单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 3681 - 3700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2024-10-20 |
Bioinformatic-Experimental Screening Uncovers Multiple Targets for Increase of MHC-I Expression through Activating the Interferon Response in Breast Cancer
2024-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910546
PMID:39408874
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验筛选，识别出多个可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 首次通过综合分析MHC-I评分、基因表达相关性、生存预测和Cibersort肿瘤浸润淋巴细胞评分，识别出144个与MHC-I表达和TILs负相关的基因，并通过实验验证了其中多个基因的有效性 | 研究主要集中在乳腺癌细胞系和患者样本，结果的普适性需要进一步验证 | 识别并验证可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 乳腺癌细胞中的MHC-I表达和肿瘤浸润淋巴细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3682 | 2024-10-20 |
Cerebrospinal Fluid and Peripheral Blood Lymphomonocyte Single-Cell Transcriptomics in a Subject with Multiple Sclerosis Acutely Infected with HIV
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910459
PMID:39408789
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研究论文 | 研究了多发性硬化症（MS）急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 首次在多发性硬化症和HIV感染的临床样本中使用单细胞转录组技术，揭示了神经退行性基因表达的特征 | 无法区分多发性硬化症和HIV感染的具体原因 | 探讨多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 脑脊液中1446个单细胞转录组，外周血单核细胞中4647个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 3683 | 2024-10-20 |
Characterization of Endothelial Cell Subclusters in Localized Scleroderma Skin with Single-Cell RNA Sequencing Identifies NOTCH Signaling Pathway
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910473
PMID:39408800
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群，并识别出NOTCH信号通路 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细研究局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群，并识别出与疾病进展相关的信号通路 | 研究样本仅包括27名局限性硬皮病患者和17名健康对照，样本量有限 | 探讨局限性硬皮病皮肤中内皮细胞的分子机制 | 局限性硬皮病患者的皮肤内皮细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27名局限性硬皮病患者和17名健康对照的皮肤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3684 | 2024-10-20 |
Unravelling the Complexity of HNSCC Using Single-Cell Transcriptomics
2024-Sep-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16193265
PMID:39409886
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）研究中的应用 | scRNAseq技术能够详细描述肿瘤微环境（TME）中的细胞水平特征，为HNSCC的病因、诊断、预后和治疗提供了新的见解 | NA | 评估scRNAseq在解决HNSCC管理挑战中的效用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3685 | 2024-10-20 |
SELF-Former: multi-scale gene filtration transformer for single-cell spatial reconstruction
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae523
PMID:39413798
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的框架SELF-Former，用于单细胞空间重构任务 | 引入了基因过滤模块，显著提升了空间重构任务的准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据到空间转录组数据的空间重构问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | Transformer | Transformer | 基因表达数据 | 四个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3686 | 2024-10-20 |
An isoform-resolution transcriptomic atlas of colorectal cancer from long-read single-cell sequencing
2024-Sep-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100641
PMID:39216476
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研究论文 | 本研究通过整合短读和长读单细胞RNA测序数据，构建了结直肠癌的isoform分辨率转录组图谱 | 首次整合短读和长读单细胞RNA测序数据，揭示了结直肠癌中394个失调的转录结构，并开发了一种算法来识别可能用于癌症疫苗开发的复发性新抗原 | NA | 揭示结直肠癌中的转录异质性和潜在的治疗靶点 | 结直肠癌样本中的肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3687 | 2024-10-20 |
SSR1 and CKAP4 as potential biomarkers for intervertebral disc degeneration based on integrated bioinformatics analysis
2024-Mar, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1309
PMID:38222802
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变潜在的生物标志物，并在体外进行了验证 | 本研究首次通过综合生物信息学方法鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变的潜在生物标志物，并在体外实验中验证了其诊断价值 | 本研究的样本量较小，且仅限于人类椎间盘组织，未来需要更大规模和多样本的验证 | 鉴定椎间盘退变的潜在生物标志物并验证其诊断价值 | 椎间盘退变相关的关键基因和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 脊柱疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、MCODE、LASSO算法、ROC曲线、免疫浸润分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 30个人类椎间盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3688 | 2024-10-20 |
Single-cell sequencing reveals increased LAMB3-positive basal keratinocytes and ZNF90-positive fibroblasts in autologous cultured epithelium
2024-01-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05747-5
PMID:38200141
|
研究论文 | 研究在无血清和无饲养层条件下培养的自体表皮移植的安全性和有效性，并与传统条件进行比较 | 发现无血清和无饲养层培养的表皮中LAMB3阳性基底角质形成细胞和ZNF90阳性成纤维细胞数量增加，这些细胞在色素再生中起关键作用 | 研究仅限于稳定期的白癜风患者，未涉及其他疾病或更广泛的患者群体 | 探讨无血清和无饲养层条件下自体表皮移植的安全性和有效性 | 自体表皮移植在无血清和无饲养层条件下的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 稳定期白癜风患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3689 | 2024-10-20 |
Profiling the heterogeneity of colorectal cancer consensus molecular subtypes using spatial transcriptomics
2024-Jan-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00488-4
PMID:38200223
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，解析了结直肠癌共识分子亚型的空间细胞和分子组成 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境中的细胞通讯事件 | NA | 进一步阐明结直肠癌的组成和结构，以推进个性化治疗 | 结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3690 | 2024-10-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor cell heterogeneity and immune microenvironment features of pituitary neuroendocrine tumors
2024-01-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01267-3
