单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 3581 - 3600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3581 | 2024-10-26 |
Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer
2024-Oct, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843
PMID:39305996
|
研究论文 | 研究探讨了胃癌中细胞外基质（ECM）的蛋白质组异质性，并分析了其与组织学亚型和患者预后的关系 | 首次通过定量蛋白质组学分析胃癌去细胞化组织中的肿瘤ECM，识别出与特定组织学亚型相关的关键分子标记 | 研究主要集中在ECM的蛋白质组分析，未涉及其他分子层面的深入探讨 | 研究胃癌中细胞外基质的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和患者预后的关系 | 胃癌患者的去细胞化组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | 多个胃癌患者的去细胞化组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3582 | 2024-10-26 |
Senolytic and senomorphic agent procyanidin C1 alleviates structural and functional decline in the aged retina
2024-Apr-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311028121
PMID:38657052
|
研究论文 | 研究了衰老视网膜中细胞衰老负担增加对结构和功能的影响，并验证了原花青素C1（PCC1）的抗衰老和抗衰老细胞特性 | 首次全面描述了PCC1对衰老视网膜的改善作用，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨衰老视网膜中的细胞衰老负担及其治疗潜力 | 衰老视网膜的结构和功能变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3583 | 2024-10-26 |
LIG1 is a novel marker for bladder cancer prognosis: evidence based on experimental studies, machine learning and single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419126
PMID:39234248
|
研究论文 | 本文探讨了LIG1在膀胱癌中的作用及其与预后的关系 | 首次系统研究LIG1在膀胱癌中的作用，结合实验研究、机器学习和单细胞测序技术 | 实验验证主要基于体外和细胞系，缺乏临床样本的直接验证 | 阐明LIG1与膀胱癌的相互作用及其与临床病理因素的相关性 | LIG1在膀胱癌中的表达、功能及其与预后的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的膀胱癌和癌旁组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3584 | 2024-10-26 |
TP63 transcriptionally regulates SLC7A5 to suppress ferroptosis in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445472
PMID:39234254
|
研究论文 | 研究探讨了TP63通过转录调控SLC7A5抑制头颈鳞状细胞癌中的铁死亡机制 | 首次揭示了TP63+ SLC7A5+头颈鳞状细胞癌亚群通过TP63上调SLC7A5表达抑制铁死亡，从而促进肿瘤生长和免疫治疗抵抗的新机制 | NA | 研究头颈鳞状细胞癌在免疫治疗前后肿瘤微环境的异质性及其机制 | 头颈鳞状细胞癌患者在免疫治疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3585 | 2024-10-26 |
Transcriptomic signatures of WNT-driven pathways and granulosa cell-oocyte interactions during primordial follicle activation
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311978
PMID:39441825
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 | 首次使用Wntless条件性敲除小鼠模型，揭示了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞转录组变化的影响 | 研究仅限于Wntless条件性敲除小鼠模型，未探讨其他信号通路的影响 | 探讨WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 | 颗粒细胞和卵母细胞在原始卵泡激活过程中的转录组变化 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Wntless条件性敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3586 | 2024-10-26 |
Application of a risk score model based on glycosylation-related genes in the prognosis and treatment of patients with low-grade glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1467858
PMID:39445005
|
研究论文 | 研究基于糖基化相关基因的风险评分模型在低级别胶质瘤患者预后和治疗中的应用 | 首次构建了基于糖基化相关基因的风险评分模型，用于低级别胶质瘤的预后预测和治疗指导 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，需要进一步的临床验证 | 探讨糖基化相关基因在低级别胶质瘤中的生物学功能及其在预后和治疗中的应用 | 低级别胶质瘤患者及其糖基化相关基因 | 数字病理 | 脑肿瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的低级别胶质瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3587 | 2024-10-26 |
Single-cell sequencing technology in skin wound healing
2024, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkae043
PMID:39445224
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用价值 | 单细胞测序技术能够准确检测细胞表达和基因序列，为伤口愈合研究提供了新的概念和工具 | NA | 探讨单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用及其在临床中的价值 | 皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子机制 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3588 | 2024-10-25 |
Decoding the multiple functions of ZBP1 in the mechanism of sepsis-induced acute lung injury
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07072-x
PMID:39433574
|
研究论文 | 研究探讨了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的多重功能 | 首次定义了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用，并揭示了其在调节巨噬细胞和肺内皮细胞功能中的重要性 | 研究仅基于ZBP1敲除小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在治疗价值 | ZBP1在巨噬细胞和肺内皮细胞中的功能 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ZBP1敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3589 | 2024-10-25 |
Enhancing spatial domain detection in spatial transcriptomics with EnSDD
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07001-y
PMID:39433947
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnSDD的方法，通过集成学习整合多种空间域检测方法，以提高空间转录组学中空间域的识别准确性 | EnSDD的创新点在于其动态加权机制，优化了每个基础模型的贡献，并提供了一种无需真实标签数据的性能评估指标 | NA | 提高空间转录组学中空间域的识别准确性，揭示组织异质性和区域化特征 | 空间转录组学数据中的空间域、特定空间变异基因和细胞类型的空间分布 | 空间转录组学 | NA | 集成学习 | 集成学习模型 | 空间转录组数据 | 多种组织结构的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3590 | 2024-10-25 |
Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology
2024-Oct-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01877-3
PMID:39434124
|
研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在理解骨髓纤维化病理生理学中的应用 | 引入空间转录组学技术，提供了对骨髓和脾脏中基因表达的高分辨率映射，揭示了驱动疾病进展的分子特征和病理微环境 | NA | 通过空间转录组学技术深入理解骨髓纤维化的病理生理学，识别新的治疗靶点和生物标志物 | 骨髓纤维化的病理生理学、临床表型和治疗干预 | 数字病理学 | 血液病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3591 | 2024-10-25 |
Exploring the impact of ITGB2 on glioma progression and treatment: Insights from non-apoptotic cell death and immunotherapy
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24231
PMID:38488682
|
研究论文 | 研究探讨了整合素β2（ITGB2）在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 首次揭示了ITGB2在非凋亡细胞死亡和免疫治疗反应中的关键作用，并展示了其在预测免疫活动、突变特征和药物反应中的潜力 | 研究主要基于体外模型和数据分析，未来需要进一步的临床验证 | 探讨ITGB2在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 胶质瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析（iTalk和ICELLNET） | NA | 数据集 | 10个不同的胶质瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3592 | 2024-10-25 |
Elucidating the role of FOS in modulating the immune microenvironment through fibroblast and myeloid cell regulation in locoregional recurrent HNSCC
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24262
PMID:38567514
|
研究论文 | 本研究探讨了FOS在调节头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）局部复发中的免疫微环境中的作用，特别是其对成纤维细胞和髓系细胞的影响 | 本研究揭示了FOS在HNSCC肿瘤微环境中不同细胞群体中的表达差异，并探讨了其与免疫和缺氧相关通路的关联，为HNSCC的治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 研究FOS在HNSCC局部复发中的免疫微环境调节作用 | FOS在HNSCC肿瘤微环境中对成纤维细胞和髓系细胞的调节作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | HNSCC患者组织样本及相邻非癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3593 | 2024-10-25 |
Single-cell and bulk RNA-sequencing reveal SPP1 and CXCL12 as cell-to-cell communication markers to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24297
PMID:38622884
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，揭示了SPP1和CXCL12作为细胞间通讯标志物，用于预测肺腺癌预后的潜力 | 首次揭示了SPP1和CXCL12在肺腺癌微环境中的细胞间通讯作用，并探讨了它们与免疫细胞的关系 | 研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探讨肺腺癌微环境中的细胞间通讯特征及其与预后的关系 | 肺腺癌肿瘤组织及其邻近的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自公共数据集的肺腺癌批量RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3594 | 2024-10-25 |
PTPN7 mediates macrophage-polarization and determines immunotherapy in gliomas: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24259
PMID:38581214
|
研究论文 | 研究探讨了PTPN7在胶质瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 首次系统分析了PTPN7在胶质瘤微环境中的特征及其对免疫治疗的影响 | 研究主要基于单细胞测序和细胞培养实验，缺乏临床验证 | 探讨PTPN7在胶质瘤中的作用及其对免疫治疗的影响 | PTPN7在胶质瘤中的表达、预后价值、基因组特征、免疫特性及对化疗和免疫治疗的预测作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及HMC3和M0细胞与U251和T98G细胞的共培养实验 | NA | NA | NA | NA |
| 3595 | 2024-10-25 |
RNA modification-related EIF4G2 is an immunotherapy determinant in osteosarcoma: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24261
PMID:38578024
|
研究论文 | 本研究探讨了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的关系，并识别出EIF4G2作为关键的免疫治疗决定因素 | 首次建立了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的联系，并识别出EIF4G2作为潜在的治疗靶点 | NA | 探索骨肉瘤中RNA修饰与免疫治疗之间的关系，以识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤中的RNA修饰和免疫治疗 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | 随机森林 | RNA修饰相关特征 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3596 | 2024-10-25 |
Using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data to reveal a correlation between smoking and neutrophil activation in esophageal carcinoma patients
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24312
PMID:38700434
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据揭示吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联 | 首次揭示了吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联，并探讨了中性粒细胞在肿瘤微环境中的促癌作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关系 | 食管癌患者的中性粒细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 公共数据库中的数据，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 3597 | 2024-10-25 |
LineageVAE: reconstructing historical cell states and transcriptomes toward unobserved progenitors
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae520
PMID:39172488
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LineageVAE的新型计算方法，利用深度学习技术重建不可观测的细胞状态和转录组 | 开发了LineageVAE，一种基于深度生成模型的计算方法，能够将具有相同谱系条码的scRNA-seq观测数据转换为潜在细胞状态空间中的序列轨迹，从而重建不可观测的细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 由于实验性质，观测数据稀疏，早期状态的细胞并非后期观测细胞的直接祖先 | 克服单细胞RNA测序在动态过程中测量基因表达变化的限制，重建不可观测的细胞状态和转录组 | 细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE | 基因表达数据 | 涉及造血和重编程成纤维细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3598 | 2024-10-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal apelin/APJ pathway's role in microvessel formation and tumour progression in hepatocellular carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70152
PMID:39434201
|
研究论文 | 本研究探讨了apelin/APJ通路在肝细胞癌（HCC）中的作用及其对微血管形成和肿瘤进展的影响 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术揭示了apelin/APJ通路在HCC中的功能，并验证了其作为潜在治疗靶点的可能性 | 实验验证主要集中在基因沉默对血管生成的影响，未涉及其他治疗策略的探索 | 阐明apelin/APJ通路在HCC中的功能，并识别潜在的治疗生物标志物 | 肝细胞癌（HCC）中的apelin/APJ通路及其对微血管形成和肿瘤进展的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 3599 | 2024-10-25 |
Research progress on single-cell expression quantitative trait loci
2024-Oct, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-162
PMID:39443309
|
综述 | 本文综述了单细胞表达定量性状位点（sc-eQTL）研究的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）揭示依赖于细胞类型、状态和动态的eQTL，增强了对基因表达相关遗传变异的分析能力 | 当前研究面临实验设计和建模方法的挑战 | 提供新的视角来识别与疾病相关的位点并阐明基因调控机制 | 单细胞表达定量性状位点（sc-eQTL） | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3600 | 2024-10-25 |
Points2Regions: Fast, interactive clustering of imaging-based spatial transcriptomics data
2024-Sep, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24884
PMID:38958502
|
研究论文 | 介绍了一种名为Points2Regions的计算工具，用于快速识别空间转录组学数据中具有相似mRNA组成的区域 | 通过将点（代表mRNA）栅格化到金字塔网格上进行快速特征提取，并结合层次聚类和k-means聚类进行高效聚类，实现了跨多个尺度的快速区域发现 | 未提及具体限制 | 开发一种不依赖额外数据且能快速识别空间转录组学数据中相似mRNA组成区域的工具 | 空间转录组学数据中的mRNA组成区域 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 层次聚类和k-means聚类 | 空间点数据 | 两个模拟数据集和真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |