-Oct-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01849-7
PMID:39354571
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研究论文 | 研究胃癌中EPB41L3基因的表达、DNA甲基化模式及转录因子调控 | 揭示了EPB41L3基因非CpG甲基化与胃癌进展的关联，并识别了关键的转录因子和下游分子 | NA | 阐明EPB41L3在胃癌中的表达和甲基化，识别调控转录因子及受影响的下游通路 | 胃癌组织中的EPB41L3基因及其甲基化模式 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组化、高吞吐量亚硫酸氢盐测序、染色质免疫沉淀-定量PCR、荧光素酶报告基因检测、RNA测序 | NA | 组织样本 | 262例胃癌患者 |
| 3713 | 2024-10-05 |
Application of a single-cell-RNA-based biological-inspired graph neural network in diagnosis of primary liver tumors
2024-Oct-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05670-1
PMID:39354613
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的生物启发图神经网络框架，用于原发性肝肿瘤的分子诊断 | 该框架利用细胞间通信网络的生物合理性，通过整合细胞簇内的通路激活特征和建模单向细胞间通信，实现了对恶性肿瘤和良性肿瘤的稳健区分 | NA | 开发一种新的诊断方法，利用单细胞RNA测序数据进行原发性肝肿瘤的分子诊断 | 原发性肝肿瘤，包括肝细胞癌（HCC）、肝内胆管癌（iCCA）和局灶性结节性增生（FNH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3714 | 2024-10-05 |
Novel FABP4+C1q+ macrophages enhance antitumor immunity and associated with response to neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in NSCLC via AMPK/JAK/STAT axis
2024-Oct-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07074-x
PMID:39353883
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研究论文 | 研究了新型FABP4+C1q+巨噬细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中增强抗肿瘤免疫的作用及其与新辅助派姆单抗和化疗（NAPC）疗效的关系 | 发现了与新辅助化疗免疫疗法疗效相关的新型FABP4C1q巨噬细胞亚型，并揭示了其通过AMPK/JAK/STAT轴增强抗炎和吞噬能力的机制 | NA | 探讨新辅助派姆单抗和化疗在非小细胞肺癌中的疗效机制及预测标志物 | 非小细胞肺癌患者及其肿瘤组织和淋巴结中的巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3715 | 2024-10-05 |
SAE-Impute: imputation for single-cell data via subspace regression and auto-encoders
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05944-x
PMID:39354334
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAE-Impute的新计算方法，通过结合子空间回归和自动编码器来提高单细胞数据插补的准确性和可靠性 | SAE-Impute通过子空间回归评估样本相关性，并在自动编码器框架内利用这些预测进行插值，从而解决了现有方法忽略样本间相关性的问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高数据分析的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 3716 | 2024-10-05 |
ScRNAbox: empowering single-cell RNA sequencing on high performance computing systems
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05935-y
PMID:39354372
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研究论文 | 介绍了一种名为scRNAbox的创新性单细胞RNA测序分析管道，专为高性能计算系统设计 | scRNAbox是一个端到端的解决方案，通过SLURM工作负载管理器高效处理标准和Hashtag样本的原始数据，并集成了质量控制过滤、样本整合、聚类、聚类注释工具以及细胞类型特异性差异基因表达分析 | NA | 开发一个用户友好且适用于高性能计算系统的单细胞RNA测序数据处理和分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开数据集 |
| 3717 | 2024-10-05 |
Comprehensive analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics revealed IER3 for predicting malignant progression and immunotherapy efficacy in glioma
2024-Oct-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03511-1
PMID:39354533
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了IER3在预测胶质瘤恶性进展和免疫治疗效果中的作用 | 首次全面分析了IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | NA | 探讨IER3在胶质瘤病理中的作用及其作为生物标志物的潜力 | IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 免疫组化、免疫荧光、Cox回归分析、Kaplan-Meier曲线 | NA | RNA测序数据 | 公开的胶质瘤数据集 |
| 3718 | 2024-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
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研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤如何诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞招募和分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并探讨了这些细胞在肿瘤微环境中的作用 | 首次发现胶质母细胞瘤诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并揭示了这些细胞在抑制肿瘤生长中的作用 | NA | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤生物学中的作用 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关中性粒细胞、颅骨骨髓 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和鼠类胶质母细胞瘤样本 |
| 3719 | 2024-10-05 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2024-Sep-02, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
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综述 | 本文综述了原发性硬化性胆管炎（PSC）的免疫生物学最新进展 | 重点介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在PSC研究中的应用 | NA | 全面概述PSC的免疫生物学机制 | PSC相关的免疫细胞类型及其在疾病中的作用 | NA | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 3720 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of MYH11+ tumour-associated fibroblasts between left-sided and right-sided colorectal cancer
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70102
PMID:39294858
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了左半结肠癌和右半结肠癌中MYH11+肿瘤相关成纤维细胞的异质性 | 首次全面注释了左半结肠癌和右半结肠癌的特征和差异，并发现了一种新的MYH11+癌症相关成纤维细胞亚群 | 样本量较小，仅包括12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 | 探讨左半结肠癌和右半结肠癌的异质性及其潜在机制 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 |