PMID:38167466
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了垂体神经内分泌肿瘤的细胞异质性和免疫微环境特征 | 揭示了垂体神经内分泌肿瘤的内在细胞异质性和肿瘤微环境特征，发现了一种新的具有侵袭性特征的皮质激素瘤亚型 | NA | 研究垂体神经内分泌肿瘤的细胞特征和免疫微环境 | 垂体神经内分泌肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4个正常样本和24个垂体神经内分泌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3691 | 2024-10-20 |
ZNF689 deficiency promotes intratumor heterogeneity and immunotherapy resistance in triple-negative breast cancer
2024-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00909-w
PMID:38168642
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研究论文 | 研究探讨了ZNF689缺乏如何促进三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | 首次揭示了ZNF689缺乏通过激活LINE-1逆转录转座子加剧基因组不稳定性，从而促进肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中肿瘤内异质性与免疫治疗抵抗的关系及其关键决定因素 | 三阴性乳腺癌患者的多组学数据和免疫治疗数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学、流式细胞术 | NA | 多组学数据 | 260例来自本中心的患者、134例来自TCGA的患者和109例接受免疫治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3692 | 2024-10-20 |
scRNA+TCR-seq reveals the pivotal role of dual receptor T lymphocytes in the pathogenesis of Kawasaki disease and during IVIG treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1457687
PMID:39421738
|
研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和TCR-seq技术，分析了健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞，探讨了双受体T细胞在KD发病机制和IVIG治疗中的作用 | 首次揭示了双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的关键作用 | 样本量较小，仅包括3名健康对照和6名KD患者 | 探讨双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的作用 | 健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 川崎病 | scRNA-seq和TCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 3名健康对照和6名KD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3693 | 2024-10-20 |
The role of lactylation in plasma cells and its impact on rheumatoid arthritis pathogenesis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453587
PMID:39421742
|
研究论文 | 研究探讨了乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，首次揭示了乳酸化在浆细胞中的重要作用，并识别出七个核心乳酸化促进基因 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证 | 探索乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 浆细胞和类风湿性关节炎患者 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 10,163个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3694 | 2024-10-19 |
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-Dec, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2368336
PMID:38884422
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研究论文 | 研究探讨了基因deathstar在果蝇发育、运动和寿命中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序技术，首次发现并验证了基因deathstar在星形胶质细胞中的特异性表达及其对果蝇发育和生理功能的影响 | 研究主要集中在雄性果蝇上，对雌性果蝇的影响未进行深入探讨 | 揭示星形胶质细胞特异性基因在果蝇发育和生理功能中的作用 | 果蝇的星形胶质细胞及其特异性基因deathstar | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及果蝇的视觉叶和脑部的多个发育阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 3695 | 2024-10-19 |
Revolutionizing prognostic predictions in colorectal cancer: Macrophage‑driven transcriptional insights from single‑cell RNA sequencing and gene co‑expression network analysis
2024-Dec, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14721
PMID:39411205
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，揭示了结直肠癌中巨噬细胞驱动的转录组特征，并构建了一个新的预后模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，识别了与巨噬细胞相关的预后生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | 研究结果需要进一步的前瞻性研究验证 | 提高结直肠癌免疫治疗的预后预测准确性 | 结直肠癌中的巨噬细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 基因表达数据 | 23个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3696 | 2024-10-19 |
Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response
2024-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067
PMID:39322177
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研究论文 | 研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用 | NA | 研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3697 | 2024-10-19 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-Nov-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种高维过度分散广义因子模型（OverGFM），用于处理高维非线性因子分析中的过度分散混合型数据 | 引入了一个额外的误差项来捕捉因子无法解释的过度分散，并提出了一种新的变分EM算法来解决计算挑战 | NA | 解决高维非线性因子模型在处理过度分散混合型数据时的不足 | 高维过度分散混合型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 广义因子模型 | 混合型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3698 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration
2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2023.2275172
PMID:37902557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用 | 首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化 | NA | 研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物 | 椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 5种NP亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 3699 | 2024-10-19 |
The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets
2024-Nov, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10138-2
PMID:39261411
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研究论文 | 本研究探讨了不同细胞亚群中单细胞转录组谱的相反衰老效应 | 首次报告了衰老在不同细胞亚群中对基因表达的相反效应，并强调了在干预衰老相关基因时考虑细胞亚群的重要性 | NA | 研究衰老对不同细胞亚群基因表达的影响 | 小鼠的单细胞RNA测序数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tabula Muris Senis数据集，包含大量小鼠的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3700 | 2024-09-27 |
Spatial transcriptomics of acute kidney injury
2024-Nov, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00899-x
PMID:39322738
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |